MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b chromosome

Total Repeats: 85350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014837	CCG	2	6	493	498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046239
2	NC_014837	GCT	2	6	680	685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
3	NC_014837	GAAT	2	8	686	693	50 %	25 %	25 %	0 %	317046239
4	NC_014837	TGCGG	2	10	696	705	0 %	20 %	60 %	20 %	317046239
5	NC_014837	TGC	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
6	NC_014837	CCAG	2	8	760	767	25 %	0 %	25 %	50 %	317046239
7	NC_014837	GC	3	6	787	792	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
8	NC_014837	TCCGGC	2	12	812	823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317046239
9	NC_014837	TTG	2	6	916	921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046239
10	NC_014837	GC	4	8	942	949	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
11	NC_014837	GGC	2	6	950	955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046239
12	NC_014837	GTG	2	6	979	984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046239
13	NC_014837	GTT	2	6	995	1000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046239
14	NC_014837	CAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046239
15	NC_014837	GC	3	6	1065	1070	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
16	NC_014837	GTG	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046239
17	NC_014837	AAC	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046239
18	NC_014837	TTA	2	6	1166	1171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317046239
19	NC_014837	TTC	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317046239
20	NC_014837	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046239
21	NC_014837	GCT	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
22	NC_014837	ATC	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046239
23	NC_014837	GACT	2	8	1360	1367	25 %	25 %	25 %	25 %	317046239
24	NC_014837	GCC	2	6	1379	1384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046239
25	NC_014837	CG	3	6	1396	1401	0 %	0 %	50 %	50 %	317046239
26	NC_014837	TGA	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046239
27	NC_014837	GCCAAC	2	12	1527	1538	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	317046239
28	NC_014837	CGTG	2	8	1568	1575	0 %	25 %	50 %	25 %	317046239
29	NC_014837	CTG	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
30	NC_014837	CTG	2	6	1674	1679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046239
31	NC_014837	CACGTC	2	12	1705	1716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317046239
32	NC_014837	GATGGC	3	18	1718	1735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317046239
33	NC_014837	ACCA	2	8	1746	1753	50 %	0 %	0 %	50 %	317046239
34	NC_014837	TGG	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046239
35	NC_014837	ACC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046239
36	NC_014837	AGC	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046239
37	NC_014837	AG	3	6	1841	1846	50 %	0 %	50 %	0 %	317046239
38	NC_014837	AGA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046239
39	NC_014837	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046240
40	NC_014837	CAA	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046240
41	NC_014837	TGG	2	6	1965	1970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046240
42	NC_014837	TGC	3	9	2000	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046240
43	NC_014837	TGC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046240
44	NC_014837	TGGAAA	2	12	2048	2059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317046240
45	NC_014837	TGG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046240
46	NC_014837	CG	3	6	2066	2071	0 %	0 %	50 %	50 %	317046240
47	NC_014837	ACC	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046240
48	NC_014837	CTGC	2	8	2233	2240	0 %	25 %	25 %	50 %	317046240
49	NC_014837	TAC	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046240
50	NC_014837	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046240
51	NC_014837	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046240
52	NC_014837	AGC	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046240
53	NC_014837	CGC	2	6	2635	2640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046240
54	NC_014837	GAA	2	6	2649	2654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046240
55	NC_014837	CG	3	6	2707	2712	0 %	0 %	50 %	50 %	317046240
56	NC_014837	CAA	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046240
57	NC_014837	GAA	2	6	2800	2805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046240
58	NC_014837	CTG	3	9	2914	2922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046240
59	NC_014837	CGG	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046240
60	NC_014837	TGT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046240
61	NC_014837	CCT	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317046241
62	NC_014837	TGC	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
63	NC_014837	AGCG	2	8	3317	3324	25 %	0 %	50 %	25 %	317046241
64	NC_014837	GTT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046241
65	NC_014837	TTTAC	2	10	3452	3461	20 %	60 %	0 %	20 %	317046241
66	NC_014837	CGG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046241
67	NC_014837	GCT	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
68	NC_014837	TGC	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
69	NC_014837	T	6	6	3526	3531	0 %	100 %	0 %	0 %	317046241
70	NC_014837	AGC	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046241
71	NC_014837	CGC	2	6	3574	3579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046241
72	NC_014837	CTG	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
73	NC_014837	CG	3	6	3812	3817	0 %	0 %	50 %	50 %	317046241
74	NC_014837	GCA	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046241
75	NC_014837	CGT	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046241
76	NC_014837	TGAT	2	8	3987	3994	25 %	50 %	25 %	0 %	317046241
77	NC_014837	CGC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046241
78	NC_014837	CGCAGG	2	12	4056	4067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	317046241
79	NC_014837	CTC	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317046242
80	NC_014837	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
81	NC_014837	GAT	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046242
82	NC_014837	CGA	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
83	NC_014837	GGT	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
84	NC_014837	TCG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
85	NC_014837	GGT	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
86	NC_014837	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	317046242
87	NC_014837	GT	3	6	4790	4795	0 %	50 %	50 %	0 %	317046242
88	NC_014837	TGA	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046242
89	NC_014837	A	6	6	4825	4830	100 %	0 %	0 %	0 %	317046242
90	NC_014837	TTG	2	6	4865	4870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317046242
91	NC_014837	CAA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046242
92	NC_014837	CAA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046242
93	NC_014837	TGG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
94	NC_014837	AAG	2	6	5087	5092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046242
95	NC_014837	A	6	6	5101	5106	100 %	0 %	0 %	0 %	317046242
96	NC_014837	TGA	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046242
97	NC_014837	CG	3	6	5133	5138	0 %	0 %	50 %	50 %	317046242
98	NC_014837	CGG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046242
99	NC_014837	CAG	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
100	NC_014837	GAAC	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	317046242
101	NC_014837	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
102	NC_014837	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317046242
103	NC_014837	AGC	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
104	NC_014837	TGG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
105	NC_014837	TTC	2	6	5577	5582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317046242
106	NC_014837	CAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046242
107	NC_014837	CTG	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
108	NC_014837	CTT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317046242
109	NC_014837	GCC	2	6	5784	5789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
110	NC_014837	GAA	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046242
111	NC_014837	GAC	2	6	5833	5838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
112	NC_014837	GATCGC	2	12	5859	5870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317046242
113	NC_014837	TGG	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
114	NC_014837	GCT	2	6	6003	6008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
115	NC_014837	GC	4	8	6009	6016	0 %	0 %	50 %	50 %	317046242
116	NC_014837	GGCT	2	8	6067	6074	0 %	25 %	50 %	25 %	317046242
117	NC_014837	TGG	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046242
118	NC_014837	GCA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
119	NC_014837	TGC	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
120	NC_014837	AGC	2	6	6269	6274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046242
121	NC_014837	GAA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046242
122	NC_014837	CGT	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046242
123	NC_014837	CTGG	2	8	6357	6364	0 %	25 %	50 %	25 %	317046242
124	NC_014837	CCG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
125	NC_014837	GCC	2	6	6461	6466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
126	NC_014837	GCC	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046242
127	NC_014837	GAA	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317046243
128	NC_014837	GC	3	6	6909	6914	0 %	0 %	50 %	50 %	317046243
129	NC_014837	GCT	2	6	6939	6944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046243
130	NC_014837	GCG	2	6	6999	7004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046243
131	NC_014837	CGG	2	6	7059	7064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046243
132	NC_014837	GTG	2	6	7137	7142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046243
133	NC_014837	GCT	2	6	7150	7155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046243
134	NC_014837	GCA	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046243
135	NC_014837	GGC	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046243
136	NC_014837	CAT	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046243
137	NC_014837	CGA	3	9	7426	7434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046243
138	NC_014837	AAC	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046243
139	NC_014837	GAT	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046243
140	NC_014837	GCT	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046243
141	NC_014837	ATC	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046243
142	NC_014837	GC	4	8	7676	7683	0 %	0 %	50 %	50 %	317046243
143	NC_014837	GCG	2	6	7685	7690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046243
144	NC_014837	TCG	2	6	7698	7703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046243
145	NC_014837	GC	3	6	7710	7715	0 %	0 %	50 %	50 %	317046243
146	NC_014837	GTG	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046243
147	NC_014837	CAA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046243
148	NC_014837	TCA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046243
149	NC_014837	ACC	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046243
150	NC_014837	GCTG	2	8	7843	7850	0 %	25 %	50 %	25 %	317046243
151	NC_014837	GCC	2	6	7883	7888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046243
152	NC_014837	TCA	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046243
153	NC_014837	A	7	7	8027	8033	100 %	0 %	0 %	0 %	317046244
154	NC_014837	CCG	2	6	8070	8075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046244
155	NC_014837	CGAG	2	8	8163	8170	25 %	0 %	50 %	25 %	317046244
156	NC_014837	GAG	2	6	8189	8194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317046244
157	NC_014837	TGG	2	6	8217	8222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046244
158	NC_014837	CGA	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046244
159	NC_014837	GCA	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046244
160	NC_014837	CTG	2	6	8289	8294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046244
161	NC_014837	GCTGGT	2	12	8329	8340	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	317046244
162	NC_014837	CTG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046244
163	NC_014837	ACCGT	2	10	8455	8464	20 %	20 %	20 %	40 %	317046244
164	NC_014837	TGA	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046244
165	NC_014837	GTG	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046244
166	NC_014837	CGC	2	6	8583	8588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046244
167	NC_014837	GCC	2	6	8609	8614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046244
168	NC_014837	ACC	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046244
169	NC_014837	CAG	2	6	8714	8719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046244
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172	NC_014837	TGC	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046245
173	NC_014837	CGC	2	6	9251	9256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046245
174	NC_014837	TCA	2	6	9345	9350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046245
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176	NC_014837	GTG	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046245
177	NC_014837	TGA	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046245
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180	NC_014837	TGG	2	6	9608	9613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046246
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223	NC_014837	TGA	3	9	11396	11404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046247
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240	NC_014837	GTGA	2	8	12319	12326	25 %	25 %	50 %	0 %	317046248
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245	NC_014837	GCA	2	6	12699	12704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046248
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247	NC_014837	GCCAC	2	10	12741	12750	20 %	0 %	20 %	60 %	317046248
248	NC_014837	ACA	2	6	12800	12805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046248
249	NC_014837	GTG	2	6	12811	12816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046248
250	NC_014837	CAC	2	6	12848	12853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317046248
251	NC_014837	CAG	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046248
252	NC_014837	TCAG	2	8	12882	12889	25 %	25 %	25 %	25 %	317046248
253	NC_014837	TG	4	8	12927	12934	0 %	50 %	50 %	0 %	317046248
254	NC_014837	ACA	2	6	12935	12940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317046248
255	NC_014837	GCC	2	6	13002	13007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317046248
256	NC_014837	GGT	2	6	13020	13025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046248
257	NC_014837	CGTGA	2	10	13060	13069	20 %	20 %	40 %	20 %	317046248
258	NC_014837	GGC	2	6	13076	13081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046248
259	NC_014837	CGG	2	6	13120	13125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317046249
260	NC_014837	GATT	2	8	13190	13197	25 %	50 %	25 %	0 %	317046249
261	NC_014837	TCG	2	6	13203	13208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046249
262	NC_014837	AGT	2	6	13216	13221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317046249
263	NC_014837	GCA	2	6	13228	13233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046249
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265	NC_014837	ATA	2	6	13343	13348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317046249
266	NC_014837	CTGG	2	8	13352	13359	0 %	25 %	50 %	25 %	317046249
267	NC_014837	GGT	2	6	13394	13399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046249
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269	NC_014837	TCA	2	6	13441	13446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046249
270	NC_014837	TCA	2	6	13450	13455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317046249
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273	NC_014837	CTG	2	6	13801	13806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317046250
274	NC_014837	GAATC	2	10	13807	13816	40 %	20 %	20 %	20 %	317046250
275	NC_014837	TGG	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046250
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281	NC_014837	GCTG	2	8	14037	14044	0 %	25 %	50 %	25 %	317046250
282	NC_014837	GTG	2	6	14053	14058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317046250
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499	NC_014837	CGA	2	6	24344	24349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046260
500	NC_014837	CAG	3	9	24381	24389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317046260

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