MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 92173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014622	ATT	3	9	35615	35623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639505
502	NC_014622	CAAGC	2	10	35625	35634	40 %	0 %	20 %	40 %	310639505
503	NC_014622	AGC	2	6	35771	35776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639505
504	NC_014622	TGC	2	6	35779	35784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639505
505	NC_014622	GCA	2	6	35786	35791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639505
506	NC_014622	AGCG	2	8	35905	35912	25 %	0 %	50 %	25 %	310639505
507	NC_014622	GCC	2	6	35974	35979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639505
508	NC_014622	CAC	2	6	36035	36040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639505
509	NC_014622	CTT	2	6	36078	36083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639505
510	NC_014622	GGA	2	6	36118	36123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639505
511	NC_014622	GAAG	2	8	36238	36245	50 %	0 %	50 %	0 %	310639505
512	NC_014622	TTG	2	6	36496	36501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639506
513	NC_014622	A	6	6	36504	36509	100 %	0 %	0 %	0 %	310639506
514	NC_014622	AAG	2	6	36515	36520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639506
515	NC_014622	TGG	2	6	36529	36534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639506
516	NC_014622	GTC	2	6	36614	36619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639506
517	NC_014622	TAT	2	6	36638	36643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639506
518	NC_014622	AAG	2	6	36646	36651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639506
519	NC_014622	GC	3	6	36766	36771	0 %	0 %	50 %	50 %	310639506
520	NC_014622	AGC	2	6	36778	36783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639506
521	NC_014622	GAT	2	6	36842	36847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639506
522	NC_014622	CGG	2	6	36981	36986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639506
523	NC_014622	ATTA	2	8	37020	37027	50 %	50 %	0 %	0 %	310639506
524	NC_014622	GGC	2	6	37128	37133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639506
525	NC_014622	AAGC	2	8	37283	37290	50 %	0 %	25 %	25 %	310639506
526	NC_014622	ATT	2	6	37312	37317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639506
527	NC_014622	TGA	2	6	37319	37324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639506
528	NC_014622	CCG	2	6	37527	37532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639507
529	NC_014622	GAAG	2	8	37543	37550	50 %	0 %	50 %	0 %	310639507
530	NC_014622	TGT	2	6	37590	37595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639507
531	NC_014622	TAA	2	6	37620	37625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639507
532	NC_014622	GCT	2	6	37723	37728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639507
533	NC_014622	TGA	2	6	37758	37763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639507
534	NC_014622	GAA	2	6	37777	37782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639507
535	NC_014622	AAAAGA	2	12	37817	37828	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310639508
536	NC_014622	CT	3	6	37845	37850	0 %	50 %	0 %	50 %	310639508
537	NC_014622	TTG	2	6	38137	38142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639509
538	NC_014622	GCAGG	2	10	38167	38176	20 %	0 %	60 %	20 %	310639509
539	NC_014622	TA	3	6	38198	38203	50 %	50 %	0 %	0 %	310639509
540	NC_014622	GT	3	6	38270	38275	0 %	50 %	50 %	0 %	310639509
541	NC_014622	GTC	2	6	38287	38292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639509
542	NC_014622	AGC	2	6	38360	38365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639509
543	NC_014622	CAAG	2	8	38385	38392	50 %	0 %	25 %	25 %	310639509
544	NC_014622	CAC	2	6	38421	38426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639509
545	NC_014622	GCA	2	6	38509	38514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639509
546	NC_014622	CAG	2	6	38716	38721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639509
547	NC_014622	TAC	2	6	38725	38730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639509
548	NC_014622	TCT	2	6	38911	38916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639509
549	NC_014622	TGT	2	6	38934	38939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639509
550	NC_014622	TG	3	6	39007	39012	0 %	50 %	50 %	0 %	310639509
551	NC_014622	GCAG	2	8	39021	39028	25 %	0 %	50 %	25 %	310639509
552	NC_014622	GAA	2	6	39186	39191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639509
553	NC_014622	ATG	2	6	39296	39301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639509
554	NC_014622	ATA	2	6	39305	39310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639509
555	NC_014622	GAT	2	6	39331	39336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639509
556	NC_014622	GCA	2	6	39347	39352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639509
557	NC_014622	TGT	2	6	39396	39401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639509
558	NC_014622	CG	4	8	39496	39503	0 %	0 %	50 %	50 %	310639509
559	NC_014622	CAAAG	2	10	39507	39516	60 %	0 %	20 %	20 %	310639509
560	NC_014622	A	7	7	39517	39523	100 %	0 %	0 %	0 %	310639509
561	NC_014622	CCA	2	6	39653	39658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639510
562	NC_014622	TGAT	2	8	39823	39830	25 %	50 %	25 %	0 %	310639510
563	NC_014622	TGT	2	6	39863	39868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639510
564	NC_014622	TTGA	2	8	39948	39955	25 %	50 %	25 %	0 %	310639510
565	NC_014622	CAAA	2	8	40076	40083	75 %	0 %	0 %	25 %	310639510
566	NC_014622	TTG	2	6	40096	40101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639510
567	NC_014622	TGG	2	6	40115	40120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639510
568	NC_014622	GTT	2	6	40122	40127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639510
569	NC_014622	CG	4	8	40128	40135	0 %	0 %	50 %	50 %	310639510
570	NC_014622	CGCT	2	8	40162	40169	0 %	25 %	25 %	50 %	310639510
571	NC_014622	ATT	2	6	40170	40175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639510
572	NC_014622	CGT	2	6	40182	40187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639510
573	NC_014622	AGTGA	2	10	40203	40212	40 %	20 %	40 %	0 %	310639510
574	NC_014622	ATC	2	6	40218	40223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639510
575	NC_014622	TGA	2	6	40256	40261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639510
576	NC_014622	GGC	2	6	40314	40319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639510
577	NC_014622	CA	3	6	40343	40348	50 %	0 %	0 %	50 %	310639510
578	NC_014622	GGT	2	6	40403	40408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639510
579	NC_014622	CAAG	2	8	40447	40454	50 %	0 %	25 %	25 %	310639510
580	NC_014622	CTGT	2	8	40464	40471	0 %	50 %	25 %	25 %	310639510
581	NC_014622	CAT	2	6	40493	40498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639510
582	NC_014622	GAA	2	6	40509	40514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639510
583	NC_014622	GT	3	6	40663	40668	0 %	50 %	50 %	0 %	310639511
584	NC_014622	CGA	2	6	40678	40683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639511
585	NC_014622	TTGA	2	8	40805	40812	25 %	50 %	25 %	0 %	310639511
586	NC_014622	ATA	2	6	40989	40994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639512
587	NC_014622	TGG	2	6	41044	41049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639512
588	NC_014622	AT	3	6	41080	41085	50 %	50 %	0 %	0 %	310639512
589	NC_014622	TC	3	6	41089	41094	0 %	50 %	0 %	50 %	310639512
590	NC_014622	AT	3	6	41113	41118	50 %	50 %	0 %	0 %	310639512
591	NC_014622	ACT	2	6	41121	41126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639512
592	NC_014622	GAT	2	6	41162	41167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639512
593	NC_014622	AAGGAA	2	12	41348	41359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639512
594	NC_014622	AGA	2	6	41377	41382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639512
595	NC_014622	ATC	2	6	41412	41417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639512
596	NC_014622	CTG	2	6	41640	41645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639513
597	NC_014622	ATA	2	6	41657	41662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639513
598	NC_014622	GTG	2	6	41676	41681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639513
599	NC_014622	AAT	2	6	41729	41734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639513
600	NC_014622	T	6	6	41901	41906	0 %	100 %	0 %	0 %	310639514
601	NC_014622	GAC	2	6	42056	42061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639514
602	NC_014622	A	6	6	42098	42103	100 %	0 %	0 %	0 %	310639514
603	NC_014622	GAT	2	6	42109	42114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
604	NC_014622	GCT	2	6	42172	42177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
605	NC_014622	TCCAG	2	10	42190	42199	20 %	20 %	20 %	40 %	310639514
606	NC_014622	GTT	2	6	42256	42261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639514
607	NC_014622	CTA	2	6	42289	42294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639514
608	NC_014622	TGC	2	6	42368	42373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
609	NC_014622	GTT	2	6	42492	42497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639514
610	NC_014622	CCA	2	6	42603	42608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310639514
611	NC_014622	GCT	2	6	42634	42639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
612	NC_014622	TGT	2	6	42641	42646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639514
613	NC_014622	GGA	2	6	42648	42653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639514
614	NC_014622	AGC	2	6	42686	42691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639514
615	NC_014622	AT	3	6	42762	42767	50 %	50 %	0 %	0 %	310639514
616	NC_014622	TGA	2	6	42834	42839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
617	NC_014622	CTG	2	6	42961	42966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
618	NC_014622	CTTC	2	8	43002	43009	0 %	50 %	0 %	50 %	310639514
619	NC_014622	AATG	2	8	43083	43090	50 %	25 %	25 %	0 %	310639514
620	NC_014622	AGGC	2	8	43121	43128	25 %	0 %	50 %	25 %	310639514
621	NC_014622	ATG	2	6	43138	43143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
622	NC_014622	GCG	2	6	43176	43181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639514
623	NC_014622	TGA	2	6	43203	43208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
624	NC_014622	AGC	2	6	43301	43306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639514
625	NC_014622	CTGT	2	8	43495	43502	0 %	50 %	25 %	25 %	310639514
626	NC_014622	GGC	2	6	43576	43581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639514
627	NC_014622	GCTTT	2	10	43679	43688	0 %	60 %	20 %	20 %	310639514
628	NC_014622	ATG	2	6	43736	43741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
629	NC_014622	GAA	2	6	43768	43773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639514
630	NC_014622	AAG	2	6	43777	43782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639514
631	NC_014622	GTC	2	6	43796	43801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
632	NC_014622	TGC	2	6	43860	43865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
633	NC_014622	CGA	3	9	43910	43918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639514
634	NC_014622	GAC	2	6	44022	44027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639514
635	NC_014622	GCT	2	6	44112	44117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
636	NC_014622	GAG	2	6	44128	44133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639514
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639	NC_014622	TTA	2	6	44376	44381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639514
640	NC_014622	ATG	2	6	44525	44530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
641	NC_014622	ATG	2	6	44597	44602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639514
642	NC_014622	ACTT	2	8	44810	44817	25 %	50 %	0 %	25 %	310639514
643	NC_014622	AGC	2	6	44825	44830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639514
644	NC_014622	GCTG	2	8	44874	44881	0 %	25 %	50 %	25 %	310639514
645	NC_014622	GATT	2	8	44952	44959	25 %	50 %	25 %	0 %	310639514
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648	NC_014622	GGA	2	6	45069	45074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639514
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651	NC_014622	CTG	2	6	45355	45360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639514
652	NC_014622	AAG	2	6	45383	45388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639514
653	NC_014622	AGG	2	6	45401	45406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639514
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655	NC_014622	GCTA	2	8	45475	45482	25 %	25 %	25 %	25 %	310639515
656	NC_014622	GCA	2	6	45494	45499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639515
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659	NC_014622	ATG	2	6	45617	45622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639515
660	NC_014622	GCT	2	6	45647	45652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639515
661	NC_014622	AGT	2	6	45694	45699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639515
662	NC_014622	GAC	2	6	45725	45730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639515
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667	NC_014622	AAG	2	6	46094	46099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639515
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693	NC_014622	GCT	2	6	47696	47701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639517
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749	NC_014622	CTGC	2	8	50332	50339	0 %	25 %	25 %	50 %	310639518
750	NC_014622	AGA	2	6	50363	50368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639518
751	NC_014622	GAA	2	6	50428	50433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639518
752	NC_014622	GAAG	2	8	50445	50452	50 %	0 %	50 %	0 %	310639518
753	NC_014622	TTG	2	6	50510	50515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639518
754	NC_014622	GGA	2	6	50550	50555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639518
755	NC_014622	CGT	2	6	50629	50634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639518
756	NC_014622	CAG	2	6	50643	50648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639518
757	NC_014622	CTT	2	6	50689	50694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639518
758	NC_014622	GATT	2	8	50701	50708	25 %	50 %	25 %	0 %	310639518
759	NC_014622	CAA	2	6	51061	51066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639519
760	NC_014622	GTG	2	6	51153	51158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639519
761	NC_014622	TAA	2	6	51286	51291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310639519
762	NC_014622	AAG	2	6	51297	51302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310639519
763	NC_014622	GTG	2	6	51397	51402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639520
764	NC_014622	AAGCC	2	10	51413	51422	40 %	0 %	20 %	40 %	310639520
765	NC_014622	AGC	2	6	51829	51834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310639521
766	NC_014622	ACA	2	6	51923	51928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639521
767	NC_014622	AC	3	6	52068	52073	50 %	0 %	0 %	50 %	310639522
768	NC_014622	TTG	2	6	52184	52189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310639522
769	NC_014622	ACT	2	6	52282	52287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639522
770	NC_014622	TTC	2	6	52410	52415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639522
771	NC_014622	AGGA	2	8	52483	52490	50 %	0 %	50 %	0 %	310639522
772	NC_014622	TCCG	2	8	52539	52546	0 %	25 %	25 %	50 %	310639522
773	NC_014622	GTA	2	6	52633	52638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639522
774	NC_014622	GTCCAA	2	12	52679	52690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310639523
775	NC_014622	GCGG	2	8	52692	52699	0 %	0 %	75 %	25 %	310639523
776	NC_014622	GCC	2	6	52734	52739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310639523
777	NC_014622	T	7	7	52764	52770	0 %	100 %	0 %	0 %	310639523
778	NC_014622	AAGC	2	8	52827	52834	50 %	0 %	25 %	25 %	310639523
779	NC_014622	AAC	2	6	52849	52854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639523
780	NC_014622	GA	3	6	52900	52905	50 %	0 %	50 %	0 %	310639523
781	NC_014622	ATC	2	6	52950	52955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639523
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783	NC_014622	ATG	2	6	53251	53256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639524
784	NC_014622	AGG	2	6	53378	53383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639524
785	NC_014622	GGA	2	6	53391	53396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639524
786	NC_014622	GGC	2	6	53406	53411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310639524
787	NC_014622	GGT	3	9	53439	53447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639524
788	NC_014622	TCG	2	6	53550	53555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639524
789	NC_014622	GGA	2	6	53583	53588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310639524
790	NC_014622	ATG	2	6	54115	54120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310639525
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795	NC_014622	TGG	2	6	54444	54449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310639525
796	NC_014622	TCT	2	6	54530	54535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310639525
797	NC_014622	ATTT	2	8	54554	54561	25 %	75 %	0 %	0 %	310639525
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800	NC_014622	TTA	2	6	54722	54727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
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803	NC_014622	CTGT	2	8	54778	54785	0 %	50 %	25 %	25 %	310639525
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822	NC_014622	TCCA	2	8	55693	55700	25 %	25 %	0 %	50 %	310639525
823	NC_014622	ATT	2	6	55711	55716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639525
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868	NC_014622	TTGA	2	8	57977	57984	25 %	50 %	25 %	0 %	310639527
869	NC_014622	AT	3	6	58119	58124	50 %	50 %	0 %	0 %	310639527
870	NC_014622	AG	3	6	58126	58131	50 %	0 %	50 %	0 %	310639527
871	NC_014622	ATT	2	6	58196	58201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310639527
872	NC_014622	GCT	2	6	58237	58242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310639527
873	NC_014622	ATC	2	6	58324	58329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639527
874	NC_014622	GCTG	2	8	58350	58357	0 %	25 %	50 %	25 %	310639527
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877	NC_014622	AAC	2	6	58492	58497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310639528
878	NC_014622	ACCG	2	8	58501	58508	25 %	0 %	25 %	50 %	310639528
879	NC_014622	TCA	2	6	58675	58680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310639528
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