MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015680	CAT	2	6	1059749	1059754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284680
19002	NC_015680	CGT	2	6	1059812	1059817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284680
19003	NC_015680	T	6	6	1059929	1059934	0 %	100 %	0 %	0 %	337284681
19004	NC_015680	TCC	2	6	1060093	1060098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284681
19005	NC_015680	GCC	2	6	1060134	1060139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284681
19006	NC_015680	AGG	2	6	1060147	1060152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284681
19007	NC_015680	TC	3	6	1060174	1060179	0 %	50 %	0 %	50 %	337284681
19008	NC_015680	CT	3	6	1060209	1060214	0 %	50 %	0 %	50 %	337284681
19009	NC_015680	CCT	2	6	1060295	1060300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284681
19010	NC_015680	CTT	2	6	1060332	1060337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284681
19011	NC_015680	TTC	2	6	1060435	1060440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284681
19012	NC_015680	CGT	2	6	1060458	1060463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284681
19013	NC_015680	GCC	3	9	1060477	1060485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284681
19014	NC_015680	CCG	2	6	1060535	1060540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284681
19015	NC_015680	TCC	2	6	1060546	1060551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284681
19016	NC_015680	TAT	2	6	1060557	1060562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284681
19017	NC_015680	AG	3	6	1060579	1060584	50 %	0 %	50 %	0 %	337284681
19018	NC_015680	ACG	2	6	1060618	1060623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284681
19019	NC_015680	GAC	2	6	1060641	1060646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284681
19020	NC_015680	CTTC	2	8	1060649	1060656	0 %	50 %	0 %	50 %	337284681
19021	NC_015680	CCT	2	6	1060682	1060687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284681
19022	NC_015680	CGCC	2	8	1060691	1060698	0 %	0 %	25 %	75 %	337284681
19023	NC_015680	GT	3	6	1060703	1060708	0 %	50 %	50 %	0 %	337284681
19024	NC_015680	AAG	2	6	1060753	1060758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284681
19025	NC_015680	GTCTC	2	10	1060765	1060774	0 %	40 %	20 %	40 %	337284681
19026	NC_015680	CT	3	6	1060792	1060797	0 %	50 %	0 %	50 %	337284681
19027	NC_015680	CT	3	6	1060834	1060839	0 %	50 %	0 %	50 %	337284681
19028	NC_015680	AAT	2	6	1060892	1060897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284681
19029	NC_015680	GGGT	2	8	1060912	1060919	0 %	25 %	75 %	0 %	337284681
19030	NC_015680	TTC	2	6	1060957	1060962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284681
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19032	NC_015680	GGC	2	6	1061016	1061021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284681
19033	NC_015680	G	6	6	1061045	1061050	0 %	0 %	100 %	0 %	337284681
19034	NC_015680	TCT	2	6	1061065	1061070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284681
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19036	NC_015680	ATG	2	6	1061101	1061106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284681
19037	NC_015680	ATC	2	6	1061116	1061121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284681
19038	NC_015680	CTT	2	6	1061160	1061165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284681
19039	NC_015680	CT	4	8	1061172	1061179	0 %	50 %	0 %	50 %	337284681
19040	NC_015680	TAT	2	6	1061199	1061204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284681
19041	NC_015680	ATT	2	6	1061227	1061232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284681
19042	NC_015680	CGG	2	6	1061247	1061252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284681
19043	NC_015680	CTTT	2	8	1061262	1061269	0 %	75 %	0 %	25 %	337284681
19044	NC_015680	CAT	2	6	1061274	1061279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284681
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19046	NC_015680	TCCCT	2	10	1061695	1061704	0 %	40 %	0 %	60 %	337284682
19047	NC_015680	TAA	2	6	1061732	1061737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284682
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19050	NC_015680	TCT	2	6	1061870	1061875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284682
19051	NC_015680	TCA	2	6	1061893	1061898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284682
19052	NC_015680	GAG	2	6	1061938	1061943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284682
19053	NC_015680	GTT	2	6	1061973	1061978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284682
19054	NC_015680	GCAGG	2	10	1061981	1061990	20 %	0 %	60 %	20 %	337284682
19055	NC_015680	CTC	2	6	1062037	1062042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284682
19056	NC_015680	AGA	2	6	1062069	1062074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284682
19057	NC_015680	CTT	2	6	1062084	1062089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284682
19058	NC_015680	TCC	2	6	1062256	1062261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284682
19059	NC_015680	CTTT	2	8	1062346	1062353	0 %	75 %	0 %	25 %	337284682
19060	NC_015680	TGG	2	6	1062358	1062363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284682
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19062	NC_015680	TCG	2	6	1062388	1062393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284682
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19075	NC_015680	CGG	2	6	1063667	1063672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284684
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19101	NC_015680	TA	3	6	1065174	1065179	50 %	50 %	0 %	0 %	337284684
19102	NC_015680	ATG	2	6	1065569	1065574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284685
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19104	NC_015680	TTG	2	6	1065599	1065604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284685
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19106	NC_015680	GAG	2	6	1065781	1065786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284685
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19112	NC_015680	GTT	2	6	1066060	1066065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284685
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19115	NC_015680	A	6	6	1066322	1066327	100 %	0 %	0 %	0 %	337284685
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19235	NC_015680	CCT	2	6	1073842	1073847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284693
19236	NC_015680	TCCC	2	8	1073921	1073928	0 %	25 %	0 %	75 %	337284693
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19351	NC_015680	CAA	2	6	1081427	1081432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284703
19352	NC_015680	ACA	2	6	1081473	1081478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284703
19353	NC_015680	ACA	2	6	1081684	1081689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284703
19354	NC_015680	AGAT	2	8	1081726	1081733	50 %	25 %	25 %	0 %	337284703
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19467	NC_015680	CCA	2	6	1088373	1088378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284710
19468	NC_015680	TGA	2	6	1088409	1088414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284710
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