MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 127014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015379	GCA	2	6	149	154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
2	NC_015379	CTGC	2	8	180	187	0 %	25 %	25 %	50 %	330806658
3	NC_015379	CAA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806658
4	NC_015379	CGA	2	6	236	241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
5	NC_015379	CGA	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
6	NC_015379	ATGGCA	2	12	328	339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330806658
7	NC_015379	TTA	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330806658
8	NC_015379	GCA	2	6	367	372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
9	NC_015379	CGC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806658
10	NC_015379	GCC	2	6	414	419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806658
11	NC_015379	CAG	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
12	NC_015379	AAC	2	6	459	464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806658
13	NC_015379	TGC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806658
14	NC_015379	CGCC	2	8	484	491	0 %	0 %	25 %	75 %	330806658
15	NC_015379	ACGCA	2	10	500	509	40 %	0 %	20 %	40 %	330806658
16	NC_015379	GAA	2	6	531	536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806658
17	NC_015379	CAG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
18	NC_015379	TCG	2	6	676	681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806658
19	NC_015379	CCAA	2	8	691	698	50 %	0 %	0 %	50 %	330806658
20	NC_015379	CG	3	6	705	710	0 %	0 %	50 %	50 %	330806658
21	NC_015379	TGG	2	6	767	772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806658
22	NC_015379	AGA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806658
23	NC_015379	CGA	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
24	NC_015379	TTC	2	6	969	974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330806658
25	NC_015379	GCA	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
26	NC_015379	GAAA	2	8	1070	1077	75 %	0 %	25 %	0 %	330806658
27	NC_015379	GAA	2	6	1089	1094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806658
28	NC_015379	GCC	2	6	1139	1144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806658
29	NC_015379	TGA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806658
30	NC_015379	ACG	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806658
31	NC_015379	TTC	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330806658
32	NC_015379	CGTG	2	8	1250	1257	0 %	25 %	50 %	25 %	330806658
33	NC_015379	TAC	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330806658
34	NC_015379	CTG	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806658
35	NC_015379	CGTTCG	2	12	1449	1460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806658
36	NC_015379	ACCA	2	8	1506	1513	50 %	0 %	0 %	50 %	330806658
37	NC_015379	ACCAC	2	10	1552	1561	40 %	0 %	0 %	60 %	330806658
38	NC_015379	TGC	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806658
39	NC_015379	CTG	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806658
40	NC_015379	TGA	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806658
41	NC_015379	CGT	2	6	1754	1759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806659
42	NC_015379	CGC	2	6	1764	1769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806659
43	NC_015379	TGC	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806659
44	NC_015379	GGTC	2	8	1856	1863	0 %	25 %	50 %	25 %	330806659
45	NC_015379	GAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806659
46	NC_015379	GC	3	6	1911	1916	0 %	0 %	50 %	50 %	330806659
47	NC_015379	ACG	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806659
48	NC_015379	GCCA	2	8	2030	2037	25 %	0 %	25 %	50 %	330806659
49	NC_015379	GAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806659
50	NC_015379	CAG	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806659
51	NC_015379	TTA	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330806659
52	NC_015379	CCA	2	6	2270	2275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330806659
53	NC_015379	CTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806659
54	NC_015379	CAC	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330806659
55	NC_015379	CCA	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330806659
56	NC_015379	TGC	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806659
57	NC_015379	TC	3	6	2516	2521	0 %	50 %	0 %	50 %	330806659
58	NC_015379	AAC	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806659
59	NC_015379	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806659
60	NC_015379	GAA	3	9	2607	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806659
61	NC_015379	CGG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806659
62	NC_015379	TGA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806659
63	NC_015379	CAG	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806659
64	NC_015379	ACG	2	6	2761	2766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806659
65	NC_015379	TCCCCC	2	12	2879	2890	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	330806660
66	NC_015379	CGTT	2	8	2969	2976	0 %	50 %	25 %	25 %	330806660
67	NC_015379	GCA	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806660
68	NC_015379	GGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806660
69	NC_015379	TCG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806660
70	NC_015379	GAC	2	6	3268	3273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806660
71	NC_015379	GCCAG	2	10	3372	3381	20 %	0 %	40 %	40 %	330806660
72	NC_015379	CCG	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806660
73	NC_015379	GAGC	2	8	3448	3455	25 %	0 %	50 %	25 %	330806660
74	NC_015379	TGGC	2	8	3528	3535	0 %	25 %	50 %	25 %	330806660
75	NC_015379	CAG	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806660
76	NC_015379	CGC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806660
77	NC_015379	GCA	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806660
78	NC_015379	TGG	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806660
79	NC_015379	TG	3	6	3660	3665	0 %	50 %	50 %	0 %	330806660
80	NC_015379	CCG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806660
81	NC_015379	TGG	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806660
82	NC_015379	CCG	2	6	3763	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806660
83	NC_015379	CG	3	6	3767	3772	0 %	0 %	50 %	50 %	330806660
84	NC_015379	TCA	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330806660
85	NC_015379	ATT	2	6	3832	3837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330806660
86	NC_015379	CGA	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806661
87	NC_015379	CAC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330806661
88	NC_015379	GGT	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806661
89	NC_015379	CGA	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806661
90	NC_015379	CGA	2	6	4104	4109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806661
91	NC_015379	CAT	3	9	4116	4124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330806661
92	NC_015379	CCG	3	9	4202	4210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806661
93	NC_015379	TCA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330806661
94	NC_015379	TCC	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330806661
95	NC_015379	CGA	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806661
96	NC_015379	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806661
97	NC_015379	AAC	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806661
98	NC_015379	CGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806661
99	NC_015379	TCCT	2	8	4516	4523	0 %	50 %	0 %	50 %	330806661
100	NC_015379	GGC	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806661
101	NC_015379	TGCG	2	8	4598	4605	0 %	25 %	50 %	25 %	330806661
102	NC_015379	CAA	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806661
103	NC_015379	TGT	2	6	4730	4735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330806661
104	NC_015379	CAA	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806661
105	NC_015379	CGG	2	6	4764	4769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806661
106	NC_015379	CACC	2	8	4770	4777	25 %	0 %	0 %	75 %	330806661
107	NC_015379	TGG	2	6	4778	4783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806661
108	NC_015379	AAC	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806661
109	NC_015379	GAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806661
110	NC_015379	CCA	2	6	4859	4864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330806661
111	NC_015379	CTG	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806661
112	NC_015379	CGAA	2	8	5027	5034	50 %	0 %	25 %	25 %	330806661
113	NC_015379	TGG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806661
114	NC_015379	GAT	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806661
115	NC_015379	CGC	2	6	5064	5069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806661
116	NC_015379	GCG	2	6	5083	5088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806661
117	NC_015379	CGC	2	6	5110	5115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806661
118	NC_015379	GC	3	6	5120	5125	0 %	0 %	50 %	50 %	330806661
119	NC_015379	CCCTG	2	10	5175	5184	0 %	20 %	20 %	60 %	330806661
120	NC_015379	TGG	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806661
121	NC_015379	CTG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806661
122	NC_015379	CCG	2	6	5244	5249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806661
123	NC_015379	GC	3	6	5299	5304	0 %	0 %	50 %	50 %	330806661
124	NC_015379	GAT	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806661
125	NC_015379	TCC	2	6	5320	5325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330806661
126	NC_015379	ACA	2	6	5381	5386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330806661
127	NC_015379	CAT	4	12	5409	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330806661
128	NC_015379	GCT	3	9	5457	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806661
129	NC_015379	TTC	3	9	5470	5478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330806661
130	NC_015379	CTACAT	2	12	5508	5519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330806661
131	NC_015379	GCC	2	6	5526	5531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330806661
132	NC_015379	GCAA	2	8	5552	5559	50 %	0 %	25 %	25 %	330806661
133	NC_015379	GAC	3	9	5575	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806661
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136	NC_015379	AGCC	2	8	5877	5884	25 %	0 %	25 %	50 %	330806661
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142	NC_015379	GCT	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330806661
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149	NC_015379	TGAC	2	8	6739	6746	25 %	25 %	25 %	25 %	330806662
150	NC_015379	TCGG	2	8	6834	6841	0 %	25 %	50 %	25 %	330806662
151	NC_015379	GAT	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806662
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153	NC_015379	GAT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806662
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244	NC_015379	GTG	2	6	11848	11853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806666
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247	NC_015379	CAC	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330806667
248	NC_015379	TGA	2	6	12243	12248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330806667
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250	NC_015379	TG	3	6	12297	12302	0 %	50 %	50 %	0 %	330806667
251	NC_015379	GCA	2	6	12309	12314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330806667
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255	NC_015379	CGAT	2	8	12482	12489	25 %	25 %	25 %	25 %	330806667
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257	NC_015379	GAA	2	6	12523	12528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330806667
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259	NC_015379	GA	3	6	12584	12589	50 %	0 %	50 %	0 %	330806667
260	NC_015379	TGG	2	6	12611	12616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330806667
261	NC_015379	TTGGA	2	10	12617	12626	20 %	40 %	40 %	0 %	330806667
262	NC_015379	GC	3	6	12705	12710	0 %	0 %	50 %	50 %	330806667
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388	NC_015379	GGC	2	6	18934	18939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330806673
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