MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015733	CGC	2	6	237387	237392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485142
4502	NC_015733	ATC	2	6	237394	237399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485142
4503	NC_015733	AAGGCG	2	12	237413	237424	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339485142
4504	NC_015733	GC	3	6	237462	237467	0 %	0 %	50 %	50 %	339485142
4505	NC_015733	CTG	2	6	237490	237495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4506	NC_015733	CGA	2	6	237501	237506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4507	NC_015733	CTT	2	6	237537	237542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485142
4508	NC_015733	CCTGA	2	10	237568	237577	20 %	20 %	20 %	40 %	339485142
4509	NC_015733	GGC	2	6	237601	237606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485142
4510	NC_015733	GT	3	6	237620	237625	0 %	50 %	50 %	0 %	339485142
4511	NC_015733	GGC	2	6	237661	237666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485142
4512	NC_015733	GAA	3	9	237733	237741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485142
4513	NC_015733	CTG	2	6	237745	237750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4514	NC_015733	GCA	2	6	237755	237760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4515	NC_015733	AGA	2	6	237803	237808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485142
4516	NC_015733	ATC	2	6	237817	237822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485142
4517	NC_015733	GAT	2	6	237846	237851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485142
4518	NC_015733	GCT	3	9	237892	237900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4519	NC_015733	CTG	2	6	237943	237948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4520	NC_015733	CCG	2	6	237995	238000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485142
4521	NC_015733	CTG	2	6	238009	238014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485142
4522	NC_015733	CAT	2	6	238029	238034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485142
4523	NC_015733	GGA	2	6	238138	238143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485143
4524	NC_015733	GAA	2	6	238162	238167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485143
4525	NC_015733	GTC	2	6	238180	238185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4526	NC_015733	TCG	2	6	238208	238213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4527	NC_015733	ACCA	2	8	238315	238322	50 %	0 %	0 %	50 %	339485143
4528	NC_015733	GCG	2	6	238398	238403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485143
4529	NC_015733	GGCA	2	8	238432	238439	25 %	0 %	50 %	25 %	339485143
4530	NC_015733	ACC	2	6	238448	238453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485143
4531	NC_015733	TGT	2	6	238479	238484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485143
4532	NC_015733	CCG	2	6	238485	238490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485143
4533	NC_015733	ACG	2	6	238520	238525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4534	NC_015733	CTT	2	6	238576	238581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485143
4535	NC_015733	TTG	2	6	238652	238657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485143
4536	NC_015733	CGA	2	6	238695	238700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4537	NC_015733	CGC	2	6	238734	238739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485143
4538	NC_015733	GTC	2	6	238804	238809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4539	NC_015733	TATAGG	2	12	238818	238829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485143
4540	NC_015733	CTC	2	6	238837	238842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485143
4541	NC_015733	GCGA	2	8	238900	238907	25 %	0 %	50 %	25 %	339485143
4542	NC_015733	CAG	2	6	238921	238926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4543	NC_015733	CT	3	6	238963	238968	0 %	50 %	0 %	50 %	339485143
4544	NC_015733	CAG	2	6	239031	239036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4545	NC_015733	CGG	2	6	239052	239057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485143
4546	NC_015733	GTTTCG	2	12	239060	239071	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339485143
4547	NC_015733	GTG	2	6	239093	239098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485143
4548	NC_015733	C	6	6	239134	239139	0 %	0 %	0 %	100 %	339485143
4549	NC_015733	CAC	2	6	239176	239181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485143
4550	NC_015733	TGGC	2	8	239182	239189	0 %	25 %	50 %	25 %	339485143
4551	NC_015733	GAA	2	6	239194	239199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485143
4552	NC_015733	GAT	2	6	239221	239226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485143
4553	NC_015733	GTC	2	6	239272	239277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4554	NC_015733	CCGG	2	8	239333	239340	0 %	0 %	50 %	50 %	339485143
4555	NC_015733	GCT	2	6	239384	239389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4556	NC_015733	CAG	2	6	239533	239538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4557	NC_015733	GCA	2	6	239649	239654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4558	NC_015733	CCG	2	6	239657	239662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485143
4559	NC_015733	ACA	2	6	239721	239726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485143
4560	NC_015733	TGA	2	6	239757	239762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485143
4561	NC_015733	GCA	2	6	239819	239824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4562	NC_015733	CGGCC	2	10	239895	239904	0 %	0 %	40 %	60 %	339485143
4563	NC_015733	CGA	2	6	239925	239930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4564	NC_015733	GTT	2	6	239934	239939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485143
4565	NC_015733	GTC	2	6	239971	239976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4566	NC_015733	GCC	2	6	240013	240018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485143
4567	NC_015733	CAG	2	6	240046	240051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4568	NC_015733	CTGCGG	2	12	240065	240076	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485143
4569	NC_015733	GTA	2	6	240082	240087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485143
4570	NC_015733	GCC	2	6	240155	240160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485143
4571	NC_015733	AGC	2	6	240173	240178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4572	NC_015733	AGC	2	6	240216	240221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4573	NC_015733	CTT	2	6	240231	240236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485143
4574	NC_015733	GCG	2	6	240246	240251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485143
4575	NC_015733	AAC	2	6	240281	240286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485143
4576	NC_015733	TCG	2	6	240302	240307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4577	NC_015733	CAC	2	6	240331	240336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485143
4578	NC_015733	GTG	2	6	240374	240379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485143
4579	NC_015733	GCC	2	6	240458	240463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485143
4580	NC_015733	TGC	2	6	240464	240469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4581	NC_015733	CAG	2	6	240535	240540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4582	NC_015733	GCG	2	6	240609	240614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485143
4583	NC_015733	CGG	2	6	240666	240671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485143
4584	NC_015733	GTC	2	6	240694	240699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4585	NC_015733	TGA	2	6	240750	240755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485143
4586	NC_015733	GT	3	6	240857	240862	0 %	50 %	50 %	0 %	339485143
4587	NC_015733	TCC	2	6	240902	240907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485143
4588	NC_015733	GCCA	2	8	240947	240954	25 %	0 %	25 %	50 %	339485143
4589	NC_015733	CTG	2	6	241087	241092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4590	NC_015733	GCT	2	6	241152	241157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4591	NC_015733	GTTC	2	8	241161	241168	0 %	50 %	25 %	25 %	339485143
4592	NC_015733	GCT	2	6	241218	241223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4593	NC_015733	CAG	2	6	241240	241245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4594	NC_015733	TCT	2	6	241257	241262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485143
4595	NC_015733	ACT	2	6	241280	241285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485143
4596	NC_015733	CGTT	2	8	241301	241308	0 %	50 %	25 %	25 %	339485143
4597	NC_015733	T	6	6	241327	241332	0 %	100 %	0 %	0 %	339485143
4598	NC_015733	GCA	2	6	241345	241350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4599	NC_015733	AGC	2	6	241352	241357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4600	NC_015733	CAG	2	6	241396	241401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4601	NC_015733	GC	4	8	241531	241538	0 %	0 %	50 %	50 %	339485143
4602	NC_015733	CTA	2	6	241656	241661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485143
4603	NC_015733	CGT	2	6	241770	241775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4604	NC_015733	CTG	2	6	241867	241872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4605	NC_015733	TGC	2	6	241908	241913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4606	NC_015733	GCT	2	6	241939	241944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4607	NC_015733	GCT	2	6	242101	242106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4608	NC_015733	AGGC	2	8	242125	242132	25 %	0 %	50 %	25 %	339485143
4609	NC_015733	TCG	2	6	242165	242170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4610	NC_015733	GC	3	6	242219	242224	0 %	0 %	50 %	50 %	339485143
4611	NC_015733	GTT	2	6	242283	242288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485143
4612	NC_015733	GCCA	2	8	242444	242451	25 %	0 %	25 %	50 %	339485143
4613	NC_015733	CAG	2	6	242452	242457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4614	NC_015733	TGC	2	6	242515	242520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485143
4615	NC_015733	CGAG	2	8	242562	242569	25 %	0 %	50 %	25 %	339485143
4616	NC_015733	GCAG	2	8	242574	242581	25 %	0 %	50 %	25 %	339485143
4617	NC_015733	GGC	2	6	242670	242675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485143
4618	NC_015733	CGAC	2	8	242694	242701	25 %	0 %	25 %	50 %	339485143
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4620	NC_015733	TGC	2	6	243213	243218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485144
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4979	NC_015733	TG	3	6	260502	260507	0 %	50 %	50 %	0 %	339485158
4980	NC_015733	GCCG	2	8	260523	260530	0 %	0 %	50 %	50 %	339485158
4981	NC_015733	CCCTT	2	10	260878	260887	0 %	40 %	0 %	60 %	339485159
4982	NC_015733	C	6	6	260911	260916	0 %	0 %	0 %	100 %	339485159
4983	NC_015733	AGC	2	6	260980	260985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485159
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4986	NC_015733	TAC	2	6	261038	261043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485159
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