MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B02

Total Repeats: 5534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014839	TGC	3	9	392253	392261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053817
5502	NC_014839	CTGG	2	8	392349	392356	0 %	25 %	50 %	25 %	317053817
5503	NC_014839	AGA	2	6	392369	392374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053817
5504	NC_014839	CTG	2	6	392431	392436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053817
5505	NC_014839	CTA	2	6	392490	392495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053817
5506	NC_014839	CGG	2	6	392631	392636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053817
5507	NC_014839	GGC	2	6	392658	392663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053817
5508	NC_014839	GGCA	2	8	392670	392677	25 %	0 %	50 %	25 %	317053817
5509	NC_014839	GGC	2	6	392679	392684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053817
5510	NC_014839	TGG	2	6	392693	392698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053817
5511	NC_014839	ACC	2	6	392761	392766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053817
5512	NC_014839	GGC	2	6	392775	392780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053817
5513	NC_014839	CAG	2	6	392817	392822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053817
5514	NC_014839	CGT	2	6	392856	392861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053817
5515	NC_014839	CAA	2	6	392871	392876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053817
5516	NC_014839	GAAGC	2	10	392896	392905	40 %	0 %	40 %	20 %	317053817
5517	NC_014839	AACTG	2	10	393048	393057	40 %	20 %	20 %	20 %	317053818
5518	NC_014839	CTG	2	6	393067	393072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053818
5519	NC_014839	CA	3	6	393132	393137	50 %	0 %	0 %	50 %	317053818
5520	NC_014839	TTC	2	6	393143	393148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053818
5521	NC_014839	T	6	6	393238	393243	0 %	100 %	0 %	0 %	317053818
5522	NC_014839	TGTA	2	8	393245	393252	25 %	50 %	25 %	0 %	317053818
5523	NC_014839	CTG	2	6	393253	393258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053818
5524	NC_014839	CGGTA	2	10	393282	393291	20 %	20 %	40 %	20 %	317053818
5525	NC_014839	TTA	2	6	393345	393350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317053818
5526	NC_014839	TGC	2	6	393689	393694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053819
5527	NC_014839	TGA	2	6	393785	393790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053819
5528	NC_014839	ATG	2	6	393796	393801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053819
5529	NC_014839	CAG	2	6	393807	393812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053819
5530	NC_014839	TGCGC	2	10	393831	393840	0 %	20 %	40 %	40 %	317053819
5531	NC_014839	TGC	2	6	393878	393883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053819
5532	NC_014839	CCT	2	6	393888	393893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053819
5533	NC_014839	GCC	2	6	393901	393906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053819
5534	NC_014839	TGG	2	6	393932	393937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053819

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.