MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015680	TCG	2	6	308949	308954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283865
5503	NC_015680	CCA	2	6	308973	308978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283865
5504	NC_015680	TCG	2	6	309008	309013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283865
5505	NC_015680	CGT	2	6	309027	309032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283865
5506	NC_015680	TCT	2	6	309051	309056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283865
5507	NC_015680	G	6	6	309063	309068	0 %	0 %	100 %	0 %	337283865
5508	NC_015680	AG	3	6	309108	309113	50 %	0 %	50 %	0 %	337283865
5509	NC_015680	CTT	2	6	309162	309167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283865
5510	NC_015680	CTT	2	6	309205	309210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283865
5511	NC_015680	TAC	2	6	309286	309291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283865
5512	NC_015680	TCCG	2	8	309300	309307	0 %	25 %	25 %	50 %	337283865
5513	NC_015680	TGG	2	6	309344	309349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283865
5514	NC_015680	CCGC	2	8	309407	309414	0 %	0 %	25 %	75 %	337283865
5515	NC_015680	CTTC	2	8	309492	309499	0 %	50 %	0 %	50 %	337283865
5516	NC_015680	CTC	2	6	309502	309507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283865
5517	NC_015680	TC	3	6	309520	309525	0 %	50 %	0 %	50 %	337283865
5518	NC_015680	GGC	2	6	309592	309597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283865
5519	NC_015680	CTC	2	6	309628	309633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283865
5520	NC_015680	TCG	2	6	309779	309784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283865
5521	NC_015680	TCC	2	6	309845	309850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283866
5522	NC_015680	TCT	2	6	309949	309954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283866
5523	NC_015680	TCGGC	2	10	309997	310006	0 %	20 %	40 %	40 %	337283866
5524	NC_015680	CCT	2	6	310033	310038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283866
5525	NC_015680	C	7	7	310077	310083	0 %	0 %	0 %	100 %	337283866
5526	NC_015680	CTC	2	6	310127	310132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283866
5527	NC_015680	ATT	2	6	310260	310265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283866
5528	NC_015680	GAT	2	6	310286	310291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283866
5529	NC_015680	TCG	3	9	310317	310325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283866
5530	NC_015680	GCC	2	6	310343	310348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283866
5531	NC_015680	GCTC	2	8	310360	310367	0 %	25 %	25 %	50 %	337283866
5532	NC_015680	CAA	2	6	310477	310482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283866
5533	NC_015680	CCTCC	2	10	310652	310661	0 %	20 %	0 %	80 %	337283866
5534	NC_015680	CGC	2	6	310747	310752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283866
5535	NC_015680	CTTC	2	8	310795	310802	0 %	50 %	0 %	50 %	337283866
5536	NC_015680	TCT	2	6	310921	310926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283866
5537	NC_015680	CTT	2	6	310928	310933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283866
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5539	NC_015680	TAGC	2	8	310951	310958	25 %	25 %	25 %	25 %	337283866
5540	NC_015680	CTG	2	6	310998	311003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283866
5541	NC_015680	TCG	2	6	311065	311070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283866
5542	NC_015680	TCT	2	6	311110	311115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283866
5543	NC_015680	TCC	2	6	311160	311165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283866
5544	NC_015680	CTG	2	6	311485	311490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283867
5545	NC_015680	GTG	2	6	311536	311541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283867
5546	NC_015680	ACA	2	6	311593	311598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283867
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5549	NC_015680	TAA	2	6	311891	311896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283867
5550	NC_015680	GGA	2	6	311905	311910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283867
5551	NC_015680	ACT	2	6	311914	311919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283867
5552	NC_015680	GTA	3	9	311945	311953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283867
5553	NC_015680	TGC	2	6	312015	312020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283867
5554	NC_015680	TCTG	2	8	312080	312087	0 %	50 %	25 %	25 %	337283867
5555	NC_015680	TG	3	6	312121	312126	0 %	50 %	50 %	0 %	337283867
5556	NC_015680	GAA	2	6	312151	312156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283867
5557	NC_015680	TGA	2	6	312387	312392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283868
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5559	NC_015680	GAACT	2	10	312432	312441	40 %	20 %	20 %	20 %	337283868
5560	NC_015680	CTG	2	6	312522	312527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283868
5561	NC_015680	CTG	2	6	312530	312535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283868
5562	NC_015680	CAAA	2	8	312580	312587	75 %	0 %	0 %	25 %	337283868
5563	NC_015680	CT	3	6	312700	312705	0 %	50 %	0 %	50 %	337283869
5564	NC_015680	GAAG	2	8	312723	312730	50 %	0 %	50 %	0 %	337283869
5565	NC_015680	ATA	2	6	312810	312815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283869
5566	NC_015680	GGCGA	2	10	312819	312828	20 %	0 %	60 %	20 %	337283869
5567	NC_015680	CGA	2	6	312920	312925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283869
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5570	NC_015680	CTTGAA	2	12	312981	312992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337283869
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5573	NC_015680	TTA	2	6	313090	313095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283870
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5594	NC_015680	GAC	2	6	314227	314232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283871
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5607	NC_015680	GGA	2	6	315046	315051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283872
5608	NC_015680	GAG	3	9	315104	315112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283872
5609	NC_015680	AG	3	6	315166	315171	50 %	0 %	50 %	0 %	337283872
5610	NC_015680	AG	3	6	315185	315190	50 %	0 %	50 %	0 %	337283873
5611	NC_015680	TTG	2	6	315212	315217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283873
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5614	NC_015680	TCA	2	6	315491	315496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283873
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5622	NC_015680	GAG	3	9	315916	315924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283873
5623	NC_015680	GAA	2	6	315934	315939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283873
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