MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015680	CCA	2	6	227097	227102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283773
4002	NC_015680	TCC	2	6	227171	227176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4003	NC_015680	CTC	2	6	227218	227223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4004	NC_015680	CT	3	6	227264	227269	0 %	50 %	0 %	50 %	337283773
4005	NC_015680	CCT	2	6	227295	227300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4006	NC_015680	CTC	2	6	227318	227323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4007	NC_015680	TCG	2	6	227378	227383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283773
4008	NC_015680	GAG	2	6	227530	227535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283773
4009	NC_015680	AGT	2	6	227541	227546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283773
4010	NC_015680	GAA	2	6	227581	227586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283773
4011	NC_015680	CTCC	2	8	227604	227611	0 %	25 %	0 %	75 %	337283773
4012	NC_015680	ACC	2	6	227672	227677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283773
4013	NC_015680	TCCT	2	8	227732	227739	0 %	50 %	0 %	50 %	337283773
4014	NC_015680	TCC	2	6	227772	227777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4015	NC_015680	CTC	2	6	227791	227796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4016	NC_015680	TTC	2	6	227930	227935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283773
4017	NC_015680	CTC	2	6	227971	227976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
4018	NC_015680	CTT	2	6	228346	228351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283774
4019	NC_015680	GTG	2	6	228435	228440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283774
4020	NC_015680	GC	3	6	228503	228508	0 %	0 %	50 %	50 %	337283774
4021	NC_015680	ATC	2	6	228569	228574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283774
4022	NC_015680	CTC	2	6	228610	228615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283774
4023	NC_015680	AATG	2	8	228640	228647	50 %	25 %	25 %	0 %	337283774
4024	NC_015680	GAG	2	6	228670	228675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283774
4025	NC_015680	TAT	2	6	228688	228693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283774
4026	NC_015680	GCC	2	6	228710	228715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283774
4027	NC_015680	CAG	2	6	228745	228750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283774
4028	NC_015680	CCCT	2	8	228783	228790	0 %	25 %	0 %	75 %	337283774
4029	NC_015680	GAG	2	6	228838	228843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283774
4030	NC_015680	CTC	2	6	228937	228942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283774
4031	NC_015680	GAG	2	6	228943	228948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283774
4032	NC_015680	GAA	2	6	228964	228969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283774
4033	NC_015680	TCT	2	6	228971	228976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283774
4034	NC_015680	GCC	2	6	229025	229030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283774
4035	NC_015680	AGA	2	6	229164	229169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283774
4036	NC_015680	CT	3	6	229194	229199	0 %	50 %	0 %	50 %	337283774
4037	NC_015680	CGC	2	6	229216	229221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283774
4038	NC_015680	TGG	2	6	229377	229382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283774
4039	NC_015680	GCG	2	6	229505	229510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283774
4040	NC_015680	GCC	2	6	229511	229516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283774
4041	NC_015680	TCA	2	6	229841	229846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283775
4042	NC_015680	AGG	2	6	229912	229917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283775
4043	NC_015680	CTGC	2	8	230001	230008	0 %	25 %	25 %	50 %	337283775
4044	NC_015680	TCG	2	6	230030	230035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283775
4045	NC_015680	TAT	2	6	230049	230054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283775
4046	NC_015680	GGC	2	6	230103	230108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283775
4047	NC_015680	GAC	2	6	230160	230165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283775
4048	NC_015680	GGTC	2	8	230249	230256	0 %	25 %	50 %	25 %	337283775
4049	NC_015680	CT	3	6	230315	230320	0 %	50 %	0 %	50 %	337283775
4050	NC_015680	CAC	2	6	230351	230356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283775
4051	NC_015680	CCTG	2	8	230367	230374	0 %	25 %	25 %	50 %	337283775
4052	NC_015680	ACC	2	6	230514	230519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283775
4053	NC_015680	GGC	2	6	230649	230654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283775
4054	NC_015680	TAT	2	6	230748	230753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283775
4055	NC_015680	ACC	2	6	230772	230777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283775
4056	NC_015680	CGC	2	6	230808	230813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283775
4057	NC_015680	CTG	2	6	230845	230850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283775
4058	NC_015680	TCC	2	6	230901	230906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283775
4059	NC_015680	CAG	2	6	230949	230954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283775
4060	NC_015680	CGA	2	6	230981	230986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283775
4061	NC_015680	GCC	2	6	231021	231026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283775
4062	NC_015680	TTCC	2	8	231133	231140	0 %	50 %	0 %	50 %	337283775
4063	NC_015680	AGCCT	2	10	231167	231176	20 %	20 %	20 %	40 %	337283775
4064	NC_015680	ACC	2	6	231189	231194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283775
4065	NC_015680	TAT	2	6	231237	231242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283775
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4067	NC_015680	AAGGC	2	10	231461	231470	40 %	0 %	40 %	20 %	337283776
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4069	NC_015680	CTC	2	6	231497	231502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283776
4070	NC_015680	ACG	2	6	231539	231544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283776
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4072	NC_015680	TCT	2	6	231597	231602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283776
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4076	NC_015680	CTA	2	6	231868	231873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283776
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4078	NC_015680	CTGG	2	8	232075	232082	0 %	25 %	50 %	25 %	337283776
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4081	NC_015680	GA	3	6	232205	232210	50 %	0 %	50 %	0 %	337283776
4082	NC_015680	GGA	2	6	232219	232224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283776
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4087	NC_015680	GCGGG	2	10	232425	232434	0 %	0 %	80 %	20 %	337283777
4088	NC_015680	GGA	2	6	232438	232443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283777
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4091	NC_015680	GCCC	2	8	232482	232489	0 %	0 %	25 %	75 %	337283777
4092	NC_015680	AG	3	6	232575	232580	50 %	0 %	50 %	0 %	337283777
4093	NC_015680	ATG	2	6	232615	232620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283777
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4095	NC_015680	GAG	2	6	232681	232686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283777
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4100	NC_015680	TCATAG	2	12	233099	233110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337283778
4101	NC_015680	AGG	2	6	233132	233137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283778
4102	NC_015680	GGGT	2	8	233189	233196	0 %	25 %	75 %	0 %	337283778
4103	NC_015680	CAA	2	6	233201	233206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283778
4104	NC_015680	GAA	2	6	233234	233239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283778
4105	NC_015680	GGA	2	6	233253	233258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283778
4106	NC_015680	GAGG	2	8	233376	233383	25 %	0 %	75 %	0 %	337283778
4107	NC_015680	CT	3	6	233440	233445	0 %	50 %	0 %	50 %	337283778
4108	NC_015680	CGA	2	6	233487	233492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283778
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4112	NC_015680	CTTT	2	8	233688	233695	0 %	75 %	0 %	25 %	337283779
4113	NC_015680	ACTC	2	8	233738	233745	25 %	25 %	0 %	50 %	337283779
4114	NC_015680	TCT	2	6	233746	233751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283779
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4120	NC_015680	GA	3	6	234088	234093	50 %	0 %	50 %	0 %	337283779
4121	NC_015680	GAG	2	6	234114	234119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283779
4122	NC_015680	GCC	2	6	234378	234383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283779
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4239	NC_015680	CT	3	6	240520	240525	0 %	50 %	0 %	50 %	337283787
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4241	NC_015680	GAA	2	6	240620	240625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283787
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4243	NC_015680	GAC	2	6	240742	240747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283787
4244	NC_015680	GGT	2	6	240856	240861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283787
4245	NC_015680	AGGA	2	8	240873	240880	50 %	0 %	50 %	0 %	337283787
4246	NC_015680	GAA	2	6	240926	240931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283788
4247	NC_015680	AG	3	6	240940	240945	50 %	0 %	50 %	0 %	337283788
4248	NC_015680	AG	4	8	240967	240974	50 %	0 %	50 %	0 %	337283788
4249	NC_015680	GGA	2	6	241037	241042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283788
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4272	NC_015680	CGA	3	9	241867	241875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283790
4273	NC_015680	CCT	2	6	241889	241894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283790
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4352	NC_015680	CCCCG	2	10	245733	245742	0 %	0 %	20 %	80 %	337283795
4353	NC_015680	CTC	2	6	245778	245783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283795
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4357	NC_015680	TC	3	6	245955	245960	0 %	50 %	0 %	50 %	337283795
4358	NC_015680	CTC	2	6	246027	246032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283795
4359	NC_015680	ATT	2	6	246043	246048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283795
4360	NC_015680	T	6	6	246047	246052	0 %	100 %	0 %	0 %	337283795
4361	NC_015680	TTACCA	2	12	246098	246109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283795
4362	NC_015680	CTCC	2	8	246110	246117	0 %	25 %	0 %	75 %	337283796
4363	NC_015680	CTCC	2	8	246232	246239	0 %	25 %	0 %	75 %	337283796
4364	NC_015680	TCCT	2	8	246264	246271	0 %	50 %	0 %	50 %	337283796
4365	NC_015680	CTT	2	6	246314	246319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283796
4366	NC_015680	CGAGC	2	10	246443	246452	20 %	0 %	40 %	40 %	337283796
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4465	NC_015680	ACG	4	12	252157	252168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283803
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4469	NC_015680	TTC	2	6	252319	252324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283803
4470	NC_015680	CT	3	6	252341	252346	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
4471	NC_015680	CGA	2	6	252347	252352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283803
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4473	NC_015680	TC	3	6	252377	252382	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
4474	NC_015680	CT	3	6	252404	252409	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
4475	NC_015680	TCC	2	6	252431	252436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283803
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4477	NC_015680	AGT	2	6	252482	252487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283803
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4479	NC_015680	GAA	2	6	252600	252605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283803
4480	NC_015680	TCC	2	6	252619	252624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283803
4481	NC_015680	ATC	3	9	252736	252744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283803
4482	NC_015680	TC	3	6	252780	252785	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
4483	NC_015680	TCT	2	6	252941	252946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283803
4484	NC_015680	ATG	2	6	253060	253065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283803
4485	NC_015680	GTC	2	6	253083	253088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283803
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4487	NC_015680	TCT	2	6	253192	253197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283804
4488	NC_015680	AGGGCG	2	12	253259	253270	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	337283804
4489	NC_015680	CT	3	6	253322	253327	0 %	50 %	0 %	50 %	337283804
4490	NC_015680	TCG	2	6	253328	253333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283804
4491	NC_015680	CAT	2	6	253416	253421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283804
4492	NC_015680	CT	3	6	253436	253441	0 %	50 %	0 %	50 %	337283804
4493	NC_015680	TAT	2	6	253444	253449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283804
4494	NC_015680	CGG	2	6	253486	253491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283804
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4496	NC_015680	G	6	6	253709	253714	0 %	0 %	100 %	0 %	337283805
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4499	NC_015680	TTC	3	9	253838	253846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283805
4500	NC_015680	TC	3	6	253857	253862	0 %	50 %	0 %	50 %	337283805

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