MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014562	CAG	2	6	180432	180437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3502	NC_014562	TCA	2	6	180688	180693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185699
3503	NC_014562	CCG	2	6	180800	180805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185699
3504	NC_014562	CGC	2	6	180806	180811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185699
3505	NC_014562	CGA	2	6	180816	180821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3506	NC_014562	GGC	2	6	180822	180827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185699
3507	NC_014562	TCAG	2	8	180869	180876	25 %	25 %	25 %	25 %	308185699
3508	NC_014562	GGT	2	6	180897	180902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185699
3509	NC_014562	CAG	2	6	180925	180930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3510	NC_014562	GGCT	2	8	180931	180938	0 %	25 %	50 %	25 %	308185699
3511	NC_014562	GGC	2	6	180990	180995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185699
3512	NC_014562	GC	3	6	180999	181004	0 %	0 %	50 %	50 %	308185699
3513	NC_014562	TGG	2	6	181025	181030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185699
3514	NC_014562	CAC	2	6	181056	181061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185699
3515	NC_014562	GATC	2	8	181182	181189	25 %	25 %	25 %	25 %	308185699
3516	NC_014562	GGC	2	6	181227	181232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185699
3517	NC_014562	GTG	3	9	181243	181251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185699
3518	NC_014562	GCG	2	6	181297	181302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185699
3519	NC_014562	CTG	2	6	181321	181326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3520	NC_014562	GCC	2	6	181333	181338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185699
3521	NC_014562	TGC	2	6	181359	181364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3522	NC_014562	CTT	2	6	181379	181384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185699
3523	NC_014562	GGT	2	6	181407	181412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185699
3524	NC_014562	GTC	2	6	181424	181429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3525	NC_014562	AGC	2	6	181436	181441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3526	NC_014562	GCT	2	6	181452	181457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3527	NC_014562	CAG	2	6	181462	181467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3528	NC_014562	CAG	2	6	181507	181512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3529	NC_014562	GGC	2	6	181548	181553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185699
3530	NC_014562	CAG	2	6	181636	181641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3531	NC_014562	CAG	2	6	181657	181662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3532	NC_014562	GCT	2	6	181683	181688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3533	NC_014562	TGG	2	6	181811	181816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185699
3534	NC_014562	TG	3	6	181822	181827	0 %	50 %	50 %	0 %	308185699
3535	NC_014562	TGA	2	6	181868	181873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185699
3536	NC_014562	TGA	2	6	181893	181898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185699
3537	NC_014562	AGC	2	6	181911	181916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185699
3538	NC_014562	GAG	2	6	181930	181935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185699
3539	NC_014562	GAGT	2	8	181941	181948	25 %	25 %	50 %	0 %	308185699
3540	NC_014562	ATT	2	6	181952	181957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185700
3541	NC_014562	CGG	2	6	181977	181982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185700
3542	NC_014562	ATC	3	9	181997	182005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185700
3543	NC_014562	CT	3	6	182012	182017	0 %	50 %	0 %	50 %	308185700
3544	NC_014562	GTG	2	6	182045	182050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185700
3545	NC_014562	TGGCG	2	10	182235	182244	0 %	20 %	60 %	20 %	308185700
3546	NC_014562	CGC	2	6	182304	182309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185700
3547	NC_014562	ATGC	2	8	182324	182331	25 %	25 %	25 %	25 %	308185700
3548	NC_014562	CTG	2	6	182363	182368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185700
3549	NC_014562	CTGA	2	8	182375	182382	25 %	25 %	25 %	25 %	308185700
3550	NC_014562	TCAT	2	8	182427	182434	25 %	50 %	0 %	25 %	308185700
3551	NC_014562	CGT	2	6	182525	182530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185700
3552	NC_014562	CGA	2	6	182602	182607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185700
3553	NC_014562	CAC	2	6	182614	182619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185700
3554	NC_014562	CCG	2	6	182678	182683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185700
3555	NC_014562	TGG	3	9	182724	182732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185700
3556	NC_014562	CTG	2	6	182768	182773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185700
3557	NC_014562	ATG	2	6	182781	182786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185700
3558	NC_014562	CTG	2	6	182826	182831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185700
3559	NC_014562	CACGG	2	10	182834	182843	20 %	0 %	40 %	40 %	308185700
3560	NC_014562	TTAA	2	8	183047	183054	50 %	50 %	0 %	0 %	308185701
3561	NC_014562	GGC	2	6	183089	183094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185701
3562	NC_014562	CGGG	2	8	183200	183207	0 %	0 %	75 %	25 %	308185701
3563	NC_014562	GGT	2	6	183214	183219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185701
3564	NC_014562	ACC	2	6	183233	183238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185701
3565	NC_014562	ATT	2	6	183344	183349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185701
3566	NC_014562	GGCG	2	8	183350	183357	0 %	0 %	75 %	25 %	308185701
3567	NC_014562	CGA	2	6	183361	183366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185701
3568	NC_014562	CAGT	2	8	183370	183377	25 %	25 %	25 %	25 %	308185701
3569	NC_014562	TG	3	6	183380	183385	0 %	50 %	50 %	0 %	308185701
3570	NC_014562	CGG	2	6	183398	183403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185701
3571	NC_014562	TGC	2	6	183405	183410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185701
3572	NC_014562	GCA	2	6	183411	183416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185701
3573	NC_014562	CTG	2	6	183512	183517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185701
3574	NC_014562	GCG	2	6	183524	183529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185701
3575	NC_014562	CTG	2	6	183539	183544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185701
3576	NC_014562	CAG	2	6	183550	183555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185701
3577	NC_014562	TGACC	2	10	183598	183607	20 %	20 %	20 %	40 %	308185701
3578	NC_014562	CTGAA	2	10	183691	183700	40 %	20 %	20 %	20 %	308185701
3579	NC_014562	CG	3	6	183801	183806	0 %	0 %	50 %	50 %	308185702
3580	NC_014562	A	6	6	183943	183948	100 %	0 %	0 %	0 %	308185702
3581	NC_014562	TCAG	2	8	183971	183978	25 %	25 %	25 %	25 %	308185703
3582	NC_014562	GCT	3	9	183979	183987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185703
3583	NC_014562	ACTGAT	2	12	183994	184005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308185703
3584	NC_014562	GCTGTA	2	12	184096	184107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308185704
3585	NC_014562	GCA	2	6	184128	184133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3586	NC_014562	TCC	2	6	184151	184156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185704
3587	NC_014562	GCC	2	6	184192	184197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185704
3588	NC_014562	GAT	2	6	184258	184263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185704
3589	NC_014562	GCC	2	6	184276	184281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185704
3590	NC_014562	CAG	2	6	184318	184323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3591	NC_014562	AAT	2	6	184336	184341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185704
3592	NC_014562	GCT	2	6	184365	184370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3593	NC_014562	CCGCG	2	10	184377	184386	0 %	0 %	40 %	60 %	308185704
3594	NC_014562	GTC	2	6	184408	184413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3595	NC_014562	CTGG	2	8	184450	184457	0 %	25 %	50 %	25 %	308185704
3596	NC_014562	ATCAAT	2	12	184459	184470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	308185704
3597	NC_014562	TCC	2	6	184580	184585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185704
3598	NC_014562	CA	3	6	184591	184596	50 %	0 %	0 %	50 %	308185704
3599	NC_014562	ACC	2	6	184610	184615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185704
3600	NC_014562	CCA	2	6	184644	184649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185704
3601	NC_014562	TCG	3	9	184697	184705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3602	NC_014562	CCA	2	6	184720	184725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185704
3603	NC_014562	CGC	2	6	184798	184803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185704
3604	NC_014562	CG	3	6	184830	184835	0 %	0 %	50 %	50 %	308185704
3605	NC_014562	TCC	2	6	184853	184858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185704
3606	NC_014562	GCTG	2	8	184863	184870	0 %	25 %	50 %	25 %	308185704
3607	NC_014562	AGC	2	6	184874	184879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3608	NC_014562	CTG	2	6	184971	184976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185704
3609	NC_014562	CG	3	6	184990	184995	0 %	0 %	50 %	50 %	308185704
3610	NC_014562	AAT	2	6	185047	185052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185704
3611	NC_014562	T	8	8	185067	185074	0 %	100 %	0 %	0 %	308185704
3612	NC_014562	ATC	2	6	185238	185243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185705
3613	NC_014562	GTA	2	6	185281	185286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185705
3614	NC_014562	CAG	2	6	185308	185313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185705
3615	NC_014562	CGGG	2	8	185353	185360	0 %	0 %	75 %	25 %	308185705
3616	NC_014562	CCA	2	6	185442	185447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185705
3617	NC_014562	TGG	2	6	185588	185593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185705
3618	NC_014562	CA	3	6	185704	185709	50 %	0 %	0 %	50 %	308185705
3619	NC_014562	CCA	2	6	185733	185738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185705
3620	NC_014562	GATC	2	8	185787	185794	25 %	25 %	25 %	25 %	308185705
3621	NC_014562	GC	3	6	185848	185853	0 %	0 %	50 %	50 %	308185705
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3742	NC_014562	TGTC	2	8	191954	191961	0 %	50 %	25 %	25 %	308185711
3743	NC_014562	GC	4	8	191994	192001	0 %	0 %	50 %	50 %	308185711
3744	NC_014562	CGG	2	6	192116	192121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185712
3745	NC_014562	CTG	2	6	192177	192182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185712
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3750	NC_014562	AGC	2	6	192436	192441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185712
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3752	NC_014562	CGG	2	6	192485	192490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185712
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3842	NC_014562	GCA	2	6	197245	197250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185717
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3847	NC_014562	CAG	2	6	197578	197583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185718
3848	NC_014562	TAA	2	6	197616	197621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185718
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3850	NC_014562	CTG	2	6	197710	197715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185718
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3852	NC_014562	CGGG	2	8	197790	197797	0 %	0 %	75 %	25 %	308185718
3853	NC_014562	GGC	2	6	197804	197809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185718
3854	NC_014562	TGCGT	2	10	197835	197844	0 %	40 %	40 %	20 %	308185718
3855	NC_014562	ACG	2	6	197955	197960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185719
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3858	NC_014562	GCG	3	9	198047	198055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185719
3859	NC_014562	CAC	2	6	198076	198081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185719
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3861	NC_014562	CG	3	6	198120	198125	0 %	0 %	50 %	50 %	308185719
3862	NC_014562	CAG	2	6	198132	198137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185719
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3865	NC_014562	GCA	2	6	198215	198220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185719
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3981	NC_014562	GCT	2	6	204667	204672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185724
3982	NC_014562	CGCC	2	8	204675	204682	0 %	0 %	25 %	75 %	308185724
3983	NC_014562	GGC	2	6	204712	204717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185724
3984	NC_014562	CAA	2	6	204810	204815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185724
3985	NC_014562	A	7	7	204824	204830	100 %	0 %	0 %	0 %	308185724
3986	NC_014562	GCC	2	6	204993	204998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185725
3987	NC_014562	GCA	2	6	205001	205006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185725
3988	NC_014562	GAC	2	6	205019	205024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185725
3989	NC_014562	ATG	2	6	205064	205069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185725
3990	NC_014562	GAG	2	6	205072	205077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185725
3991	NC_014562	GTAAAG	2	12	205094	205105	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	308185725
3992	NC_014562	CCG	2	6	205114	205119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185725
3993	NC_014562	CG	3	6	205118	205123	0 %	0 %	50 %	50 %	308185725
3994	NC_014562	GGAT	2	8	205141	205148	25 %	25 %	50 %	0 %	308185725
3995	NC_014562	TGG	2	6	205172	205177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185725
3996	NC_014562	ACA	2	6	205298	205303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185725
3997	NC_014562	TGG	2	6	205313	205318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185725
3998	NC_014562	GCT	2	6	205320	205325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185725
3999	NC_014562	CTG	2	6	205402	205407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185725
4000	NC_014562	CG	3	6	205452	205457	0 %	0 %	50 %	50 %	308185725

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