MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014562	CTG	2	6	155756	155761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185680
3002	NC_014562	TGG	2	6	155793	155798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185680
3003	NC_014562	CTG	2	6	155837	155842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185680
3004	NC_014562	GCCA	2	8	155918	155925	25 %	0 %	25 %	50 %	308185680
3005	NC_014562	GAC	3	9	155927	155935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185680
3006	NC_014562	GGC	2	6	155953	155958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185680
3007	NC_014562	CTGG	2	8	156073	156080	0 %	25 %	50 %	25 %	308185680
3008	NC_014562	TGG	3	9	156078	156086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185680
3009	NC_014562	TGC	2	6	156105	156110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185680
3010	NC_014562	TGG	2	6	156111	156116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185680
3011	NC_014562	GCTG	2	8	156144	156151	0 %	25 %	50 %	25 %	308185680
3012	NC_014562	GCT	2	6	156253	156258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185680
3013	NC_014562	GAC	2	6	156334	156339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185680
3014	NC_014562	CG	3	6	156360	156365	0 %	0 %	50 %	50 %	308185680
3015	NC_014562	GCTGGT	2	12	156427	156438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	308185680
3016	NC_014562	CAG	2	6	156483	156488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185681
3017	NC_014562	CG	3	6	156596	156601	0 %	0 %	50 %	50 %	308185681
3018	NC_014562	TGG	2	6	156665	156670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185681
3019	NC_014562	CCG	2	6	156831	156836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185681
3020	NC_014562	CCGG	2	8	156879	156886	0 %	0 %	50 %	50 %	308185681
3021	NC_014562	CAG	2	6	156925	156930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185681
3022	NC_014562	ACTG	2	8	157044	157051	25 %	25 %	25 %	25 %	308185681
3023	NC_014562	CGG	2	6	157058	157063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185681
3024	NC_014562	GCC	2	6	157094	157099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185681
3025	NC_014562	CA	3	6	157101	157106	50 %	0 %	0 %	50 %	308185681
3026	NC_014562	CTT	2	6	157137	157142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185681
3027	NC_014562	GCT	2	6	157160	157165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185681
3028	NC_014562	CAGCC	2	10	157279	157288	20 %	0 %	20 %	60 %	308185681
3029	NC_014562	GC	3	6	157298	157303	0 %	0 %	50 %	50 %	308185681
3030	NC_014562	TAG	2	6	157346	157351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185681
3031	NC_014562	GC	3	6	157382	157387	0 %	0 %	50 %	50 %	308185681
3032	NC_014562	ACA	2	6	157444	157449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185682
3033	NC_014562	GT	3	6	157468	157473	0 %	50 %	50 %	0 %	308185682
3034	NC_014562	GCGCA	2	10	157494	157503	20 %	0 %	40 %	40 %	308185682
3035	NC_014562	CTG	2	6	157509	157514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3036	NC_014562	ATC	2	6	157522	157527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185682
3037	NC_014562	TCA	2	6	157544	157549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185682
3038	NC_014562	CAC	2	6	157554	157559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185682
3039	NC_014562	CAG	2	6	157602	157607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3040	NC_014562	ATG	2	6	157609	157614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185682
3041	NC_014562	CTG	2	6	157635	157640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3042	NC_014562	CAG	2	6	157671	157676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3043	NC_014562	GAA	2	6	157719	157724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185682
3044	NC_014562	GATC	2	8	157883	157890	25 %	25 %	25 %	25 %	308185682
3045	NC_014562	AG	3	6	157910	157915	50 %	0 %	50 %	0 %	308185682
3046	NC_014562	AGA	3	9	157934	157942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185682
3047	NC_014562	CGGT	2	8	157960	157967	0 %	25 %	50 %	25 %	308185682
3048	NC_014562	TGC	2	6	157985	157990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3049	NC_014562	CAT	2	6	157995	158000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185682
3050	NC_014562	TGG	2	6	158075	158080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185682
3051	NC_014562	CAG	3	9	158121	158129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3052	NC_014562	TTC	2	6	158149	158154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185682
3053	NC_014562	TCTT	2	8	158170	158177	0 %	75 %	0 %	25 %	308185682
3054	NC_014562	TCA	2	6	158182	158187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185682
3055	NC_014562	CAGAA	2	10	158233	158242	60 %	0 %	20 %	20 %	308185682
3056	NC_014562	TGG	2	6	158258	158263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185682
3057	NC_014562	CGCCAT	2	12	158271	158282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308185682
3058	NC_014562	GCA	2	6	158330	158335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3059	NC_014562	GCGACA	2	12	158336	158347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3060	NC_014562	TGAC	2	8	158385	158392	25 %	25 %	25 %	25 %	308185682
3061	NC_014562	CGC	2	6	158426	158431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185682
3062	NC_014562	GTG	2	6	158533	158538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185682
3063	NC_014562	CAG	2	6	158580	158585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3064	NC_014562	AGC	2	6	158677	158682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185682
3065	NC_014562	AGCC	2	8	158703	158710	25 %	0 %	25 %	50 %	308185682
3066	NC_014562	AGT	2	6	158729	158734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185682
3067	NC_014562	ATG	2	6	158746	158751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185682
3068	NC_014562	CCAG	2	8	159080	159087	25 %	0 %	25 %	50 %	308185683
3069	NC_014562	CAGA	2	8	159100	159107	50 %	0 %	25 %	25 %	308185683
3070	NC_014562	CGC	2	6	159147	159152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185683
3071	NC_014562	CCG	2	6	159179	159184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185683
3072	NC_014562	AGC	2	6	159190	159195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3073	NC_014562	GTG	2	6	159208	159213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185683
3074	NC_014562	CTG	2	6	159219	159224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3075	NC_014562	TCTT	2	8	159226	159233	0 %	75 %	0 %	25 %	308185683
3076	NC_014562	ACG	2	6	159234	159239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3077	NC_014562	ATC	2	6	159262	159267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185683
3078	NC_014562	CAG	2	6	159306	159311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3079	NC_014562	GCAC	2	8	159347	159354	25 %	0 %	25 %	50 %	308185683
3080	NC_014562	CGA	2	6	159403	159408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3081	NC_014562	CAG	2	6	159417	159422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3082	NC_014562	CTG	2	6	159441	159446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3083	NC_014562	GCC	2	6	159505	159510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185683
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3085	NC_014562	CAG	2	6	159621	159626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
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3088	NC_014562	CCG	2	6	159787	159792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185683
3089	NC_014562	GCC	2	6	159810	159815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185683
3090	NC_014562	CAG	2	6	159867	159872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185683
3091	NC_014562	CCA	2	6	159877	159882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185683
3092	NC_014562	TAA	2	6	159914	159919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185683
3093	NC_014562	ATC	2	6	159979	159984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185683
3094	NC_014562	GAA	2	6	159987	159992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185683
3095	NC_014562	GGC	2	6	159996	160001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185683
3096	NC_014562	CCA	2	6	160026	160031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185683
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3099	NC_014562	AGT	2	6	160094	160099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185683
3100	NC_014562	CCA	3	9	160178	160186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185683
3101	NC_014562	CGG	2	6	160259	160264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185683
3102	NC_014562	CAC	2	6	160310	160315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185683
3103	NC_014562	TGT	2	6	160375	160380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185683
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3105	NC_014562	GA	3	6	160993	160998	50 %	0 %	50 %	0 %	308185684
3106	NC_014562	GCT	2	6	161000	161005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185684
3107	NC_014562	TC	3	6	161049	161054	0 %	50 %	0 %	50 %	308185684
3108	NC_014562	ATT	2	6	161087	161092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185684
3109	NC_014562	CTG	2	6	161199	161204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185684
3110	NC_014562	GAA	2	6	161262	161267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185684
3111	NC_014562	CTG	2	6	161271	161276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185684
3112	NC_014562	CAG	2	6	161304	161309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185684
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3118	NC_014562	TGAT	2	8	161874	161881	25 %	50 %	25 %	0 %	308185685
3119	NC_014562	GGC	2	6	161906	161911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185685
3120	NC_014562	CT	3	6	161998	162003	0 %	50 %	0 %	50 %	308185685
3121	NC_014562	CGT	2	6	162008	162013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185685
3122	NC_014562	TGC	2	6	162051	162056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185685
3123	NC_014562	GC	3	6	162055	162060	0 %	0 %	50 %	50 %	308185685
3124	NC_014562	GAA	2	6	162064	162069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185685
3125	NC_014562	GGT	2	6	162083	162088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185685
3126	NC_014562	TCC	2	6	162095	162100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185685
3127	NC_014562	TCT	2	6	162107	162112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185685
3128	NC_014562	CGA	2	6	162114	162119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185685
3129	NC_014562	CTT	2	6	162142	162147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185685
3130	NC_014562	GGC	2	6	162170	162175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185685
3131	NC_014562	TC	3	6	162201	162206	0 %	50 %	0 %	50 %	308185685
3132	NC_014562	CTGA	2	8	162242	162249	25 %	25 %	25 %	25 %	308185685
3133	NC_014562	AAC	2	6	162260	162265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185685
3134	NC_014562	CT	3	6	162293	162298	0 %	50 %	0 %	50 %	308185685
3135	NC_014562	TGGGTC	2	12	162354	162365	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	308185685
3136	NC_014562	GATG	2	8	162469	162476	25 %	25 %	50 %	0 %	308185685
3137	NC_014562	TCA	3	9	162537	162545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185685
3138	NC_014562	ATC	2	6	162593	162598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185685
3139	NC_014562	GCTG	2	8	162626	162633	0 %	25 %	50 %	25 %	308185685
3140	NC_014562	GCT	2	6	162673	162678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185685
3141	NC_014562	TGA	2	6	162711	162716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185685
3142	NC_014562	CTT	2	6	162781	162786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185685
3143	NC_014562	GAT	2	6	162830	162835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185685
3144	NC_014562	GGC	2	6	162857	162862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185685
3145	NC_014562	GAA	2	6	162871	162876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185685
3146	NC_014562	A	6	6	162893	162898	100 %	0 %	0 %	0 %	308185685
3147	NC_014562	TATGG	2	10	162953	162962	20 %	40 %	40 %	0 %	308185685
3148	NC_014562	GAA	2	6	163000	163005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185685
3149	NC_014562	ATGG	2	8	163013	163020	25 %	25 %	50 %	0 %	308185685
3150	NC_014562	GAA	2	6	163073	163078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185685
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3152	NC_014562	GGC	2	6	163148	163153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185685
3153	NC_014562	GCT	2	6	163222	163227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185685
3154	NC_014562	ACC	2	6	163253	163258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185685
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3156	NC_014562	CAG	2	6	163400	163405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185685
3157	NC_014562	AGA	2	6	163444	163449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185685
3158	NC_014562	CTGG	2	8	163504	163511	0 %	25 %	50 %	25 %	308185685
3159	NC_014562	GCG	2	6	163514	163519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185685
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3161	NC_014562	GAT	2	6	163546	163551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185685
3162	NC_014562	TGGC	2	8	163607	163614	0 %	25 %	50 %	25 %	308185685
3163	NC_014562	CAG	2	6	163622	163627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185685
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3169	NC_014562	TAC	3	9	163829	163837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185685
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3193	NC_014562	TGG	2	6	164867	164872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185686
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3203	NC_014562	GCT	2	6	165334	165339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185686
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3229	NC_014562	ACC	2	6	166265	166270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185686
3230	NC_014562	TCA	2	6	166301	166306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185686
3231	NC_014562	TGT	2	6	166322	166327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185686
3232	NC_014562	TCG	2	6	166335	166340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185686
3233	NC_014562	ATG	2	6	166511	166516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185687
3234	NC_014562	GGT	2	6	166637	166642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185687
3235	NC_014562	GCT	2	6	166678	166683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185687
3236	NC_014562	GCCA	2	8	166743	166750	25 %	0 %	25 %	50 %	308185687
3237	NC_014562	CAA	2	6	166762	166767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185687
3238	NC_014562	GGC	2	6	166808	166813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185687
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3240	NC_014562	TGG	2	6	166887	166892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185687
3241	NC_014562	GGC	2	6	166904	166909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185687
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3354	NC_014562	TGC	3	9	173320	173328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185692
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3361	NC_014562	TGC	2	6	173737	173742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185692
3362	NC_014562	GAT	2	6	173750	173755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185692
3363	NC_014562	TCG	2	6	173774	173779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185692
3364	NC_014562	TGGC	2	8	173814	173821	0 %	25 %	50 %	25 %	308185692
3365	NC_014562	GCT	2	6	173831	173836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185692
3366	NC_014562	CGGATG	2	12	173842	173853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308185692
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3369	NC_014562	CT	3	6	173943	173948	0 %	50 %	0 %	50 %	308185692
3370	NC_014562	CGA	2	6	173969	173974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185692
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3372	NC_014562	CTG	2	6	174030	174035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185692
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3374	NC_014562	GATG	2	8	174089	174096	25 %	25 %	50 %	0 %	308185692
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3381	NC_014562	CTG	2	6	174882	174887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185693
3382	NC_014562	ACT	2	6	174922	174927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185693
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3393	NC_014562	ACTG	2	8	175355	175362	25 %	25 %	25 %	25 %	308185694
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3460	NC_014562	T	6	6	178558	178563	0 %	100 %	0 %	0 %	308185697
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3466	NC_014562	CTGC	2	8	178832	178839	0 %	25 %	25 %	50 %	308185697
3467	NC_014562	GAT	2	6	178855	178860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185697
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3469	NC_014562	CTG	2	6	178990	178995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185697
3470	NC_014562	GC	3	6	179115	179120	0 %	0 %	50 %	50 %	308185697
3471	NC_014562	GGT	3	9	179143	179151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185697
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3473	NC_014562	GCC	2	6	179200	179205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185697
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3477	NC_014562	TCG	2	6	179392	179397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185698
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3479	NC_014562	GGCA	2	8	179502	179509	25 %	0 %	50 %	25 %	308185698
3480	NC_014562	AGT	2	6	179537	179542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185698
3481	NC_014562	CGTCGG	2	12	179582	179593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308185698
3482	NC_014562	GCA	2	6	179594	179599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3483	NC_014562	CGGA	2	8	179634	179641	25 %	0 %	50 %	25 %	308185698
3484	NC_014562	CAG	2	6	179661	179666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3485	NC_014562	GCC	2	6	179703	179708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185698
3486	NC_014562	GCC	2	6	179763	179768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185698
3487	NC_014562	ATA	2	6	179769	179774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185698
3488	NC_014562	GCG	2	6	179960	179965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185698
3489	NC_014562	TGG	2	6	179972	179977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185698
3490	NC_014562	GCA	2	6	180008	180013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3491	NC_014562	AAT	2	6	180024	180029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185698
3492	NC_014562	CAG	2	6	180095	180100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3493	NC_014562	CAG	2	6	180150	180155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3494	NC_014562	AGC	2	6	180196	180201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185698
3495	NC_014562	CCG	2	6	180226	180231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185698
3496	NC_014562	CAT	2	6	180287	180292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185698
3497	NC_014562	GGCTC	2	10	180296	180305	0 %	20 %	40 %	40 %	308185698
3498	NC_014562	GGC	2	6	180307	180312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185698
3499	NC_014562	CCG	2	6	180374	180379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185698
3500	NC_014562	GTCA	2	8	180399	180406	25 %	25 %	25 %	25 %	308185698

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