MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015680	TCG	2	6	197322	197327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283742
3502	NC_015680	AT	3	6	197467	197472	50 %	50 %	0 %	0 %	337283742
3503	NC_015680	TCCTG	2	10	197497	197506	0 %	40 %	20 %	40 %	337283742
3504	NC_015680	CCT	2	6	197542	197547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283742
3505	NC_015680	GAG	2	6	197552	197557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283742
3506	NC_015680	TCC	2	6	197565	197570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283742
3507	NC_015680	GTA	2	6	197585	197590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283742
3508	NC_015680	TCG	2	6	197775	197780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283742
3509	NC_015680	TCCA	2	8	197882	197889	25 %	25 %	0 %	50 %	337283742
3510	NC_015680	GT	3	6	197947	197952	0 %	50 %	50 %	0 %	337283742
3511	NC_015680	CCT	2	6	197963	197968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283742
3512	NC_015680	CTC	2	6	198164	198169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283742
3513	NC_015680	TC	3	6	198173	198178	0 %	50 %	0 %	50 %	337283742
3514	NC_015680	TCA	2	6	198470	198475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283743
3515	NC_015680	C	6	6	198513	198518	0 %	0 %	0 %	100 %	337283743
3516	NC_015680	TAA	2	6	198557	198562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283743
3517	NC_015680	GTC	2	6	198598	198603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283743
3518	NC_015680	GCG	2	6	198671	198676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283743
3519	NC_015680	CTC	2	6	198721	198726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283743
3520	NC_015680	CCG	2	6	198728	198733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283743
3521	NC_015680	GGA	2	6	198777	198782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283743
3522	NC_015680	GA	3	6	198815	198820	50 %	0 %	50 %	0 %	337283743
3523	NC_015680	GCC	2	6	198831	198836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283743
3524	NC_015680	AGG	2	6	198856	198861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283743
3525	NC_015680	TC	3	6	198958	198963	0 %	50 %	0 %	50 %	337283743
3526	NC_015680	AAG	2	6	199014	199019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283743
3527	NC_015680	AAG	2	6	199023	199028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283743
3528	NC_015680	AGG	2	6	199040	199045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283743
3529	NC_015680	ACT	2	6	199079	199084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283743
3530	NC_015680	AGA	2	6	199098	199103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283743
3531	NC_015680	AGA	2	6	199110	199115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283743
3532	NC_015680	CGG	2	6	199187	199192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283743
3533	NC_015680	G	6	6	199262	199267	0 %	0 %	100 %	0 %	337283743
3534	NC_015680	TCG	2	6	199301	199306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283743
3535	NC_015680	AGA	2	6	199346	199351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283743
3536	NC_015680	AAG	2	6	199620	199625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283744
3537	NC_015680	TGT	2	6	199631	199636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283744
3538	NC_015680	CTTG	2	8	199640	199647	0 %	50 %	25 %	25 %	337283744
3539	NC_015680	ATG	2	6	199650	199655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283744
3540	NC_015680	AGG	2	6	199725	199730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283744
3541	NC_015680	CCTGTC	2	12	199825	199836	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	337283744
3542	NC_015680	ACA	2	6	199900	199905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283744
3543	NC_015680	GAG	2	6	200000	200005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283744
3544	NC_015680	ATG	2	6	200098	200103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283744
3545	NC_015680	TTG	2	6	200119	200124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283744
3546	NC_015680	TAC	2	6	200166	200171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283744
3547	NC_015680	CAG	2	6	200298	200303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283744
3548	NC_015680	CAG	2	6	200320	200325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283744
3549	NC_015680	TGG	2	6	200382	200387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283744
3550	NC_015680	CCT	2	6	200398	200403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283744
3551	NC_015680	AAT	2	6	200414	200419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283744
3552	NC_015680	ACA	2	6	200553	200558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283744
3553	NC_015680	CTT	2	6	201305	201310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283745
3554	NC_015680	ACT	3	9	201361	201369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283745
3555	NC_015680	TCT	2	6	201457	201462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283745
3556	NC_015680	GGA	2	6	201526	201531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283745
3557	NC_015680	AGG	2	6	201615	201620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283745
3558	NC_015680	ATA	2	6	201726	201731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283745
3559	NC_015680	GGC	2	6	201807	201812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283745
3560	NC_015680	TTA	2	6	201853	201858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283745
3561	NC_015680	GGA	2	6	201869	201874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283745
3562	NC_015680	CGTG	2	8	202057	202064	0 %	25 %	50 %	25 %	337283746
3563	NC_015680	AGC	2	6	202092	202097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283746
3564	NC_015680	CCA	2	6	202143	202148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283746
3565	NC_015680	CGA	2	6	202201	202206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283746
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3568	NC_015680	GCCT	2	8	202404	202411	0 %	25 %	25 %	50 %	337283746
3569	NC_015680	GAA	3	9	202471	202479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283746
3570	NC_015680	A	6	6	202517	202522	100 %	0 %	0 %	0 %	337283747
3571	NC_015680	CAAGAA	2	12	202598	202609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	337283747
3572	NC_015680	GGC	2	6	202670	202675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283747
3573	NC_015680	GCA	2	6	202703	202708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283747
3574	NC_015680	AAG	2	6	202824	202829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283747
3575	NC_015680	AGGC	2	8	202848	202855	25 %	0 %	50 %	25 %	337283747
3576	NC_015680	AGG	2	6	202930	202935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283747
3577	NC_015680	CAAGC	2	10	203010	203019	40 %	0 %	20 %	40 %	337283747
3578	NC_015680	GTG	2	6	203029	203034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283747
3579	NC_015680	GAG	2	6	203045	203050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283748
3580	NC_015680	AGA	2	6	203064	203069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283748
3581	NC_015680	CTC	2	6	203098	203103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283748
3582	NC_015680	ACA	3	9	203106	203114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283748
3583	NC_015680	CAT	2	6	203116	203121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283748
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3585	NC_015680	GTC	2	6	203177	203182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283748
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3587	NC_015680	AGG	2	6	203244	203249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283748
3588	NC_015680	TGG	2	6	203296	203301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283748
3589	NC_015680	GGC	2	6	203335	203340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283748
3590	NC_015680	GGC	2	6	203426	203431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283748
3591	NC_015680	TAGCA	2	10	203546	203555	40 %	20 %	20 %	20 %	337283749
3592	NC_015680	TGA	2	6	203609	203614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283749
3593	NC_015680	CGA	2	6	203648	203653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283749
3594	NC_015680	CAC	2	6	203687	203692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283749
3595	NC_015680	TC	3	6	203718	203723	0 %	50 %	0 %	50 %	337283749
3596	NC_015680	GAC	2	6	203802	203807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283749
3597	NC_015680	CTA	2	6	203936	203941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283749
3598	NC_015680	GA	3	6	204083	204088	50 %	0 %	50 %	0 %	337283749
3599	NC_015680	GAG	2	6	204120	204125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283749
3600	NC_015680	GTC	2	6	204186	204191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283749
3601	NC_015680	GGACC	2	10	204430	204439	20 %	0 %	40 %	40 %	337283750
3602	NC_015680	AGG	2	6	204456	204461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283750
3603	NC_015680	GAA	2	6	204479	204484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283750
3604	NC_015680	AAG	2	6	204542	204547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283750
3605	NC_015680	GTT	2	6	204609	204614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283750
3606	NC_015680	TTG	2	6	204658	204663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283750
3607	NC_015680	GAG	2	6	204732	204737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283750
3608	NC_015680	ATT	2	6	204798	204803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283751
3609	NC_015680	GAG	2	6	204867	204872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283751
3610	NC_015680	GTC	2	6	204873	204878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283751
3611	NC_015680	GAG	2	6	204974	204979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283751
3612	NC_015680	AGG	2	6	205017	205022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283751
3613	NC_015680	GAAG	2	8	205060	205067	50 %	0 %	50 %	0 %	337283751
3614	NC_015680	TGG	2	6	205205	205210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283751
3615	NC_015680	TTA	2	6	205284	205289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283752
3616	NC_015680	AAGGG	2	10	205298	205307	40 %	0 %	60 %	0 %	337283752
3617	NC_015680	CTGG	2	8	205382	205389	0 %	25 %	50 %	25 %	337283752
3618	NC_015680	AGG	2	6	205392	205397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283752
3619	NC_015680	GGC	2	6	205436	205441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283752
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3621	NC_015680	CATAGC	2	12	205468	205479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337283752
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3989	NC_015680	TCT	2	6	226560	226565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283773
3990	NC_015680	CTT	2	6	226576	226581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283773
3991	NC_015680	CTT	2	6	226590	226595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283773
3992	NC_015680	AGG	2	6	226644	226649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283773
3993	NC_015680	CTC	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283773
3994	NC_015680	TCG	2	6	226746	226751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283773
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3996	NC_015680	CTT	2	6	226807	226812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283773
3997	NC_015680	TAT	2	6	226831	226836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283773
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3999	NC_015680	GAG	2	6	227011	227016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283773
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