MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 30736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015680	CT	3	6	253884	253889	0 %	50 %	0 %	50 %	337283805
4502	NC_015680	TGA	2	6	253898	253903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283805
4503	NC_015680	AGG	2	6	253924	253929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283805
4504	NC_015680	TGC	2	6	253956	253961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283805
4505	NC_015680	GAG	3	9	254035	254043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283805
4506	NC_015680	AGG	2	6	254071	254076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283805
4507	NC_015680	TTA	2	6	254081	254086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283805
4508	NC_015680	CGC	2	6	254127	254132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283805
4509	NC_015680	CGA	2	6	254163	254168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283805
4510	NC_015680	AAG	2	6	254194	254199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283805
4511	NC_015680	ATT	2	6	254256	254261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283805
4512	NC_015680	AGA	2	6	254323	254328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283805
4513	NC_015680	GAA	2	6	254347	254352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283805
4514	NC_015680	TAG	2	6	254396	254401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283805
4515	NC_015680	CAG	2	6	254402	254407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283805
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4517	NC_015680	A	6	6	254438	254443	100 %	0 %	0 %	0 %	337283805
4518	NC_015680	AG	3	6	254452	254457	50 %	0 %	50 %	0 %	337283805
4519	NC_015680	TCGC	2	8	254468	254475	0 %	25 %	25 %	50 %	337283805
4520	NC_015680	CTG	2	6	254605	254610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283806
4521	NC_015680	TC	3	6	254618	254623	0 %	50 %	0 %	50 %	337283806
4522	NC_015680	TCG	2	6	254661	254666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283806
4523	NC_015680	CTC	2	6	254687	254692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283806
4524	NC_015680	CGGG	2	8	254731	254738	0 %	0 %	75 %	25 %	337283806
4525	NC_015680	GAA	2	6	254744	254749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283806
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4527	NC_015680	CGC	2	6	254857	254862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283806
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4529	NC_015680	TGGC	2	8	255066	255073	0 %	25 %	50 %	25 %	337283806
4530	NC_015680	GAG	2	6	255164	255169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283806
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4532	NC_015680	TCC	2	6	255180	255185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283806
4533	NC_015680	TAG	2	6	255205	255210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283806
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4535	NC_015680	CT	3	6	255293	255298	0 %	50 %	0 %	50 %	337283806
4536	NC_015680	AGGC	2	8	255325	255332	25 %	0 %	50 %	25 %	337283806
4537	NC_015680	AGGC	2	8	255352	255359	25 %	0 %	50 %	25 %	337283806
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4541	NC_015680	TCCT	2	8	255543	255550	0 %	50 %	0 %	50 %	337283806
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4545	NC_015680	CGT	2	6	255727	255732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283807
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4548	NC_015680	CGA	2	6	255834	255839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283807
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4551	NC_015680	TA	3	6	255914	255919	50 %	50 %	0 %	0 %	337283807
4552	NC_015680	CAG	2	6	256087	256092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283808
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4554	NC_015680	CGG	2	6	256194	256199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283808
4555	NC_015680	CGA	2	6	256352	256357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283808
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4557	NC_015680	TCTGCC	2	12	256571	256582	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	337283808
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4559	NC_015680	CATTT	2	10	256786	256795	20 %	60 %	0 %	20 %	337283808
4560	NC_015680	CCT	2	6	256817	256822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283808
4561	NC_015680	TCC	2	6	256874	256879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283808
4562	NC_015680	CGT	2	6	256881	256886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283808
4563	NC_015680	CTAT	2	8	256933	256940	25 %	50 %	0 %	25 %	337283808
4564	NC_015680	TGA	2	6	256985	256990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283808
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4570	NC_015680	CGA	2	6	257365	257370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283809
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4573	NC_015680	GAC	2	6	257528	257533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283809
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4589	NC_015680	GAC	2	6	258288	258293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283810
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4593	NC_015680	CCA	2	6	258462	258467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283810
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4600	NC_015680	AAG	2	6	258934	258939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283810
4601	NC_015680	GGGAG	2	10	259020	259029	20 %	0 %	80 %	0 %	337283810
4602	NC_015680	TTC	2	6	259059	259064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283810
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4604	NC_015680	TCT	2	6	259163	259168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283810
4605	NC_015680	TCC	2	6	259174	259179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283810
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4609	NC_015680	CGCC	2	8	259689	259696	0 %	0 %	25 %	75 %	337283811
4610	NC_015680	GAA	2	6	259720	259725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283811
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4622	NC_015680	TCC	2	6	260163	260168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283811
4623	NC_015680	CAT	2	6	260270	260275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283812
4624	NC_015680	CCT	2	6	260295	260300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283812
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4726	NC_015680	CT	3	6	266115	266120	0 %	50 %	0 %	50 %	337283816
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4860	NC_015680	GA	3	6	275112	275117	50 %	0 %	50 %	0 %	337283831
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4866	NC_015680	CGA	2	6	275249	275254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283831
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4983	NC_015680	TCCCT	2	10	281012	281021	0 %	40 %	0 %	60 %	337283837
4984	NC_015680	GA	3	6	281093	281098	50 %	0 %	50 %	0 %	337283837
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4986	NC_015680	CTT	2	6	281131	281136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283837
4987	NC_015680	CT	3	6	281138	281143	0 %	50 %	0 %	50 %	337283837
4988	NC_015680	TTA	2	6	281187	281192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283837
4989	NC_015680	GTG	2	6	281267	281272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283837
4990	NC_015680	GA	3	6	281287	281292	50 %	0 %	50 %	0 %	337283837
4991	NC_015680	AACG	2	8	281353	281360	50 %	0 %	25 %	25 %	337283837
4992	NC_015680	GGGA	2	8	281405	281412	25 %	0 %	75 %	0 %	337283837
4993	NC_015680	TGT	2	6	281428	281433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283837
4994	NC_015680	GAC	2	6	281491	281496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283837
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4999	NC_015680	CG	3	6	282008	282013	0 %	0 %	50 %	50 %	337283838
5000	NC_015680	ACC	3	9	282028	282036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283838

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