MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015680	CCT	2	6	26210	26215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283539
502	NC_015680	GCC	2	6	26238	26243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283539
503	NC_015680	TCC	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283539
504	NC_015680	GCA	2	6	26325	26330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283539
505	NC_015680	CCT	2	6	26357	26362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283539
506	NC_015680	TCT	2	6	26374	26379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283539
507	NC_015680	TCA	2	6	26383	26388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283539
508	NC_015680	GA	3	6	26396	26401	50 %	0 %	50 %	0 %	337283539
509	NC_015680	GA	3	6	26424	26429	50 %	0 %	50 %	0 %	337283539
510	NC_015680	GAA	3	9	26440	26448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283539
511	NC_015680	T	6	6	26477	26482	0 %	100 %	0 %	0 %	337283539
512	NC_015680	TAT	2	6	26540	26545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283539
513	NC_015680	TCC	2	6	26823	26828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283540
514	NC_015680	T	6	6	26844	26849	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
515	NC_015680	TGT	3	9	26891	26899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283540
516	NC_015680	AT	3	6	26932	26937	50 %	50 %	0 %	0 %	337283540
517	NC_015680	CTC	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283540
518	NC_015680	CTT	2	6	27064	27069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
519	NC_015680	CTT	2	6	27100	27105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
520	NC_015680	CTT	2	6	27158	27163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
521	NC_015680	TAGGGG	2	12	27218	27229	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	337283540
522	NC_015680	GCTC	2	8	27284	27291	0 %	25 %	25 %	50 %	337283540
523	NC_015680	AGA	2	6	27328	27333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283540
524	NC_015680	TCT	2	6	27388	27393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
525	NC_015680	AACG	2	8	27413	27420	50 %	0 %	25 %	25 %	337283540
526	NC_015680	ACG	2	6	27501	27506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283540
527	NC_015680	AGA	2	6	27589	27594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283540
528	NC_015680	TCT	2	6	27654	27659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
529	NC_015680	GTG	2	6	27707	27712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283540
530	NC_015680	ATT	2	6	27759	27764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283540
531	NC_015680	CTTT	2	8	27804	27811	0 %	75 %	0 %	25 %	337283540
532	NC_015680	T	6	6	27878	27883	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
533	NC_015680	T	6	6	28055	28060	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
534	NC_015680	T	6	6	28100	28105	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
535	NC_015680	TAG	2	6	28176	28181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283540
536	NC_015680	AT	3	6	28206	28211	50 %	50 %	0 %	0 %	337283540
537	NC_015680	ATG	2	6	28240	28245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283540
538	NC_015680	TTATGT	2	12	28246	28257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337283540
539	NC_015680	GGA	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
540	NC_015680	GGAGG	2	10	28497	28506	20 %	0 %	80 %	0 %	337283541
541	NC_015680	GGA	2	6	28606	28611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
542	NC_015680	A	6	6	28667	28672	100 %	0 %	0 %	0 %	337283541
543	NC_015680	AGA	2	6	28710	28715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283541
544	NC_015680	TTG	2	6	28758	28763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283541
545	NC_015680	GTT	2	6	28797	28802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283541
546	NC_015680	GAGC	2	8	28820	28827	25 %	0 %	50 %	25 %	337283541
547	NC_015680	TTG	2	6	28912	28917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283541
548	NC_015680	GAG	2	6	28920	28925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
549	NC_015680	GGCTTG	2	12	28930	28941	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	337283541
550	NC_015680	TGAG	2	8	28948	28955	25 %	25 %	50 %	0 %	337283541
551	NC_015680	CTTT	2	8	28969	28976	0 %	75 %	0 %	25 %	337283541
552	NC_015680	TGGAG	2	10	29140	29149	20 %	20 %	60 %	0 %	337283541
553	NC_015680	GA	3	6	29210	29215	50 %	0 %	50 %	0 %	337283541
554	NC_015680	GAG	2	6	29364	29369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
555	NC_015680	CTT	2	6	29423	29428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283541
556	NC_015680	GAG	2	6	29439	29444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
557	NC_015680	G	6	6	29492	29497	0 %	0 %	100 %	0 %	337283541
558	NC_015680	TTA	2	6	29552	29557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283541
559	NC_015680	TGA	2	6	29696	29701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283541
560	NC_015680	TGA	2	6	29723	29728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283541
561	NC_015680	GA	4	8	29745	29752	50 %	0 %	50 %	0 %	337283541
562	NC_015680	ATT	2	6	29758	29763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283541
563	NC_015680	GGA	2	6	29780	29785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
564	NC_015680	TA	3	6	29786	29791	50 %	50 %	0 %	0 %	337283541
565	NC_015680	CA	3	6	29799	29804	50 %	0 %	0 %	50 %	337283541
566	NC_015680	GGT	3	9	29834	29842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283541
567	NC_015680	GT	3	6	29860	29865	0 %	50 %	50 %	0 %	337283541
568	NC_015680	GAAG	2	8	29881	29888	50 %	0 %	50 %	0 %	337283541
569	NC_015680	GAC	2	6	29925	29930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283541
570	NC_015680	GGT	2	6	29966	29971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283541
571	NC_015680	ATG	2	6	29977	29982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283541
572	NC_015680	AT	3	6	30102	30107	50 %	50 %	0 %	0 %	337283542
573	NC_015680	TCC	2	6	30120	30125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283542
574	NC_015680	TAA	2	6	30146	30151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283542
575	NC_015680	ATGC	2	8	30190	30197	25 %	25 %	25 %	25 %	337283542
576	NC_015680	AGA	2	6	30285	30290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
577	NC_015680	AAG	2	6	30292	30297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
578	NC_015680	AG	3	6	30340	30345	50 %	0 %	50 %	0 %	337283542
579	NC_015680	AAT	2	6	30372	30377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283542
580	NC_015680	TGT	2	6	30393	30398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283542
581	NC_015680	GTT	2	6	30468	30473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283542
582	NC_015680	GGGGA	2	10	30492	30501	20 %	0 %	80 %	0 %	337283542
583	NC_015680	AAC	2	6	30520	30525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283542
584	NC_015680	TAAA	2	8	30548	30555	75 %	25 %	0 %	0 %	337283542
585	NC_015680	GAAC	2	8	30561	30568	50 %	0 %	25 %	25 %	337283542
586	NC_015680	TACAT	2	10	30669	30678	40 %	40 %	0 %	20 %	337283542
587	NC_015680	CATCT	2	10	30710	30719	20 %	40 %	0 %	40 %	337283542
588	NC_015680	CTT	2	6	30820	30825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283542
589	NC_015680	CTTCCT	2	12	30843	30854	0 %	50 %	0 %	50 %	337283542
590	NC_015680	TAT	2	6	30898	30903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283542
591	NC_015680	ATC	2	6	30923	30928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283542
592	NC_015680	GAA	2	6	30983	30988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
593	NC_015680	TTC	2	6	31007	31012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283542
594	NC_015680	CGA	2	6	31014	31019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283542
595	NC_015680	TAC	2	6	31042	31047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283542
596	NC_015680	GGGA	2	8	31078	31085	25 %	0 %	75 %	0 %	337283542
597	NC_015680	GAGG	2	8	31101	31108	25 %	0 %	75 %	0 %	337283542
598	NC_015680	CCA	2	6	31174	31179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283542
599	NC_015680	AAC	2	6	31215	31220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283542
600	NC_015680	GAAA	2	8	31320	31327	75 %	0 %	25 %	0 %	337283542
601	NC_015680	GAG	2	6	31338	31343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283542
602	NC_015680	AGG	2	6	31363	31368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283542
603	NC_015680	AGG	2	6	31394	31399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283542
604	NC_015680	AG	3	6	31426	31431	50 %	0 %	50 %	0 %	337283542
605	NC_015680	CGA	2	6	31515	31520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283542
606	NC_015680	CTT	2	6	31530	31535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283542
607	NC_015680	GAA	2	6	31647	31652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
608	NC_015680	AAG	2	6	31670	31675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
609	NC_015680	GAAA	2	8	31692	31699	75 %	0 %	25 %	0 %	337283542
610	NC_015680	AAT	2	6	31707	31712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283542
611	NC_015680	GTA	2	6	31744	31749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283542
612	NC_015680	A	6	6	31852	31857	100 %	0 %	0 %	0 %	337283542
613	NC_015680	TGA	2	6	31909	31914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283542
614	NC_015680	AGTGC	2	10	32338	32347	20 %	20 %	40 %	20 %	337283543
615	NC_015680	A	6	6	32361	32366	100 %	0 %	0 %	0 %	337283543
616	NC_015680	GAA	2	6	32399	32404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283543
617	NC_015680	CAC	2	6	32482	32487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283543
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619	NC_015680	TAA	2	6	32798	32803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283544
620	NC_015680	TTG	2	6	32862	32867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283544
621	NC_015680	TCT	2	6	32949	32954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283544
622	NC_015680	GT	3	6	32958	32963	0 %	50 %	50 %	0 %	337283544
623	NC_015680	TCG	2	6	33221	33226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283545
624	NC_015680	CTT	2	6	33347	33352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283545
625	NC_015680	CTC	2	6	33356	33361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283545
626	NC_015680	GGAG	2	8	33607	33614	25 %	0 %	75 %	0 %	337283547
627	NC_015680	GTG	2	6	34205	34210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283548
628	NC_015680	CCT	2	6	34230	34235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283548
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630	NC_015680	A	7	7	34498	34504	100 %	0 %	0 %	0 %	337283549
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