MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus sp. NA2 chromosome

Total Repeats: 33318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015474	TATGT	2	10	26983	26992	20 %	60 %	20 %	0 %	332157676
502	NC_015474	TCT	2	6	27090	27095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157676
503	NC_015474	ACC	2	6	27099	27104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157676
504	NC_015474	ATT	2	6	27160	27165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157676
505	NC_015474	CT	4	8	27166	27173	0 %	50 %	0 %	50 %	332157676
506	NC_015474	GCC	2	6	27181	27186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332157676
507	NC_015474	CTG	2	6	27194	27199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157676
508	NC_015474	CT	3	6	27293	27298	0 %	50 %	0 %	50 %	332157676
509	NC_015474	ATT	2	6	27316	27321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157676
510	NC_015474	TCA	2	6	27322	27327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157676
511	NC_015474	TCCA	2	8	27483	27490	25 %	25 %	0 %	50 %	332157676
512	NC_015474	TC	3	6	27589	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	332157676
513	NC_015474	ATA	2	6	27625	27630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157676
514	NC_015474	TG	3	6	27725	27730	0 %	50 %	50 %	0 %	332157677
515	NC_015474	CT	3	6	27742	27747	0 %	50 %	0 %	50 %	332157677
516	NC_015474	AAG	2	6	27805	27810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157677
517	NC_015474	TA	3	6	27847	27852	50 %	50 %	0 %	0 %	332157677
518	NC_015474	TC	3	6	27959	27964	0 %	50 %	0 %	50 %	332157677
519	NC_015474	CTG	2	6	27983	27988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157677
520	NC_015474	ATT	2	6	28011	28016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157677
521	NC_015474	TC	3	6	28077	28082	0 %	50 %	0 %	50 %	332157677
522	NC_015474	ACCTT	2	10	28090	28099	20 %	40 %	0 %	40 %	332157677
523	NC_015474	TCC	2	6	28138	28143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157677
524	NC_015474	CCT	2	6	28168	28173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157678
525	NC_015474	TTCT	2	8	28251	28258	0 %	75 %	0 %	25 %	332157678
526	NC_015474	TCCA	2	8	28288	28295	25 %	25 %	0 %	50 %	332157678
527	NC_015474	TA	3	6	28332	28337	50 %	50 %	0 %	0 %	332157678
528	NC_015474	CCAT	2	8	28338	28345	25 %	25 %	0 %	50 %	332157678
529	NC_015474	TTA	3	9	28507	28515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157678
530	NC_015474	AGG	2	6	28631	28636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157678
531	NC_015474	CCA	2	6	28647	28652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157678
532	NC_015474	CAA	2	6	28669	28674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157678
533	NC_015474	CTT	2	6	28685	28690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157678
534	NC_015474	TAAA	2	8	28702	28709	75 %	25 %	0 %	0 %	332157678
535	NC_015474	AAT	2	6	28716	28721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157678
536	NC_015474	GCAA	2	8	28858	28865	50 %	0 %	25 %	25 %	332157679
537	NC_015474	CAC	2	6	28893	28898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157679
538	NC_015474	GTT	2	6	28936	28941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157679
539	NC_015474	GAA	2	6	28971	28976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157679
540	NC_015474	ACC	2	6	29034	29039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157679
541	NC_015474	ATA	2	6	29223	29228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157679
542	NC_015474	TTA	2	6	29240	29245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157679
543	NC_015474	GCAA	2	8	29272	29279	50 %	0 %	25 %	25 %	332157679
544	NC_015474	CT	3	6	29291	29296	0 %	50 %	0 %	50 %	332157679
545	NC_015474	ATT	2	6	29344	29349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157679
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547	NC_015474	GT	3	6	29531	29536	0 %	50 %	50 %	0 %	332157679
548	NC_015474	TAT	2	6	29538	29543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157679
549	NC_015474	TA	3	6	29551	29556	50 %	50 %	0 %	0 %	332157679
550	NC_015474	GGA	2	6	29557	29562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157679
551	NC_015474	TCC	2	6	29567	29572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157679
552	NC_015474	CATGAA	2	12	29607	29618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332157679
553	NC_015474	ACC	2	6	29662	29667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157679
554	NC_015474	CCT	2	6	29849	29854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
555	NC_015474	GAA	2	6	29865	29870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
556	NC_015474	CTGA	2	8	29915	29922	25 %	25 %	25 %	25 %	332157680
557	NC_015474	AACC	2	8	29997	30004	50 %	0 %	0 %	50 %	332157680
558	NC_015474	TCC	2	6	30063	30068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
559	NC_015474	CAA	2	6	30107	30112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157680
560	NC_015474	GC	3	6	30143	30148	0 %	0 %	50 %	50 %	332157680
561	NC_015474	ACCAA	2	10	30219	30228	60 %	0 %	0 %	40 %	332157680
562	NC_015474	TTA	2	6	30245	30250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157680
563	NC_015474	GAA	2	6	30276	30281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
564	NC_015474	GGA	2	6	30361	30366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157680
565	NC_015474	TCT	2	6	30419	30424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157680
566	NC_015474	GAA	2	6	30492	30497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157680
567	NC_015474	AG	3	6	30509	30514	50 %	0 %	50 %	0 %	332157680
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569	NC_015474	CCAA	2	8	30574	30581	50 %	0 %	0 %	50 %	332157680
570	NC_015474	GCA	2	6	30643	30648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157680
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572	NC_015474	TA	3	6	30693	30698	50 %	50 %	0 %	0 %	332157680
573	NC_015474	AG	3	6	30704	30709	50 %	0 %	50 %	0 %	332157680
574	NC_015474	CTC	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157680
575	NC_015474	GCTG	2	8	30946	30953	0 %	25 %	50 %	25 %	332157680
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580	NC_015474	AT	3	6	31032	31037	50 %	50 %	0 %	0 %	332157680
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582	NC_015474	CAT	2	6	31125	31130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157680
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584	NC_015474	TCA	2	6	31217	31222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157680
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591	NC_015474	TTA	2	6	31469	31474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157680
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594	NC_015474	AGCC	2	8	31598	31605	25 %	0 %	25 %	50 %	332157681
595	NC_015474	TAT	2	6	31650	31655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157681
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598	NC_015474	TAT	2	6	31827	31832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157681
599	NC_015474	TTTC	2	8	31920	31927	0 %	75 %	0 %	25 %	332157681
600	NC_015474	C	6	6	31957	31962	0 %	0 %	0 %	100 %	332157681
601	NC_015474	ATC	2	6	32116	32121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157681
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609	NC_015474	CCA	2	6	32521	32526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157681
610	NC_015474	CAG	2	6	32552	32557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157681
611	NC_015474	TTA	2	6	32569	32574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157681
612	NC_015474	ATC	2	6	32650	32655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157681
613	NC_015474	AGG	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157681
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620	NC_015474	TCT	2	6	33042	33047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157682
621	NC_015474	AGT	2	6	33104	33109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157682
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625	NC_015474	TAT	2	6	33430	33435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157683
626	NC_015474	GAAT	2	8	33450	33457	50 %	25 %	25 %	0 %	332157683
627	NC_015474	CCT	2	6	33683	33688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157683
628	NC_015474	GTT	2	6	33761	33766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157683
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630	NC_015474	TC	4	8	33796	33803	0 %	50 %	0 %	50 %	332157683
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