MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Parachlamydia acanthamoebae UV-7 chromosome

Total Repeats: 57811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015702	TGCA	2	8	181	188	25 %	25 %	25 %	25 %	338173995
2	NC_015702	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	338173995
3	NC_015702	TG	4	8	316	323	0 %	50 %	50 %	0 %	338173995
4	NC_015702	ACAA	2	8	440	447	75 %	0 %	0 %	25 %	338173995
5	NC_015702	A	7	7	508	514	100 %	0 %	0 %	0 %	338173995
6	NC_015702	ATTGG	2	10	524	533	20 %	40 %	40 %	0 %	338173995
7	NC_015702	GAA	2	6	554	559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338173995
8	NC_015702	A	6	6	558	563	100 %	0 %	0 %	0 %	338173995
9	NC_015702	CA	3	6	688	693	50 %	0 %	0 %	50 %	338173995
10	NC_015702	CAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338173995
11	NC_015702	T	6	6	793	798	0 %	100 %	0 %	0 %	338173995
12	NC_015702	A	7	7	819	825	100 %	0 %	0 %	0 %	338173995
13	NC_015702	GCC	2	6	903	908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338173996
14	NC_015702	GC	3	6	1010	1015	0 %	0 %	50 %	50 %	338173996
15	NC_015702	TGC	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338173996
16	NC_015702	CAAA	2	8	1033	1040	75 %	0 %	0 %	25 %	338173996
17	NC_015702	ATA	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338173996
18	NC_015702	AAT	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338173996
19	NC_015702	T	7	7	1221	1227	0 %	100 %	0 %	0 %	338173996
20	NC_015702	TCGA	2	8	1288	1295	25 %	25 %	25 %	25 %	338173996
21	NC_015702	TAA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338173996
22	NC_015702	CTT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338173998
23	NC_015702	TTC	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338173998
24	NC_015702	AC	3	6	2285	2290	50 %	0 %	0 %	50 %	338173998
25	NC_015702	A	6	6	2357	2362	100 %	0 %	0 %	0 %	338173998
26	NC_015702	AGG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338173998
27	NC_015702	TC	3	6	2390	2395	0 %	50 %	0 %	50 %	338173998
28	NC_015702	CTG	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338173998
29	NC_015702	GTTGT	2	10	2495	2504	0 %	60 %	40 %	0 %	338173998
30	NC_015702	TGT	2	6	2532	2537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338173998
31	NC_015702	ATC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338173998
32	NC_015702	GCA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338173998
33	NC_015702	TTG	2	6	2714	2719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338173998
34	NC_015702	TGT	2	6	2796	2801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338173998
35	NC_015702	A	7	7	3009	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	338173999
36	NC_015702	ATG	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338173999
37	NC_015702	ATG	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338173999
38	NC_015702	CT	4	8	3312	3319	0 %	50 %	0 %	50 %	338173999
39	NC_015702	ACG	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338173999
40	NC_015702	A	7	7	3413	3419	100 %	0 %	0 %	0 %	338173999
41	NC_015702	AAG	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338173999
42	NC_015702	A	6	6	3647	3652	100 %	0 %	0 %	0 %	338173999
43	NC_015702	CGTG	2	8	3685	3692	0 %	25 %	50 %	25 %	338173999
44	NC_015702	A	7	7	3693	3699	100 %	0 %	0 %	0 %	338173999
45	NC_015702	A	6	6	3728	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	338173999
46	NC_015702	CTT	2	6	3780	3785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338173999
47	NC_015702	GAA	3	9	3797	3805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338173999
48	NC_015702	GTT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338173999
49	NC_015702	AAT	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338173999
50	NC_015702	TTATC	2	10	4109	4118	20 %	60 %	0 %	20 %	338174000
51	NC_015702	T	6	6	4304	4309	0 %	100 %	0 %	0 %	338174000
52	NC_015702	ACCT	2	8	4335	4342	25 %	25 %	0 %	50 %	338174000
53	NC_015702	ATG	3	9	4353	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174000
54	NC_015702	AGA	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174000
55	NC_015702	TTA	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338174000
56	NC_015702	AGC	3	9	4479	4487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174000
57	NC_015702	ATC	2	6	4512	4517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174000
58	NC_015702	CT	3	6	4607	4612	0 %	50 %	0 %	50 %	338174000
59	NC_015702	A	7	7	4640	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	338174000
60	NC_015702	GGT	2	6	4680	4685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338174000
61	NC_015702	TGG	3	9	4690	4698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338174000
62	NC_015702	A	6	6	4724	4729	100 %	0 %	0 %	0 %	338174000
63	NC_015702	TGA	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174000
64	NC_015702	GCA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174000
65	NC_015702	GGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338174000
66	NC_015702	TTTCT	2	10	4872	4881	0 %	80 %	0 %	20 %	338174000
67	NC_015702	CAA	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338174001
68	NC_015702	GCA	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174001
69	NC_015702	TGT	2	6	5041	5046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174001
70	NC_015702	GCT	2	6	5079	5084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174001
71	NC_015702	T	6	6	5182	5187	0 %	100 %	0 %	0 %	338174001
72	NC_015702	ACGC	2	8	5403	5410	25 %	0 %	25 %	50 %	338174001
73	NC_015702	GTT	2	6	5417	5422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174001
74	NC_015702	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	338174001
75	NC_015702	CAT	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174001
76	NC_015702	CTT	2	6	5673	5678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174001
77	NC_015702	CAC	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338174001
78	NC_015702	GCA	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174001
79	NC_015702	AGGA	2	8	5739	5746	50 %	0 %	50 %	0 %	338174001
80	NC_015702	GCA	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174001
81	NC_015702	AAT	2	6	5860	5865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338174001
82	NC_015702	CCG	2	6	5882	5887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338174001
83	NC_015702	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174001
84	NC_015702	T	6	6	5992	5997	0 %	100 %	0 %	0 %	338174001
85	NC_015702	TGAC	2	8	6002	6009	25 %	25 %	25 %	25 %	338174001
86	NC_015702	T	6	6	6026	6031	0 %	100 %	0 %	0 %	338174001
87	NC_015702	ACGA	2	8	6501	6508	50 %	0 %	25 %	25 %	338174002
88	NC_015702	AAG	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
89	NC_015702	TCA	2	6	6526	6531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174002
90	NC_015702	ATC	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174002
91	NC_015702	GA	3	6	6598	6603	50 %	0 %	50 %	0 %	338174002
92	NC_015702	TTC	2	6	6606	6611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174002
93	NC_015702	CTT	2	6	6635	6640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174002
94	NC_015702	CAT	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174002
95	NC_015702	ATG	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174002
96	NC_015702	T	6	6	6782	6787	0 %	100 %	0 %	0 %	338174002
97	NC_015702	AGA	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
98	NC_015702	GCT	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174002
99	NC_015702	AGC	2	6	6847	6852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174002
100	NC_015702	AGA	2	6	6887	6892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
101	NC_015702	CAA	2	6	6946	6951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338174002
102	NC_015702	TACAAA	2	12	7006	7017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338174002
103	NC_015702	TTGCT	2	10	7105	7114	0 %	60 %	20 %	20 %	338174002
104	NC_015702	GCA	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174002
105	NC_015702	T	7	7	7252	7258	0 %	100 %	0 %	0 %	338174002
106	NC_015702	GAT	2	6	7259	7264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174002
107	NC_015702	ATC	2	6	7290	7295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174002
108	NC_015702	AAG	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
109	NC_015702	TTTG	2	8	7324	7331	0 %	75 %	25 %	0 %	338174002
110	NC_015702	ATT	2	6	7346	7351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338174002
111	NC_015702	TTG	2	6	7365	7370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174002
112	NC_015702	TATC	2	8	7444	7451	25 %	50 %	0 %	25 %	338174002
113	NC_015702	AAG	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
114	NC_015702	AGA	3	9	7633	7641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
115	NC_015702	GATG	2	8	7708	7715	25 %	25 %	50 %	0 %	338174002
116	NC_015702	GAA	2	6	7737	7742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174002
117	NC_015702	A	6	6	7752	7757	100 %	0 %	0 %	0 %	338174002
118	NC_015702	GTT	2	6	7758	7763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174002
119	NC_015702	ATG	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174002
120	NC_015702	GA	3	6	7796	7801	50 %	0 %	50 %	0 %	338174002
121	NC_015702	T	7	7	7891	7897	0 %	100 %	0 %	0 %	338174002
122	NC_015702	TAAGT	2	10	7951	7960	40 %	40 %	20 %	0 %	338174003
123	NC_015702	ATG	2	6	7978	7983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174003
124	NC_015702	CTT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174003
125	NC_015702	GCC	2	6	8087	8092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338174003
126	NC_015702	CAG	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174003
127	NC_015702	ACG	2	6	8179	8184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174003
128	NC_015702	T	6	6	8313	8318	0 %	100 %	0 %	0 %	338174003
129	NC_015702	AAT	2	6	8357	8362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338174003
130	NC_015702	CCA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338174003
131	NC_015702	AGA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174003
132	NC_015702	GAA	2	6	8507	8512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174003
133	NC_015702	TTC	2	6	8530	8535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174003
134	NC_015702	T	6	6	8586	8591	0 %	100 %	0 %	0 %	338174003
135	NC_015702	T	6	6	8669	8674	0 %	100 %	0 %	0 %	338174003
136	NC_015702	TAG	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174003
137	NC_015702	TAGG	2	8	8716	8723	25 %	25 %	50 %	0 %	338174003
138	NC_015702	AGTTA	2	10	8734	8743	40 %	40 %	20 %	0 %	338174003
139	NC_015702	TTC	2	6	9342	9347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174004
140	NC_015702	GCT	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174004
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142	NC_015702	AAG	2	6	9560	9565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174004
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146	NC_015702	A	6	6	9719	9724	100 %	0 %	0 %	0 %	338174004
147	NC_015702	ATTG	2	8	9783	9790	25 %	50 %	25 %	0 %	338174004
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176	NC_015702	AATG	2	8	11636	11643	50 %	25 %	25 %	0 %	338174004
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251	NC_015702	GTGGG	2	10	16241	16250	0 %	20 %	80 %	0 %	338174008
252	NC_015702	ATA	2	6	16252	16257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338174008
253	NC_015702	GAG	2	6	16260	16265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338174008
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255	NC_015702	ATGG	2	8	16289	16296	25 %	25 %	50 %	0 %	338174008
256	NC_015702	T	7	7	16298	16304	0 %	100 %	0 %	0 %	338174008
257	NC_015702	AGCT	2	8	16323	16330	25 %	25 %	25 %	25 %	338174008
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259	NC_015702	CTT	2	6	16365	16370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174008
260	NC_015702	G	6	6	16383	16388	0 %	0 %	100 %	0 %	338174008
261	NC_015702	GCA	2	6	16402	16407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338174008
262	NC_015702	TGAAG	2	10	16413	16422	40 %	20 %	40 %	0 %	338174008
263	NC_015702	CT	3	6	16429	16434	0 %	50 %	0 %	50 %	338174008
264	NC_015702	AAC	2	6	16453	16458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338174008
265	NC_015702	TTTG	2	8	16477	16484	0 %	75 %	25 %	0 %	338174008
266	NC_015702	GTC	2	6	16558	16563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174008
267	NC_015702	CAC	2	6	16591	16596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338174008
268	NC_015702	GC	3	6	16643	16648	0 %	0 %	50 %	50 %	338174008
269	NC_015702	CAT	2	6	16650	16655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174008
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271	NC_015702	CTA	2	6	16749	16754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174008
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273	NC_015702	TGC	2	6	16818	16823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174008
274	NC_015702	CTC	2	6	16869	16874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338174008
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280	NC_015702	TCA	2	6	17117	17122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338174008
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300	NC_015702	GTT	2	6	18078	18083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338174009
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355	NC_015702	CTG	2	6	21066	21071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338174012
356	NC_015702	AGG	2	6	21136	21141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338174012
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377	NC_015702	AGAT	2	8	22587	22594	50 %	25 %	25 %	0 %	338174013
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381	NC_015702	AAG	2	6	22836	22841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174013
382	NC_015702	TCC	2	6	22849	22854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338174013
383	NC_015702	TCT	2	6	23024	23029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338174013
384	NC_015702	AAG	2	6	23030	23035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338174013
385	NC_015702	CG	3	6	23063	23068	0 %	0 %	50 %	50 %	338174013
386	NC_015702	GTTT	2	8	23143	23150	0 %	75 %	25 %	0 %	338174013
387	NC_015702	AAAAT	2	10	23218	23227	80 %	20 %	0 %	0 %	338174013
388	NC_015702	TATT	2	8	23250	23257	25 %	75 %	0 %	0 %	338174013
389	NC_015702	TGA	2	6	23262	23267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174013
390	NC_015702	CAC	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338174013
391	NC_015702	ATT	3	9	23345	23353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338174013
392	NC_015702	TGA	2	6	23354	23359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338174013
393	NC_015702	AAAGA	2	10	23375	23384	80 %	0 %	20 %	0 %	338174013
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395	NC_015702	CCAA	2	8	23435	23442	50 %	0 %	0 %	50 %	338174013
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