MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 127014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_015379	GCT	2	6	6481729	6481734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120002	NC_015379	TCA	2	6	6481740	6481745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812404
120003	NC_015379	GCG	2	6	6481746	6481751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812404
120004	NC_015379	GCAG	2	8	6481783	6481790	25 %	0 %	50 %	25 %	330812404
120005	NC_015379	CTG	2	6	6481820	6481825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120006	NC_015379	GCC	2	6	6481946	6481951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812404
120007	NC_015379	CTG	3	9	6481967	6481975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120008	NC_015379	TGC	2	6	6481977	6481982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120009	NC_015379	GCT	2	6	6482035	6482040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120010	NC_015379	GC	3	6	6482052	6482057	0 %	0 %	50 %	50 %	330812404
120011	NC_015379	CTG	3	9	6482069	6482077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120012	NC_015379	ACC	2	6	6482111	6482116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812404
120013	NC_015379	CGG	2	6	6482122	6482127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812404
120014	NC_015379	TCG	2	6	6482136	6482141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120015	NC_015379	GC	3	6	6482160	6482165	0 %	0 %	50 %	50 %	330812404
120016	NC_015379	GCCC	2	8	6482167	6482174	0 %	0 %	25 %	75 %	330812404
120017	NC_015379	GC	4	8	6482244	6482251	0 %	0 %	50 %	50 %	330812404
120018	NC_015379	GCTG	3	12	6482261	6482272	0 %	25 %	50 %	25 %	330812404
120019	NC_015379	TGC	2	6	6482280	6482285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120020	NC_015379	GCCTGG	2	12	6482307	6482318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330812404
120021	NC_015379	CTG	2	6	6482321	6482326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120022	NC_015379	CAG	2	6	6482416	6482421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120023	NC_015379	AATA	2	8	6482488	6482495	75 %	25 %	0 %	0 %	330812404
120024	NC_015379	CTG	2	6	6482507	6482512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120025	NC_015379	GAC	2	6	6482528	6482533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812404
120026	NC_015379	GCC	2	6	6482542	6482547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812404
120027	NC_015379	CTC	2	6	6482609	6482614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812404
120028	NC_015379	CCG	2	6	6482633	6482638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812404
120029	NC_015379	CAGCGC	2	12	6482716	6482727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330812404
120030	NC_015379	GCC	2	6	6482752	6482757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812404
120031	NC_015379	CAGTTG	2	12	6482810	6482821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330812404
120032	NC_015379	CTGG	2	8	6482848	6482855	0 %	25 %	50 %	25 %	330812404
120033	NC_015379	GCT	2	6	6482930	6482935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120034	NC_015379	CAC	2	6	6482987	6482992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812405
120035	NC_015379	GCT	2	6	6483035	6483040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120036	NC_015379	GGA	2	6	6483065	6483070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812405
120037	NC_015379	GC	3	6	6483135	6483140	0 %	0 %	50 %	50 %	330812405
120038	NC_015379	TGC	2	6	6483199	6483204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120039	NC_015379	GCT	2	6	6483311	6483316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120040	NC_015379	CAG	2	6	6483335	6483340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120041	NC_015379	CCA	2	6	6483344	6483349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812405
120042	NC_015379	CGCCC	2	10	6483419	6483428	0 %	0 %	20 %	80 %	330812405
120043	NC_015379	GCGA	2	8	6483436	6483443	25 %	0 %	50 %	25 %	330812405
120044	NC_015379	CAG	2	6	6483537	6483542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120045	NC_015379	GCGCG	2	10	6483544	6483553	0 %	0 %	60 %	40 %	330812405
120046	NC_015379	CTG	2	6	6483567	6483572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120047	NC_015379	GCC	2	6	6483582	6483587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812405
120048	NC_015379	AGC	2	6	6483667	6483672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120049	NC_015379	CGC	3	9	6483719	6483727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812405
120050	NC_015379	GCT	2	6	6483740	6483745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120051	NC_015379	CGG	2	6	6483823	6483828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812405
120052	NC_015379	GGCCGG	2	12	6483836	6483847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812405
120053	NC_015379	TGG	2	6	6483859	6483864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812405
120054	NC_015379	CGG	2	6	6483908	6483913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812405
120055	NC_015379	GAC	2	6	6483987	6483992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120056	NC_015379	TGC	2	6	6483997	6484002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
120057	NC_015379	GCCAAC	2	12	6484018	6484029	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330812405
120058	NC_015379	TGC	2	6	6484030	6484035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812405
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120077	NC_015379	ACC	2	6	6484974	6484979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812407
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120090	NC_015379	GCC	2	6	6485773	6485778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812408
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120099	NC_015379	GGC	2	6	6486123	6486128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812408
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120102	NC_015379	GCCAGC	2	12	6486194	6486205	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330812408
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120109	NC_015379	AGT	2	6	6486386	6486391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812408
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120113	NC_015379	GCA	2	6	6486618	6486623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812409
120114	NC_015379	GCT	2	6	6486691	6486696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812409
120115	NC_015379	GGC	2	6	6486700	6486705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812409
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120215	NC_015379	ATC	2	6	6492510	6492515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812417
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120217	NC_015379	CTG	2	6	6492581	6492586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812417
120218	NC_015379	GA	3	6	6492630	6492635	50 %	0 %	50 %	0 %	330812417
120219	NC_015379	GCTC	2	8	6492642	6492649	0 %	25 %	25 %	50 %	330812417
120220	NC_015379	CG	4	8	6492702	6492709	0 %	0 %	50 %	50 %	330812418
120221	NC_015379	GTC	2	6	6492739	6492744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812418
120222	NC_015379	CAGGCG	2	12	6492757	6492768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330812418
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120224	NC_015379	TGC	2	6	6492909	6492914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812418
120225	NC_015379	GCA	2	6	6492960	6492965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812418
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120227	NC_015379	GAC	2	6	6493009	6493014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812418
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120452	NC_015379	CCCG	2	8	6504693	6504700	0 %	0 %	25 %	75 %	330812434
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