MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015680	GCC	2	6	171023	171028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283710
3002	NC_015680	CT	3	6	171125	171130	0 %	50 %	0 %	50 %	337283710
3003	NC_015680	CTTC	2	8	171151	171158	0 %	50 %	0 %	50 %	337283710
3004	NC_015680	TGG	2	6	171159	171164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283710
3005	NC_015680	CGA	2	6	171300	171305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283710
3006	NC_015680	GAG	2	6	171313	171318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283710
3007	NC_015680	GAG	2	6	171321	171326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283710
3008	NC_015680	CCT	2	6	171339	171344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283710
3009	NC_015680	GAA	2	6	171436	171441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283710
3010	NC_015680	TCG	2	6	171443	171448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283710
3011	NC_015680	GAG	2	6	171463	171468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283710
3012	NC_015680	GGA	2	6	171540	171545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283710
3013	NC_015680	AG	5	10	171559	171568	50 %	0 %	50 %	0 %	337283710
3014	NC_015680	GGA	2	6	171600	171605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283710
3015	NC_015680	AG	3	6	171624	171629	50 %	0 %	50 %	0 %	337283710
3016	NC_015680	GAG	2	6	171788	171793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283711
3017	NC_015680	GCC	2	6	171807	171812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283711
3018	NC_015680	GGT	2	6	171838	171843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283711
3019	NC_015680	AT	3	6	171856	171861	50 %	50 %	0 %	0 %	337283711
3020	NC_015680	CCT	2	6	171875	171880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283711
3021	NC_015680	CAAC	2	8	171889	171896	50 %	0 %	0 %	50 %	337283711
3022	NC_015680	GGTG	2	8	171919	171926	0 %	25 %	75 %	0 %	337283711
3023	NC_015680	TA	3	6	171984	171989	50 %	50 %	0 %	0 %	337283712
3024	NC_015680	GGT	2	6	172030	172035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283712
3025	NC_015680	AAGG	2	8	172078	172085	50 %	0 %	50 %	0 %	337283712
3026	NC_015680	GAG	2	6	172106	172111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283712
3027	NC_015680	GAG	2	6	172139	172144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283712
3028	NC_015680	AAG	2	6	172163	172168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283712
3029	NC_015680	GAG	2	6	172324	172329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283713
3030	NC_015680	GGC	2	6	172357	172362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283713
3031	NC_015680	GGA	2	6	172414	172419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283713
3032	NC_015680	GA	4	8	172484	172491	50 %	0 %	50 %	0 %	337283713
3033	NC_015680	CTG	2	6	172499	172504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283713
3034	NC_015680	TGG	3	9	172527	172535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283713
3035	NC_015680	GAG	2	6	172610	172615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283713
3036	NC_015680	CTC	2	6	172628	172633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283713
3037	NC_015680	GAA	2	6	172644	172649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283713
3038	NC_015680	GGCCT	2	10	172688	172697	0 %	20 %	40 %	40 %	337283713
3039	NC_015680	TCC	2	6	172759	172764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283713
3040	NC_015680	CTA	2	6	172828	172833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283713
3041	NC_015680	GAG	2	6	172903	172908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283713
3042	NC_015680	TA	3	6	172925	172930	50 %	50 %	0 %	0 %	337283713
3043	NC_015680	CTC	2	6	172994	172999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283713
3044	NC_015680	GAG	2	6	173029	173034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283713
3045	NC_015680	GCG	2	6	173148	173153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283713
3046	NC_015680	ACT	2	6	173352	173357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283713
3047	NC_015680	GATGA	2	10	173411	173420	40 %	20 %	40 %	0 %	337283713
3048	NC_015680	GGC	2	6	173440	173445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283713
3049	NC_015680	GAG	2	6	173513	173518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283713
3050	NC_015680	GAC	2	6	173602	173607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283713
3051	NC_015680	ATA	2	6	173679	173684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283714
3052	NC_015680	GAG	2	6	173703	173708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283714
3053	NC_015680	AGA	2	6	173715	173720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283714
3054	NC_015680	GAG	2	6	173796	173801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283714
3055	NC_015680	CTGA	2	8	173811	173818	25 %	25 %	25 %	25 %	337283714
3056	NC_015680	GGCG	2	8	173828	173835	0 %	0 %	75 %	25 %	337283714
3057	NC_015680	GGC	2	6	173848	173853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283714
3058	NC_015680	AAGG	2	8	173921	173928	50 %	0 %	50 %	0 %	337283714
3059	NC_015680	AGA	2	6	173942	173947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283714
3060	NC_015680	CCA	2	6	174031	174036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283715
3061	NC_015680	AGAGA	2	10	174054	174063	60 %	0 %	40 %	0 %	337283715
3062	NC_015680	GGT	2	6	174077	174082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283715
3063	NC_015680	CGA	2	6	174211	174216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283715
3064	NC_015680	AAT	2	6	174343	174348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283715
3065	NC_015680	AGA	2	6	174415	174420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283715
3066	NC_015680	CCA	2	6	174429	174434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283715
3067	NC_015680	GGA	3	9	174484	174492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283715
3068	NC_015680	GAA	2	6	174518	174523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283715
3069	NC_015680	ATC	2	6	174614	174619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283715
3070	NC_015680	CCT	2	6	174646	174651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283715
3071	NC_015680	CAT	2	6	174706	174711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283715
3072	NC_015680	CAG	2	6	174718	174723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283715
3073	NC_015680	AGG	2	6	174834	174839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283715
3074	NC_015680	GAA	2	6	174842	174847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283715
3075	NC_015680	CAA	2	6	174919	174924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283715
3076	NC_015680	AG	3	6	174952	174957	50 %	0 %	50 %	0 %	337283715
3077	NC_015680	AAAG	2	8	174961	174968	75 %	0 %	25 %	0 %	337283715
3078	NC_015680	GAG	2	6	174974	174979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283715
3079	NC_015680	GAAGA	2	10	174995	175004	60 %	0 %	40 %	0 %	337283715
3080	NC_015680	GCTC	2	8	175018	175025	0 %	25 %	25 %	50 %	337283715
3081	NC_015680	CAG	2	6	175097	175102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283715
3082	NC_015680	AG	3	6	175109	175114	50 %	0 %	50 %	0 %	337283715
3083	NC_015680	CTC	2	6	175160	175165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283715
3084	NC_015680	AGA	2	6	175222	175227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283715
3085	NC_015680	AGT	2	6	175246	175251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283715
3086	NC_015680	ATA	2	6	175262	175267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283715
3087	NC_015680	AAGG	2	8	175324	175331	50 %	0 %	50 %	0 %	337283715
3088	NC_015680	GAG	2	6	175342	175347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283715
3089	NC_015680	AAT	2	6	175380	175385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283715
3090	NC_015680	GGT	2	6	175483	175488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283716
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3092	NC_015680	CTT	2	6	175542	175547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283716
3093	NC_015680	AGA	2	6	175634	175639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283716
3094	NC_015680	GAG	2	6	175663	175668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283716
3095	NC_015680	ATT	2	6	175685	175690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283716
3096	NC_015680	A	6	6	175731	175736	100 %	0 %	0 %	0 %	337283716
3097	NC_015680	AAG	2	6	175828	175833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283716
3098	NC_015680	GAA	2	6	176022	176027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283716
3099	NC_015680	GCCT	2	8	176072	176079	0 %	25 %	25 %	50 %	337283716
3100	NC_015680	CT	3	6	176078	176083	0 %	50 %	0 %	50 %	337283716
3101	NC_015680	CGA	2	6	176097	176102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283716
3102	NC_015680	ACG	2	6	176111	176116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283716
3103	NC_015680	GGA	2	6	176148	176153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283716
3104	NC_015680	AAGCTT	2	12	176167	176178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337283716
3105	NC_015680	GAA	2	6	176240	176245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283716
3106	NC_015680	ATT	2	6	176269	176274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283716
3107	NC_015680	TCT	2	6	176339	176344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283716
3108	NC_015680	AGG	2	6	176360	176365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283716
3109	NC_015680	AG	3	6	176377	176382	50 %	0 %	50 %	0 %	337283716
3110	NC_015680	AAT	2	6	176385	176390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283716
3111	NC_015680	TA	3	6	176404	176409	50 %	50 %	0 %	0 %	337283716
3112	NC_015680	CGT	3	9	176418	176426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283716
3113	NC_015680	ATA	2	6	176458	176463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283716
3114	NC_015680	CAG	2	6	176472	176477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283716
3115	NC_015680	CTGA	2	8	176540	176547	25 %	25 %	25 %	25 %	337283716
3116	NC_015680	AT	3	6	176568	176573	50 %	50 %	0 %	0 %	337283717
3117	NC_015680	TAC	2	6	176808	176813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283717
3118	NC_015680	CGA	2	6	176852	176857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283717
3119	NC_015680	TCG	2	6	176887	176892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283717
3120	NC_015680	TAT	2	6	176925	176930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283717
3121	NC_015680	GTT	2	6	176960	176965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283717
3122	NC_015680	CGG	2	6	176987	176992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283717
3123	NC_015680	GTTG	2	8	176999	177006	0 %	50 %	50 %	0 %	337283717
3124	NC_015680	TTA	2	6	177076	177081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283717
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3245	NC_015680	ATA	2	6	183060	183065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283725
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3368	NC_015680	TTC	2	6	189454	189459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283734
3369	NC_015680	TTC	2	6	189481	189486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283734
3370	NC_015680	TCC	2	6	189527	189532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283734
3371	NC_015680	GA	3	6	189554	189559	50 %	0 %	50 %	0 %	337283734
3372	NC_015680	CGAG	2	8	189569	189576	25 %	0 %	50 %	25 %	337283734
3373	NC_015680	GGT	2	6	189633	189638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283734
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3375	NC_015680	TGG	2	6	189719	189724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283734
3376	NC_015680	CCG	2	6	189760	189765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283734
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3380	NC_015680	GCC	2	6	189843	189848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283734
3381	NC_015680	CTT	2	6	189888	189893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283734
3382	NC_015680	CGT	2	6	189945	189950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283734
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3388	NC_015680	CGT	3	9	190255	190263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283735
3389	NC_015680	TGA	2	6	190264	190269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283735
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3403	NC_015680	CAT	2	6	191285	191290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283735
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3478	NC_015680	GAG	3	9	195659	195667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283740
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3480	NC_015680	CTC	2	6	195815	195820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283741
3481	NC_015680	TACCT	2	10	195848	195857	20 %	40 %	0 %	40 %	337283741
3482	NC_015680	GCTG	2	8	195879	195886	0 %	25 %	50 %	25 %	337283741
3483	NC_015680	CGA	2	6	195939	195944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283741
3484	NC_015680	CT	4	8	196020	196027	0 %	50 %	0 %	50 %	337283741
3485	NC_015680	GTC	2	6	196058	196063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283741
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3487	NC_015680	CACGAG	2	12	196129	196140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283741
3488	NC_015680	TCTT	2	8	196148	196155	0 %	75 %	0 %	25 %	337283741
3489	NC_015680	GAA	2	6	196197	196202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283741
3490	NC_015680	AGA	2	6	196209	196214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283741
3491	NC_015680	CTCG	2	8	196297	196304	0 %	25 %	25 %	50 %	337283741
3492	NC_015680	ACCCTC	2	12	196361	196372	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	337283741
3493	NC_015680	TTC	2	6	196448	196453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283741
3494	NC_015680	CGG	2	6	196635	196640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283741
3495	NC_015680	CCT	2	6	196644	196649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283741
3496	NC_015680	CGG	2	6	196725	196730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283741
3497	NC_015680	G	6	6	196741	196746	0 %	0 %	100 %	0 %	337283741
3498	NC_015680	TCA	2	6	196814	196819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283741
3499	NC_015680	CT	3	6	196948	196953	0 %	50 %	0 %	50 %	337283742
3500	NC_015680	CCT	2	6	197092	197097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283742

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