MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 92173

< Previous12...173174175176177178179180181182183184185Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
92001	NC_014622	AAT	2	6	5721120	5721125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644864
92002	NC_014622	CAA	2	6	5721164	5721169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644864
92003	NC_014622	GCT	2	6	5721179	5721184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644864
92004	NC_014622	ATTCA	2	10	5721198	5721207	40 %	40 %	0 %	20 %	310644864
92005	NC_014622	TGCTT	2	10	5721252	5721261	0 %	60 %	20 %	20 %	310644865
92006	NC_014622	TTTTA	2	10	5721265	5721274	20 %	80 %	0 %	0 %	310644865
92007	NC_014622	CAAAG	2	10	5721355	5721364	60 %	0 %	20 %	20 %	310644865
92008	NC_014622	ACT	2	6	5721416	5721421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644866
92009	NC_014622	CTG	2	6	5721450	5721455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644866
92010	NC_014622	TAA	2	6	5721460	5721465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644866
92011	NC_014622	CTTTAT	2	12	5721482	5721493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310644866
92012	NC_014622	GTT	2	6	5721511	5721516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644866
92013	NC_014622	T	6	6	5721565	5721570	0 %	100 %	0 %	0 %	310644866
92014	NC_014622	CTG	2	6	5721615	5721620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644866
92015	NC_014622	GTT	2	6	5721677	5721682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310644866
92016	NC_014622	CAA	2	6	5721707	5721712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644866
92017	NC_014622	TG	3	6	5721803	5721808	0 %	50 %	50 %	0 %	310644866
92018	NC_014622	GCTACT	2	12	5721880	5721891	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310644866
92019	NC_014622	TCAA	2	8	5721925	5721932	50 %	25 %	0 %	25 %	310644866
92020	NC_014622	CTG	2	6	5721948	5721953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644866
92021	NC_014622	AAC	2	6	5721969	5721974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644866
92022	NC_014622	AAT	2	6	5722065	5722070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644866
92023	NC_014622	CTC	2	6	5722122	5722127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644866
92024	NC_014622	CAA	2	6	5722184	5722189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644866
92025	NC_014622	ACTG	2	8	5722203	5722210	25 %	25 %	25 %	25 %	310644866
92026	NC_014622	AGGG	2	8	5722213	5722220	25 %	0 %	75 %	0 %	310644866
92027	NC_014622	AT	3	6	5722286	5722291	50 %	50 %	0 %	0 %	310644867
92028	NC_014622	TAA	2	6	5722323	5722328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644867
92029	NC_014622	AAT	2	6	5722375	5722380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644867
92030	NC_014622	CTTTG	2	10	5722392	5722401	0 %	60 %	20 %	20 %	310644867
92031	NC_014622	CTT	2	6	5722416	5722421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644867
92032	NC_014622	AC	3	6	5722470	5722475	50 %	0 %	0 %	50 %	310644867
92033	NC_014622	CAA	2	6	5722528	5722533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644867
92034	NC_014622	AAT	2	6	5722576	5722581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644867
92035	NC_014622	AT	3	6	5722647	5722652	50 %	50 %	0 %	0 %	310644867
92036	NC_014622	ATA	2	6	5722760	5722765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644867
92037	NC_014622	CAT	2	6	5722827	5722832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644867
92038	NC_014622	AGT	2	6	5722957	5722962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644867
92039	NC_014622	TAT	2	6	5722999	5723004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644867
92040	NC_014622	CTTA	2	8	5723200	5723207	25 %	50 %	0 %	25 %	310644868
92041	NC_014622	TTC	2	6	5723462	5723467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644868
92042	NC_014622	AAT	2	6	5723481	5723486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644868
92043	NC_014622	CT	3	6	5723536	5723541	0 %	50 %	0 %	50 %	310644868
92044	NC_014622	AGC	2	6	5723553	5723558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644868
92045	NC_014622	TTA	2	6	5723565	5723570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644868
92046	NC_014622	TCAA	2	8	5723697	5723704	50 %	25 %	0 %	25 %	310644868
92047	NC_014622	GATG	2	8	5723708	5723715	25 %	25 %	50 %	0 %	310644868
92048	NC_014622	ACG	2	6	5723789	5723794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644868
92049	NC_014622	ACGA	2	8	5723831	5723838	50 %	0 %	25 %	25 %	310644868
92050	NC_014622	TCA	2	6	5723883	5723888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644868
92051	NC_014622	TCT	2	6	5723890	5723895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644868
92052	NC_014622	CGT	2	6	5723896	5723901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644868
92053	NC_014622	CTG	2	6	5723928	5723933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644868
92054	NC_014622	GTG	2	6	5724456	5724461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310644869
92055	NC_014622	GCT	2	6	5724464	5724469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644869
92056	NC_014622	T	6	6	5724471	5724476	0 %	100 %	0 %	0 %	310644869
92057	NC_014622	AAT	3	9	5724478	5724486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644869
92058	NC_014622	TTC	2	6	5724583	5724588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644869
92059	NC_014622	CCT	2	6	5724623	5724628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644869
92060	NC_014622	CTG	2	6	5724743	5724748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644869
92061	NC_014622	ACA	2	6	5724785	5724790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644869
92062	NC_014622	CAT	2	6	5724915	5724920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644869
92063	NC_014622	T	6	6	5725008	5725013	0 %	100 %	0 %	0 %	310644869
92064	NC_014622	CATTC	2	10	5725014	5725023	20 %	40 %	0 %	40 %	310644869
92065	NC_014622	ACTG	2	8	5725059	5725066	25 %	25 %	25 %	25 %	310644869
92066	NC_014622	ATGCT	2	10	5725079	5725088	20 %	40 %	20 %	20 %	310644869
92067	NC_014622	GCT	2	6	5725098	5725103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644869
92068	NC_014622	CTG	2	6	5725108	5725113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644869
92069	NC_014622	TCT	2	6	5725247	5725252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644870
92070	NC_014622	CTT	3	9	5725317	5725325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644870
92071	NC_014622	AGGTGA	2	12	5725431	5725442	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310644870
92072	NC_014622	AAACGC	2	12	5725573	5725584	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	310644870
92073	NC_014622	T	6	6	5725608	5725613	0 %	100 %	0 %	0 %	310644870
92074	NC_014622	GCA	2	6	5725700	5725705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644870
92075	NC_014622	ACG	2	6	5725813	5725818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644870
92076	NC_014622	CTT	2	6	5725880	5725885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644870
92077	NC_014622	T	6	6	5725935	5725940	0 %	100 %	0 %	0 %	310644870
92078	NC_014622	CATCG	2	10	5725974	5725983	20 %	20 %	20 %	40 %	310644870
92079	NC_014622	CAT	2	6	5726007	5726012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644870
92080	NC_014622	GTA	2	6	5726042	5726047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644870
92081	NC_014622	CAC	2	6	5726163	5726168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644870
92082	NC_014622	CAGC	2	8	5726286	5726293	25 %	0 %	25 %	50 %	310644870
92083	NC_014622	GCT	2	6	5726300	5726305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644870
92084	NC_014622	GAA	2	6	5726334	5726339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644870
92085	NC_014622	ATC	2	6	5726349	5726354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644870
92086	NC_014622	GTG	3	9	5726405	5726413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310644870
92087	NC_014622	CT	3	6	5726448	5726453	0 %	50 %	0 %	50 %	310644870
92088	NC_014622	GCT	2	6	5726480	5726485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644870
92089	NC_014622	AGT	2	6	5726550	5726555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644870
92090	NC_014622	TAC	2	6	5726570	5726575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644870
92091	NC_014622	TCT	2	6	5726620	5726625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644870
92092	NC_014622	TTC	2	6	5726634	5726639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644870
92093	NC_014622	CGC	2	6	5726810	5726815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644870
92094	NC_014622	TAC	2	6	5726835	5726840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644870
92095	NC_014622	ACC	2	6	5726856	5726861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644870
92096	NC_014622	ATC	2	6	5726911	5726916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644870
92097	NC_014622	TGC	3	9	5726937	5726945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644870
92098	NC_014622	CGA	2	6	5726978	5726983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644870
92099	NC_014622	CAT	2	6	5726990	5726995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644870
92100	NC_014622	CCT	2	6	5727001	5727006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644870
92101	NC_014622	CAGA	2	8	5727124	5727131	50 %	0 %	25 %	25 %	310644871
92102	NC_014622	CAT	2	6	5727159	5727164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644871
92103	NC_014622	GC	3	6	5727280	5727285	0 %	0 %	50 %	50 %	310644871
92104	NC_014622	AGCAA	2	10	5727293	5727302	60 %	0 %	20 %	20 %	310644871
92105	NC_014622	GCA	2	6	5727447	5727452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644871
92106	NC_014622	ATA	2	6	5727494	5727499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644871
92107	NC_014622	AGC	2	6	5727581	5727586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644871
92108	NC_014622	TCAC	2	8	5727596	5727603	25 %	25 %	0 %	50 %	310644871
92109	NC_014622	ACG	2	6	5727638	5727643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644871
92110	NC_014622	ATT	2	6	5727691	5727696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644871
92111	NC_014622	CTC	2	6	5727709	5727714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644871
92112	NC_014622	GT	3	6	5727774	5727779	0 %	50 %	50 %	0 %	310644871
92113	NC_014622	GCT	2	6	5727898	5727903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644871
92114	NC_014622	CAT	2	6	5727939	5727944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644871
92115	NC_014622	ACG	2	6	5728006	5728011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644871
92116	NC_014622	A	6	6	5728130	5728135	100 %	0 %	0 %	0 %	310644871
92117	NC_014622	GCA	2	6	5728179	5728184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644871
92118	NC_014622	ACC	2	6	5728214	5728219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644871
92119	NC_014622	TCT	2	6	5728247	5728252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644871
92120	NC_014622	GTG	2	6	5728266	5728271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310644871
92121	NC_014622	TCC	2	6	5728295	5728300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644871
92122	NC_014622	CTTA	2	8	5728360	5728367	25 %	50 %	0 %	25 %	310644871
92123	NC_014622	TAC	2	6	5728377	5728382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644871
92124	NC_014622	GCC	2	6	5728441	5728446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644871
92125	NC_014622	ATT	2	6	5728619	5728624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644872
92126	NC_014622	TGC	2	6	5728687	5728692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644872
92127	NC_014622	TCC	2	6	5728795	5728800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310644872
92128	NC_014622	CCG	2	6	5728809	5728814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644872
92129	NC_014622	CAA	2	6	5728877	5728882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310644872
92130	NC_014622	TGTC	2	8	5728911	5728918	0 %	50 %	25 %	25 %	310644872
92131	NC_014622	GCA	2	6	5729020	5729025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644872
92132	NC_014622	GT	4	8	5729179	5729186	0 %	50 %	50 %	0 %	310644872
92133	NC_014622	AGC	2	6	5729209	5729214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644872
92134	NC_014622	T	7	7	5729413	5729419	0 %	100 %	0 %	0 %	310644873
92135	NC_014622	TGC	2	6	5729474	5729479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644873
92136	NC_014622	ATT	2	6	5729489	5729494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310644873
92137	NC_014622	GAA	2	6	5729537	5729542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644873
92138	NC_014622	TGC	2	6	5729631	5729636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644873
92139	NC_014622	TCA	3	9	5729653	5729661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644873
92140	NC_014622	GCT	2	6	5729688	5729693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644873
92141	NC_014622	AAG	2	6	5729709	5729714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310644873
92142	NC_014622	TAA	2	6	5729772	5729777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644873
92143	NC_014622	CTTG	2	8	5729968	5729975	0 %	50 %	25 %	25 %	310644873
92144	NC_014622	ATA	2	6	5729991	5729996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644873
92145	NC_014622	GAT	2	6	5730005	5730010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644873
92146	NC_014622	GGCCA	2	10	5730026	5730035	20 %	0 %	40 %	40 %	310644873
92147	NC_014622	CCA	2	6	5730104	5730109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644873
92148	NC_014622	CGT	2	6	5730131	5730136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644873
92149	NC_014622	GCC	2	6	5730150	5730155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310644873
92150	NC_014622	ACAGC	2	10	5730169	5730178	40 %	0 %	20 %	40 %	310644873
92151	NC_014622	AGG	2	6	5730201	5730206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310644873
92152	NC_014622	AGC	2	6	5730332	5730337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644874
92153	NC_014622	GCA	2	6	5730357	5730362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644874
92154	NC_014622	ACGA	2	8	5730406	5730413	50 %	0 %	25 %	25 %	310644874
92155	NC_014622	CCA	2	6	5730435	5730440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644874
92156	NC_014622	ATG	2	6	5730451	5730456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310644874
92157	NC_014622	TCT	2	6	5730513	5730518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644874
92158	NC_014622	CT	3	6	5730553	5730558	0 %	50 %	0 %	50 %	310644874
92159	NC_014622	GCG	2	6	5730559	5730564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310644874
92160	NC_014622	T	8	8	5730652	5730659	0 %	100 %	0 %	0 %	310644874
92161	NC_014622	CGA	2	6	5730955	5730960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310644875
92162	NC_014622	TTC	2	6	5730982	5730987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644875
92163	NC_014622	T	6	6	5731017	5731022	0 %	100 %	0 %	0 %	310644875
92164	NC_014622	A	6	6	5731123	5731128	100 %	0 %	0 %	0 %	310644876
92165	NC_014622	TC	3	6	5731182	5731187	0 %	50 %	0 %	50 %	310644876
92166	NC_014622	CAT	2	6	5731226	5731231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310644876
92167	NC_014622	ACTCT	2	10	5731234	5731243	20 %	40 %	0 %	40 %	310644876
92168	NC_014622	TTC	2	6	5731245	5731250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644876
92169	NC_014622	CTT	2	6	5731272	5731277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310644876
92170	NC_014622	ATTT	2	8	5731357	5731364	25 %	75 %	0 %	0 %	310644877
92171	NC_014622	CGT	2	6	5731384	5731389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310644877
92172	NC_014622	CCA	2	6	5731399	5731404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310644877
92173	NC_014622	AAT	2	6	5731419	5731424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310644877

< Previous12...173174175176177178179180181182183184185Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.