MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella denticola F0289 chromosome

Total Repeats: 52175

< Previous12...3233343536373839404142...104105Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015311	C	6	6	1009630	1009635	0 %	0 %	0 %	100 %	327313122
18003	NC_015311	TGC	2	6	1009644	1009649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313122
18004	NC_015311	AG	3	6	1009699	1009704	50 %	0 %	50 %	0 %	327313122
18005	NC_015311	GAA	2	6	1009731	1009736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313122
18006	NC_015311	TCT	2	6	1009847	1009852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313122
18007	NC_015311	TGA	2	6	1009853	1009858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313122
18008	NC_015311	ATG	2	6	1009894	1009899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313122
18009	NC_015311	CAC	2	6	1009904	1009909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327313122
18010	NC_015311	CTT	3	9	1010042	1010050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313122
18011	NC_015311	TCC	2	6	1010068	1010073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327313122
18012	NC_015311	TGGCTC	2	12	1010085	1010096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313122
18013	NC_015311	CAT	2	6	1010129	1010134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313122
18014	NC_015311	TGC	2	6	1010171	1010176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313122
18015	NC_015311	CTC	2	6	1010190	1010195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327313122
18016	NC_015311	GTA	2	6	1010286	1010291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313122
18017	NC_015311	GTTC	2	8	1010306	1010313	0 %	50 %	25 %	25 %	327313122
18018	NC_015311	TTG	2	6	1010350	1010355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313122
18019	NC_015311	GAA	2	6	1010418	1010423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313122
18020	NC_015311	T	6	6	1010511	1010516	0 %	100 %	0 %	0 %	327313123
18021	NC_015311	CAT	2	6	1010580	1010585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313123
18022	NC_015311	TTC	2	6	1011225	1011230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313124
18023	NC_015311	CT	3	6	1011251	1011256	0 %	50 %	0 %	50 %	327313124
18024	NC_015311	GCTT	2	8	1011286	1011293	0 %	50 %	25 %	25 %	327313124
18025	NC_015311	A	6	6	1011309	1011314	100 %	0 %	0 %	0 %	327313124
18026	NC_015311	T	6	6	1011419	1011424	0 %	100 %	0 %	0 %	327313125
18027	NC_015311	CAG	2	6	1011466	1011471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18028	NC_015311	CGC	2	6	1011516	1011521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327313125
18029	NC_015311	CGGA	2	8	1011533	1011540	25 %	0 %	50 %	25 %	327313125
18030	NC_015311	AGA	2	6	1011556	1011561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313125
18031	NC_015311	TGC	2	6	1011611	1011616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18032	NC_015311	GTC	2	6	1011633	1011638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18033	NC_015311	GAC	2	6	1011645	1011650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18034	NC_015311	GGC	2	6	1011788	1011793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313125
18035	NC_015311	CGG	3	9	1011802	1011810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313125
18036	NC_015311	CTG	2	6	1011867	1011872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18037	NC_015311	TG	3	6	1011897	1011902	0 %	50 %	50 %	0 %	327313125
18038	NC_015311	CGG	2	6	1011907	1011912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313125
18039	NC_015311	ACC	2	6	1011931	1011936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327313125
18040	NC_015311	TGC	2	6	1012039	1012044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18041	NC_015311	CAG	2	6	1012074	1012079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18042	NC_015311	TGA	2	6	1012099	1012104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313125
18043	NC_015311	GCCT	2	8	1012139	1012146	0 %	25 %	25 %	50 %	327313125
18044	NC_015311	CA	3	6	1012154	1012159	50 %	0 %	0 %	50 %	327313125
18045	NC_015311	CCTC	2	8	1012207	1012214	0 %	25 %	0 %	75 %	327313125
18046	NC_015311	CGGC	2	8	1012306	1012313	0 %	0 %	50 %	50 %	327313125
18047	NC_015311	GGC	2	6	1012320	1012325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313125
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18049	NC_015311	CTA	2	6	1012403	1012408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313125
18050	NC_015311	CAA	2	6	1012505	1012510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327313125
18051	NC_015311	CTG	2	6	1012615	1012620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18052	NC_015311	ATG	2	6	1012699	1012704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313125
18053	NC_015311	GAAAGG	2	12	1012742	1012753	50 %	0 %	50 %	0 %	327313125
18054	NC_015311	GAG	2	6	1012818	1012823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327313125
18055	NC_015311	GAA	2	6	1012931	1012936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313125
18056	NC_015311	GTG	2	6	1012947	1012952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313125
18057	NC_015311	GAG	2	6	1013058	1013063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327313125
18058	NC_015311	GCT	2	6	1013069	1013074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313125
18059	NC_015311	CAGA	2	8	1013166	1013173	50 %	0 %	25 %	25 %	327313125
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18063	NC_015311	CGTG	2	8	1013378	1013385	0 %	25 %	50 %	25 %	327313125
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18065	NC_015311	A	7	7	1013439	1013445	100 %	0 %	0 %	0 %	327313125
18066	NC_015311	CAGA	2	8	1013532	1013539	50 %	0 %	25 %	25 %	327313125
18067	NC_015311	TGA	2	6	1013554	1013559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313125
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18069	NC_015311	TCA	2	6	1013644	1013649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313125
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18076	NC_015311	GCA	2	6	1013905	1013910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313125
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18082	NC_015311	CTG	2	6	1014910	1014915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313126
18083	NC_015311	TAG	2	6	1014960	1014965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313126
18084	NC_015311	AGC	2	6	1014993	1014998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313126
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18087	NC_015311	GAT	2	6	1015184	1015189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313126
18088	NC_015311	GAT	2	6	1015247	1015252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313126
18089	NC_015311	GCC	2	6	1015274	1015279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327313126
18090	NC_015311	CCG	2	6	1015287	1015292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327313126
18091	NC_015311	GCTC	2	8	1015348	1015355	0 %	25 %	25 %	50 %	327313126
18092	NC_015311	CGA	2	6	1015375	1015380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313126
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18094	NC_015311	GCTTT	2	10	1015576	1015585	0 %	60 %	20 %	20 %	327313126
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18097	NC_015311	AC	3	6	1015669	1015674	50 %	0 %	0 %	50 %	327313126
18098	NC_015311	GGC	2	6	1015694	1015699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313126
18099	NC_015311	TG	3	6	1015767	1015772	0 %	50 %	50 %	0 %	327313126
18100	NC_015311	CAT	2	6	1015817	1015822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313126
18101	NC_015311	CTT	2	6	1015823	1015828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313126
18102	NC_015311	GTT	2	6	1015871	1015876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313126
18103	NC_015311	CTTCA	2	10	1015904	1015913	20 %	40 %	0 %	40 %	327313126
18104	NC_015311	TGC	2	6	1015916	1015921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313126
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18107	NC_015311	TCG	2	6	1016291	1016296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313127
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18109	NC_015311	AAG	2	6	1016336	1016341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313127
18110	NC_015311	GAT	2	6	1016379	1016384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313127
18111	NC_015311	GCA	2	6	1016431	1016436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313127
18112	NC_015311	TGT	2	6	1016438	1016443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313127
18113	NC_015311	CGT	2	6	1016445	1016450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313127
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18115	NC_015311	CGC	2	6	1016579	1016584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327313127
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18146	NC_015311	CT	3	6	1018596	1018601	0 %	50 %	0 %	50 %	327313128
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18228	NC_015311	GGA	2	6	1023331	1023336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327313133
18229	NC_015311	GAC	2	6	1023351	1023356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313133
18230	NC_015311	TGT	2	6	1023362	1023367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313133
18231	NC_015311	ACC	2	6	1023390	1023395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327313133
18232	NC_015311	GT	3	6	1023536	1023541	0 %	50 %	50 %	0 %	327313133
18233	NC_015311	TGC	2	6	1023591	1023596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313133
18234	NC_015311	TCT	2	6	1023730	1023735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313133
18235	NC_015311	AGC	2	6	1023739	1023744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313133
18236	NC_015311	GTGCCT	2	12	1023791	1023802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313133
18237	NC_015311	TTG	2	6	1023808	1023813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313133
18238	NC_015311	TG	4	8	1023815	1023822	0 %	50 %	50 %	0 %	327313133
18239	NC_015311	TGA	2	6	1023869	1023874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313133
18240	NC_015311	TGTT	2	8	1023917	1023924	0 %	75 %	25 %	0 %	327313133
18241	NC_015311	ATG	2	6	1024081	1024086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313134
18242	NC_015311	GAA	2	6	1024155	1024160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313134
18243	NC_015311	CTG	2	6	1024202	1024207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313134
18244	NC_015311	TGT	3	9	1024218	1024226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313134
18245	NC_015311	AAG	2	6	1024232	1024237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313134
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18247	NC_015311	CAG	2	6	1024272	1024277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313134
18248	NC_015311	GTTG	2	8	1024332	1024339	0 %	50 %	50 %	0 %	327313134
18249	NC_015311	TCA	2	6	1024360	1024365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313134
18250	NC_015311	GAT	2	6	1024422	1024427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313134
18251	NC_015311	TAT	2	6	1024432	1024437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327313134
18252	NC_015311	GAT	2	6	1024477	1024482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313134
18253	NC_015311	GCT	2	6	1024492	1024497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313134
18254	NC_015311	ATATT	2	10	1024572	1024581	40 %	60 %	0 %	0 %	327313134
18255	NC_015311	TGG	2	6	1024587	1024592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313134
18256	NC_015311	GCATG	2	10	1024596	1024605	20 %	20 %	40 %	20 %	327313134
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18258	NC_015311	TAC	2	6	1024685	1024690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313134
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18260	NC_015311	ATT	2	6	1024718	1024723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327313134
18261	NC_015311	ATGG	2	8	1024783	1024790	25 %	25 %	50 %	0 %	327313134
18262	NC_015311	GGT	2	6	1024854	1024859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313134
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18264	NC_015311	CAAA	2	8	1025115	1025122	75 %	0 %	0 %	25 %	327313135
18265	NC_015311	TTCCA	2	10	1025169	1025178	20 %	40 %	0 %	40 %	327313135
18266	NC_015311	TTTTGT	2	12	1025252	1025263	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	327313135
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18268	NC_015311	TGG	2	6	1025313	1025318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313135
18269	NC_015311	AACC	2	8	1025334	1025341	50 %	0 %	0 %	50 %	327313135
18270	NC_015311	TCC	2	6	1025438	1025443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327313135
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18272	NC_015311	AT	3	6	1025514	1025519	50 %	50 %	0 %	0 %	327313135
18273	NC_015311	AGTT	2	8	1025585	1025592	25 %	50 %	25 %	0 %	327313135
18274	NC_015311	TCT	2	6	1025649	1025654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313135
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18283	NC_015311	CTGC	2	8	1032123	1032130	0 %	25 %	25 %	50 %	327313136
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18287	NC_015311	TTGT	2	8	1032559	1032566	0 %	75 %	25 %	0 %	327313137
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18292	NC_015311	TGC	2	6	1032717	1032722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313137
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18301	NC_015311	TG	3	6	1033489	1033494	0 %	50 %	50 %	0 %	327313140
18302	NC_015311	GCTT	2	8	1033629	1033636	0 %	50 %	25 %	25 %	327313141
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18313	NC_015311	GGAA	2	8	1034503	1034510	50 %	0 %	50 %	0 %	327313141
18314	NC_015311	AATGAA	2	12	1034547	1034558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327313142
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18320	NC_015311	CT	4	8	1034760	1034767	0 %	50 %	0 %	50 %	327313142
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18326	NC_015311	GCCA	2	8	1035076	1035083	25 %	0 %	25 %	50 %	327313142
18327	NC_015311	ACG	2	6	1035115	1035120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313142
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18330	NC_015311	TGA	2	6	1035228	1035233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313142
18331	NC_015311	CCGT	2	8	1035264	1035271	0 %	25 %	25 %	50 %	327313142
18332	NC_015311	CTG	2	6	1035330	1035335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313142
18333	NC_015311	ACA	2	6	1035401	1035406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327313142
18334	NC_015311	GTC	2	6	1035415	1035420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313142
18335	NC_015311	CCGA	2	8	1035523	1035530	25 %	0 %	25 %	50 %	327313142
18336	NC_015311	TGC	2	6	1035546	1035551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313142
18337	NC_015311	GAACGG	2	12	1035600	1035611	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	327313142
18338	NC_015311	GGCA	2	8	1035723	1035730	25 %	0 %	50 %	25 %	327313142
18339	NC_015311	GGC	2	6	1035813	1035818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313142
18340	NC_015311	GAA	2	6	1035840	1035845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313142
18341	NC_015311	AGA	2	6	1036021	1036026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313142
18342	NC_015311	ACAGT	2	10	1036035	1036044	40 %	20 %	20 %	20 %	327313143
18343	NC_015311	TGGA	2	8	1036075	1036082	25 %	25 %	50 %	0 %	327313143
18344	NC_015311	GGT	2	6	1036134	1036139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313143
18345	NC_015311	CAT	2	6	1036185	1036190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313143
18346	NC_015311	TTC	2	6	1036225	1036230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327313143
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18348	NC_015311	CACG	2	8	1036284	1036291	25 %	0 %	25 %	50 %	327313143
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18352	NC_015311	TC	3	6	1036349	1036354	0 %	50 %	0 %	50 %	327313143
18353	NC_015311	GTCGCA	2	12	1036363	1036374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327313143
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18463	NC_015311	TCA	2	6	1041958	1041963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313148
18464	NC_015311	GCG	2	6	1041981	1041986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313148
18465	NC_015311	TGA	2	6	1042003	1042008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313148
18466	NC_015311	TGA	2	6	1042090	1042095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313148
18467	NC_015311	TGT	2	6	1042118	1042123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313148
18468	NC_015311	GAAG	2	8	1042163	1042170	50 %	0 %	50 %	0 %	327313148
18469	NC_015311	GAT	2	6	1042265	1042270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313148
18470	NC_015311	CTG	2	6	1042287	1042292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313148
18471	NC_015311	CCT	2	6	1042303	1042308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327313148
18472	NC_015311	GAA	2	6	1042493	1042498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313148
18473	NC_015311	TCC	2	6	1042552	1042557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327313148
18474	NC_015311	TCA	2	6	1042579	1042584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327313148
18475	NC_015311	CGA	2	6	1042586	1042591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313148
18476	NC_015311	CAG	2	6	1042614	1042619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327313148
18477	NC_015311	CAC	2	6	1042627	1042632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327313148
18478	NC_015311	TTA	2	6	1042724	1042729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327313148
18479	NC_015311	TTG	2	6	1042756	1042761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327313148
18480	NC_015311	CGC	2	6	1042770	1042775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327313148
18481	NC_015311	GGT	2	6	1042805	1042810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313148
18482	NC_015311	GAAG	2	8	1042831	1042838	50 %	0 %	50 %	0 %	327313148
18483	NC_015311	ATG	2	6	1042839	1042844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313148
18484	NC_015311	GCT	2	6	1042865	1042870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313148
18485	NC_015311	GCC	2	6	1042872	1042877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327313148
18486	NC_015311	TGG	2	6	1042945	1042950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313148
18487	NC_015311	GCAG	2	8	1042954	1042961	25 %	0 %	50 %	25 %	327313148
18488	NC_015311	CTG	2	6	1043078	1043083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313148
18489	NC_015311	TACGG	2	10	1043112	1043121	20 %	20 %	40 %	20 %	327313148
18490	NC_015311	AGA	2	6	1043122	1043127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327313148
18491	NC_015311	ACC	2	6	1043187	1043192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327313148
18492	NC_015311	GAT	2	6	1043267	1043272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313148
18493	NC_015311	GTG	2	6	1043304	1043309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313148
18494	NC_015311	ATG	3	9	1043373	1043381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327313148
18495	NC_015311	GCGG	2	8	1043392	1043399	0 %	0 %	75 %	25 %	327313148
18496	NC_015311	GGA	2	6	1043404	1043409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327313148
18497	NC_015311	GGC	2	6	1043413	1043418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327313148
18498	NC_015311	CCTG	2	8	1043453	1043460	0 %	25 %	25 %	50 %	327313148
18499	NC_015311	GGT	2	6	1043471	1043476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327313148
18500	NC_015311	CTG	2	6	1043508	1043513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327313148

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