MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_015733	TGG	3	9	24627	24635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484961
503	NC_015733	GAT	2	6	24649	24654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484961
504	NC_015733	GGC	2	6	24685	24690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484961
505	NC_015733	TGG	2	6	24801	24806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484961
506	NC_015733	TCT	2	6	24822	24827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484961
507	NC_015733	TGG	3	9	24867	24875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484961
508	NC_015733	TCT	2	6	24879	24884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484961
509	NC_015733	GAAA	2	8	24889	24896	75 %	0 %	25 %	0 %	339484961
510	NC_015733	TCT	2	6	25152	25157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484962
511	NC_015733	GGC	2	6	25161	25166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484962
512	NC_015733	CGC	2	6	25202	25207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484962
513	NC_015733	CAC	2	6	25274	25279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484962
514	NC_015733	CG	3	6	25292	25297	0 %	0 %	50 %	50 %	339484962
515	NC_015733	GCA	2	6	25348	25353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484962
516	NC_015733	TCT	2	6	25456	25461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484962
517	NC_015733	AGC	2	6	25467	25472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484962
518	NC_015733	GCA	2	6	25540	25545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484962
519	NC_015733	GAA	2	6	25562	25567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484962
520	NC_015733	GCG	2	6	25606	25611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484962
521	NC_015733	GAA	2	6	25628	25633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484962
522	NC_015733	TGG	2	6	25650	25655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484962
523	NC_015733	TCA	2	6	25677	25682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484962
524	NC_015733	AAC	2	6	25740	25745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484962
525	NC_015733	TGA	2	6	25768	25773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484962
526	NC_015733	CGA	2	6	25807	25812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484962
527	NC_015733	CAC	2	6	25827	25832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484962
528	NC_015733	AGC	2	6	25833	25838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484962
529	NC_015733	CAG	3	9	25850	25858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484962
530	NC_015733	A	6	6	25861	25866	100 %	0 %	0 %	0 %	339484962
531	NC_015733	TCG	2	6	25990	25995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484963
532	NC_015733	GGC	2	6	26085	26090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484963
533	NC_015733	GCA	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484963
534	NC_015733	GGCTTG	2	12	26176	26187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339484963
535	NC_015733	CCA	2	6	26258	26263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484963
536	NC_015733	GC	4	8	26264	26271	0 %	0 %	50 %	50 %	339484963
537	NC_015733	GC	3	6	26274	26279	0 %	0 %	50 %	50 %	339484963
538	NC_015733	TAG	2	6	26308	26313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484963
539	NC_015733	TGGT	2	8	26332	26339	0 %	50 %	50 %	0 %	339484963
540	NC_015733	GGCCAC	2	12	26340	26351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339484963
541	NC_015733	CAG	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484963
542	NC_015733	CAG	2	6	26496	26501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
543	NC_015733	GGC	2	6	26537	26542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484964
544	NC_015733	GAA	2	6	26604	26609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484964
545	NC_015733	GCC	2	6	26632	26637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484964
546	NC_015733	GCA	2	6	26668	26673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
547	NC_015733	CTG	2	6	26700	26705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484964
548	NC_015733	CAG	2	6	26790	26795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
549	NC_015733	AGGT	2	8	26920	26927	25 %	25 %	50 %	0 %	339484964
550	NC_015733	CTTCGT	2	12	26942	26953	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339484964
551	NC_015733	CGCA	2	8	26958	26965	25 %	0 %	25 %	50 %	339484964
552	NC_015733	CGG	2	6	27005	27010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484964
553	NC_015733	CAGGTC	2	12	27060	27071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339484964
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555	NC_015733	GCA	2	6	27095	27100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
556	NC_015733	GGC	2	6	27108	27113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484964
557	NC_015733	TGC	2	6	27137	27142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484964
558	NC_015733	GCA	2	6	27149	27154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
559	NC_015733	TGCCGA	2	12	27155	27166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339484964
560	NC_015733	GCA	2	6	27208	27213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
561	NC_015733	CG	3	6	27248	27253	0 %	0 %	50 %	50 %	339484964
562	NC_015733	CAGGGC	2	12	27270	27281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339484964
563	NC_015733	CGT	2	6	27299	27304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484964
564	NC_015733	GTA	3	9	27312	27320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484964
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567	NC_015733	GC	3	6	27403	27408	0 %	0 %	50 %	50 %	339484964
568	NC_015733	CGC	2	6	27416	27421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484964
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571	NC_015733	GCT	2	6	27539	27544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484964
572	NC_015733	GAA	3	9	27558	27566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484964
573	NC_015733	TGA	2	6	27653	27658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484964
574	NC_015733	GCA	2	6	27665	27670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
575	NC_015733	CAG	2	6	27687	27692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
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580	NC_015733	CTG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484964
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586	NC_015733	ACC	2	6	28039	28044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484964
587	NC_015733	CAG	2	6	28053	28058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
588	NC_015733	GCC	2	6	28102	28107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484964
589	NC_015733	CGA	2	6	28151	28156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484964
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591	NC_015733	GGT	2	6	28173	28178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484964
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596	NC_015733	CGGCG	3	15	28384	28398	0 %	0 %	60 %	40 %	339484964
597	NC_015733	CTC	2	6	28500	28505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339484964
598	NC_015733	GTAC	2	8	28653	28660	25 %	25 %	25 %	25 %	339484965
599	NC_015733	GCG	2	6	28700	28705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484965
600	NC_015733	CAG	2	6	28712	28717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484965
601	NC_015733	CGGCAG	2	12	28757	28768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339484965
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603	NC_015733	GCC	2	6	29021	29026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484965
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605	NC_015733	CCCAG	2	10	29080	29089	20 %	0 %	20 %	60 %	339484965
606	NC_015733	CGA	2	6	29128	29133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484965
607	NC_015733	ACC	2	6	29223	29228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484965
608	NC_015733	GTA	2	6	29237	29242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484965
609	NC_015733	TGC	2	6	29244	29249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484965
610	NC_015733	GGC	2	6	29309	29314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484965
611	NC_015733	GC	3	6	29337	29342	0 %	0 %	50 %	50 %	339484965
612	NC_015733	CAC	2	6	29399	29404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484965
613	NC_015733	AGT	2	6	29422	29427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484965
614	NC_015733	GGCT	2	8	29475	29482	0 %	25 %	50 %	25 %	339484965
615	NC_015733	CAGG	2	8	29689	29696	25 %	0 %	50 %	25 %	339484966
616	NC_015733	CGA	2	6	29784	29789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484966
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618	NC_015733	CAT	2	6	29820	29825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484966
619	NC_015733	CTCAAG	2	12	29836	29847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339484966
620	NC_015733	CTGG	2	8	29871	29878	0 %	25 %	50 %	25 %	339484966
621	NC_015733	CCG	2	6	29891	29896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484966
622	NC_015733	TCG	2	6	29912	29917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484966
623	NC_015733	GTG	2	6	29918	29923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484966
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625	NC_015733	ACCAC	2	10	30077	30086	40 %	0 %	0 %	60 %	339484966
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