MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B04

Total Repeats: 6084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014841	CAA	2	6	57242	57247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052949
1002	NC_014841	TG	4	8	57261	57268	0 %	50 %	50 %	0 %	317052949
1003	NC_014841	CCA	2	6	57705	57710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052950
1004	NC_014841	TTG	2	6	57725	57730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052950
1005	NC_014841	CTG	2	6	57883	57888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052950
1006	NC_014841	TGC	2	6	57902	57907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052950
1007	NC_014841	CCA	2	6	57929	57934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052950
1008	NC_014841	GCT	2	6	58062	58067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052950
1009	NC_014841	GCGT	2	8	58073	58080	0 %	25 %	50 %	25 %	317052950
1010	NC_014841	CTG	2	6	58114	58119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052950
1011	NC_014841	CGTG	2	8	58122	58129	0 %	25 %	50 %	25 %	317052950
1012	NC_014841	GCC	2	6	58202	58207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052951
1013	NC_014841	ATC	2	6	58301	58306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052951
1014	NC_014841	CCG	2	6	58368	58373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052951
1015	NC_014841	TGC	2	6	58375	58380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052951
1016	NC_014841	GGT	3	9	58405	58413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052951
1017	NC_014841	GC	3	6	58444	58449	0 %	0 %	50 %	50 %	317052951
1018	NC_014841	TGG	3	9	58464	58472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052951
1019	NC_014841	ACA	2	6	58509	58514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052951
1020	NC_014841	GCG	2	6	58536	58541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052951
1021	NC_014841	GAT	2	6	58588	58593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052951
1022	NC_014841	CTG	2	6	58663	58668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052951
1023	NC_014841	GC	3	6	58688	58693	0 %	0 %	50 %	50 %	317052951
1024	NC_014841	TGA	2	6	58701	58706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052951
1025	NC_014841	GAG	2	6	58715	58720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052951
1026	NC_014841	TGG	2	6	58749	58754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052951
1027	NC_014841	CAC	2	6	58793	58798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052951
1028	NC_014841	GCT	2	6	58812	58817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052951
1029	NC_014841	GGCT	2	8	58835	58842	0 %	25 %	50 %	25 %	317052951
1030	NC_014841	CAT	2	6	58918	58923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052951
1031	NC_014841	GCC	2	6	58948	58953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052951
1032	NC_014841	CAAACG	2	12	59008	59019	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	317052951
1033	NC_014841	ATG	2	6	59021	59026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052951
1034	NC_014841	CG	3	6	59044	59049	0 %	0 %	50 %	50 %	317052951
1035	NC_014841	ATT	2	6	59056	59061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052951
1036	NC_014841	CCCG	2	8	59084	59091	0 %	0 %	25 %	75 %	317052951
1037	NC_014841	TGA	3	9	59107	59115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052951
1038	NC_014841	GGA	2	6	59126	59131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052951
1039	NC_014841	CAG	2	6	59163	59168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052951
1040	NC_014841	TCA	2	6	59203	59208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052952
1041	NC_014841	GCA	2	6	59213	59218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052952
1042	NC_014841	GTC	2	6	59230	59235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052952
1043	NC_014841	TGG	2	6	59237	59242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052952
1044	NC_014841	ATC	2	6	59257	59262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052952
1045	NC_014841	ACA	2	6	59371	59376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052952
1046	NC_014841	GA	3	6	59392	59397	50 %	0 %	50 %	0 %	317052952
1047	NC_014841	CGG	2	6	59437	59442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052952
1048	NC_014841	ACC	2	6	59496	59501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052952
1049	NC_014841	TGC	2	6	59503	59508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052952
1050	NC_014841	CG	3	6	59532	59537	0 %	0 %	50 %	50 %	317052952
1051	NC_014841	GGC	2	6	59573	59578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052952
1052	NC_014841	GCA	2	6	59581	59586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052952
1053	NC_014841	GC	3	6	59592	59597	0 %	0 %	50 %	50 %	317052952
1054	NC_014841	GCG	2	6	59631	59636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052952
1055	NC_014841	TGA	2	6	59665	59670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052952
1056	NC_014841	GC	3	6	59703	59708	0 %	0 %	50 %	50 %	317052952
1057	NC_014841	C	6	6	59775	59780	0 %	0 %	0 %	100 %	317052952
1058	NC_014841	GC	3	6	59864	59869	0 %	0 %	50 %	50 %	317052952
1059	NC_014841	GGTCA	2	10	59952	59961	20 %	20 %	40 %	20 %	317052952
1060	NC_014841	CTGG	2	8	59973	59980	0 %	25 %	50 %	25 %	317052952
1061	NC_014841	TGT	2	6	60050	60055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052952
1062	NC_014841	TCC	2	6	60120	60125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317052952
1063	NC_014841	GAG	2	6	60247	60252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052952
1064	NC_014841	AAT	2	6	60255	60260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052953
1065	NC_014841	GCA	2	6	60312	60317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052953
1066	NC_014841	TGCGC	2	10	60324	60333	0 %	20 %	40 %	40 %	317052953
1067	NC_014841	TCT	2	6	60341	60346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052953
1068	NC_014841	TGTT	2	8	60362	60369	0 %	75 %	25 %	0 %	317052953
1069	NC_014841	GAT	2	6	60382	60387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052953
1070	NC_014841	ATCG	2	8	60388	60395	25 %	25 %	25 %	25 %	317052953
1071	NC_014841	TGG	2	6	60410	60415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052953
1072	NC_014841	GGT	2	6	60430	60435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052953
1073	NC_014841	GGT	2	6	60447	60452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052953
1074	NC_014841	TCG	2	6	60525	60530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052953
1075	NC_014841	GC	3	6	60575	60580	0 %	0 %	50 %	50 %	317052953
1076	NC_014841	GTT	2	6	60633	60638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052953
1077	NC_014841	CTGG	2	8	60666	60673	0 %	25 %	50 %	25 %	317052953
1078	NC_014841	CA	3	6	60874	60879	50 %	0 %	0 %	50 %	317052954
1079	NC_014841	CAG	2	6	60891	60896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052954
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1081	NC_014841	AGG	2	6	60913	60918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052954
1082	NC_014841	GTG	2	6	61043	61048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052954
1083	NC_014841	GGGC	2	8	61085	61092	0 %	0 %	75 %	25 %	317052954
1084	NC_014841	GGT	2	6	61103	61108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052954
1085	NC_014841	GGC	3	9	61163	61171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052954
1086	NC_014841	TCG	2	6	61195	61200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052954
1087	NC_014841	CG	3	6	61263	61268	0 %	0 %	50 %	50 %	317052954
1088	NC_014841	TGG	2	6	61309	61314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052954
1089	NC_014841	TCC	2	6	61340	61345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317052954
1090	NC_014841	GGC	2	6	61373	61378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052954
1091	NC_014841	TGC	2	6	61408	61413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052954
1092	NC_014841	TGA	2	6	61486	61491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052954
1093	NC_014841	GAC	2	6	61548	61553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052954
1094	NC_014841	T	6	6	61595	61600	0 %	100 %	0 %	0 %	317052954
1095	NC_014841	CGC	2	6	61625	61630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052954
1096	NC_014841	CAA	2	6	61635	61640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052954
1097	NC_014841	CGA	2	6	61690	61695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052954
1098	NC_014841	TCA	2	6	61702	61707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052954
1099	NC_014841	GCA	3	9	61718	61726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052954
1100	NC_014841	CAA	2	6	61749	61754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052954
1101	NC_014841	TGCC	2	8	61794	61801	0 %	25 %	25 %	50 %	317052955
1102	NC_014841	TGT	2	6	61810	61815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052955
1103	NC_014841	GCA	2	6	61830	61835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052955
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1105	NC_014841	GGA	2	6	61903	61908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052955
1106	NC_014841	CGG	2	6	62001	62006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052955
1107	NC_014841	GCA	3	9	62038	62046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052955
1108	NC_014841	A	6	6	62058	62063	100 %	0 %	0 %	0 %	317052955
1109	NC_014841	AAC	2	6	62104	62109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052956
1110	NC_014841	GTC	2	6	62122	62127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052956
1111	NC_014841	ATT	2	6	62128	62133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052956
1112	NC_014841	GGC	2	6	62134	62139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052956
1113	NC_014841	A	7	7	62177	62183	100 %	0 %	0 %	0 %	317052956
1114	NC_014841	GCCTG	2	10	62213	62222	0 %	20 %	40 %	40 %	317052956
1115	NC_014841	GGCGT	2	10	62223	62232	0 %	20 %	60 %	20 %	317052956
1116	NC_014841	AGC	2	6	62234	62239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052956
1117	NC_014841	TGC	2	6	62327	62332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052956
1118	NC_014841	TGA	2	6	62334	62339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052956
1119	NC_014841	GGT	2	6	62412	62417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052956
1120	NC_014841	CCG	2	6	62465	62470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052956
1121	NC_014841	GGT	2	6	62475	62480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052956
1122	NC_014841	TGG	2	6	62606	62611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052956
1123	NC_014841	CGC	2	6	62665	62670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052956
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1125	NC_014841	CG	3	6	62696	62701	0 %	0 %	50 %	50 %	317052956
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