MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_015680	CTT	2	6	717501	717506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284298
13003	NC_015680	TTC	2	6	717669	717674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284299
13004	NC_015680	C	6	6	717731	717736	0 %	0 %	0 %	100 %	337284299
13005	NC_015680	CTT	2	6	717750	717755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284299
13006	NC_015680	CTC	2	6	717777	717782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284299
13007	NC_015680	CAT	2	6	717788	717793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284299
13008	NC_015680	GAAAA	2	10	717928	717937	80 %	0 %	20 %	0 %	337284300
13009	NC_015680	A	6	6	717934	717939	100 %	0 %	0 %	0 %	337284300
13010	NC_015680	TGT	2	6	717961	717966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284300
13011	NC_015680	CT	3	6	717981	717986	0 %	50 %	0 %	50 %	337284300
13012	NC_015680	GCG	2	6	718062	718067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284300
13013	NC_015680	AAG	2	6	718076	718081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284300
13014	NC_015680	CGTT	2	8	718111	718118	0 %	50 %	25 %	25 %	337284300
13015	NC_015680	CT	3	6	718215	718220	0 %	50 %	0 %	50 %	337284300
13016	NC_015680	CT	3	6	718235	718240	0 %	50 %	0 %	50 %	337284300
13017	NC_015680	CGT	2	6	718316	718321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284300
13018	NC_015680	CTG	2	6	718355	718360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284300
13019	NC_015680	TTG	2	6	718382	718387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284300
13020	NC_015680	TCG	2	6	718446	718451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284300
13021	NC_015680	GA	3	6	718496	718501	50 %	0 %	50 %	0 %	337284300
13022	NC_015680	CTC	2	6	718574	718579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284300
13023	NC_015680	TCT	2	6	718600	718605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284300
13024	NC_015680	TC	4	8	718689	718696	0 %	50 %	0 %	50 %	337284300
13025	NC_015680	CCT	2	6	718729	718734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284300
13026	NC_015680	CTTC	2	8	718740	718747	0 %	50 %	0 %	50 %	337284300
13027	NC_015680	GCC	2	6	718833	718838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284300
13028	NC_015680	CTC	2	6	718907	718912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284300
13029	NC_015680	CTG	2	6	719000	719005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284300
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13032	NC_015680	CTT	2	6	719130	719135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284301
13033	NC_015680	CAT	2	6	719153	719158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284301
13034	NC_015680	TGA	2	6	719168	719173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284301
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13045	NC_015680	ATG	2	6	719638	719643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284301
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13050	NC_015680	CGG	2	6	720526	720531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284302
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13056	NC_015680	AAC	2	6	720767	720772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284302
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13060	NC_015680	ATC	2	6	720955	720960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284303
13061	NC_015680	AG	3	6	721139	721144	50 %	0 %	50 %	0 %	337284303
13062	NC_015680	CTT	2	6	721342	721347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284303
13063	NC_015680	CGGC	2	8	721349	721356	0 %	0 %	50 %	50 %	337284303
13064	NC_015680	GAG	2	6	721362	721367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284303
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13091	NC_015680	TCA	2	6	722507	722512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284305
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13093	NC_015680	CCTC	2	8	722592	722599	0 %	25 %	0 %	75 %	337284305
13094	NC_015680	GTA	2	6	722689	722694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284305
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13096	NC_015680	TAG	2	6	722780	722785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284305
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13101	NC_015680	AGG	2	6	723098	723103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284305
13102	NC_015680	GTA	2	6	723112	723117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284305
13103	NC_015680	TCA	2	6	723119	723124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284305
13104	NC_015680	ACC	2	6	723179	723184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284305
13105	NC_015680	TC	3	6	723402	723407	0 %	50 %	0 %	50 %	337284305
13106	NC_015680	GAG	2	6	723415	723420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284305
13107	NC_015680	TAG	2	6	723428	723433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284305
13108	NC_015680	GTC	2	6	723472	723477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284305
13109	NC_015680	CGG	2	6	723502	723507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284305
13110	NC_015680	CGA	2	6	723549	723554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284305
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13113	NC_015680	TCA	2	6	723708	723713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284305
13114	NC_015680	AGA	2	6	723887	723892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284306
13115	NC_015680	ACG	2	6	723932	723937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284306
13116	NC_015680	CGACA	2	10	724020	724029	40 %	0 %	20 %	40 %	337284306
13117	NC_015680	GTG	2	6	724039	724044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284306
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13119	NC_015680	CTC	2	6	724088	724093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284307
13120	NC_015680	TCA	2	6	724190	724195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284307
13121	NC_015680	TCC	2	6	724223	724228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284307
13122	NC_015680	AAT	2	6	724463	724468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284308
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13236	NC_015680	G	6	6	730768	730773	0 %	0 %	100 %	0 %	337284315
13237	NC_015680	GGAC	2	8	730795	730802	25 %	0 %	50 %	25 %	337284315
13238	NC_015680	AGGGT	2	10	730847	730856	20 %	20 %	60 %	0 %	337284315
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13364	NC_015680	TCC	2	6	738757	738762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284323
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13480	NC_015680	TCA	2	6	745046	745051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284330
13481	NC_015680	GAT	2	6	745069	745074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284330
13482	NC_015680	ATTGAG	2	12	745083	745094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284330
13483	NC_015680	CTA	2	6	745140	745145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284330
13484	NC_015680	ATA	2	6	745156	745161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284330
13485	NC_015680	AAC	2	6	745242	745247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284330
13486	NC_015680	AAC	2	6	745287	745292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284330
13487	NC_015680	TTTA	2	8	745307	745314	25 %	75 %	0 %	0 %	337284330
13488	NC_015680	CCA	2	6	745391	745396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284330
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13490	NC_015680	TGAA	2	8	745561	745568	50 %	25 %	25 %	0 %	337284331
13491	NC_015680	CTTA	2	8	745581	745588	25 %	50 %	0 %	25 %	337284331
13492	NC_015680	TCA	2	6	745589	745594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284331
13493	NC_015680	GGC	2	6	745605	745610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284331
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13495	NC_015680	CTC	2	6	745649	745654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284331
13496	NC_015680	TCTA	2	8	745688	745695	25 %	50 %	0 %	25 %	337284331
13497	NC_015680	TTC	2	6	745750	745755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284331
13498	NC_015680	TCA	2	6	745784	745789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284331
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13500	NC_015680	CAT	2	6	745890	745895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284331

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