MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_015680	ACG	2	6	1368535	1368540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285021
24503	NC_015680	TAGC	2	8	1368557	1368564	25 %	25 %	25 %	25 %	337285021
24504	NC_015680	CATTG	2	10	1368585	1368594	20 %	40 %	20 %	20 %	337285021
24505	NC_015680	ATC	2	6	1368852	1368857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285022
24506	NC_015680	CCA	2	6	1368867	1368872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285022
24507	NC_015680	CTC	2	6	1368915	1368920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285022
24508	NC_015680	CCT	2	6	1369005	1369010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285022
24509	NC_015680	CT	3	6	1369009	1369014	0 %	50 %	0 %	50 %	337285022
24510	NC_015680	CTC	2	6	1369022	1369027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285022
24511	NC_015680	CTC	2	6	1369048	1369053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285022
24512	NC_015680	TC	3	6	1369112	1369117	0 %	50 %	0 %	50 %	337285022
24513	NC_015680	TCA	2	6	1369137	1369142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285022
24514	NC_015680	ATC	2	6	1369167	1369172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285022
24515	NC_015680	GAG	2	6	1369246	1369251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285023
24516	NC_015680	AGG	2	6	1369271	1369276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285023
24517	NC_015680	ATC	2	6	1369288	1369293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285023
24518	NC_015680	CCG	2	6	1369304	1369309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285023
24519	NC_015680	AGG	2	6	1369358	1369363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285023
24520	NC_015680	TA	3	6	1369450	1369455	50 %	50 %	0 %	0 %	337285023
24521	NC_015680	TCG	2	6	1369554	1369559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285023
24522	NC_015680	GAA	2	6	1369573	1369578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285023
24523	NC_015680	CTC	2	6	1369579	1369584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285023
24524	NC_015680	CCT	2	6	1369812	1369817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285023
24525	NC_015680	ACCG	2	8	1369864	1369871	25 %	0 %	25 %	50 %	337285023
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24528	NC_015680	CGA	2	6	1370085	1370090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285023
24529	NC_015680	AGCG	2	8	1370121	1370128	25 %	0 %	50 %	25 %	337285023
24530	NC_015680	CTAT	2	8	1370144	1370151	25 %	50 %	0 %	25 %	337285023
24531	NC_015680	AAG	2	6	1370159	1370164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285023
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24533	NC_015680	AGG	2	6	1370237	1370242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285023
24534	NC_015680	GAT	2	6	1370263	1370268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285023
24535	NC_015680	ATG	2	6	1370282	1370287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285023
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24539	NC_015680	TA	3	6	1370534	1370539	50 %	50 %	0 %	0 %	337285024
24540	NC_015680	GGAG	2	8	1370550	1370557	25 %	0 %	75 %	0 %	337285024
24541	NC_015680	GA	4	8	1370645	1370652	50 %	0 %	50 %	0 %	337285024
24542	NC_015680	AGG	2	6	1370696	1370701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285024
24543	NC_015680	GA	3	6	1370750	1370755	50 %	0 %	50 %	0 %	337285024
24544	NC_015680	AGA	2	6	1370767	1370772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285024
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24549	NC_015680	GAA	2	6	1370855	1370860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285024
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24553	NC_015680	GAGG	2	8	1371134	1371141	25 %	0 %	75 %	0 %	337285025
24554	NC_015680	GGT	2	6	1371182	1371187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285025
24555	NC_015680	AATA	2	8	1371192	1371199	75 %	25 %	0 %	0 %	337285025
24556	NC_015680	CGG	2	6	1371202	1371207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285025
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24559	NC_015680	CGA	2	6	1371361	1371366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285025
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24561	NC_015680	CGAG	2	8	1371496	1371503	25 %	0 %	50 %	25 %	337285025
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24593	NC_015680	TCCT	2	8	1373068	1373075	0 %	50 %	0 %	50 %	337285027
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24601	NC_015680	TC	3	6	1373312	1373317	0 %	50 %	0 %	50 %	337285027
24602	NC_015680	TGG	2	6	1373396	1373401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285027
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24607	NC_015680	ACCTCG	2	12	1373781	1373792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337285028
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24850	NC_015680	CGAGAC	2	12	1384754	1384765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285039
24851	NC_015680	AAGG	2	8	1384775	1384782	50 %	0 %	50 %	0 %	337285039
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24966	NC_015680	TCG	2	6	1390296	1390301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285044
24967	NC_015680	ATC	2	6	1390356	1390361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285044
24968	NC_015680	GAG	2	6	1390504	1390509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285045
24969	NC_015680	AG	3	6	1390583	1390588	50 %	0 %	50 %	0 %	337285045
24970	NC_015680	AAG	2	6	1390663	1390668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285045
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24972	NC_015680	AC	3	6	1390721	1390726	50 %	0 %	0 %	50 %	337285045
24973	NC_015680	GAA	2	6	1390770	1390775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285045
24974	NC_015680	GCC	2	6	1390801	1390806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285045
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24976	NC_015680	CGTTGA	2	12	1390917	1390928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337285045
24977	NC_015680	TGA	2	6	1390959	1390964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285045
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24983	NC_015680	CAT	2	6	1391257	1391262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285046
24984	NC_015680	CTG	2	6	1391441	1391446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285046
24985	NC_015680	AGG	2	6	1391507	1391512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285046
24986	NC_015680	GGCG	2	8	1391722	1391729	0 %	0 %	75 %	25 %	337285046
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24990	NC_015680	GCCTC	2	10	1391838	1391847	0 %	20 %	20 %	60 %	337285046
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24992	NC_015680	CTC	2	6	1391893	1391898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285046
24993	NC_015680	CAT	2	6	1391911	1391916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285046
24994	NC_015680	AGT	2	6	1391997	1392002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285047
24995	NC_015680	TCC	2	6	1392007	1392012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285047
24996	NC_015680	AT	3	6	1392141	1392146	50 %	50 %	0 %	0 %	337285047
24997	NC_015680	CGA	2	6	1392152	1392157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285047
24998	NC_015680	TCCT	2	8	1392243	1392250	0 %	50 %	0 %	50 %	337285047
24999	NC_015680	CGTC	2	8	1392298	1392305	0 %	25 %	25 %	50 %	337285047
25000	NC_015680	AAC	2	6	1392308	1392313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285047

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