MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015680	CATGG	2	10	804567	804576	20 %	20 %	40 %	20 %	337284394
14502	NC_015680	ATG	2	6	804603	804608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284394
14503	NC_015680	GAC	2	6	804609	804614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284394
14504	NC_015680	GGA	2	6	804632	804637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284394
14505	NC_015680	AAT	2	6	804686	804691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284394
14506	NC_015680	G	6	6	804704	804709	0 %	0 %	100 %	0 %	337284394
14507	NC_015680	CGG	2	6	805587	805592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284395
14508	NC_015680	TC	3	6	805621	805626	0 %	50 %	0 %	50 %	337284395
14509	NC_015680	CAGG	2	8	805674	805681	25 %	0 %	50 %	25 %	337284395
14510	NC_015680	TAC	2	6	805693	805698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284395
14511	NC_015680	GCG	2	6	805700	805705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284395
14512	NC_015680	GTG	2	6	805850	805855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284396
14513	NC_015680	T	6	6	805925	805930	0 %	100 %	0 %	0 %	337284396
14514	NC_015680	CT	3	6	805934	805939	0 %	50 %	0 %	50 %	337284396
14515	NC_015680	CAG	2	6	805953	805958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284396
14516	NC_015680	AAG	2	6	805959	805964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284396
14517	NC_015680	TTG	2	6	805971	805976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284396
14518	NC_015680	AGT	2	6	806020	806025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284396
14519	NC_015680	TGG	2	6	806051	806056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284396
14520	NC_015680	T	6	6	806171	806176	0 %	100 %	0 %	0 %	337284396
14521	NC_015680	AAT	2	6	806198	806203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284396
14522	NC_015680	TTC	2	6	806204	806209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284396
14523	NC_015680	CAA	2	6	806254	806259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284396
14524	NC_015680	CTCC	2	8	806314	806321	0 %	25 %	0 %	75 %	337284396
14525	NC_015680	CTG	2	6	806358	806363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284396
14526	NC_015680	AGG	2	6	806415	806420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284396
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14528	NC_015680	CAT	2	6	806615	806620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284397
14529	NC_015680	TGA	2	6	806712	806717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284397
14530	NC_015680	TTA	2	6	806798	806803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284397
14531	NC_015680	CGG	2	6	806808	806813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284397
14532	NC_015680	AG	3	6	807003	807008	50 %	0 %	50 %	0 %	337284397
14533	NC_015680	GA	3	6	807030	807035	50 %	0 %	50 %	0 %	337284397
14534	NC_015680	AAAG	2	8	807056	807063	75 %	0 %	25 %	0 %	337284397
14535	NC_015680	ATA	2	6	807091	807096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284397
14536	NC_015680	TA	3	6	807286	807291	50 %	50 %	0 %	0 %	337284397
14537	NC_015680	TTC	2	6	807317	807322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284397
14538	NC_015680	CGG	2	6	807323	807328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284397
14539	NC_015680	AAGC	2	8	807344	807351	50 %	0 %	25 %	25 %	337284397
14540	NC_015680	CTT	2	6	807373	807378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284397
14541	NC_015680	GGT	2	6	807561	807566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284397
14542	NC_015680	GAA	3	9	807627	807635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284397
14543	NC_015680	GA	3	6	807694	807699	50 %	0 %	50 %	0 %	337284397
14544	NC_015680	ATC	2	6	807727	807732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284397
14545	NC_015680	TGGGCA	2	12	807959	807970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	337284397
14546	NC_015680	TCA	2	6	807992	807997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284397
14547	NC_015680	GGT	2	6	808035	808040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284397
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14549	NC_015680	TAA	2	6	808094	808099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284397
14550	NC_015680	TCG	2	6	808133	808138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284397
14551	NC_015680	GAA	2	6	808216	808221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284397
14552	NC_015680	GGA	2	6	808224	808229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284397
14553	NC_015680	GAG	2	6	808339	808344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284397
14554	NC_015680	ATA	2	6	808508	808513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284397
14555	NC_015680	GAA	2	6	808514	808519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284397
14556	NC_015680	AAG	2	6	808600	808605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284397
14557	NC_015680	GGT	2	6	808623	808628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284397
14558	NC_015680	ACG	2	6	808652	808657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284397
14559	NC_015680	GCG	2	6	808724	808729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284397
14560	NC_015680	CGT	2	6	808761	808766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284397
14561	NC_015680	CTT	2	6	808815	808820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284397
14562	NC_015680	ACA	2	6	808835	808840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284397
14563	NC_015680	GCG	2	6	808858	808863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284397
14564	NC_015680	GGC	2	6	808908	808913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284397
14565	NC_015680	CGT	2	6	808941	808946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284397
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14585	NC_015680	ATG	2	6	810258	810263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284400
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14588	NC_015680	GAC	2	6	810287	810292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284400
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14591	NC_015680	ACC	2	6	810568	810573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284400
14592	NC_015680	GTGG	2	8	810614	810621	0 %	25 %	75 %	0 %	337284400
14593	NC_015680	GGA	2	6	810888	810893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284401
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14595	NC_015680	TAGA	2	8	811041	811048	50 %	25 %	25 %	0 %	337284401
14596	NC_015680	CTG	2	6	811068	811073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284401
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14599	NC_015680	GA	3	6	811188	811193	50 %	0 %	50 %	0 %	337284401
14600	NC_015680	ACA	2	6	811200	811205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284401
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14602	NC_015680	CAT	2	6	811270	811275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284401
14603	NC_015680	TTC	2	6	811304	811309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284401
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14605	NC_015680	CAAG	2	8	811345	811352	50 %	0 %	25 %	25 %	337284401
14606	NC_015680	AG	3	6	811372	811377	50 %	0 %	50 %	0 %	337284401
14607	NC_015680	TGGAAT	2	12	811396	811407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284401
14608	NC_015680	TA	3	6	811416	811421	50 %	50 %	0 %	0 %	337284401
14609	NC_015680	GAA	2	6	811569	811574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284401
14610	NC_015680	TCCC	2	8	811874	811881	0 %	25 %	0 %	75 %	337284402
14611	NC_015680	GGGATG	2	12	811934	811945	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	337284402
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14620	NC_015680	AC	3	6	812301	812306	50 %	0 %	0 %	50 %	337284402
14621	NC_015680	GCCT	2	8	812317	812324	0 %	25 %	25 %	50 %	337284402
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14978	NC_015680	CGA	2	6	830401	830406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284424
14979	NC_015680	CTT	2	6	830455	830460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284424
14980	NC_015680	ACG	2	6	830472	830477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284424
14981	NC_015680	AGT	2	6	830560	830565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284424
14982	NC_015680	CCA	2	6	830640	830645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284424
14983	NC_015680	TCT	2	6	830706	830711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284424
14984	NC_015680	TC	3	6	830725	830730	0 %	50 %	0 %	50 %	337284424
14985	NC_015680	TCG	2	6	830845	830850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284424
14986	NC_015680	CCT	2	6	830880	830885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284424
14987	NC_015680	TCA	3	9	830902	830910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284424
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14991	NC_015680	TC	3	6	831418	831423	0 %	50 %	0 %	50 %	337284426
14992	NC_015680	CGA	2	6	831424	831429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284426
14993	NC_015680	AGG	2	6	831438	831443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284426
14994	NC_015680	CTA	2	6	831499	831504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284426
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14997	NC_015680	GGC	2	6	831665	831670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284426
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14999	NC_015680	ATC	2	6	831732	831737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284426
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