MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 92173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014622	TGCC	2	8	133265	133272	0 %	25 %	25 %	50 %	310639572
2003	NC_014622	CAA	2	6	133335	133340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639572
2004	NC_014622	TCAAA	2	10	133373	133382	60 %	20 %	0 %	20 %	310639572
2005	NC_014622	ATC	2	6	133555	133560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639572
2006	NC_014622	CTT	2	6	133641	133646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639572
2007	NC_014622	TCT	3	9	133651	133659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639572
2008	NC_014622	CTT	2	6	133730	133735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639572
2009	NC_014622	GAC	2	6	133762	133767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639572
2010	NC_014622	T	6	6	133845	133850	0 %	100 %	0 %	0 %	310639572
2011	NC_014622	CGAG	2	8	133856	133863	25 %	0 %	50 %	25 %	310639572
2012	NC_014622	CAGC	2	8	133926	133933	25 %	0 %	25 %	50 %	310639572
2013	NC_014622	TCG	2	6	134058	134063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639573
2014	NC_014622	CAT	2	6	134098	134103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639573
2015	NC_014622	CTT	2	6	134118	134123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639573
2016	NC_014622	TTG	2	6	134144	134149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639573
2017	NC_014622	GCG	2	6	134258	134263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639573
2018	NC_014622	CCG	2	6	134429	134434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639573
2019	NC_014622	TCG	2	6	134447	134452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639573
2020	NC_014622	ACG	2	6	134491	134496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639573
2021	NC_014622	CTG	2	6	134554	134559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639573
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2023	NC_014622	CATC	2	8	134601	134608	25 %	25 %	0 %	50 %	310639573
2024	NC_014622	TGC	2	6	134629	134634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639573
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2030	NC_014622	GC	3	6	134691	134696	0 %	0 %	50 %	50 %	310639573
2031	NC_014622	ATC	2	6	134705	134710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639573
2032	NC_014622	CGA	2	6	134712	134717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639573
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2037	NC_014622	GCG	2	6	135162	135167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639574
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2044	NC_014622	TTA	2	6	135534	135539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639575
2045	NC_014622	GATT	2	8	135541	135548	25 %	50 %	25 %	0 %	310639575
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2053	NC_014622	AGCC	2	8	136143	136150	25 %	0 %	25 %	50 %	310639576
2054	NC_014622	TGT	2	6	136156	136161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639576
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2106	NC_014622	GTA	2	6	139245	139250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639580
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2122	NC_014622	T	7	7	139988	139994	0 %	100 %	0 %	0 %	310639580
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2244	NC_014622	CAT	2	6	147617	147622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639592
2245	NC_014622	T	7	7	147637	147643	0 %	100 %	0 %	0 %	310639592
2246	NC_014622	TCCA	2	8	147652	147659	25 %	25 %	0 %	50 %	310639592
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2249	NC_014622	CAGC	2	8	147818	147825	25 %	0 %	25 %	50 %	310639593
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2252	NC_014622	GCC	2	6	148101	148106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639593
2253	NC_014622	TTC	2	6	148107	148112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639593
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2357	NC_014622	TCA	2	6	154372	154377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639597
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2362	NC_014622	T	6	6	154623	154628	0 %	100 %	0 %	0 %	310639597
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2364	NC_014622	CAG	2	6	154743	154748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639597
2365	NC_014622	CAT	2	6	154844	154849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639597
2366	NC_014622	TCC	2	6	154896	154901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639597
2367	NC_014622	CCT	2	6	155093	155098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639597
2368	NC_014622	GCT	2	6	155107	155112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639597
2369	NC_014622	GCC	2	6	155119	155124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639597
2370	NC_014622	AAT	2	6	155136	155141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639597
2371	NC_014622	CAC	2	6	155151	155156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639597
2372	NC_014622	GTAAT	2	10	155179	155188	40 %	40 %	20 %	0 %	310639597
2373	NC_014622	TAA	2	6	155189	155194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639597
2374	NC_014622	AAT	2	6	155199	155204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639597
2375	NC_014622	TGGATA	2	12	155230	155241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639597
2376	NC_014622	CCG	2	6	155242	155247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639597
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2378	NC_014622	ACC	2	6	155278	155283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639597
2379	NC_014622	ATC	2	6	155346	155351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639597
2380	NC_014622	GGC	2	6	155355	155360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639597
2381	NC_014622	CTC	2	6	155381	155386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310639597
2382	NC_014622	GCC	2	6	155533	155538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639597
2383	NC_014622	ATG	2	6	155578	155583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639597
2384	NC_014622	CAT	2	6	155660	155665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639597
2385	NC_014622	TGA	2	6	155678	155683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639597
2386	NC_014622	GA	3	6	155682	155687	50 %	0 %	50 %	0 %	310639597
2387	NC_014622	AC	3	6	155799	155804	50 %	0 %	0 %	50 %	310639597
2388	NC_014622	GA	3	6	155805	155810	50 %	0 %	50 %	0 %	310639597
2389	NC_014622	CCA	2	6	155909	155914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639597
2390	NC_014622	TAG	2	6	155915	155920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639597
2391	NC_014622	GCA	2	6	155921	155926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639597
2392	NC_014622	A	7	7	155995	156001	100 %	0 %	0 %	0 %	310639597
2393	NC_014622	ATG	2	6	156165	156170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639598
2394	NC_014622	T	6	6	156191	156196	0 %	100 %	0 %	0 %	310639598
2395	NC_014622	A	6	6	156234	156239	100 %	0 %	0 %	0 %	310639598
2396	NC_014622	GGA	2	6	156284	156289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639598
2397	NC_014622	TTC	2	6	156461	156466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639598
2398	NC_014622	TGA	2	6	156481	156486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639598
2399	NC_014622	CCG	2	6	156622	156627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639598
2400	NC_014622	TGA	2	6	156670	156675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639598
2401	NC_014622	GAA	2	6	156678	156683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639598
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2403	NC_014622	GAA	2	6	156728	156733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639598
2404	NC_014622	TA	3	6	156746	156751	50 %	50 %	0 %	0 %	310639598
2405	NC_014622	GCA	2	6	156904	156909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639598
2406	NC_014622	GAA	2	6	156942	156947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639598
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2414	NC_014622	GGAT	3	12	157481	157492	25 %	25 %	50 %	0 %	310639599
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2420	NC_014622	TTA	2	6	157864	157869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639600
2421	NC_014622	AGGT	2	8	157948	157955	25 %	25 %	50 %	0 %	310639600
2422	NC_014622	GTG	2	6	158026	158031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639600
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2429	NC_014622	ATC	2	6	158598	158603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639600
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2433	NC_014622	CTT	2	6	158816	158821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639600
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2435	NC_014622	CACG	2	8	158916	158923	25 %	0 %	25 %	50 %	310639600
2436	NC_014622	TGCA	2	8	158924	158931	25 %	25 %	25 %	25 %	310639600
2437	NC_014622	CGCAT	2	10	159085	159094	20 %	20 %	20 %	40 %	310639600
2438	NC_014622	CTA	2	6	159134	159139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639600
2439	NC_014622	TCA	2	6	159154	159159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639600
2440	NC_014622	GGA	2	6	159161	159166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639600
2441	NC_014622	TGG	2	6	159238	159243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639600
2442	NC_014622	GT	3	6	159244	159249	0 %	50 %	50 %	0 %	310639600
2443	NC_014622	GTAA	2	8	159266	159273	50 %	25 %	25 %	0 %	310639600
2444	NC_014622	CGG	2	6	159439	159444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639601
2445	NC_014622	GAT	2	6	159536	159541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639601
2446	NC_014622	TGC	2	6	159682	159687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639601
2447	NC_014622	GTTT	2	8	159776	159783	0 %	75 %	25 %	0 %	310639601
2448	NC_014622	TGCT	2	8	159810	159817	0 %	50 %	25 %	25 %	310639601
2449	NC_014622	ATC	2	6	159848	159853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639601
2450	NC_014622	CTT	2	6	159868	159873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639601
2451	NC_014622	TGAG	2	8	159882	159889	25 %	25 %	50 %	0 %	310639601
2452	NC_014622	TGC	2	6	159890	159895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639601
2453	NC_014622	T	8	8	159948	159955	0 %	100 %	0 %	0 %	310639601
2454	NC_014622	T	6	6	159962	159967	0 %	100 %	0 %	0 %	310639601
2455	NC_014622	A	6	6	160019	160024	100 %	0 %	0 %	0 %	310639601
2456	NC_014622	CAG	3	9	160121	160129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639601
2457	NC_014622	TAC	2	6	160220	160225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639601
2458	NC_014622	TTTCA	2	10	160256	160265	20 %	60 %	0 %	20 %	310639601
2459	NC_014622	CAT	2	6	160401	160406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639602
2460	NC_014622	GA	3	6	160549	160554	50 %	0 %	50 %	0 %	310639602
2461	NC_014622	GAA	2	6	160707	160712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639602
2462	NC_014622	AGCG	2	8	160745	160752	25 %	0 %	50 %	25 %	310639602
2463	NC_014622	AAT	2	6	160838	160843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639602
2464	NC_014622	AGCA	2	8	160865	160872	50 %	0 %	25 %	25 %	310639602
2465	NC_014622	GCA	2	6	160945	160950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639602
2466	NC_014622	TGC	2	6	160999	161004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639602
2467	NC_014622	TGG	2	6	161068	161073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639602
2468	NC_014622	GAT	2	6	161108	161113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639602
2469	NC_014622	GT	3	6	161125	161130	0 %	50 %	50 %	0 %	310639602
2470	NC_014622	GGT	2	6	161216	161221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639602
2471	NC_014622	CAG	2	6	161240	161245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639602
2472	NC_014622	AGA	2	6	161265	161270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639602
2473	NC_014622	TGA	2	6	161480	161485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639603
2474	NC_014622	TA	3	6	161495	161500	50 %	50 %	0 %	0 %	310639603
2475	NC_014622	AGTA	2	8	161508	161515	50 %	25 %	25 %	0 %	310639603
2476	NC_014622	ACC	2	6	161530	161535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639603
2477	NC_014622	CAC	2	6	161577	161582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639603
2478	NC_014622	GAC	2	6	161610	161615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639603
2479	NC_014622	CA	3	6	161715	161720	50 %	0 %	0 %	50 %	310639603
2480	NC_014622	GCGA	2	8	161802	161809	25 %	0 %	50 %	25 %	310639603
2481	NC_014622	CAAGG	2	10	161839	161848	40 %	0 %	40 %	20 %	310639603
2482	NC_014622	GTG	2	6	161860	161865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639603
2483	NC_014622	GGA	2	6	161901	161906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639603
2484	NC_014622	TCA	2	6	161916	161921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639603
2485	NC_014622	GGT	2	6	161929	161934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639603
2486	NC_014622	CAG	3	9	161935	161943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639603
2487	NC_014622	CGA	2	6	161994	161999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639603
2488	NC_014622	TAC	2	6	162023	162028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639603
2489	NC_014622	GAG	2	6	162031	162036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639603
2490	NC_014622	GAT	2	6	162048	162053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639603
2491	NC_014622	CCATGT	2	12	162113	162124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310639603
2492	NC_014622	TGA	2	6	162126	162131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639603
2493	NC_014622	GTG	2	6	162133	162138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639603
2494	NC_014622	CTA	2	6	162367	162372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639603
2495	NC_014622	CCA	2	6	162462	162467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639603
2496	NC_014622	GAT	2	6	162499	162504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639604
2497	NC_014622	A	6	6	162533	162538	100 %	0 %	0 %	0 %	310639604
2498	NC_014622	TGCT	2	8	162546	162553	0 %	50 %	25 %	25 %	310639604
2499	NC_014622	AGC	2	6	162649	162654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639604
2500	NC_014622	GTT	2	6	162677	162682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639604

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