MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015733	GTGGCC	3	18	261605	261622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485159
5002	NC_015733	TGA	2	6	261645	261650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485159
5003	NC_015733	GC	3	6	261675	261680	0 %	0 %	50 %	50 %	339485159
5004	NC_015733	TGC	2	6	261681	261686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485159
5005	NC_015733	CTGG	2	8	261811	261818	0 %	25 %	50 %	25 %	339485159
5006	NC_015733	TGG	2	6	261845	261850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485159
5007	NC_015733	TCA	2	6	261999	262004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485159
5008	NC_015733	CTG	3	9	262064	262072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485159
5009	NC_015733	TCA	2	6	262116	262121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485159
5010	NC_015733	TTC	2	6	262130	262135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485159
5011	NC_015733	GTG	2	6	262160	262165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485159
5012	NC_015733	TCT	2	6	262227	262232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485159
5013	NC_015733	G	6	6	262233	262238	0 %	0 %	100 %	0 %	339485159
5014	NC_015733	GC	3	6	262260	262265	0 %	0 %	50 %	50 %	339485159
5015	NC_015733	CGG	2	6	262299	262304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485159
5016	NC_015733	CTG	2	6	262337	262342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485159
5017	NC_015733	ATG	2	6	262346	262351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485159
5018	NC_015733	CGC	2	6	262433	262438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485159
5019	NC_015733	GGC	2	6	262445	262450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485159
5020	NC_015733	TGA	2	6	262492	262497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485159
5021	NC_015733	GAC	2	6	262514	262519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485159
5022	NC_015733	GTG	2	6	262520	262525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485159
5023	NC_015733	GAC	2	6	262589	262594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485159
5024	NC_015733	GAG	2	6	262634	262639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485159
5025	NC_015733	CTGG	2	8	262694	262701	0 %	25 %	50 %	25 %	339485159
5026	NC_015733	GAA	2	6	262720	262725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485159
5027	NC_015733	CCG	2	6	262726	262731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485159
5028	NC_015733	TAC	2	6	262733	262738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485159
5029	NC_015733	TGG	2	6	262782	262787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485159
5030	NC_015733	ATC	2	6	262805	262810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485159
5031	NC_015733	TAA	2	6	262865	262870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339485159
5032	NC_015733	CCG	2	6	263036	263041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485160
5033	NC_015733	CAG	2	6	263159	263164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485160
5034	NC_015733	GTG	2	6	263211	263216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485160
5035	NC_015733	TGCG	2	8	263259	263266	0 %	25 %	50 %	25 %	339485160
5036	NC_015733	CAC	2	6	263267	263272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485160
5037	NC_015733	GCG	2	6	263284	263289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485160
5038	NC_015733	GTT	2	6	263291	263296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485160
5039	NC_015733	CCG	2	6	263297	263302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485160
5040	NC_015733	GC	3	6	263315	263320	0 %	0 %	50 %	50 %	339485160
5041	NC_015733	GCG	2	6	263410	263415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485160
5042	NC_015733	CGC	2	6	263461	263466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485160
5043	NC_015733	CCG	2	6	263569	263574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485160
5044	NC_015733	GCGG	2	8	263645	263652	0 %	0 %	75 %	25 %	339485160
5045	NC_015733	CTG	3	9	263663	263671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485160
5046	NC_015733	GAA	2	6	263693	263698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485160
5047	NC_015733	TGC	2	6	263709	263714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485160
5048	NC_015733	TTC	2	6	263741	263746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485160
5049	NC_015733	CGC	2	6	263773	263778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485160
5050	NC_015733	G	6	6	263806	263811	0 %	0 %	100 %	0 %	339485160
5051	NC_015733	GCT	2	6	263853	263858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485160
5052	NC_015733	CAC	3	9	263975	263983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485161
5053	NC_015733	GCC	2	6	264003	264008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485161
5054	NC_015733	TGG	2	6	264034	264039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485161
5055	NC_015733	CGG	2	6	264052	264057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485161
5056	NC_015733	CCA	2	6	264058	264063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485161
5057	NC_015733	AGAT	2	8	264252	264259	50 %	25 %	25 %	0 %	339485161
5058	NC_015733	CAG	2	6	264260	264265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485161
5059	NC_015733	GCG	2	6	264322	264327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485161
5060	NC_015733	GGC	2	6	264422	264427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485161
5061	NC_015733	AGG	2	6	264429	264434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485161
5062	NC_015733	TGC	2	6	264468	264473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485161
5063	NC_015733	CAG	2	6	264503	264508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485161
5064	NC_015733	CGG	2	6	264532	264537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485161
5065	NC_015733	CCA	2	6	264584	264589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485161
5066	NC_015733	CAG	2	6	264596	264601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485161
5067	NC_015733	GCG	2	6	264644	264649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485161
5068	NC_015733	TGG	2	6	264655	264660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485161
5069	NC_015733	GCT	2	6	264707	264712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485161
5070	NC_015733	GC	3	6	264716	264721	0 %	0 %	50 %	50 %	339485162
5071	NC_015733	GA	3	6	264741	264746	50 %	0 %	50 %	0 %	339485162
5072	NC_015733	CCA	2	6	264858	264863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485162
5073	NC_015733	CAG	2	6	264883	264888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485162
5074	NC_015733	CTT	2	6	264915	264920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485162
5075	NC_015733	GCA	2	6	264972	264977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485162
5076	NC_015733	GCT	2	6	265083	265088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485162
5077	NC_015733	GCA	2	6	265242	265247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485162
5078	NC_015733	CGC	2	6	265269	265274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485162
5079	NC_015733	CGC	2	6	265323	265328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485162
5080	NC_015733	CGA	2	6	265335	265340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485162
5081	NC_015733	AGC	2	6	265358	265363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485162
5082	NC_015733	CCA	2	6	265395	265400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485162
5083	NC_015733	AGT	2	6	265563	265568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485163
5084	NC_015733	GCA	2	6	265572	265577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485163
5085	NC_015733	CCTTG	2	10	265587	265596	0 %	40 %	20 %	40 %	339485163
5086	NC_015733	GGT	2	6	265633	265638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485163
5087	NC_015733	GCA	3	9	265692	265700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485163
5088	NC_015733	GCCA	2	8	265763	265770	25 %	0 %	25 %	50 %	339485163
5089	NC_015733	GGC	2	6	265849	265854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485163
5090	NC_015733	CGC	2	6	265989	265994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485163
5091	NC_015733	GGC	2	6	266002	266007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485163
5092	NC_015733	CAG	2	6	266080	266085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485163
5093	NC_015733	GCG	2	6	266237	266242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485163
5094	NC_015733	CGC	2	6	266280	266285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485163
5095	NC_015733	CGG	2	6	266292	266297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485163
5096	NC_015733	GGT	2	6	266398	266403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485163
5097	NC_015733	GGTCA	2	10	266416	266425	20 %	20 %	40 %	20 %	339485163
5098	NC_015733	GCTGGC	2	12	266443	266454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485163
5099	NC_015733	GCG	2	6	266465	266470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485163
5100	NC_015733	CCTGGC	2	12	267022	267033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339485164
5101	NC_015733	CAA	2	6	267056	267061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485164
5102	NC_015733	AGAA	2	8	267156	267163	75 %	0 %	25 %	0 %	339485164
5103	NC_015733	TGG	2	6	267262	267267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485164
5104	NC_015733	CAA	2	6	267289	267294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485164
5105	NC_015733	CTT	2	6	267298	267303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485164
5106	NC_015733	TGG	2	6	267349	267354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485164
5107	NC_015733	TGC	2	6	267414	267419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485164
5108	NC_015733	ACG	2	6	267435	267440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485164
5109	NC_015733	CTG	2	6	267446	267451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485164
5110	NC_015733	CAA	2	6	267592	267597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485164
5111	NC_015733	GGT	2	6	267611	267616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485164
5112	NC_015733	TAC	3	9	267650	267658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485164
5113	NC_015733	AGC	2	6	267681	267686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485164
5114	NC_015733	GACC	2	8	267739	267746	25 %	0 %	25 %	50 %	339485164
5115	NC_015733	ACA	2	6	267804	267809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485164
5116	NC_015733	GAA	2	6	267823	267828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485164
5117	NC_015733	ACA	2	6	267843	267848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485164
5118	NC_015733	GGTC	2	8	267898	267905	0 %	25 %	50 %	25 %	339485164
5119	NC_015733	CAG	2	6	267908	267913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485164
5120	NC_015733	TGG	2	6	267925	267930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485164
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5233	NC_015733	AATG	2	8	273484	273491	50 %	25 %	25 %	0 %	339485170
5234	NC_015733	CGG	2	6	273494	273499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485170
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5237	NC_015733	CTG	4	12	273562	273573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485170
5238	NC_015733	GCA	2	6	273618	273623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485170
5239	NC_015733	AATCA	2	10	273935	273944	60 %	20 %	0 %	20 %	339485171
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5241	NC_015733	GAGCTG	2	12	274085	274096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339485171
5242	NC_015733	AGTGA	2	10	274106	274115	40 %	20 %	40 %	0 %	339485171
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5479	NC_015733	CTG	2	6	284866	284871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485182
5480	NC_015733	CCTGAC	2	12	285015	285026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339485182
5481	NC_015733	ACT	2	6	285104	285109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485182
5482	NC_015733	GGC	2	6	285157	285162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485182
5483	NC_015733	CTG	3	9	285175	285183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485182
5484	NC_015733	CG	3	6	285194	285199	0 %	0 %	50 %	50 %	339485182
5485	NC_015733	GAA	2	6	285226	285231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485182
5486	NC_015733	GCA	2	6	285237	285242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485182
5487	NC_015733	TGT	2	6	285243	285248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485182
5488	NC_015733	CCA	2	6	285257	285262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485182
5489	NC_015733	GCT	2	6	285371	285376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485182
5490	NC_015733	TGG	2	6	285434	285439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485182
5491	NC_015733	GGC	2	6	285448	285453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485182
5492	NC_015733	TTC	2	6	285493	285498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485182
5493	NC_015733	TGG	2	6	285528	285533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485182
5494	NC_015733	AAG	2	6	285802	285807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485183
5495	NC_015733	TCG	2	6	285901	285906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485183
5496	NC_015733	CAA	2	6	286004	286009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485183
5497	NC_015733	GCC	2	6	286050	286055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485183
5498	NC_015733	ACC	2	6	286080	286085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485183
5499	NC_015733	TCA	2	6	286123	286128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485183
5500	NC_015733	ATC	2	6	286236	286241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485183

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