MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 2556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014563	GCG	2	6	36597	36602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189249
502	NC_014563	CAG	2	6	36620	36625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189249
503	NC_014563	CAG	2	6	36710	36715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189249
504	NC_014563	GAC	2	6	36727	36732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189249
505	NC_014563	GCTG	2	8	36752	36759	0 %	25 %	50 %	25 %	308189249
506	NC_014563	CTGG	2	8	36842	36849	0 %	25 %	50 %	25 %	308189249
507	NC_014563	GCT	2	6	36908	36913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189249
508	NC_014563	CGC	2	6	36920	36925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189249
509	NC_014563	TGA	2	6	36965	36970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189249
510	NC_014563	CTG	2	6	37023	37028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189249
511	NC_014563	TCG	2	6	37078	37083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189249
512	NC_014563	CGCC	2	8	37103	37110	0 %	0 %	25 %	75 %	308189249
513	NC_014563	ATT	2	6	37166	37171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189249
514	NC_014563	GGC	2	6	37178	37183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189249
515	NC_014563	GC	3	6	37194	37199	0 %	0 %	50 %	50 %	308189249
516	NC_014563	GCGCA	2	10	37275	37284	20 %	0 %	40 %	40 %	308189249
517	NC_014563	AAT	2	6	37290	37295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189249
518	NC_014563	CTGC	2	8	37371	37378	0 %	25 %	25 %	50 %	308189250
519	NC_014563	GCA	2	6	37402	37407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189250
520	NC_014563	GC	3	6	37475	37480	0 %	0 %	50 %	50 %	308189250
521	NC_014563	GGGACT	2	12	37542	37553	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308189250
522	NC_014563	GCG	2	6	37622	37627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
523	NC_014563	GCT	2	6	37641	37646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189250
524	NC_014563	CAC	2	6	37677	37682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189250
525	NC_014563	GGC	2	6	37695	37700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
526	NC_014563	GGTTG	2	10	37722	37731	0 %	40 %	60 %	0 %	308189250
527	NC_014563	GAC	2	6	37848	37853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189250
528	NC_014563	TCT	2	6	37920	37925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189250
529	NC_014563	GAC	2	6	37993	37998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189250
530	NC_014563	TGC	2	6	38042	38047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189250
531	NC_014563	CGG	2	6	38073	38078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
532	NC_014563	TTG	2	6	38108	38113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189250
533	NC_014563	GCG	2	6	38186	38191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
534	NC_014563	TGG	2	6	38201	38206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189250
535	NC_014563	CGG	2	6	38255	38260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189250
536	NC_014563	TTG	2	6	38267	38272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189250
537	NC_014563	GC	3	6	38282	38287	0 %	0 %	50 %	50 %	308189250
538	NC_014563	T	6	6	38290	38295	0 %	100 %	0 %	0 %	308189250
539	NC_014563	TGC	2	6	38303	38308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189250
540	NC_014563	CGTA	2	8	38317	38324	25 %	25 %	25 %	25 %	308189250
541	NC_014563	CCTG	2	8	38412	38419	0 %	25 %	25 %	50 %	308189251
542	NC_014563	TG	3	6	38431	38436	0 %	50 %	50 %	0 %	308189251
543	NC_014563	GCT	2	6	38469	38474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189251
544	NC_014563	GGAT	2	8	38528	38535	25 %	25 %	50 %	0 %	308189251
545	NC_014563	CAG	2	6	38544	38549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189251
546	NC_014563	CCA	2	6	38599	38604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189251
547	NC_014563	CAG	2	6	38675	38680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189251
548	NC_014563	CGGG	2	8	38759	38766	0 %	0 %	75 %	25 %	308189251
549	NC_014563	CAT	2	6	38913	38918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189251
550	NC_014563	ATC	2	6	38960	38965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189251
551	NC_014563	GACG	2	8	38980	38987	25 %	0 %	50 %	25 %	308189251
552	NC_014563	GC	3	6	39002	39007	0 %	0 %	50 %	50 %	308189251
553	NC_014563	ATT	2	6	39064	39069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189251
554	NC_014563	CTTT	2	8	39077	39084	0 %	75 %	0 %	25 %	308189251
555	NC_014563	AGA	2	6	39153	39158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189252
556	NC_014563	GTT	2	6	39241	39246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189252
557	NC_014563	GCC	2	6	39290	39295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189252
558	NC_014563	ATT	2	6	39298	39303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189252
559	NC_014563	ATG	2	6	39411	39416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189252
560	NC_014563	GCGTG	2	10	39485	39494	0 %	20 %	60 %	20 %	308189252
561	NC_014563	CCG	2	6	39594	39599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189252
562	NC_014563	CTTCCC	2	12	39696	39707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189252
563	NC_014563	TCG	2	6	39787	39792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189252
564	NC_014563	CTG	2	6	39796	39801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189252
565	NC_014563	TTA	2	6	39805	39810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189252
566	NC_014563	TAA	2	6	39926	39931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189253
567	NC_014563	CTG	2	6	39935	39940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189253
568	NC_014563	CAGC	2	8	39969	39976	25 %	0 %	25 %	50 %	308189253
569	NC_014563	ATG	2	6	39982	39987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189253
570	NC_014563	AAT	2	6	40312	40317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189254
571	NC_014563	GAT	2	6	40333	40338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189254
572	NC_014563	GAT	2	6	40340	40345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189254
573	NC_014563	AGG	2	6	40368	40373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189254
574	NC_014563	GCT	2	6	40454	40459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189254
575	NC_014563	CTG	2	6	40482	40487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189254
576	NC_014563	GCG	2	6	40491	40496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189254
577	NC_014563	ACT	2	6	40500	40505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189254
578	NC_014563	TAA	2	6	40570	40575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308189254
579	NC_014563	T	8	8	40834	40841	0 %	100 %	0 %	0 %	308189255
580	NC_014563	GCC	2	6	40861	40866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189255
581	NC_014563	GGCG	2	8	40873	40880	0 %	0 %	75 %	25 %	308189255
582	NC_014563	G	6	6	40880	40885	0 %	0 %	100 %	0 %	308189255
583	NC_014563	TAT	2	6	41118	41123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189256
584	NC_014563	GA	3	6	41130	41135	50 %	0 %	50 %	0 %	308189256
585	NC_014563	AACTT	2	10	41137	41146	40 %	40 %	0 %	20 %	308189256
586	NC_014563	CTG	2	6	41193	41198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189256
587	NC_014563	TCT	2	6	41280	41285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189256
588	NC_014563	CCTTT	2	10	41336	41345	0 %	60 %	0 %	40 %	308189257
589	NC_014563	TGACC	2	10	41385	41394	20 %	20 %	20 %	40 %	308189257
590	NC_014563	AT	3	6	41409	41414	50 %	50 %	0 %	0 %	308189257
591	NC_014563	GGC	2	6	41510	41515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189257
592	NC_014563	CAG	2	6	41545	41550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189257
593	NC_014563	T	6	6	41619	41624	0 %	100 %	0 %	0 %	308189257
594	NC_014563	CGC	2	6	41689	41694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189258
595	NC_014563	AG	3	6	41795	41800	50 %	0 %	50 %	0 %	308189258
596	NC_014563	T	7	7	41812	41818	0 %	100 %	0 %	0 %	308189258
597	NC_014563	TGG	2	6	41826	41831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189258
598	NC_014563	T	6	6	41832	41837	0 %	100 %	0 %	0 %	308189258
599	NC_014563	T	6	6	41843	41848	0 %	100 %	0 %	0 %	308189258
600	NC_014563	CTT	2	6	41859	41864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189258
601	NC_014563	GC	3	6	42126	42131	0 %	0 %	50 %	50 %	308189259
602	NC_014563	GCT	2	6	42146	42151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189259
603	NC_014563	CGG	2	6	42185	42190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189259
604	NC_014563	CTG	2	6	42244	42249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189259
605	NC_014563	GCC	2	6	42276	42281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189259
606	NC_014563	CTG	2	6	42306	42311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189259
607	NC_014563	CGG	2	6	42322	42327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189259
608	NC_014563	GAA	2	6	42342	42347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189259
609	NC_014563	ATCA	2	8	42348	42355	50 %	25 %	0 %	25 %	308189259
610	NC_014563	GGA	2	6	42392	42397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189259
611	NC_014563	GTC	2	6	43059	43064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189260
612	NC_014563	T	6	6	43213	43218	0 %	100 %	0 %	0 %	308189261
613	NC_014563	AG	3	6	43223	43228	50 %	0 %	50 %	0 %	308189261
614	NC_014563	GC	3	6	43230	43235	0 %	0 %	50 %	50 %	308189261
615	NC_014563	GCT	2	6	43252	43257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189261
616	NC_014563	TCA	2	6	43267	43272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189261
617	NC_014563	GCCG	2	8	43317	43324	0 %	0 %	50 %	50 %	308189261
618	NC_014563	CAT	2	6	43389	43394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189261
619	NC_014563	ACG	2	6	43413	43418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189261
620	NC_014563	AC	3	6	43589	43594	50 %	0 %	0 %	50 %	308189262
621	NC_014563	CTG	2	6	43620	43625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189262
622	NC_014563	CG	4	8	43716	43723	0 %	0 %	50 %	50 %	308189263
623	NC_014563	GCG	2	6	43743	43748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189263
624	NC_014563	TCAG	2	8	43755	43762	25 %	25 %	25 %	25 %	308189263
625	NC_014563	GGC	2	6	43820	43825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189264
626	NC_014563	GCAC	2	8	43847	43854	25 %	0 %	25 %	50 %	308189264
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628	NC_014563	CG	3	6	43951	43956	0 %	0 %	50 %	50 %	308189264
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791	NC_014563	CCGT	2	8	53597	53604	0 %	25 %	25 %	50 %	308189279
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