MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED03

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015313	GC	3	6	1798	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
2	NC_015313	AGTCC	2	10	1842	1851	20 %	20 %	20 %	40 %	327309735
3	NC_015313	GCC	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
4	NC_015313	GA	3	6	1925	1930	50 %	0 %	50 %	0 %	327309735
5	NC_015313	TCC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309735
6	NC_015313	GCT	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
7	NC_015313	CCG	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
8	NC_015313	GCG	2	6	2302	2307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
9	NC_015313	GCG	2	6	2355	2360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
10	NC_015313	GTG	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309735
11	NC_015313	TGC	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
12	NC_015313	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
13	NC_015313	TCG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
14	NC_015313	GC	4	8	2561	2568	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
15	NC_015313	CGCAG	2	10	2680	2689	20 %	0 %	40 %	40 %	327309735
16	NC_015313	GTC	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
17	NC_015313	CTA	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309735
18	NC_015313	GTGC	2	8	2766	2773	0 %	25 %	50 %	25 %	327309735
19	NC_015313	ACA	2	6	2809	2814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309735
20	NC_015313	TTC	2	6	2845	2850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309735
21	NC_015313	CG	3	6	2899	2904	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
22	NC_015313	CAC	3	9	2923	2931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309735
23	NC_015313	CAC	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309735
24	NC_015313	GTG	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309735
25	NC_015313	CG	3	6	3045	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
26	NC_015313	CGGA	2	8	3134	3141	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
27	NC_015313	CTC	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309735
28	NC_015313	ACGG	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
29	NC_015313	CGGA	2	8	3303	3310	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
30	NC_015313	GAA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309735
31	NC_015313	GTCG	2	8	3389	3396	0 %	25 %	50 %	25 %	327309735
32	NC_015313	GCGG	2	8	3480	3487	0 %	0 %	75 %	25 %	327309735
33	NC_015313	CGG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
34	NC_015313	GTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309735
35	NC_015313	TTC	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309735
36	NC_015313	TCCG	2	8	3566	3573	0 %	25 %	25 %	50 %	327309735
37	NC_015313	AAC	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309735
38	NC_015313	GC	3	6	3646	3651	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
39	NC_015313	GATC	2	8	3788	3795	25 %	25 %	25 %	25 %	327309735
40	NC_015313	GGCATC	2	12	3837	3848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327309735
41	NC_015313	CGG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
42	NC_015313	TCG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
43	NC_015313	TGCT	2	8	4011	4018	0 %	50 %	25 %	25 %	327309735
44	NC_015313	GCTTG	2	10	4040	4049	0 %	40 %	40 %	20 %	327309735
45	NC_015313	CGT	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
46	NC_015313	CGC	2	6	4133	4138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
47	NC_015313	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
48	NC_015313	G	7	7	4196	4202	0 %	0 %	100 %	0 %	327309735
49	NC_015313	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309735
50	NC_015313	TCA	2	6	4223	4228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309735
51	NC_015313	GGCCGG	2	12	4590	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309736
52	NC_015313	TCG	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309736
53	NC_015313	TAG	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309736
54	NC_015313	GAC	2	6	4764	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309736
55	NC_015313	TCC	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309736
56	NC_015313	CGA	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309736
57	NC_015313	GAG	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309736
58	NC_015313	TAA	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309736
59	NC_015313	CG	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	327309736
60	NC_015313	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309736
61	NC_015313	TCG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309736
62	NC_015313	ACTC	2	8	5015	5022	25 %	25 %	0 %	50 %	327309736
63	NC_015313	GAT	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309736
64	NC_015313	GTGC	2	8	5063	5070	0 %	25 %	50 %	25 %	327309736
65	NC_015313	AAC	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309737
66	NC_015313	TC	3	6	5670	5675	0 %	50 %	0 %	50 %	327309737
67	NC_015313	ATT	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309737
68	NC_015313	TCC	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309738
69	NC_015313	TGA	2	6	5762	5767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309738
70	NC_015313	CGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309738
71	NC_015313	CCGG	2	8	5799	5806	0 %	0 %	50 %	50 %	327309738
72	NC_015313	ATG	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309738
73	NC_015313	CG	3	6	5883	5888	0 %	0 %	50 %	50 %	327309738
74	NC_015313	TCG	2	6	5920	5925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309738
75	NC_015313	CCG	2	6	5994	5999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309739
76	NC_015313	CGAT	2	8	6078	6085	25 %	25 %	25 %	25 %	327309739
77	NC_015313	TCG	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309739
78	NC_015313	CGG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309739
79	NC_015313	CGG	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309739
80	NC_015313	GC	3	6	6259	6264	0 %	0 %	50 %	50 %	327309739
81	NC_015313	GGC	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309740
82	NC_015313	GGC	2	6	6349	6354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309740
83	NC_015313	GCG	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309740
84	NC_015313	CG	3	6	6437	6442	0 %	0 %	50 %	50 %	327309740
85	NC_015313	CGGC	2	8	6516	6523	0 %	0 %	50 %	50 %	327309740
86	NC_015313	GCG	2	6	6923	6928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309741
87	NC_015313	GAC	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309741
88	NC_015313	ACT	2	6	6987	6992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309741
89	NC_015313	GTC	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309741
90	NC_015313	CGA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309741
91	NC_015313	TGG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309741
92	NC_015313	TCA	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309741
93	NC_015313	GCG	2	6	7148	7153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309741
94	NC_015313	TCC	2	6	7159	7164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309741
95	NC_015313	CG	3	6	7220	7225	0 %	0 %	50 %	50 %	327309741
96	NC_015313	CGA	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309741
97	NC_015313	GCG	2	6	7264	7269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309741
98	NC_015313	GGT	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309741
99	NC_015313	GCT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309741
100	NC_015313	GC	3	6	7350	7355	0 %	0 %	50 %	50 %	327309741
101	NC_015313	ACG	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309741
102	NC_015313	GGC	2	6	7549	7554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309742
103	NC_015313	CCG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309742
104	NC_015313	GCG	2	6	7623	7628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309742
105	NC_015313	CGA	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309742
106	NC_015313	TGA	2	6	7779	7784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309742
107	NC_015313	AGT	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309742
108	NC_015313	GCC	2	6	8051	8056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309743
109	NC_015313	CGG	2	6	8071	8076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309743
110	NC_015313	ATT	2	6	8086	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309743
111	NC_015313	CGGCG	2	10	8100	8109	0 %	0 %	60 %	40 %	327309743
112	NC_015313	CT	3	6	8239	8244	0 %	50 %	0 %	50 %	327309743
113	NC_015313	AC	3	6	8269	8274	50 %	0 %	0 %	50 %	327309743
114	NC_015313	ATC	2	6	8339	8344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309743
115	NC_015313	TTTC	2	8	8379	8386	0 %	75 %	0 %	25 %	327309743
116	NC_015313	CCG	2	6	8430	8435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309743
117	NC_015313	GCG	2	6	8439	8444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309743
118	NC_015313	CGCT	2	8	8480	8487	0 %	25 %	25 %	50 %	327309743
119	NC_015313	TC	3	6	8562	8567	0 %	50 %	0 %	50 %	327309743
120	NC_015313	CGAT	2	8	8573	8580	25 %	25 %	25 %	25 %	327309743
121	NC_015313	CGC	2	6	8655	8660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309743
122	NC_015313	GCG	2	6	8674	8679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309743
123	NC_015313	CGC	2	6	8686	8691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309743
124	NC_015313	CCCGG	2	10	8719	8728	0 %	0 %	40 %	60 %	327309743
125	NC_015313	GCC	2	6	8803	8808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309743
126	NC_015313	GCC	2	6	8811	8816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309743
127	NC_015313	CCGC	2	8	9012	9019	0 %	0 %	25 %	75 %	327309744
128	NC_015313	CG	3	6	9031	9036	0 %	0 %	50 %	50 %	327309744
129	NC_015313	TCG	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309744
130	NC_015313	GCC	2	6	9114	9119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309744
131	NC_015313	GCC	2	6	9129	9134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309744
132	NC_015313	GGC	2	6	9183	9188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309744
133	NC_015313	GAC	2	6	9267	9272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309744
134	NC_015313	CCGG	2	8	9296	9303	0 %	0 %	50 %	50 %	327309744
135	NC_015313	ACC	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309744
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.