MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 127014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_015379	GCA	2	6	6562874	6562879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812492
121502	NC_015379	CGA	2	6	6562983	6562988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812493
121503	NC_015379	T	7	7	6563005	6563011	0 %	100 %	0 %	0 %	330812493
121504	NC_015379	TGA	2	6	6563022	6563027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812493
121505	NC_015379	GCC	2	6	6563039	6563044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812493
121506	NC_015379	GCC	2	6	6563109	6563114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812493
121507	NC_015379	CGA	2	6	6563176	6563181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812493
121508	NC_015379	TCA	2	6	6563193	6563198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812493
121509	NC_015379	GC	3	6	6563213	6563218	0 %	0 %	50 %	50 %	330812493
121510	NC_015379	AGGCCG	2	12	6563253	6563264	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330812493
121511	NC_015379	CGTG	2	8	6563269	6563276	0 %	25 %	50 %	25 %	330812493
121512	NC_015379	GCC	2	6	6563291	6563296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812493
121513	NC_015379	GCTC	2	8	6563335	6563342	0 %	25 %	25 %	50 %	330812493
121514	NC_015379	CAA	2	6	6563411	6563416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812493
121515	NC_015379	CGC	2	6	6563449	6563454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812493
121516	NC_015379	CGG	2	6	6563469	6563474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812493
121517	NC_015379	CGG	2	6	6563608	6563613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812493
121518	NC_015379	TGA	2	6	6563625	6563630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812493
121519	NC_015379	GC	3	6	6563705	6563710	0 %	0 %	50 %	50 %	330812493
121520	NC_015379	CTG	2	6	6563711	6563716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812493
121521	NC_015379	TCG	2	6	6563760	6563765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812493
121522	NC_015379	AAG	2	6	6563790	6563795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812493
121523	NC_015379	TGA	2	6	6563806	6563811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812493
121524	NC_015379	GGCC	2	8	6563925	6563932	0 %	0 %	50 %	50 %	330812493
121525	NC_015379	CGA	2	6	6563955	6563960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121526	NC_015379	CAG	2	6	6563998	6564003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121527	NC_015379	CTG	2	6	6564088	6564093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121528	NC_015379	GAA	2	6	6564111	6564116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812494
121529	NC_015379	TCGA	2	8	6564151	6564158	25 %	25 %	25 %	25 %	330812494
121530	NC_015379	CGAC	2	8	6564159	6564166	25 %	0 %	25 %	50 %	330812494
121531	NC_015379	CTT	2	6	6564261	6564266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812494
121532	NC_015379	AAC	2	6	6564302	6564307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812494
121533	NC_015379	TGC	2	6	6564320	6564325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121534	NC_015379	CGG	2	6	6564359	6564364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812494
121535	NC_015379	CGG	2	6	6564375	6564380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812494
121536	NC_015379	GC	3	6	6564407	6564412	0 %	0 %	50 %	50 %	330812494
121537	NC_015379	CTG	2	6	6564430	6564435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121538	NC_015379	CGA	2	6	6564441	6564446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121539	NC_015379	CAC	2	6	6564450	6564455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812494
121540	NC_015379	CGG	2	6	6564475	6564480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812494
121541	NC_015379	AGA	2	6	6564498	6564503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812494
121542	NC_015379	CTG	2	6	6564532	6564537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121543	NC_015379	C	7	7	6564720	6564726	0 %	0 %	0 %	100 %	330812494
121544	NC_015379	ACC	2	6	6564739	6564744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812494
121545	NC_015379	CCG	2	6	6564794	6564799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812494
121546	NC_015379	ACC	3	9	6564871	6564879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812494
121547	NC_015379	GCT	2	6	6564927	6564932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121548	NC_015379	GGGT	2	8	6564974	6564981	0 %	25 %	75 %	0 %	330812494
121549	NC_015379	ACG	2	6	6565066	6565071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121550	NC_015379	CGA	2	6	6565089	6565094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121551	NC_015379	GAT	2	6	6565255	6565260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812494
121552	NC_015379	TTTCC	2	10	6565308	6565317	0 %	60 %	0 %	40 %	330812494
121553	NC_015379	CGG	2	6	6565397	6565402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812494
121554	NC_015379	CCTG	2	8	6565451	6565458	0 %	25 %	25 %	50 %	330812494
121555	NC_015379	CAA	2	6	6565480	6565485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812494
121556	NC_015379	CGC	2	6	6565488	6565493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812494
121557	NC_015379	C	6	6	6565520	6565525	0 %	0 %	0 %	100 %	330812494
121558	NC_015379	GCT	2	6	6565587	6565592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121559	NC_015379	ATG	2	6	6565639	6565644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812494
121560	NC_015379	CTTCGG	2	12	6565650	6565661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121561	NC_015379	GAG	2	6	6565765	6565770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812494
121562	NC_015379	ATC	2	6	6565777	6565782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812494
121563	NC_015379	CGCGA	2	10	6565783	6565792	20 %	0 %	40 %	40 %	330812494
121564	NC_015379	C	6	6	6565845	6565850	0 %	0 %	0 %	100 %	330812494
121565	NC_015379	GCC	2	6	6565877	6565882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812494
121566	NC_015379	CTGG	2	8	6565899	6565906	0 %	25 %	50 %	25 %	330812494
121567	NC_015379	CGG	2	6	6565908	6565913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812494
121568	NC_015379	CAG	2	6	6565992	6565997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121569	NC_015379	ACGCC	2	10	6566180	6566189	20 %	0 %	20 %	60 %	330812494
121570	NC_015379	CTG	2	6	6566209	6566214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121571	NC_015379	CTG	2	6	6566260	6566265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121572	NC_015379	GCTG	2	8	6566279	6566286	0 %	25 %	50 %	25 %	330812494
121573	NC_015379	CCT	2	6	6566334	6566339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812494
121574	NC_015379	ACC	2	6	6566353	6566358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812494
121575	NC_015379	GCT	2	6	6566367	6566372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812494
121576	NC_015379	ATC	2	6	6566422	6566427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812494
121577	NC_015379	GTT	2	6	6566508	6566513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812494
121578	NC_015379	CCG	2	6	6566516	6566521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812494
121579	NC_015379	AGG	2	6	6566654	6566659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812494
121580	NC_015379	CTG	3	9	6566733	6566741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121581	NC_015379	GCCG	2	8	6566777	6566784	0 %	0 %	50 %	50 %	330812495
121582	NC_015379	TC	3	6	6566846	6566851	0 %	50 %	0 %	50 %	330812495
121583	NC_015379	CCG	2	6	6566877	6566882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812495
121584	NC_015379	GCCCT	2	10	6566901	6566910	0 %	20 %	20 %	60 %	330812495
121585	NC_015379	TA	3	6	6567066	6567071	50 %	50 %	0 %	0 %	330812495
121586	NC_015379	GAC	2	6	6567095	6567100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121587	NC_015379	CAA	2	6	6567212	6567217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812495
121588	NC_015379	CAT	2	6	6567233	6567238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812495
121589	NC_015379	GCT	2	6	6567254	6567259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121590	NC_015379	GCGCGA	2	12	6567260	6567271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330812495
121591	NC_015379	TGC	2	6	6567298	6567303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121592	NC_015379	CTG	2	6	6567348	6567353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121593	NC_015379	GTG	2	6	6567354	6567359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812495
121594	NC_015379	ATC	2	6	6567387	6567392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812495
121595	NC_015379	CTG	2	6	6567441	6567446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121596	NC_015379	CTCG	2	8	6567501	6567508	0 %	25 %	25 %	50 %	330812495
121597	NC_015379	CGC	2	6	6567514	6567519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812495
121598	NC_015379	TCA	2	6	6567544	6567549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812495
121599	NC_015379	TGC	2	6	6567556	6567561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121600	NC_015379	TGT	2	6	6567562	6567567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812495
121601	NC_015379	GCA	2	6	6567574	6567579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121602	NC_015379	GCG	2	6	6567657	6567662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812495
121603	NC_015379	CTG	2	6	6567705	6567710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812495
121604	NC_015379	GGC	2	6	6567716	6567721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812495
121605	NC_015379	GTT	2	6	6567865	6567870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812496
121606	NC_015379	AAC	2	6	6567872	6567877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812496
121607	NC_015379	TCG	2	6	6567905	6567910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812496
121608	NC_015379	TCA	2	6	6567912	6567917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812496
121609	NC_015379	CTG	2	6	6567919	6567924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812496
121610	NC_015379	GGT	2	6	6567985	6567990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812496
121611	NC_015379	CTG	2	6	6567991	6567996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812496
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