MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 127014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_015379	GCA	2	6	6107514	6107519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812027
113002	NC_015379	GGCGCG	2	12	6107523	6107534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812027
113003	NC_015379	GGT	2	6	6107546	6107551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812027
113004	NC_015379	GAC	2	6	6107555	6107560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812027
113005	NC_015379	TTG	2	6	6107576	6107581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812027
113006	NC_015379	CGC	2	6	6107582	6107587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812027
113007	NC_015379	CCGCG	2	10	6107614	6107623	0 %	0 %	40 %	60 %	330812027
113008	NC_015379	CTG	2	6	6107663	6107668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812027
113009	NC_015379	GTG	2	6	6107681	6107686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812027
113010	NC_015379	CGG	2	6	6107782	6107787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812027
113011	NC_015379	GGCG	2	8	6107806	6107813	0 %	0 %	75 %	25 %	330812027
113012	NC_015379	GCT	2	6	6107842	6107847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812027
113013	NC_015379	CGC	3	9	6107858	6107866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812027
113014	NC_015379	TGG	2	6	6107883	6107888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812027
113015	NC_015379	GCG	2	6	6107895	6107900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812027
113016	NC_015379	TGC	2	6	6107928	6107933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812027
113017	NC_015379	GGC	2	6	6107995	6108000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812027
113018	NC_015379	AGC	2	6	6108015	6108020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812027
113019	NC_015379	CTC	2	6	6108254	6108259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812028
113020	NC_015379	ACC	2	6	6108279	6108284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113021	NC_015379	CCG	2	6	6108313	6108318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812028
113022	NC_015379	CTT	2	6	6108335	6108340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812028
113023	NC_015379	CTG	2	6	6108344	6108349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113024	NC_015379	CCG	2	6	6108378	6108383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812028
113025	NC_015379	CAC	2	6	6108410	6108415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113026	NC_015379	GAA	2	6	6108566	6108571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812028
113027	NC_015379	TGGT	2	8	6108594	6108601	0 %	50 %	50 %	0 %	330812028
113028	NC_015379	CGCAGG	2	12	6108654	6108665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330812028
113029	NC_015379	CAC	2	6	6108713	6108718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113030	NC_015379	ATG	3	9	6108747	6108755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812028
113031	NC_015379	AACCGA	2	12	6108793	6108804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330812028
113032	NC_015379	CAC	2	6	6108815	6108820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113033	NC_015379	TGG	2	6	6108868	6108873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812028
113034	NC_015379	CAC	2	6	6108887	6108892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113035	NC_015379	GAT	2	6	6108896	6108901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812028
113036	NC_015379	GCG	2	6	6108976	6108981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812028
113037	NC_015379	CAC	2	6	6109013	6109018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113038	NC_015379	TCA	2	6	6109033	6109038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812028
113039	NC_015379	TCCG	2	8	6109129	6109136	0 %	25 %	25 %	50 %	330812028
113040	NC_015379	ACC	2	6	6109152	6109157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113041	NC_015379	GCA	2	6	6109171	6109176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113042	NC_015379	GCA	2	6	6109183	6109188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113043	NC_015379	GGC	2	6	6109198	6109203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812028
113044	NC_015379	CAG	2	6	6109292	6109297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113045	NC_015379	TGG	2	6	6109300	6109305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812028
113046	NC_015379	AAC	2	6	6109308	6109313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812028
113047	NC_015379	CCG	2	6	6109363	6109368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812028
113048	NC_015379	GCGG	2	8	6109462	6109469	0 %	0 %	75 %	25 %	330812028
113049	NC_015379	CCAG	2	8	6109510	6109517	25 %	0 %	25 %	50 %	330812028
113050	NC_015379	TGC	2	6	6109558	6109563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113051	NC_015379	GCG	2	6	6109623	6109628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812028
113052	NC_015379	ATC	2	6	6109671	6109676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812028
113053	NC_015379	ATCACG	2	12	6109710	6109721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330812028
113054	NC_015379	GCT	2	6	6109751	6109756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113055	NC_015379	CGAC	2	8	6109788	6109795	25 %	0 %	25 %	50 %	330812028
113056	NC_015379	GGCA	2	8	6109833	6109840	25 %	0 %	50 %	25 %	330812028
113057	NC_015379	CGC	2	6	6109847	6109852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812028
113058	NC_015379	GCA	2	6	6109864	6109869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113059	NC_015379	TGG	2	6	6109896	6109901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812028
113060	NC_015379	CAGC	2	8	6109907	6109914	25 %	0 %	25 %	50 %	330812028
113061	NC_015379	GCA	3	9	6109933	6109941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113062	NC_015379	ACA	3	9	6109990	6109998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812028
113063	NC_015379	CCA	2	6	6110041	6110046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113064	NC_015379	CCG	2	6	6110062	6110067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812028
113065	NC_015379	CCGC	2	8	6110074	6110081	0 %	0 %	25 %	75 %	330812028
113066	NC_015379	CCA	2	6	6110095	6110100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812028
113067	NC_015379	GCG	2	6	6110179	6110184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812028
113068	NC_015379	CGG	2	6	6110191	6110196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812028
113069	NC_015379	CTGGG	2	10	6110205	6110214	0 %	20 %	60 %	20 %	330812028
113070	NC_015379	GCG	2	6	6110229	6110234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812028
113071	NC_015379	CAG	2	6	6110264	6110269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113072	NC_015379	CAG	2	6	6110273	6110278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812028
113073	NC_015379	G	6	6	6110675	6110680	0 %	0 %	100 %	0 %	330812029
113074	NC_015379	TCA	2	6	6110852	6110857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812029
113075	NC_015379	TTC	2	6	6110902	6110907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812029
113076	NC_015379	GCC	3	9	6111034	6111042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812029
113077	NC_015379	GCT	2	6	6111165	6111170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812029
113078	NC_015379	ACG	2	6	6111179	6111184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812029
113079	NC_015379	CGA	2	6	6111300	6111305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812029
113080	NC_015379	GCAA	2	8	6111350	6111357	50 %	0 %	25 %	25 %	330812029
113081	NC_015379	CCG	2	6	6111359	6111364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812029
113082	NC_015379	GATC	2	8	6111375	6111382	25 %	25 %	25 %	25 %	330812029
113083	NC_015379	AAG	2	6	6111388	6111393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812029
113084	NC_015379	CG	3	6	6111451	6111456	0 %	0 %	50 %	50 %	330812029
113085	NC_015379	ACGC	2	8	6111464	6111471	25 %	0 %	25 %	50 %	330812029
113086	NC_015379	AGCGA	2	10	6111567	6111576	40 %	0 %	40 %	20 %	330812030
113087	NC_015379	CCG	2	6	6111721	6111726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812030
113088	NC_015379	CGG	2	6	6111868	6111873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812030
113089	NC_015379	TGT	2	6	6111892	6111897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330812030
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113094	NC_015379	TCG	2	6	6112111	6112116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812030
113095	NC_015379	GC	3	6	6112224	6112229	0 %	0 %	50 %	50 %	330812030
113096	NC_015379	CAT	2	6	6112278	6112283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812030
113097	NC_015379	CGA	2	6	6112362	6112367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812031
113098	NC_015379	CCAC	2	8	6112400	6112407	25 %	0 %	0 %	75 %	330812031
113099	NC_015379	CAA	2	6	6112453	6112458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812031
113100	NC_015379	GCT	2	6	6112468	6112473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812031
113101	NC_015379	TCC	2	6	6112536	6112541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330812031
113102	NC_015379	GCC	2	6	6112604	6112609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812031
113103	NC_015379	GCGTG	2	10	6112612	6112621	0 %	20 %	60 %	20 %	330812031
113104	NC_015379	ACC	2	6	6112664	6112669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812031
113105	NC_015379	CCG	2	6	6112759	6112764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812031
113106	NC_015379	GTG	3	9	6112781	6112789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812031
113107	NC_015379	CCG	2	6	6112827	6112832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812031
113108	NC_015379	ACC	2	6	6112833	6112838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812031
113109	NC_015379	CGG	2	6	6112893	6112898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812031
113110	NC_015379	TGG	2	6	6112899	6112904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812031
113111	NC_015379	CCA	2	6	6112909	6112914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812031
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113113	NC_015379	TGG	2	6	6112958	6112963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812031
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113454	NC_015379	CAA	2	6	6130034	6130039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812046
113455	NC_015379	CTG	2	6	6130074	6130079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812046
113456	NC_015379	TCCGGC	2	12	6130098	6130109	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330812046
113457	NC_015379	CAA	2	6	6130124	6130129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330812046
113458	NC_015379	CCA	2	6	6130168	6130173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330812046
113459	NC_015379	GCC	2	6	6130185	6130190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812046
113460	NC_015379	GGT	2	6	6130226	6130231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812046
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113467	NC_015379	GATG	2	8	6130613	6130620	25 %	25 %	50 %	0 %	330812046
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113469	NC_015379	CGA	2	6	6130742	6130747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330812046
113470	NC_015379	TGC	2	6	6130795	6130800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812046
113471	NC_015379	GTG	3	9	6130827	6130835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330812046
113472	NC_015379	CTGG	2	8	6130871	6130878	0 %	25 %	50 %	25 %	330812046
113473	NC_015379	GGC	2	6	6130896	6130901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812046
113474	NC_015379	ATC	2	6	6130917	6130922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812046
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113476	NC_015379	GCT	2	6	6130988	6130993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812046
113477	NC_015379	AGT	2	6	6131144	6131149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812047
113478	NC_015379	CCAG	2	8	6131189	6131196	25 %	0 %	25 %	50 %	330812047
113479	NC_015379	TCT	2	6	6131206	6131211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330812047
113480	NC_015379	CAGCG	2	10	6131292	6131301	20 %	0 %	40 %	40 %	330812047
113481	NC_015379	CGG	2	6	6131327	6131332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330812047
113482	NC_015379	GC	3	6	6131374	6131379	0 %	0 %	50 %	50 %	330812047
113483	NC_015379	GCGTG	2	10	6131382	6131391	0 %	20 %	60 %	20 %	330812047
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113485	NC_015379	GAA	2	6	6131810	6131815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330812048
113486	NC_015379	TGC	2	6	6131817	6131822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812048
113487	NC_015379	TCG	2	6	6131898	6131903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812048
113488	NC_015379	TCA	2	6	6131905	6131910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330812048
113489	NC_015379	GTA	2	6	6131936	6131941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330812048
113490	NC_015379	CCG	2	6	6131971	6131976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812048
113491	NC_015379	GCC	2	6	6132060	6132065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330812048
113492	NC_015379	TGC	2	6	6132073	6132078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330812048
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