MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoxanthomonas suwonensis 11-1 chromosome

Total Repeats: 87361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014924	GATG	2	8	193	200	25 %	25 %	50 %	0 %	319785621
2	NC_014924	CGT	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
3	NC_014924	TCG	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
4	NC_014924	GCA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785621
5	NC_014924	CGG	2	6	456	461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785621
6	NC_014924	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785621
7	NC_014924	CCGG	2	8	484	491	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
8	NC_014924	TCG	2	6	546	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
9	NC_014924	GCCGC	2	10	573	582	0 %	0 %	40 %	60 %	319785621
10	NC_014924	GGC	2	6	592	597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785621
11	NC_014924	CG	3	6	614	619	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
12	NC_014924	TGC	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
13	NC_014924	CGC	2	6	676	681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785621
14	NC_014924	GCC	2	6	696	701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785621
15	NC_014924	GC	4	8	711	718	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
16	NC_014924	CTT	2	6	754	759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319785621
17	NC_014924	CCG	2	6	780	785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785621
18	NC_014924	CAG	2	6	806	811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785621
19	NC_014924	GCT	2	6	820	825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
20	NC_014924	CGA	2	6	829	834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785621
21	NC_014924	TTC	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319785621
22	NC_014924	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319785621
23	NC_014924	GCA	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785621
24	NC_014924	ATC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785621
25	NC_014924	GCCTG	2	10	981	990	0 %	20 %	40 %	40 %	319785621
26	NC_014924	CCG	2	6	1013	1018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785621
27	NC_014924	CG	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
28	NC_014924	GC	3	6	1055	1060	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
29	NC_014924	GTG	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319785621
30	NC_014924	CTG	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
31	NC_014924	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319785621
32	NC_014924	GC	3	6	1140	1145	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
33	NC_014924	GCC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785621
34	NC_014924	CG	3	6	1181	1186	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
35	NC_014924	GC	4	8	1228	1235	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
36	NC_014924	AGC	2	6	1236	1241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785621
37	NC_014924	AGA	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319785621
38	NC_014924	ACT	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785621
39	NC_014924	CTG	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
40	NC_014924	GC	3	6	1337	1342	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
41	NC_014924	GCCG	2	8	1415	1422	0 %	0 %	50 %	50 %	319785621
42	NC_014924	ACCAC	2	10	1425	1434	40 %	0 %	0 %	60 %	319785621
43	NC_014924	TGC	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785621
44	NC_014924	GCC	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785621
45	NC_014924	CGG	2	6	1875	1880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785622
46	NC_014924	GAT	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319785622
47	NC_014924	GCC	2	6	1977	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785622
48	NC_014924	CG	3	6	2018	2023	0 %	0 %	50 %	50 %	319785622
49	NC_014924	CGTG	2	8	2039	2046	0 %	25 %	50 %	25 %	319785622
50	NC_014924	CGA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785622
51	NC_014924	CAG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785622
52	NC_014924	CTA	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785622
53	NC_014924	CTG	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785622
54	NC_014924	TGCGT	2	10	2305	2314	0 %	40 %	40 %	20 %	319785622
55	NC_014924	AGC	2	6	2359	2364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785622
56	NC_014924	ATC	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785622
57	NC_014924	GCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785622
58	NC_014924	GGC	2	6	2433	2438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785622
59	NC_014924	GCTGGA	2	12	2447	2458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319785622
60	NC_014924	CGA	2	6	2489	2494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785622
61	NC_014924	GAAG	2	8	2567	2574	50 %	0 %	50 %	0 %	319785622
62	NC_014924	CGC	2	6	2600	2605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785622
63	NC_014924	GC	3	6	2612	2617	0 %	0 %	50 %	50 %	319785622
64	NC_014924	CTG	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785622
65	NC_014924	GC	3	6	2794	2799	0 %	0 %	50 %	50 %	319785622
66	NC_014924	CTC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319785622
67	NC_014924	GCC	2	6	2878	2883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785622
68	NC_014924	CGT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785622
69	NC_014924	CCG	2	6	2984	2989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785623
70	NC_014924	CCG	2	6	3021	3026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785623
71	NC_014924	GGGC	2	8	3086	3093	0 %	0 %	75 %	25 %	319785623
72	NC_014924	GCG	2	6	3184	3189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785623
73	NC_014924	GCAGG	2	10	3245	3254	20 %	0 %	60 %	20 %	319785623
74	NC_014924	GGT	2	6	3339	3344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319785623
75	NC_014924	GCC	2	6	3382	3387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785623
76	NC_014924	GCC	2	6	3444	3449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785623
77	NC_014924	GGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785623
78	NC_014924	GGC	2	6	3502	3507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785623
79	NC_014924	CCTGCA	2	12	3639	3650	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319785623
80	NC_014924	GCC	2	6	3677	3682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785623
81	NC_014924	CTG	3	9	3706	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785623
82	NC_014924	CCGCGA	2	12	3717	3728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319785623
83	NC_014924	CA	3	6	3758	3763	50 %	0 %	0 %	50 %	319785623
84	NC_014924	TGC	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785623
85	NC_014924	CGCC	2	8	3873	3880	0 %	0 %	25 %	75 %	319785623
86	NC_014924	CGA	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785623
87	NC_014924	TGC	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785623
88	NC_014924	CGC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785623
89	NC_014924	CGGCC	2	10	4107	4116	0 %	0 %	40 %	60 %	319785623
90	NC_014924	TGC	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
91	NC_014924	CAC	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319785624
92	NC_014924	GGT	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319785624
93	NC_014924	CGA	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
94	NC_014924	GGCC	2	8	4380	4387	0 %	0 %	50 %	50 %	319785624
95	NC_014924	GGA	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319785624
96	NC_014924	CGG	2	6	4490	4495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
97	NC_014924	TGC	2	6	4514	4519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
98	NC_014924	CGG	2	6	4524	4529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
99	NC_014924	CGA	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
100	NC_014924	CGG	2	6	4560	4565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
101	NC_014924	CGGCGT	2	12	4572	4583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319785624
102	NC_014924	GGT	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319785624
103	NC_014924	GCA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
104	NC_014924	AGC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
105	NC_014924	GCCG	2	8	4734	4741	0 %	0 %	50 %	50 %	319785624
106	NC_014924	GC	3	6	4783	4788	0 %	0 %	50 %	50 %	319785624
107	NC_014924	CGA	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
108	NC_014924	GCC	2	6	4856	4861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785624
109	NC_014924	GGC	2	6	4882	4887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
110	NC_014924	TCG	2	6	4898	4903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
111	NC_014924	GCG	2	6	4955	4960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
112	NC_014924	GTG	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319785624
113	NC_014924	CAA	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319785624
114	NC_014924	CCGCG	2	10	5079	5088	0 %	0 %	40 %	60 %	319785624
115	NC_014924	CGA	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
116	NC_014924	CCAG	2	8	5222	5229	25 %	0 %	25 %	50 %	319785624
117	NC_014924	CGG	2	6	5264	5269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
118	NC_014924	GAG	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319785624
119	NC_014924	TCG	2	6	5336	5341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
120	NC_014924	GTC	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
121	NC_014924	CGC	2	6	5355	5360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785624
122	NC_014924	CGCA	2	8	5376	5383	25 %	0 %	25 %	50 %	319785624
123	NC_014924	CGC	2	6	5401	5406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785624
124	NC_014924	GC	3	6	5411	5416	0 %	0 %	50 %	50 %	319785624
125	NC_014924	TCG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
126	NC_014924	CGG	2	6	5504	5509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785624
127	NC_014924	CCGCAA	2	12	5529	5540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319785624
128	NC_014924	TGC	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
129	NC_014924	CG	4	8	5587	5594	0 %	0 %	50 %	50 %	319785624
130	NC_014924	ACC	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319785624
131	NC_014924	CAT	4	12	5700	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785624
132	NC_014924	CTG	3	9	5749	5757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
133	NC_014924	TTC	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319785624
134	NC_014924	GCT	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785624
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136	NC_014924	GAC	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785624
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232	NC_014924	ACT	2	6	9373	9378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785627
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236	NC_014924	CAG	2	6	9513	9518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785627
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240	NC_014924	GAA	2	6	9739	9744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319785628
241	NC_014924	CAT	2	6	9774	9779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785628
242	NC_014924	GGC	2	6	9810	9815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785628
243	NC_014924	TGC	3	9	9821	9829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785628
244	NC_014924	CGC	3	9	9902	9910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
245	NC_014924	CGC	7	21	9914	9934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
246	NC_014924	GCC	4	12	9948	9959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
247	NC_014924	CGC	2	6	9974	9979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
248	NC_014924	GCC	4	12	9996	10007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
249	NC_014924	CCG	2	6	10015	10020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
250	NC_014924	CG	3	6	10037	10042	0 %	0 %	50 %	50 %	319785628
251	NC_014924	TCG	2	6	10052	10057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785628
252	NC_014924	CGC	2	6	10067	10072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
253	NC_014924	CGCCGG	2	12	10079	10090	0 %	0 %	50 %	50 %	319785628
254	NC_014924	CCG	2	6	10138	10143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
255	NC_014924	CCCG	2	8	10149	10156	0 %	0 %	25 %	75 %	319785628
256	NC_014924	CCG	3	9	10154	10162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785628
257	NC_014924	CG	3	6	10161	10166	0 %	0 %	50 %	50 %	319785628
258	NC_014924	TCGACG	2	12	10199	10210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319785628
259	NC_014924	CCGCG	2	10	10269	10278	0 %	0 %	40 %	60 %	319785628
260	NC_014924	GGC	2	6	10321	10326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785628
261	NC_014924	GGC	2	6	10332	10337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785628
262	NC_014924	TGC	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785629
263	NC_014924	GCC	4	12	10494	10505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785629
264	NC_014924	CGC	2	6	10514	10519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785629
265	NC_014924	ACC	2	6	10563	10568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319785629
266	NC_014924	CGG	2	6	10681	10686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785629
267	NC_014924	CAT	2	6	10742	10747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785629
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270	NC_014924	GCC	2	6	10806	10811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785629
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275	NC_014924	CTG	2	6	10986	10991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785629
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279	NC_014924	TCG	2	6	11110	11115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785629
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283	NC_014924	CG	3	6	11224	11229	0 %	0 %	50 %	50 %	319785629
284	NC_014924	ACA	2	6	11297	11302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319785630
285	NC_014924	ATGA	2	8	11314	11321	50 %	25 %	25 %	0 %	319785630
286	NC_014924	TGC	2	6	11357	11362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785630
287	NC_014924	TCA	2	6	11363	11368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785630
288	NC_014924	TCA	3	9	11372	11380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785630
289	NC_014924	CGC	2	6	11384	11389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785630
290	NC_014924	AAGGTG	2	12	11401	11412	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319785630
291	NC_014924	ATG	2	6	11464	11469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319785630
292	NC_014924	GGA	2	6	11490	11495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319785630
293	NC_014924	ACG	2	6	11513	11518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785630
294	NC_014924	CAG	2	6	11566	11571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785630
295	NC_014924	C	6	6	11573	11578	0 %	0 %	0 %	100 %	319785630
296	NC_014924	GCC	2	6	11580	11585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785630
297	NC_014924	GC	3	6	11595	11600	0 %	0 %	50 %	50 %	319785630
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363	NC_014924	GTA	2	6	14619	14624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319785634
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369	NC_014924	GC	3	6	14754	14759	0 %	0 %	50 %	50 %	319785634
370	NC_014924	GTC	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785634
371	NC_014924	TCG	2	6	14792	14797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319785634
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373	NC_014924	GGC	2	6	14843	14848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785634
374	NC_014924	GCA	2	6	14951	14956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785634
375	NC_014924	CCA	2	6	14966	14971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319785634
376	NC_014924	AGC	2	6	14986	14991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785634
377	NC_014924	GAG	2	6	15054	15059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319785634
378	NC_014924	GC	4	8	15181	15188	0 %	0 %	50 %	50 %	319785635
379	NC_014924	GCCGG	2	10	15197	15206	0 %	0 %	60 %	40 %	319785635
380	NC_014924	ACC	4	12	15213	15224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319785635
381	NC_014924	GAC	2	6	15234	15239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319785635
382	NC_014924	GAG	2	6	15309	15314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319785635
383	NC_014924	CG	3	6	15317	15322	0 %	0 %	50 %	50 %	319785635
384	NC_014924	CAT	2	6	15326	15331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319785635
385	NC_014924	CAA	2	6	15338	15343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319785635
386	NC_014924	CGG	2	6	15606	15611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319785635
387	NC_014924	CGACCT	2	12	15680	15691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319785635
388	NC_014924	CGC	2	6	15701	15706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319785635
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