MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015680	ATA	2	6	548664	548669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284138
10003	NC_015680	AGA	2	6	548717	548722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284138
10004	NC_015680	AGGA	2	8	548731	548738	50 %	0 %	50 %	0 %	337284138
10005	NC_015680	TCG	2	6	548764	548769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284138
10006	NC_015680	GGA	2	6	548786	548791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284138
10007	NC_015680	GAA	2	6	548796	548801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284138
10008	NC_015680	GGA	2	6	548870	548875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284138
10009	NC_015680	GAG	2	6	548891	548896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284138
10010	NC_015680	GGCT	2	8	548990	548997	0 %	25 %	50 %	25 %	337284138
10011	NC_015680	AAC	2	6	549218	549223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284139
10012	NC_015680	CTT	2	6	549338	549343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284139
10013	NC_015680	AGG	2	6	549420	549425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284139
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10017	NC_015680	AAC	2	6	549777	549782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284140
10018	NC_015680	GAA	2	6	549803	549808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284140
10019	NC_015680	TTC	2	6	550137	550142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284141
10020	NC_015680	T	6	6	550167	550172	0 %	100 %	0 %	0 %	337284141
10021	NC_015680	CTG	2	6	550264	550269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284141
10022	NC_015680	GCG	2	6	550270	550275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284141
10023	NC_015680	TAGG	2	8	550320	550327	25 %	25 %	50 %	0 %	337284141
10024	NC_015680	TAT	2	6	550353	550358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284141
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10026	NC_015680	CAATGC	2	12	550460	550471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337284141
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10028	NC_015680	ATCC	2	8	550591	550598	25 %	25 %	0 %	50 %	337284141
10029	NC_015680	TCG	2	6	550648	550653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284141
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10033	NC_015680	TTTG	2	8	550776	550783	0 %	75 %	25 %	0 %	337284141
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10043	NC_015680	CT	4	8	551217	551224	0 %	50 %	0 %	50 %	337284141
10044	NC_015680	CTT	2	6	551240	551245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284141
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10050	NC_015680	CTC	2	6	551517	551522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284141
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10052	NC_015680	CGG	2	6	551624	551629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284141
10053	NC_015680	AT	3	6	551631	551636	50 %	50 %	0 %	0 %	337284141
10054	NC_015680	AG	3	6	551640	551645	50 %	0 %	50 %	0 %	337284141
10055	NC_015680	GATG	2	8	551724	551731	25 %	25 %	50 %	0 %	337284141
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10058	NC_015680	CAT	2	6	551873	551878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284141
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10088	NC_015680	GTC	2	6	553350	553355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284141
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10095	NC_015680	TCCT	2	8	553826	553833	0 %	50 %	0 %	50 %	337284141
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10103	NC_015680	AAAG	2	8	554736	554743	75 %	0 %	25 %	0 %	337284142
10104	NC_015680	GCT	2	6	554758	554763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284142
10105	NC_015680	GGC	2	6	554772	554777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284142
10106	NC_015680	TGA	2	6	554802	554807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284142
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10108	NC_015680	ACAG	2	8	554851	554858	50 %	0 %	25 %	25 %	337284142
10109	NC_015680	GA	3	6	554871	554876	50 %	0 %	50 %	0 %	337284142
10110	NC_015680	TGA	2	6	554892	554897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284142
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10114	NC_015680	ACA	2	6	555133	555138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284142
10115	NC_015680	GCCCA	2	10	555160	555169	20 %	0 %	20 %	60 %	337284142
10116	NC_015680	TGA	2	6	555170	555175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284142
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10119	NC_015680	ATG	2	6	555481	555486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284142
10120	NC_015680	ATCCTC	2	12	555487	555498	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	337284142
10121	NC_015680	TGT	2	6	555546	555551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284142
10122	NC_015680	TC	3	6	555570	555575	0 %	50 %	0 %	50 %	337284142
10123	NC_015680	ACC	2	6	555628	555633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284142
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10125	NC_015680	ACC	2	6	555689	555694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284142
10126	NC_015680	AC	3	6	555839	555844	50 %	0 %	0 %	50 %	337284142
10127	NC_015680	GCA	2	6	555865	555870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284142
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10131	NC_015680	ACT	2	6	555927	555932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284142
10132	NC_015680	AGTG	2	8	555976	555983	25 %	25 %	50 %	0 %	337284142
10133	NC_015680	GAAA	2	8	555989	555996	75 %	0 %	25 %	0 %	337284142
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10140	NC_015680	TTC	2	6	557033	557038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284144
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10144	NC_015680	AGA	3	9	557428	557436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284145
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10200	NC_015680	TACC	2	8	560890	560897	25 %	25 %	0 %	50 %	337284148
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10214	NC_015680	CATA	2	8	561476	561483	50 %	25 %	0 %	25 %	337284149
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10219	NC_015680	CAG	2	6	561727	561732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284149
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10224	NC_015680	CCACT	2	10	561911	561920	20 %	20 %	0 %	60 %	337284150
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10228	NC_015680	ATT	2	6	562029	562034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284150
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10231	NC_015680	CTC	2	6	562157	562162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284150
10232	NC_015680	CCCT	2	8	562212	562219	0 %	25 %	0 %	75 %	337284150
10233	NC_015680	CCT	2	6	562237	562242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284150
10234	NC_015680	ATC	2	6	562311	562316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284150
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10236	NC_015680	GTA	2	6	562418	562423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284150
10237	NC_015680	GCC	2	6	562442	562447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284150
10238	NC_015680	AG	3	6	562483	562488	50 %	0 %	50 %	0 %	337284150
10239	NC_015680	CGG	2	6	562496	562501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284150
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10241	NC_015680	CCT	2	6	562642	562647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284150
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10357	NC_015680	CCCTC	2	10	568212	568221	0 %	20 %	0 %	80 %	337284158
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10482	NC_015680	CAT	2	6	575304	575309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284163
10483	NC_015680	GTT	2	6	575482	575487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284163
10484	NC_015680	CTC	2	6	575946	575951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284164
10485	NC_015680	CT	3	6	576022	576027	0 %	50 %	0 %	50 %	337284164
10486	NC_015680	GCGAA	2	10	576028	576037	40 %	0 %	40 %	20 %	337284164
10487	NC_015680	TCCC	2	8	576145	576152	0 %	25 %	0 %	75 %	337284165
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10490	NC_015680	CTC	2	6	576285	576290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284165
10491	NC_015680	TCC	2	6	576294	576299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284165
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