MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_015680	CCA	2	6	920824	920829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284530
16503	NC_015680	AAT	2	6	920837	920842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284530
16504	NC_015680	CCT	2	6	920876	920881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284530
16505	NC_015680	TGG	2	6	920927	920932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284530
16506	NC_015680	CAC	2	6	921005	921010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284530
16507	NC_015680	TGAT	2	8	921021	921028	25 %	50 %	25 %	0 %	337284530
16508	NC_015680	CCT	2	6	921055	921060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284530
16509	NC_015680	TAA	2	6	921081	921086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284530
16510	NC_015680	TCT	2	6	921108	921113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284530
16511	NC_015680	TCA	2	6	921168	921173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284530
16512	NC_015680	CTC	2	6	921233	921238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284530
16513	NC_015680	A	7	7	921351	921357	100 %	0 %	0 %	0 %	337284530
16514	NC_015680	C	8	8	921377	921384	0 %	0 %	0 %	100 %	337284531
16515	NC_015680	AGG	2	6	921443	921448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284531
16516	NC_015680	CCTC	2	8	921450	921457	0 %	25 %	0 %	75 %	337284531
16517	NC_015680	AGG	2	6	921480	921485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284531
16518	NC_015680	TTC	2	6	921497	921502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284531
16519	NC_015680	GCCT	2	8	921632	921639	0 %	25 %	25 %	50 %	337284531
16520	NC_015680	CTG	2	6	921662	921667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284531
16521	NC_015680	GAG	3	9	921685	921693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284531
16522	NC_015680	CTT	2	6	921738	921743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284531
16523	NC_015680	CCT	2	6	921780	921785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284531
16524	NC_015680	T	7	7	921987	921993	0 %	100 %	0 %	0 %	337284531
16525	NC_015680	AGC	2	6	921994	921999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284531
16526	NC_015680	GTTAAG	2	12	922109	922120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284531
16527	NC_015680	GA	3	6	922238	922243	50 %	0 %	50 %	0 %	337284531
16528	NC_015680	CTC	2	6	922300	922305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284531
16529	NC_015680	AAG	2	6	922372	922377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284531
16530	NC_015680	AGC	2	6	922447	922452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284531
16531	NC_015680	GAG	2	6	922655	922660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284532
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16533	NC_015680	TCA	2	6	922692	922697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284532
16534	NC_015680	CT	3	6	922741	922746	0 %	50 %	0 %	50 %	337284532
16535	NC_015680	GGA	2	6	922774	922779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284532
16536	NC_015680	AAC	2	6	922832	922837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284532
16537	NC_015680	GGA	2	6	922851	922856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284532
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16539	NC_015680	GA	3	6	923016	923021	50 %	0 %	50 %	0 %	337284532
16540	NC_015680	ACC	2	6	923098	923103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284532
16541	NC_015680	AGG	2	6	923141	923146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284532
16542	NC_015680	TCC	2	6	923199	923204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284532
16543	NC_015680	AGA	2	6	923279	923284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284532
16544	NC_015680	GAAG	2	8	923416	923423	50 %	0 %	50 %	0 %	337284532
16545	NC_015680	CTA	2	6	923458	923463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284532
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16547	NC_015680	GAG	2	6	923621	923626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284532
16548	NC_015680	TGA	2	6	923655	923660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284532
16549	NC_015680	GAG	2	6	923945	923950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284533
16550	NC_015680	AACTC	2	10	923971	923980	40 %	20 %	0 %	40 %	337284533
16551	NC_015680	CTC	2	6	924089	924094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284533
16552	NC_015680	GA	3	6	924130	924135	50 %	0 %	50 %	0 %	337284533
16553	NC_015680	AGG	2	6	924185	924190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284533
16554	NC_015680	AGG	2	6	924195	924200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284533
16555	NC_015680	GAA	2	6	924241	924246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284533
16556	NC_015680	AAG	2	6	924251	924256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284533
16557	NC_015680	GAA	2	6	924267	924272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284533
16558	NC_015680	ATG	2	6	924285	924290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284534
16559	NC_015680	TCG	2	6	924306	924311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284534
16560	NC_015680	CCT	2	6	924353	924358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284534
16561	NC_015680	AGG	2	6	924411	924416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284534
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16566	NC_015680	TAC	2	6	924497	924502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284534
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16590	NC_015680	CAAGG	2	10	925591	925600	40 %	0 %	40 %	20 %	337284536
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16599	NC_015680	CT	3	6	926121	926126	0 %	50 %	0 %	50 %	337284537
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16605	NC_015680	GTG	2	6	926433	926438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284537
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16607	NC_015680	CTGA	2	8	926517	926524	25 %	25 %	25 %	25 %	337284537
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16610	NC_015680	AG	3	6	926594	926599	50 %	0 %	50 %	0 %	337284537
16611	NC_015680	CGG	2	6	926602	926607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284537
16612	NC_015680	TAG	2	6	926771	926776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284537
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16618	NC_015680	G	7	7	926972	926978	0 %	0 %	100 %	0 %	337284537
16619	NC_015680	CTCC	2	8	927297	927304	0 %	25 %	0 %	75 %	337284538
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16982	NC_015680	AGG	2	6	947661	947666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284555
16983	NC_015680	AAG	2	6	947897	947902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284555
16984	NC_015680	GTC	3	9	947924	947932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284555
16985	NC_015680	T	6	6	947992	947997	0 %	100 %	0 %	0 %	337284556
16986	NC_015680	CTC	2	6	948036	948041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284556
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16988	NC_015680	GAT	3	9	948135	948143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284556
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16990	NC_015680	CCTC	2	8	948220	948227	0 %	25 %	0 %	75 %	337284556
16991	NC_015680	GAT	2	6	948240	948245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284556
16992	NC_015680	GTA	2	6	948291	948296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284556
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16994	NC_015680	ATGGCC	2	12	948361	948372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337284556
16995	NC_015680	GTGA	2	8	948384	948391	25 %	25 %	50 %	0 %	337284556
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16997	NC_015680	CT	3	6	948414	948419	0 %	50 %	0 %	50 %	337284556
16998	NC_015680	TTC	2	6	948425	948430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284556
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