MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus sp. NA2 chromosome

Total Repeats: 33318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015474	AAG	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157645
2	NC_015474	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
3	NC_015474	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157645
4	NC_015474	GGA	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157645
5	NC_015474	GA	3	6	1604	1609	50 %	0 %	50 %	0 %	332157645
6	NC_015474	GAT	2	6	1632	1637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157645
7	NC_015474	ATA	2	6	1714	1719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
8	NC_015474	TAA	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
9	NC_015474	GATA	2	8	1863	1870	50 %	25 %	25 %	0 %	332157645
10	NC_015474	GTT	2	6	1873	1878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157645
11	NC_015474	TCT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157645
12	NC_015474	CCA	2	6	1984	1989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157645
13	NC_015474	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157645
14	NC_015474	GAA	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157645
15	NC_015474	GGA	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157645
16	NC_015474	GGA	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157645
17	NC_015474	TCAA	2	8	2343	2350	50 %	25 %	0 %	25 %	332157645
18	NC_015474	GTT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157645
19	NC_015474	AAT	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
20	NC_015474	AAG	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
21	NC_015474	TCA	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157646
22	NC_015474	AAG	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
23	NC_015474	TGGA	2	8	2581	2588	25 %	25 %	50 %	0 %	332157646
24	NC_015474	GAA	2	6	2608	2613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
25	NC_015474	CTT	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157646
26	NC_015474	TA	3	6	2747	2752	50 %	50 %	0 %	0 %	332157646
27	NC_015474	TCC	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157646
28	NC_015474	GTA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157646
29	NC_015474	TCT	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157646
30	NC_015474	AAT	2	6	2913	2918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157646
31	NC_015474	GGA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157646
32	NC_015474	TAA	2	6	2996	3001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157646
33	NC_015474	TAC	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157646
34	NC_015474	CAGA	2	8	3071	3078	50 %	0 %	25 %	25 %	332157646
35	NC_015474	CATT	2	8	3086	3093	25 %	50 %	0 %	25 %	332157646
36	NC_015474	AGA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
37	NC_015474	TGCAT	2	10	3135	3144	20 %	40 %	20 %	20 %	332157646
38	NC_015474	GA	4	8	3145	3152	50 %	0 %	50 %	0 %	332157646
39	NC_015474	CTC	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157646
40	NC_015474	TGG	2	6	3205	3210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157646
41	NC_015474	GA	4	8	3250	3257	50 %	0 %	50 %	0 %	332157646
42	NC_015474	GCT	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157646
43	NC_015474	CTAC	2	8	3292	3299	25 %	25 %	0 %	50 %	332157646
44	NC_015474	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157646
45	NC_015474	ACG	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157646
46	NC_015474	TGG	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157646
47	NC_015474	TAC	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157646
48	NC_015474	CCT	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157646
49	NC_015474	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
50	NC_015474	AAG	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
51	NC_015474	AGG	2	6	3623	3628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157646
52	NC_015474	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157647
53	NC_015474	TAG	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157647
54	NC_015474	AG	3	6	3857	3862	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
55	NC_015474	AGGA	2	8	4035	4042	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
56	NC_015474	AAGG	2	8	4045	4052	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
57	NC_015474	GTCC	2	8	4069	4076	0 %	25 %	25 %	50 %	332157647
58	NC_015474	AGA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157647
59	NC_015474	AG	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
60	NC_015474	AAT	2	6	4169	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157647
61	NC_015474	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157647
62	NC_015474	ACT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157647
63	NC_015474	GA	3	6	4250	4255	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
64	NC_015474	CAG	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157647
65	NC_015474	CTC	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157647
66	NC_015474	AG	3	6	4453	4458	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
67	NC_015474	AATC	2	8	4492	4499	50 %	25 %	0 %	25 %	332157647
68	NC_015474	TCCA	2	8	4518	4525	25 %	25 %	0 %	50 %	332157647
69	NC_015474	GCAA	2	8	4551	4558	50 %	0 %	25 %	25 %	332157647
70	NC_015474	GAAA	2	8	4573	4580	75 %	0 %	25 %	0 %	332157647
71	NC_015474	GTC	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157648
72	NC_015474	AAG	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
73	NC_015474	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157648
74	NC_015474	AAG	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
75	NC_015474	TTG	2	6	4766	4771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157648
76	NC_015474	ACA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157648
77	NC_015474	ATA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157648
78	NC_015474	GAA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
79	NC_015474	CTC	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157648
80	NC_015474	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157648
81	NC_015474	GAT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157648
82	NC_015474	GGT	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157648
83	NC_015474	CAGAGA	2	12	5101	5112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332157648
84	NC_015474	CTAG	2	8	5119	5126	25 %	25 %	25 %	25 %	332157648
85	NC_015474	AC	3	6	5210	5215	50 %	0 %	0 %	50 %	332157648
86	NC_015474	GTT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157648
87	NC_015474	CTG	2	6	5339	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157648
88	NC_015474	CAATTC	2	12	5396	5407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157648
89	NC_015474	AG	3	6	5425	5430	50 %	0 %	50 %	0 %	332157648
90	NC_015474	GAA	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
91	NC_015474	ACC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157648
92	NC_015474	CCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157648
93	NC_015474	TCCA	2	8	5501	5508	25 %	25 %	0 %	50 %	332157648
94	NC_015474	AAG	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
95	NC_015474	ACC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157648
96	NC_015474	CTG	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157648
97	NC_015474	ATA	2	6	5703	5708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157649
98	NC_015474	GAG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157649
99	NC_015474	AT	3	6	5814	5819	50 %	50 %	0 %	0 %	332157649
100	NC_015474	GAG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157649
101	NC_015474	TGG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157649
102	NC_015474	CAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157649
103	NC_015474	GAAA	2	8	6146	6153	75 %	0 %	25 %	0 %	332157650
104	NC_015474	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
105	NC_015474	TC	3	6	6218	6223	0 %	50 %	0 %	50 %	332157650
106	NC_015474	AG	3	6	6235	6240	50 %	0 %	50 %	0 %	332157650
107	NC_015474	CTC	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157650
108	NC_015474	ATT	2	6	6293	6298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157650
109	NC_015474	AAG	2	6	6372	6377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
110	NC_015474	GAGAA	3	15	6387	6401	60 %	0 %	40 %	0 %	332157650
111	NC_015474	AGA	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
112	NC_015474	CTAG	2	8	6438	6445	25 %	25 %	25 %	25 %	332157650
113	NC_015474	TTA	2	6	6525	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157650
114	NC_015474	AGC	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157650
115	NC_015474	GCCA	2	8	6621	6628	25 %	0 %	25 %	50 %	332157650
116	NC_015474	GAAAAA	2	12	6688	6699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332157650
117	NC_015474	TAA	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157650
118	NC_015474	GGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157650
119	NC_015474	GAA	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
120	NC_015474	TTC	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157650
121	NC_015474	TCC	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157650
122	NC_015474	TGA	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157650
123	NC_015474	GAA	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
124	NC_015474	GAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
125	NC_015474	TGT	2	6	7155	7160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157651
126	NC_015474	ATT	2	6	7184	7189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157651
127	NC_015474	ATT	2	6	7238	7243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157651
128	NC_015474	TAG	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157651
129	NC_015474	ATT	3	9	7367	7375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157651
130	NC_015474	CTTTA	2	10	7429	7438	20 %	60 %	0 %	20 %	332157651
131	NC_015474	T	6	6	7510	7515	0 %	100 %	0 %	0 %	332157651
132	NC_015474	CCTT	2	8	7571	7578	0 %	50 %	0 %	50 %	332157651
133	NC_015474	GA	3	6	7620	7625	50 %	0 %	50 %	0 %	332157651
134	NC_015474	ATGA	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	332157651
135	NC_015474	TACCT	2	10	7738	7747	20 %	40 %	0 %	40 %	332157651
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137	NC_015474	AACT	2	8	7963	7970	50 %	25 %	0 %	25 %	332157651
138	NC_015474	TTTTA	2	10	8023	8032	20 %	80 %	0 %	0 %	332157651
139	NC_015474	TAAG	2	8	8043	8050	50 %	25 %	25 %	0 %	332157651
140	NC_015474	AACT	2	8	8059	8066	50 %	25 %	0 %	25 %	332157651
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142	NC_015474	TCC	2	6	8078	8083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157651
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152	NC_015474	CT	3	6	8720	8725	0 %	50 %	0 %	50 %	332157653
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254	NC_015474	TCAGC	2	10	14417	14426	20 %	20 %	20 %	40 %	332157661
255	NC_015474	TGA	2	6	14429	14434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157661
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260	NC_015474	AG	3	6	14626	14631	50 %	0 %	50 %	0 %	332157662
261	NC_015474	GAA	2	6	14729	14734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157662
262	NC_015474	TGA	2	6	14747	14752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157662
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264	NC_015474	GGA	2	6	14784	14789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157662
265	NC_015474	GGA	2	6	14899	14904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157662
266	NC_015474	TGA	2	6	14919	14924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157662
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269	NC_015474	TAA	2	6	15104	15109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157663
270	NC_015474	AGC	2	6	15162	15167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157663
271	NC_015474	TTC	2	6	15190	15195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157663
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282	NC_015474	TAA	2	6	15810	15815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157665
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286	NC_015474	AT	3	6	16107	16112	50 %	50 %	0 %	0 %	332157665
287	NC_015474	ACT	2	6	16261	16266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157665
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353	NC_015474	TAT	2	6	19981	19986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157670
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380	NC_015474	A	6	6	21275	21280	100 %	0 %	0 %	0 %	332157671
381	NC_015474	ATA	2	6	21383	21388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157672
382	NC_015474	CAATA	2	10	21414	21423	60 %	20 %	0 %	20 %	332157672
383	NC_015474	AGG	3	9	21469	21477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157672
384	NC_015474	ATC	2	6	21522	21527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157672
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388	NC_015474	TGA	2	6	21652	21657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157672
389	NC_015474	GAG	2	6	21674	21679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157672
390	NC_015474	TTAGG	2	10	21693	21702	20 %	40 %	40 %	0 %	332157672
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393	NC_015474	AT	3	6	21777	21782	50 %	50 %	0 %	0 %	332157672
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