MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 127014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_015379	TGA	2	6	6639594	6639599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812569
123002	NC_015379	GCAA	2	8	6639732	6639739	50 %	0 %	25 %	25 %	330812569
123003	NC_015379	CTG	2	6	6639764	6639769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812569
123004	NC_015379	CAG	2	6	6639838	6639843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812569
123005	NC_015379	ATC	2	6	6639857	6639862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812569
123006	NC_015379	ATC	2	6	6639908	6639913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812569
123007	NC_015379	CAA	2	6	6640216	6640221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812570
123008	NC_015379	AAC	2	6	6640229	6640234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812570
123009	NC_015379	TGT	2	6	6640479	6640484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812570
123010	NC_015379	CGG	2	6	6640527	6640532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812570
123011	NC_015379	CAA	2	6	6640582	6640587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812570
123012	NC_015379	CAC	2	6	6640645	6640650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812570
123013	NC_015379	GCA	3	9	6640740	6640748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123014	NC_015379	CGCC	2	8	6640757	6640764	0 %	0 %	25 %	75 %	330812570
123015	NC_015379	GCCC	2	8	6640800	6640807	0 %	0 %	25 %	75 %	330812570
123016	NC_015379	CGC	2	6	6640809	6640814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123017	NC_015379	CCCG	2	8	6640821	6640828	0 %	0 %	25 %	75 %	330812570
123018	NC_015379	TGA	2	6	6640884	6640889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812570
123019	NC_015379	GGC	2	6	6640980	6640985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812570
123020	NC_015379	GAA	2	6	6641032	6641037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812570
123021	NC_015379	CCG	2	6	6641039	6641044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123022	NC_015379	GCC	2	6	6641069	6641074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123023	NC_015379	TCG	2	6	6641075	6641080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123024	NC_015379	GAT	2	6	6641137	6641142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812570
123025	NC_015379	CCAGCA	2	12	6641154	6641165	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330812570
123026	NC_015379	AGC	2	6	6641312	6641317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123027	NC_015379	GCC	2	6	6641318	6641323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123028	NC_015379	GCCGAT	2	12	6641344	6641355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123029	NC_015379	CCG	2	6	6641366	6641371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123030	NC_015379	GAT	2	6	6641406	6641411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812570
123031	NC_015379	TCG	2	6	6641465	6641470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123032	NC_015379	AGG	2	6	6641549	6641554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812570
123033	NC_015379	GCC	2	6	6641567	6641572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123034	NC_015379	CGC	2	6	6641573	6641578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812570
123035	NC_015379	ATC	2	6	6641585	6641590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812570
123036	NC_015379	GCA	2	6	6641592	6641597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123037	NC_015379	GCTCAG	2	12	6641623	6641634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123038	NC_015379	TCGC	2	8	6641654	6641661	0 %	25 %	25 %	50 %	330812570
123039	NC_015379	CCA	2	6	6641673	6641678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812570
123040	NC_015379	CGG	2	6	6641688	6641693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812570
123041	NC_015379	GGC	2	6	6641707	6641712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812570
123042	NC_015379	TGC	2	6	6641724	6641729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123043	NC_015379	CTG	2	6	6641740	6641745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812570
123044	NC_015379	GAA	2	6	6641782	6641787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812570
123045	NC_015379	GGC	2	6	6641807	6641812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812570
123046	NC_015379	GTC	2	6	6642281	6642286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812571
123047	NC_015379	GGC	2	6	6642315	6642320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812571
123048	NC_015379	GCC	2	6	6642365	6642370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812571
123049	NC_015379	GC	3	6	6642381	6642386	0 %	0 %	50 %	50 %	330812571
123050	NC_015379	GCC	2	6	6642396	6642401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812571
123051	NC_015379	CAG	2	6	6642425	6642430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812571
123052	NC_015379	CTT	2	6	6642479	6642484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812571
123053	NC_015379	CAC	2	6	6642487	6642492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812571
123054	NC_015379	CGC	2	6	6642496	6642501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812571
123055	NC_015379	TCG	2	6	6642585	6642590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812571
123056	NC_015379	CGC	2	6	6642596	6642601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812571
123057	NC_015379	ACTG	2	8	6642608	6642615	25 %	25 %	25 %	25 %	330812571
123058	NC_015379	CAGC	2	8	6642643	6642650	25 %	0 %	25 %	50 %	330812571
123059	NC_015379	TAG	2	6	6642930	6642935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812572
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123063	NC_015379	TGCCC	2	10	6643100	6643109	0 %	20 %	20 %	60 %	330812572
123064	NC_015379	TTC	2	6	6643196	6643201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812572
123065	NC_015379	TTC	2	6	6643278	6643283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812572
123066	NC_015379	ATC	2	6	6643287	6643292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812572
123067	NC_015379	CG	3	6	6643316	6643321	0 %	0 %	50 %	50 %	330812572
123068	NC_015379	CGC	2	6	6643547	6643552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812573
123069	NC_015379	CGG	2	6	6643584	6643589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812573
123070	NC_015379	CGAGC	2	10	6643639	6643648	20 %	0 %	40 %	40 %	330812573
123071	NC_015379	AC	3	6	6643676	6643681	50 %	0 %	0 %	50 %	330812573
123072	NC_015379	GCTGC	2	10	6643714	6643723	0 %	20 %	40 %	40 %	330812573
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123081	NC_015379	TCA	2	6	6644124	6644129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812573
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123085	NC_015379	CAC	2	6	6644296	6644301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812573
123086	NC_015379	CGA	2	6	6644319	6644324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812573
123087	NC_015379	A	6	6	6644348	6644353	100 %	0 %	0 %	0 %	330812573
123088	NC_015379	CAG	3	9	6644359	6644367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812573
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123092	NC_015379	GATC	2	8	6644565	6644572	25 %	25 %	25 %	25 %	330812573
123093	NC_015379	ACG	2	6	6644706	6644711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812574
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123096	NC_015379	GTC	2	6	6644951	6644956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812574
123097	NC_015379	TGC	2	6	6645065	6645070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812575
123098	NC_015379	TTC	2	6	6645115	6645120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812575
123099	NC_015379	CGC	2	6	6645287	6645292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812575
123100	NC_015379	ATC	2	6	6645316	6645321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812575
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123102	NC_015379	TCG	2	6	6645433	6645438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812575
123103	NC_015379	CGG	2	6	6645581	6645586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812575
123104	NC_015379	CG	3	6	6645810	6645815	0 %	0 %	50 %	50 %	330812575
123105	NC_015379	GGT	2	6	6645906	6645911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812575
123106	NC_015379	GC	3	6	6645949	6645954	0 %	0 %	50 %	50 %	330812575
123107	NC_015379	TCG	2	6	6645958	6645963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812575
123108	NC_015379	TTG	2	6	6646006	6646011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812575
123109	NC_015379	GCA	2	6	6646040	6646045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812575
123110	NC_015379	GCG	2	6	6646097	6646102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812575
123111	NC_015379	GCA	2	6	6646112	6646117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812575
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123113	NC_015379	ATA	2	6	6646266	6646271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330812575
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123213	NC_015379	TCG	2	6	6651437	6651442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812581
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123223	NC_015379	CAGGC	2	10	6652315	6652324	20 %	0 %	40 %	40 %	330812581
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123226	NC_015379	TGG	2	6	6652399	6652404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812581
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