MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED01

Total Repeats: 4145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015314	CGCA	2	8	376	383	25 %	0 %	25 %	50 %	327309750
2	NC_015314	GACG	2	8	436	443	25 %	0 %	50 %	25 %	327309750
3	NC_015314	GCA	2	6	470	475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309750
4	NC_015314	GCC	2	6	500	505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309750
5	NC_015314	CAGC	2	8	806	813	25 %	0 %	25 %	50 %	327309751
6	NC_015314	ACT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309751
7	NC_015314	CCCA	3	12	931	942	25 %	0 %	0 %	75 %	327309751
8	NC_015314	CCG	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309751
9	NC_015314	CGC	2	6	981	986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309751
10	NC_015314	AGC	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309751
11	NC_015314	GC	3	6	1040	1045	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
12	NC_015314	GCCG	2	8	1048	1055	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
13	NC_015314	CGC	2	6	1109	1114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309751
14	NC_015314	AGG	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309751
15	NC_015314	TCG	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309751
16	NC_015314	CG	3	6	1213	1218	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
17	NC_015314	CGA	3	9	1225	1233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309751
18	NC_015314	TCG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309751
19	NC_015314	CA	3	6	1290	1295	50 %	0 %	0 %	50 %	327309751
20	NC_015314	CAC	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309751
21	NC_015314	CG	3	6	1379	1384	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
22	NC_015314	GTC	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309751
23	NC_015314	GTGCG	2	10	1426	1435	0 %	20 %	60 %	20 %	327309751
24	NC_015314	CAG	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309751
25	NC_015314	CAC	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309751
26	NC_015314	TC	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	327309751
27	NC_015314	CAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309751
28	NC_015314	CAC	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309751
29	NC_015314	CCA	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309751
30	NC_015314	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	327309751
31	NC_015314	GGT	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309751
32	NC_015314	GAC	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309751
33	NC_015314	CGAC	2	8	1816	1823	25 %	0 %	25 %	50 %	327309751
34	NC_015314	GGCAG	2	10	1899	1908	20 %	0 %	60 %	20 %	327309751
35	NC_015314	GAC	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309751
36	NC_015314	CG	3	6	1962	1967	0 %	0 %	50 %	50 %	327309751
37	NC_015314	GCG	2	6	1984	1989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309751
38	NC_015314	GCC	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309751
39	NC_015314	GCGCC	2	10	2092	2101	0 %	0 %	40 %	60 %	327309751
40	NC_015314	CGA	2	6	2113	2118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309751
41	NC_015314	CGAC	2	8	2155	2162	25 %	0 %	25 %	50 %	327309751
42	NC_015314	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309752
43	NC_015314	CGG	2	6	4092	4097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309752
44	NC_015314	GCA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309752
45	NC_015314	GCC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309752
46	NC_015314	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309752
47	NC_015314	GTC	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309752
48	NC_015314	TGC	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309752
49	NC_015314	CG	3	6	4277	4282	0 %	0 %	50 %	50 %	327309752
50	NC_015314	GAA	2	6	4296	4301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309752
51	NC_015314	TCT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309752
52	NC_015314	GGT	2	6	4334	4339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309752
53	NC_015314	CTC	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309752
54	NC_015314	GCT	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309752
55	NC_015314	CCG	2	6	4604	4609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309753
56	NC_015314	CTT	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309753
57	NC_015314	CGC	2	6	4668	4673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309753
58	NC_015314	GCG	2	6	4716	4721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309753
59	NC_015314	CCG	2	6	4751	4756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309753
60	NC_015314	GC	3	6	4759	4764	0 %	0 %	50 %	50 %	327309753
61	NC_015314	CGA	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309753
62	NC_015314	GAG	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309753
63	NC_015314	CCG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309753
64	NC_015314	CAC	2	6	4938	4943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309753
65	NC_015314	GGA	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309753
66	NC_015314	TCG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309753
67	NC_015314	AC	3	6	5110	5115	50 %	0 %	0 %	50 %	327309753
68	NC_015314	GCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309753
69	NC_015314	CGG	2	6	5182	5187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309753
70	NC_015314	CGG	2	6	5192	5197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309753
71	NC_015314	GCC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309754
72	NC_015314	GTG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309754
73	NC_015314	GCC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309754
74	NC_015314	GT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	50 %	0 %	327309754
75	NC_015314	CGG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309754
76	NC_015314	AC	3	6	5568	5573	50 %	0 %	0 %	50 %	327309754
77	NC_015314	CGA	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
78	NC_015314	C	6	6	5641	5646	0 %	0 %	0 %	100 %	327309754
79	NC_015314	TCG	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309754
80	NC_015314	CAG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
81	NC_015314	CGC	2	6	5731	5736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309754
82	NC_015314	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	327309754
83	NC_015314	AGC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
84	NC_015314	TG	3	6	5942	5947	0 %	50 %	50 %	0 %	327309754
85	NC_015314	CGA	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
86	NC_015314	GGCC	2	8	6030	6037	0 %	0 %	50 %	50 %	327309754
87	NC_015314	GGC	2	6	6097	6102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309754
88	NC_015314	AGGCG	2	10	6123	6132	20 %	0 %	60 %	20 %	327309754
89	NC_015314	CGG	2	6	6163	6168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309754
90	NC_015314	GTC	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309754
91	NC_015314	ACA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309754
92	NC_015314	GCCG	2	8	6316	6323	0 %	0 %	50 %	50 %	327309754
93	NC_015314	AGCG	2	8	6337	6344	25 %	0 %	50 %	25 %	327309754
94	NC_015314	GCA	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
95	NC_015314	TC	3	6	6378	6383	0 %	50 %	0 %	50 %	327309754
96	NC_015314	CCA	2	6	6418	6423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309754
97	NC_015314	ACG	3	9	6539	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
98	NC_015314	CGA	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
99	NC_015314	CGC	2	6	6587	6592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309754
100	NC_015314	AGC	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
101	NC_015314	GC	3	6	6714	6719	0 %	0 %	50 %	50 %	327309754
102	NC_015314	CGA	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
103	NC_015314	CGA	2	6	6942	6947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309754
104	NC_015314	ACCCG	2	10	7213	7222	20 %	0 %	20 %	60 %	327309755
105	NC_015314	AC	3	6	7292	7297	50 %	0 %	0 %	50 %	327309755
106	NC_015314	GCG	2	6	7305	7310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309755
107	NC_015314	CGAC	2	8	7387	7394	25 %	0 %	25 %	50 %	327309755
108	NC_015314	CCGA	2	8	7424	7431	25 %	0 %	25 %	50 %	327309755
109	NC_015314	CCAC	2	8	7487	7494	25 %	0 %	0 %	75 %	327309755
110	NC_015314	CGT	2	6	7511	7516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309755
111	NC_015314	ACCCG	2	10	7526	7535	20 %	0 %	20 %	60 %	327309755
112	NC_015314	ACC	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309755
113	NC_015314	CGC	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309755
114	NC_015314	CGGC	2	8	7597	7604	0 %	0 %	50 %	50 %	327309755
115	NC_015314	CTG	2	6	7619	7624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309755
116	NC_015314	AGG	2	6	7638	7643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309755
117	NC_015314	CGT	2	6	7717	7722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309755
118	NC_015314	CTC	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309755
119	NC_015314	AGCC	2	8	7762	7769	25 %	0 %	25 %	50 %	327309755
120	NC_015314	TCG	2	6	11632	11637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
121	NC_015314	CTG	2	6	11670	11675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
122	NC_015314	GCCG	2	8	11682	11689	0 %	0 %	50 %	50 %	327309756
123	NC_015314	CGT	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
124	NC_015314	AC	3	6	11705	11710	50 %	0 %	0 %	50 %	327309756
125	NC_015314	GCCC	2	8	11720	11727	0 %	0 %	25 %	75 %	327309756
126	NC_015314	CTG	2	6	11769	11774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
127	NC_015314	CTGA	2	8	11880	11887	25 %	25 %	25 %	25 %	327309756
128	NC_015314	GC	3	6	11913	11918	0 %	0 %	50 %	50 %	327309756
129	NC_015314	CTTC	2	8	11942	11949	0 %	50 %	0 %	50 %	327309756
130	NC_015314	TCG	2	6	11974	11979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
131	NC_015314	CGA	2	6	12011	12016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309756
132	NC_015314	GTC	2	6	12045	12050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
133	NC_015314	CGG	2	6	12089	12094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309756
134	NC_015314	CCG	2	6	12102	12107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309756
135	NC_015314	CTG	2	6	12166	12171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
136	NC_015314	GCA	2	6	12206	12211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309756
137	NC_015314	CGA	2	6	12233	12238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309756
138	NC_015314	TCA	2	6	12253	12258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309756
139	NC_015314	GCGG	2	8	12364	12371	0 %	0 %	75 %	25 %	327309756
140	NC_015314	GTC	2	6	12403	12408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309756
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143	NC_015314	CCG	2	6	12544	12549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309757
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150	NC_015314	CTG	2	6	12732	12737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309757
151	NC_015314	CG	3	6	12755	12760	0 %	0 %	50 %	50 %	327309757
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155	NC_015314	GATC	2	8	12819	12826	25 %	25 %	25 %	25 %	327309757
156	NC_015314	CGGC	2	8	12830	12837	0 %	0 %	50 %	50 %	327309757
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159	NC_015314	CGA	2	6	12938	12943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309757
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165	NC_015314	GGC	2	6	14449	14454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309758
166	NC_015314	CGG	2	6	14462	14467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309758
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241	NC_015314	ACGC	2	8	19122	19129	25 %	0 %	25 %	50 %	327309761
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250	NC_015314	CG	3	6	19658	19663	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
251	NC_015314	GGAGCG	2	12	19673	19684	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	327309761
252	NC_015314	TGC	2	6	19693	19698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
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256	NC_015314	GGA	2	6	19817	19822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309761
257	NC_015314	CGG	2	6	19837	19842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
258	NC_015314	GGA	2	6	19880	19885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309761
259	NC_015314	GGC	2	6	19901	19906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
260	NC_015314	ACA	2	6	19933	19938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309761
261	NC_015314	GCT	2	6	19958	19963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
262	NC_015314	GCG	2	6	20000	20005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
263	NC_015314	CTG	2	6	20007	20012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
264	NC_015314	GCC	2	6	20023	20028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309761
265	NC_015314	CGG	2	6	20046	20051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
266	NC_015314	GCT	2	6	20066	20071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
267	NC_015314	GCGG	2	8	20114	20121	0 %	0 %	75 %	25 %	327309761
268	NC_015314	GTG	2	6	20172	20177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309761
269	NC_015314	AGC	2	6	20188	20193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309761
270	NC_015314	CG	3	6	20199	20204	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
271	NC_015314	CGC	2	6	20225	20230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309761
272	NC_015314	CG	4	8	20254	20261	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
273	NC_015314	GCG	2	6	20373	20378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
274	NC_015314	GGC	2	6	20380	20385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
275	NC_015314	CGA	2	6	20414	20419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309761
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279	NC_015314	TGT	2	6	20566	20571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309761
280	NC_015314	CTG	2	6	20667	20672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
281	NC_015314	CGC	2	6	20786	20791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309761
282	NC_015314	CGC	2	6	20798	20803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309761
283	NC_015314	TCA	2	6	20806	20811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309761
284	NC_015314	GCG	2	6	20848	20853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
285	NC_015314	GCT	2	6	20855	20860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
286	NC_015314	TCG	2	6	20884	20889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
287	NC_015314	TAC	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309761
288	NC_015314	CG	3	6	21016	21021	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
289	NC_015314	CTG	2	6	21045	21050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
290	NC_015314	CGG	2	6	21059	21064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
291	NC_015314	TGG	2	6	21079	21084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309761
292	NC_015314	CGAC	2	8	21085	21092	25 %	0 %	25 %	50 %	327309761
293	NC_015314	GCCG	2	8	21215	21222	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
294	NC_015314	CAA	2	6	21254	21259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309761
295	NC_015314	TCA	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309761
296	NC_015314	CTG	2	6	21348	21353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309761
297	NC_015314	CCACC	2	10	21374	21383	20 %	0 %	0 %	80 %	327309761
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299	NC_015314	CGG	2	6	21471	21476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
300	NC_015314	TGA	2	6	21478	21483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309761
301	NC_015314	CG	3	6	21525	21530	0 %	0 %	50 %	50 %	327309761
302	NC_015314	CGG	2	6	21539	21544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309761
303	NC_015314	AGG	2	6	21580	21585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309761
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307	NC_015314	CGC	2	6	21815	21820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309761
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319	NC_015314	CGC	2	6	23756	23761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309762
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323	NC_015314	CGA	2	6	23899	23904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309762
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383	NC_015314	CCG	2	6	26097	26102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309765
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