MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B04

Total Repeats: 6084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014841	GCC	2	6	27829	27834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052921
502	NC_014841	CCA	2	6	27844	27849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052921
503	NC_014841	TGG	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052921
504	NC_014841	GATC	2	8	28044	28051	25 %	25 %	25 %	25 %	317052921
505	NC_014841	CGC	2	6	28089	28094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052921
506	NC_014841	GCG	2	6	28102	28107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052921
507	NC_014841	GAG	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052921
508	NC_014841	CGG	2	6	28172	28177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052921
509	NC_014841	TCA	2	6	28310	28315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052921
510	NC_014841	C	6	6	28375	28380	0 %	0 %	0 %	100 %	317052921
511	NC_014841	GGA	2	6	28474	28479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052921
512	NC_014841	GCC	2	6	28549	28554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052921
513	NC_014841	AAGC	2	8	28578	28585	50 %	0 %	25 %	25 %	317052921
514	NC_014841	GCTGC	2	10	28601	28610	0 %	20 %	40 %	40 %	317052921
515	NC_014841	GCGT	2	8	28754	28761	0 %	25 %	50 %	25 %	317052922
516	NC_014841	TCT	2	6	28782	28787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052922
517	NC_014841	TGG	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052922
518	NC_014841	GCCGT	2	10	29037	29046	0 %	20 %	40 %	40 %	317052922
519	NC_014841	GTT	2	6	29051	29056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052922
520	NC_014841	GAA	2	6	29108	29113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052922
521	NC_014841	GGC	2	6	29123	29128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052922
522	NC_014841	GTT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052922
523	NC_014841	CGC	3	9	29230	29238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052922
524	NC_014841	CGC	2	6	29314	29319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052922
525	NC_014841	GCA	2	6	29341	29346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052922
526	NC_014841	GGT	2	6	29471	29476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052922
527	NC_014841	CAG	2	6	29492	29497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052922
528	NC_014841	CGT	2	6	29504	29509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052922
529	NC_014841	CAG	2	6	29573	29578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052922
530	NC_014841	CAG	2	6	29585	29590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052922
531	NC_014841	GCA	2	6	29672	29677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052923
532	NC_014841	CCA	2	6	29774	29779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052923
533	NC_014841	GGT	2	6	29790	29795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052923
534	NC_014841	AGCG	2	8	29848	29855	25 %	0 %	50 %	25 %	317052923
535	NC_014841	AAC	2	6	29930	29935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052923
536	NC_014841	GCG	2	6	29981	29986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052923
537	NC_014841	GCA	2	6	29987	29992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052923
538	NC_014841	TCCA	2	8	30031	30038	25 %	25 %	0 %	50 %	317052923
539	NC_014841	TGT	2	6	30065	30070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052923
540	NC_014841	CAC	3	9	30081	30089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052923
541	NC_014841	CGG	2	6	30098	30103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052923
542	NC_014841	AAT	2	6	30117	30122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052923
543	NC_014841	ACC	2	6	30350	30355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052923
544	NC_014841	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	317052923
545	NC_014841	GCA	2	6	30394	30399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052923
546	NC_014841	TGC	2	6	30511	30516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052923
547	NC_014841	GTT	2	6	30539	30544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052923
548	NC_014841	ACC	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052923
549	NC_014841	TCG	2	6	30637	30642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052923
550	NC_014841	ATG	2	6	31064	31069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052924
551	NC_014841	ACT	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052924
552	NC_014841	GCAAA	2	10	31199	31208	60 %	0 %	20 %	20 %	317052924
553	NC_014841	GAT	2	6	31231	31236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052924
554	NC_014841	GGC	2	6	31258	31263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052924
555	NC_014841	G	6	6	31281	31286	0 %	0 %	100 %	0 %	317052924
556	NC_014841	ACCTC	2	10	31298	31307	20 %	20 %	0 %	60 %	317052924
557	NC_014841	TGG	2	6	31356	31361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052924
558	NC_014841	CAT	2	6	31464	31469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052924
559	NC_014841	GAT	2	6	31482	31487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052924
560	NC_014841	GCT	2	6	31554	31559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052924
561	NC_014841	CTG	2	6	31564	31569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052924
562	NC_014841	TCGCCC	2	12	31688	31699	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	317052924
563	NC_014841	CG	3	6	31726	31731	0 %	0 %	50 %	50 %	317052924
564	NC_014841	GCAG	2	8	31830	31837	25 %	0 %	50 %	25 %	317052924
565	NC_014841	TGA	2	6	31916	31921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052924
566	NC_014841	CGTTA	2	10	32052	32061	20 %	40 %	20 %	20 %	317052925
567	NC_014841	A	6	6	32071	32076	100 %	0 %	0 %	0 %	317052925
568	NC_014841	TGA	2	6	32159	32164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052925
569	NC_014841	GTCA	2	8	32210	32217	25 %	25 %	25 %	25 %	317052925
570	NC_014841	CCT	2	6	32252	32257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317052925
571	NC_014841	GCA	2	6	32269	32274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052925
572	NC_014841	ACTG	2	8	32290	32297	25 %	25 %	25 %	25 %	317052925
573	NC_014841	GGT	2	6	32368	32373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052925
574	NC_014841	ATC	2	6	32429	32434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052925
575	NC_014841	GTG	2	6	32435	32440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052925
576	NC_014841	GCG	2	6	32465	32470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052925
577	NC_014841	TGA	2	6	32489	32494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052925
578	NC_014841	TTC	2	6	32656	32661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052926
579	NC_014841	CTG	2	6	32750	32755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052926
580	NC_014841	CAGAAA	2	12	32797	32808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	317052926
581	NC_014841	CG	3	6	32878	32883	0 %	0 %	50 %	50 %	317052926
582	NC_014841	AT	3	6	32946	32951	50 %	50 %	0 %	0 %	317052926
583	NC_014841	ATC	2	6	32987	32992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052926
584	NC_014841	T	7	7	33019	33025	0 %	100 %	0 %	0 %	317052926
585	NC_014841	TGC	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052926
586	NC_014841	TG	3	6	33087	33092	0 %	50 %	50 %	0 %	317052926
587	NC_014841	CCGC	2	8	33098	33105	0 %	0 %	25 %	75 %	317052926
588	NC_014841	TAA	2	6	33358	33363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052926
589	NC_014841	TGT	2	6	33429	33434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052926
590	NC_014841	T	6	6	33484	33489	0 %	100 %	0 %	0 %	317052926
591	NC_014841	AGCC	2	8	33553	33560	25 %	0 %	25 %	50 %	317052926
592	NC_014841	ACC	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052926
593	NC_014841	ACG	2	6	33699	33704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052926
594	NC_014841	CT	3	6	33758	33763	0 %	50 %	0 %	50 %	317052926
595	NC_014841	ACC	2	6	33800	33805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052926
596	NC_014841	TCAGA	2	10	33826	33835	40 %	20 %	20 %	20 %	317052926
597	NC_014841	CCA	2	6	33955	33960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052926
598	NC_014841	AAT	2	6	33980	33985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052926
599	NC_014841	CCCT	2	8	34029	34036	0 %	25 %	0 %	75 %	317052926
600	NC_014841	AGT	2	6	34077	34082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052926
601	NC_014841	TGC	2	6	34110	34115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052926
602	NC_014841	ATT	2	6	34118	34123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052926
603	NC_014841	TCT	2	6	34170	34175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052926
604	NC_014841	AGCA	2	8	34232	34239	50 %	0 %	25 %	25 %	317052926
605	NC_014841	GTCAT	2	10	34251	34260	20 %	40 %	20 %	20 %	317052926
606	NC_014841	T	6	6	34313	34318	0 %	100 %	0 %	0 %	317052926
607	NC_014841	TGGC	2	8	34345	34352	0 %	25 %	50 %	25 %	317052926
608	NC_014841	TCCTT	2	10	34374	34383	0 %	60 %	0 %	40 %	317052926
609	NC_014841	CAAA	2	8	34385	34392	75 %	0 %	0 %	25 %	317052926
610	NC_014841	CTGA	2	8	34411	34418	25 %	25 %	25 %	25 %	317052926
611	NC_014841	TTGA	2	8	34454	34461	25 %	50 %	25 %	0 %	317052926
612	NC_014841	TTG	2	6	34479	34484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052926
613	NC_014841	CTC	2	6	34520	34525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317052926
614	NC_014841	GCC	2	6	34547	34552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052926
615	NC_014841	ACC	2	6	34619	34624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052926
616	NC_014841	CAA	2	6	34654	34659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052926
617	NC_014841	AAT	2	6	34673	34678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052926
618	NC_014841	TAA	2	6	34955	34960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052927
619	NC_014841	TTG	2	6	34976	34981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052927
620	NC_014841	GCT	2	6	34986	34991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052927
621	NC_014841	GAA	2	6	35010	35015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052927
622	NC_014841	GCCCG	2	10	35052	35061	0 %	0 %	40 %	60 %	317052927
623	NC_014841	TGT	2	6	35063	35068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052927
624	NC_014841	GGA	2	6	35079	35084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052927
625	NC_014841	TGT	2	6	35186	35191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052927
626	NC_014841	TGG	2	6	35237	35242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052927
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628	NC_014841	CCA	2	6	35260	35265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052927
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