MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 127014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_015379	A	6	6	6218229	6218234	100 %	0 %	0 %	0 %	330812138
115002	NC_015379	CCG	2	6	6218368	6218373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812138
115003	NC_015379	GAT	2	6	6218378	6218383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812138
115004	NC_015379	GTCG	2	8	6218396	6218403	0 %	25 %	50 %	25 %	330812138
115005	NC_015379	CAC	2	6	6218421	6218426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812138
115006	NC_015379	TCA	2	6	6218503	6218508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812138
115007	NC_015379	GAA	2	6	6218538	6218543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812138
115008	NC_015379	TGCA	2	8	6218553	6218560	25 %	25 %	25 %	25 %	330812138
115009	NC_015379	TGG	3	9	6218566	6218574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812138
115010	NC_015379	CTT	2	6	6218600	6218605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812138
115011	NC_015379	ATC	2	6	6218649	6218654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812138
115012	NC_015379	CAT	2	6	6218681	6218686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812138
115013	NC_015379	GGA	2	6	6218720	6218725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812138
115014	NC_015379	CTG	2	6	6218727	6218732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115015	NC_015379	TGA	2	6	6218749	6218754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812138
115016	NC_015379	CCG	2	6	6218794	6218799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812138
115017	NC_015379	AAG	2	6	6218800	6218805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812138
115018	NC_015379	GCT	2	6	6218969	6218974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115019	NC_015379	TGA	2	6	6219091	6219096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812138
115020	NC_015379	ACG	2	6	6219106	6219111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115021	NC_015379	GTG	2	6	6219165	6219170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812138
115022	NC_015379	TAC	2	6	6219195	6219200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812138
115023	NC_015379	TCG	2	6	6219281	6219286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115024	NC_015379	CCA	2	6	6219322	6219327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812138
115025	NC_015379	AGC	2	6	6219342	6219347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115026	NC_015379	CTG	2	6	6219444	6219449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115027	NC_015379	GGC	2	6	6219471	6219476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812138
115028	NC_015379	CAT	2	6	6219482	6219487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812138
115029	NC_015379	GGC	2	6	6219500	6219505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812138
115030	NC_015379	CCG	2	6	6219557	6219562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812138
115031	NC_015379	TCGC	2	8	6219569	6219576	0 %	25 %	25 %	50 %	330812138
115032	NC_015379	CGA	2	6	6219626	6219631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812138
115033	NC_015379	TGA	2	6	6219700	6219705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812138
115034	NC_015379	TCAT	2	8	6219772	6219779	25 %	50 %	0 %	25 %	330812138
115035	NC_015379	CGG	2	6	6219866	6219871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812139
115036	NC_015379	CTG	2	6	6219888	6219893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812139
115037	NC_015379	ATCG	2	8	6219912	6219919	25 %	25 %	25 %	25 %	330812139
115038	NC_015379	GTG	2	6	6219924	6219929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812139
115039	NC_015379	CCG	2	6	6219937	6219942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812139
115040	NC_015379	GCG	2	6	6220009	6220014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812139
115041	NC_015379	GGC	2	6	6220062	6220067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812139
115042	NC_015379	GGA	3	9	6220100	6220108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812139
115043	NC_015379	CGC	2	6	6220271	6220276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812139
115044	NC_015379	GAAA	2	8	6220382	6220389	75 %	0 %	25 %	0 %	330812139
115045	NC_015379	GCC	2	6	6220563	6220568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812139
115046	NC_015379	CAA	2	6	6220575	6220580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812139
115047	NC_015379	GCCT	2	8	6220599	6220606	0 %	25 %	25 %	50 %	330812139
115048	NC_015379	AACG	2	8	6220701	6220708	50 %	0 %	25 %	25 %	330812139
115049	NC_015379	CG	3	6	6220776	6220781	0 %	0 %	50 %	50 %	330812139
115050	NC_015379	GCT	2	6	6220811	6220816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812139
115051	NC_015379	GAG	2	6	6220854	6220859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330812139
115052	NC_015379	GATG	2	8	6220877	6220884	25 %	25 %	50 %	0 %	330812139
115053	NC_015379	ATT	2	6	6220930	6220935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330812139
115054	NC_015379	GCA	2	6	6220950	6220955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812139
115055	NC_015379	CG	3	6	6220959	6220964	0 %	0 %	50 %	50 %	330812139
115056	NC_015379	GCG	2	6	6221064	6221069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812139
115057	NC_015379	GCT	2	6	6221223	6221228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812140
115058	NC_015379	TCC	2	6	6221279	6221284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812140
115059	NC_015379	ATCCG	2	10	6221321	6221330	20 %	20 %	20 %	40 %	330812140
115060	NC_015379	CG	4	8	6221380	6221387	0 %	0 %	50 %	50 %	330812140
115061	NC_015379	ACA	3	9	6221427	6221435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812140
115062	NC_015379	GAC	2	6	6221505	6221510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812140
115063	NC_015379	GAC	2	6	6221548	6221553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812140
115064	NC_015379	GAA	2	6	6221560	6221565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812140
115065	NC_015379	GGCT	2	8	6221588	6221595	0 %	25 %	50 %	25 %	330812140
115066	NC_015379	CCA	2	6	6221622	6221627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812140
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115068	NC_015379	CGC	2	6	6221741	6221746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812141
115069	NC_015379	CGA	2	6	6221889	6221894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812141
115070	NC_015379	GTC	2	6	6221925	6221930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812141
115071	NC_015379	GCTCG	2	10	6222169	6222178	0 %	20 %	40 %	40 %	330812142
115072	NC_015379	GCC	2	6	6222201	6222206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812142
115073	NC_015379	CCA	2	6	6222255	6222260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812142
115074	NC_015379	TGC	2	6	6222264	6222269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812142
115075	NC_015379	CTG	2	6	6222302	6222307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812142
115076	NC_015379	GCA	2	6	6222367	6222372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812142
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115080	NC_015379	TGC	2	6	6222468	6222473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812142
115081	NC_015379	CCCG	2	8	6222484	6222491	0 %	0 %	25 %	75 %	330812142
115082	NC_015379	CTG	2	6	6222497	6222502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812142
115083	NC_015379	CTGT	2	8	6222504	6222511	0 %	50 %	25 %	25 %	330812142
115084	NC_015379	GCT	2	6	6222517	6222522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812142
115085	NC_015379	CTGGC	2	10	6222590	6222599	0 %	20 %	40 %	40 %	330812142
115086	NC_015379	CGG	2	6	6222606	6222611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812142
115087	NC_015379	TGC	2	6	6222615	6222620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812142
115088	NC_015379	GCG	2	6	6222720	6222725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812143
115089	NC_015379	GC	3	6	6222745	6222750	0 %	0 %	50 %	50 %	330812143
115090	NC_015379	GGCC	2	8	6222780	6222787	0 %	0 %	50 %	50 %	330812143
115091	NC_015379	ATC	2	6	6222815	6222820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812143
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115096	NC_015379	CTG	2	6	6223006	6223011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812143
115097	NC_015379	GTC	2	6	6223048	6223053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812143
115098	NC_015379	CTG	2	6	6223069	6223074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812143
115099	NC_015379	CTGAAA	2	12	6223106	6223117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330812143
115100	NC_015379	GA	3	6	6223188	6223193	50 %	0 %	50 %	0 %	330812143
115101	NC_015379	CAT	2	6	6223222	6223227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812143
115102	NC_015379	GCA	2	6	6223256	6223261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812143
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115105	NC_015379	CGA	2	6	6223347	6223352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812143
115106	NC_015379	GCG	2	6	6223362	6223367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812143
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115110	NC_015379	CCA	2	6	6223485	6223490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812143
115111	NC_015379	CGG	2	6	6223500	6223505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812143
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115113	NC_015379	GCA	2	6	6223572	6223577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812143
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115341	NC_015379	CAG	2	6	6234727	6234732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812150
115342	NC_015379	CGGGC	2	10	6234747	6234756	0 %	0 %	60 %	40 %	330812150
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115456	NC_015379	CAT	2	6	6241554	6241559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812161
115457	NC_015379	ATC	2	6	6241562	6241567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812161
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115463	NC_015379	CTG	2	6	6241828	6241833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812161
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115484	NC_015379	AGC	2	6	6243288	6243293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812162
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115490	NC_015379	GCA	2	6	6243729	6243734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812162
115491	NC_015379	CGA	2	6	6243889	6243894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812162
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