MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B04

Total Repeats: 6084

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014841	CTGG	2	8	313134	313141	0 %	25 %	50 %	25 %	317053182
6002	NC_014841	TGAT	2	8	313175	313182	25 %	50 %	25 %	0 %	317053182
6003	NC_014841	TTG	2	6	313199	313204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053182
6004	NC_014841	CAA	2	6	313231	313236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053182
6005	NC_014841	GC	3	6	313269	313274	0 %	0 %	50 %	50 %	317053182
6006	NC_014841	CAA	2	6	313339	313344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053182
6007	NC_014841	TTC	2	6	313378	313383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053182
6008	NC_014841	ACC	2	6	313400	313405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053182
6009	NC_014841	CGC	2	6	313410	313415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053182
6010	NC_014841	ATC	2	6	313436	313441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053182
6011	NC_014841	CGTG	2	8	313936	313943	0 %	25 %	50 %	25 %	317053183
6012	NC_014841	T	6	6	314060	314065	0 %	100 %	0 %	0 %	317053183
6013	NC_014841	ACA	2	6	314176	314181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053183
6014	NC_014841	GGA	2	6	314277	314282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317053183
6015	NC_014841	AAT	3	9	314285	314293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317053183
6016	NC_014841	CCG	2	6	314304	314309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053183
6017	NC_014841	GCG	2	6	314326	314331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053183
6018	NC_014841	GCC	2	6	314336	314341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053183
6019	NC_014841	AGG	2	6	314346	314351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317053183
6020	NC_014841	CTG	2	6	314414	314419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053183
6021	NC_014841	ATG	2	6	314598	314603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053183
6022	NC_014841	TTG	2	6	314637	314642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053183
6023	NC_014841	CAA	2	6	314649	314654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053183
6024	NC_014841	AGC	2	6	314734	314739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053183
6025	NC_014841	GTG	2	6	314745	314750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053183
6026	NC_014841	CG	3	6	314765	314770	0 %	0 %	50 %	50 %	317053183
6027	NC_014841	ATCC	2	8	314798	314805	25 %	25 %	0 %	50 %	317053183
6028	NC_014841	CAT	2	6	314991	314996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053183
6029	NC_014841	ATG	2	6	315024	315029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053183
6030	NC_014841	GAT	2	6	315053	315058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053183
6031	NC_014841	TA	3	6	315113	315118	50 %	50 %	0 %	0 %	317053183
6032	NC_014841	CG	3	6	315120	315125	0 %	0 %	50 %	50 %	317053183
6033	NC_014841	AGCA	2	8	315186	315193	50 %	0 %	25 %	25 %	317053183
6034	NC_014841	TCAA	2	8	315254	315261	50 %	25 %	0 %	25 %	317053183
6035	NC_014841	TCA	2	6	315339	315344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053183
6036	NC_014841	GAG	2	6	315365	315370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317053183
6037	NC_014841	CTG	2	6	315466	315471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053184
6038	NC_014841	GC	3	6	315485	315490	0 %	0 %	50 %	50 %	317053184
6039	NC_014841	AGC	2	6	315515	315520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053184
6040	NC_014841	GAA	2	6	315568	315573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053184
6041	NC_014841	GGC	2	6	315607	315612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053184
6042	NC_014841	CAT	2	6	315666	315671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053184
6043	NC_014841	GGC	2	6	315801	315806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053184
6044	NC_014841	TCA	2	6	315816	315821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053184
6045	NC_014841	GGC	2	6	315871	315876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053184
6046	NC_014841	GGT	2	6	315894	315899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053184
6047	NC_014841	CAGC	2	8	315956	315963	25 %	0 %	25 %	50 %	317053184
6048	NC_014841	GGT	2	6	315978	315983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053184
6049	NC_014841	CTA	2	6	316083	316088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053184
6050	NC_014841	TGA	2	6	316194	316199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053184
6051	NC_014841	TGC	2	6	316209	316214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053184
6052	NC_014841	CAG	2	6	316215	316220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053184
6053	NC_014841	GAT	2	6	316300	316305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053184
6054	NC_014841	TGCC	2	8	316307	316314	0 %	25 %	25 %	50 %	317053184
6055	NC_014841	ATA	2	6	316579	316584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317053185
6056	NC_014841	GGC	2	6	316646	316651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053185
6057	NC_014841	TCAC	2	8	316752	316759	25 %	25 %	0 %	50 %	317053185
6058	NC_014841	CTG	2	6	316767	316772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053185
6059	NC_014841	AATGA	2	10	316779	316788	60 %	20 %	20 %	0 %	317053185
6060	NC_014841	CCA	2	6	316807	316812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053185
6061	NC_014841	ATG	2	6	316848	316853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053185
6062	NC_014841	GTG	2	6	316860	316865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053185
6063	NC_014841	GCC	2	6	316947	316952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053185
6064	NC_014841	AGCA	2	8	317046	317053	50 %	0 %	25 %	25 %	317053185
6065	NC_014841	GCG	2	6	317077	317082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053185
6066	NC_014841	CGC	2	6	317141	317146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053185
6067	NC_014841	GAA	2	6	317153	317158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053185
6068	NC_014841	CG	3	6	317274	317279	0 %	0 %	50 %	50 %	317053185
6069	NC_014841	TTA	2	6	317306	317311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317053185
6070	NC_014841	CAC	2	6	317336	317341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053185
6071	NC_014841	CTGG	2	8	317354	317361	0 %	25 %	50 %	25 %	317053185
6072	NC_014841	CGCC	2	8	317434	317441	0 %	0 %	25 %	75 %	317053185
6073	NC_014841	CGC	2	6	317524	317529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053185
6074	NC_014841	CCCAT	2	10	317539	317548	20 %	20 %	0 %	60 %	317053185
6075	NC_014841	CTGGCG	2	12	317648	317659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317053185
6076	NC_014841	GCG	2	6	317682	317687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053185
6077	NC_014841	TGGAC	2	10	317692	317701	20 %	20 %	40 %	20 %	317053185
6078	NC_014841	TTC	2	6	317753	317758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053185
6079	NC_014841	GCA	2	6	317894	317899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053185
6080	NC_014841	GTG	2	6	317929	317934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053185
6081	NC_014841	CCG	2	6	317952	317957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053185
6082	NC_014841	AGCG	2	8	317975	317982	25 %	0 %	50 %	25 %	317053185
6083	NC_014841	AGTC	2	8	318002	318009	25 %	25 %	25 %	25 %	317053185
6084	NC_014841	TC	3	6	318060	318065	0 %	50 %	0 %	50 %	317053185

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.