MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_015680	AAT	2	6	1419240	1419245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285072
25502	NC_015680	GTA	2	6	1419295	1419300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285072
25503	NC_015680	CGT	2	6	1419459	1419464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285072
25504	NC_015680	TGA	2	6	1419468	1419473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285072
25505	NC_015680	GCAGTA	2	12	1419504	1419515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337285073
25506	NC_015680	TC	3	6	1419587	1419592	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25507	NC_015680	CGA	2	6	1419609	1419614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285073
25508	NC_015680	CT	3	6	1419665	1419670	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25509	NC_015680	CCT	2	6	1419685	1419690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285073
25510	NC_015680	TCT	2	6	1419702	1419707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285073
25511	NC_015680	ATC	2	6	1419782	1419787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285073
25512	NC_015680	CTG	2	6	1419799	1419804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285073
25513	NC_015680	CCT	2	6	1419844	1419849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285073
25514	NC_015680	CTT	2	6	1419853	1419858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285073
25515	NC_015680	TCT	2	6	1419870	1419875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285073
25516	NC_015680	CCT	2	6	1419882	1419887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285073
25517	NC_015680	TTG	3	9	1419893	1419901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337285073
25518	NC_015680	TC	3	6	1419904	1419909	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25519	NC_015680	CTG	2	6	1419913	1419918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285073
25520	NC_015680	TC	3	6	1420027	1420032	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25521	NC_015680	TCT	2	6	1420038	1420043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285073
25522	NC_015680	CCT	2	6	1420060	1420065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285073
25523	NC_015680	TC	3	6	1420082	1420087	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25524	NC_015680	CCT	2	6	1420107	1420112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285073
25525	NC_015680	AGG	2	6	1420118	1420123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285073
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25527	NC_015680	TCT	2	6	1420170	1420175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285073
25528	NC_015680	TC	4	8	1420215	1420222	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25529	NC_015680	GTT	2	6	1420237	1420242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337285073
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25531	NC_015680	TC	4	8	1420308	1420315	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25532	NC_015680	TTCTCC	2	12	1420316	1420327	0 %	50 %	0 %	50 %	337285073
25533	NC_015680	TGA	2	6	1420523	1420528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285074
25534	NC_015680	AGGGA	2	10	1420559	1420568	40 %	0 %	60 %	0 %	337285074
25535	NC_015680	GGA	2	6	1420600	1420605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285074
25536	NC_015680	ACA	2	6	1420642	1420647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285074
25537	NC_015680	GGAAGG	2	12	1420682	1420693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285074
25538	NC_015680	TCG	2	6	1420748	1420753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285074
25539	NC_015680	AG	3	6	1420804	1420809	50 %	0 %	50 %	0 %	337285074
25540	NC_015680	GAT	3	9	1420840	1420848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285074
25541	NC_015680	GA	3	6	1420855	1420860	50 %	0 %	50 %	0 %	337285074
25542	NC_015680	TGG	2	6	1420883	1420888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285074
25543	NC_015680	GGCT	2	8	1420946	1420953	0 %	25 %	50 %	25 %	337285074
25544	NC_015680	GCAT	2	8	1420957	1420964	25 %	25 %	25 %	25 %	337285074
25545	NC_015680	CAC	2	6	1421004	1421009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285074
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25547	NC_015680	AGGG	2	8	1421143	1421150	25 %	0 %	75 %	0 %	337285074
25548	NC_015680	CGA	2	6	1421175	1421180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285074
25549	NC_015680	TTC	2	6	1421182	1421187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285074
25550	NC_015680	GAA	2	6	1421242	1421247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285074
25551	NC_015680	TGA	2	6	1421274	1421279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285074
25552	NC_015680	ATG	2	6	1421298	1421303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285074
25553	NC_015680	CT	3	6	1421339	1421344	0 %	50 %	0 %	50 %	337285075
25554	NC_015680	AAC	2	6	1421399	1421404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285075
25555	NC_015680	CTT	2	6	1421505	1421510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285075
25556	NC_015680	ATA	2	6	1421547	1421552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285075
25557	NC_015680	CCT	2	6	1421615	1421620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285075
25558	NC_015680	TCT	2	6	1421630	1421635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285075
25559	NC_015680	GAC	2	6	1421639	1421644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285075
25560	NC_015680	CCA	2	6	1421707	1421712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285075
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25564	NC_015680	GA	3	6	1421814	1421819	50 %	0 %	50 %	0 %	337285075
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25568	NC_015680	TC	3	6	1421979	1421984	0 %	50 %	0 %	50 %	337285075
25569	NC_015680	ATC	2	6	1422000	1422005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285075
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25589	NC_015680	ATC	2	6	1423720	1423725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285077
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25598	NC_015680	ACAT	2	8	1423960	1423967	50 %	25 %	0 %	25 %	337285077
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25602	NC_015680	GAAG	2	8	1424171	1424178	50 %	0 %	50 %	0 %	337285077
25603	NC_015680	CAGC	2	8	1424196	1424203	25 %	0 %	25 %	50 %	337285077
25604	NC_015680	GAG	2	6	1424230	1424235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285077
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25608	NC_015680	CAGA	2	8	1424367	1424374	50 %	0 %	25 %	25 %	337285077
25609	NC_015680	CTCAT	2	10	1424401	1424410	20 %	40 %	0 %	40 %	337285078
25610	NC_015680	CAT	2	6	1424415	1424420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285078
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25612	NC_015680	CCTC	2	8	1424516	1424523	0 %	25 %	0 %	75 %	337285078
25613	NC_015680	TCG	2	6	1424524	1424529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285078
25614	NC_015680	TCC	2	6	1424533	1424538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285078
25615	NC_015680	TCT	2	6	1424558	1424563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285078
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25734	NC_015680	GAA	2	6	1431395	1431400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285083
25735	NC_015680	GAT	2	6	1431444	1431449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285083
25736	NC_015680	CTC	2	6	1431451	1431456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285083
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25745	NC_015680	AT	3	6	1431899	1431904	50 %	50 %	0 %	0 %	337285083
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