MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_014562	GGC	2	6	987366	987371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186451
19004	NC_014562	ATA	2	6	987503	987508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186451
19005	NC_014562	CGT	2	6	987559	987564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186451
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19017	NC_014562	TGGA	2	8	988129	988136	25 %	25 %	50 %	0 %	308186452
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19089	NC_014562	CAG	2	6	995824	995829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186456
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19092	NC_014562	TGA	2	6	995942	995947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186457
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19100	NC_014562	GA	3	6	996231	996236	50 %	0 %	50 %	0 %	308186457
19101	NC_014562	ATCA	2	8	996258	996265	50 %	25 %	0 %	25 %	308186457
19102	NC_014562	A	6	6	996291	996296	100 %	0 %	0 %	0 %	308186457
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19224	NC_014562	TACCG	2	10	1003150	1003159	20 %	20 %	20 %	40 %	308186463
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19231	NC_014562	CAG	3	9	1003577	1003585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186464
19232	NC_014562	CAG	2	6	1003657	1003662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186464
19233	NC_014562	GCCT	2	8	1003673	1003680	0 %	25 %	25 %	50 %	308186464
19234	NC_014562	TGC	2	6	1003683	1003688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186464
19235	NC_014562	TGG	2	6	1005398	1005403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186465
19236	NC_014562	ACC	2	6	1005461	1005466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186465
19237	NC_014562	CAA	2	6	1005497	1005502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186465
19238	NC_014562	GC	3	6	1005635	1005640	0 %	0 %	50 %	50 %	308186465
19239	NC_014562	GCA	2	6	1005680	1005685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186465
19240	NC_014562	CTG	2	6	1005697	1005702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186465
19241	NC_014562	GGC	2	6	1005710	1005715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186465
19242	NC_014562	CCG	2	6	1005790	1005795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186465
19243	NC_014562	CGACCA	2	12	1006082	1006093	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	308186466
19244	NC_014562	T	6	6	1006102	1006107	0 %	100 %	0 %	0 %	308186466
19245	NC_014562	GAG	2	6	1006298	1006303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186466
19246	NC_014562	TGGC	2	8	1006321	1006328	0 %	25 %	50 %	25 %	308186466
19247	NC_014562	GC	3	6	1006334	1006339	0 %	0 %	50 %	50 %	308186466
19248	NC_014562	GCA	3	9	1006342	1006350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186466
19249	NC_014562	ACT	2	6	1006404	1006409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186466
19250	NC_014562	GC	3	6	1006491	1006496	0 %	0 %	50 %	50 %	308186466
19251	NC_014562	ATTCA	2	10	1006501	1006510	40 %	40 %	0 %	20 %	308186466
19252	NC_014562	GGC	2	6	1006515	1006520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186466
19253	NC_014562	GAG	2	6	1006550	1006555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186466
19254	NC_014562	GTT	2	6	1006565	1006570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186466
19255	NC_014562	TGG	2	6	1006605	1006610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186466
19256	NC_014562	TGA	2	6	1006674	1006679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186466
19257	NC_014562	TCA	2	6	1006753	1006758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186467
19258	NC_014562	TTG	2	6	1006792	1006797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186467
19259	NC_014562	A	6	6	1006889	1006894	100 %	0 %	0 %	0 %	308186467
19260	NC_014562	ACGC	2	8	1006979	1006986	25 %	0 %	25 %	50 %	308186467
19261	NC_014562	ATG	2	6	1006995	1007000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186467
19262	NC_014562	A	6	6	1007011	1007016	100 %	0 %	0 %	0 %	308186467
19263	NC_014562	GCA	2	6	1007119	1007124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186467
19264	NC_014562	ACCA	2	8	1007135	1007142	50 %	0 %	0 %	50 %	308186467
19265	NC_014562	TGAC	2	8	1007174	1007181	25 %	25 %	25 %	25 %	308186467
19266	NC_014562	GAT	2	6	1007321	1007326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186468
19267	NC_014562	GCG	2	6	1007338	1007343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186468
19268	NC_014562	AGG	2	6	1007395	1007400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186468
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19270	NC_014562	CTGG	2	8	1007426	1007433	0 %	25 %	50 %	25 %	308186468
19271	NC_014562	AGTC	2	8	1007572	1007579	25 %	25 %	25 %	25 %	308186468
19272	NC_014562	GAA	2	6	1007619	1007624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186468
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19299	NC_014562	AAG	2	6	1009251	1009256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186470
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19334	NC_014562	G	6	6	1010822	1010827	0 %	0 %	100 %	0 %	308186472
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19337	NC_014562	A	7	7	1011000	1011006	100 %	0 %	0 %	0 %	308186472
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19339	NC_014562	TGA	2	6	1011316	1011321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186473
19340	NC_014562	TGA	2	6	1011355	1011360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186473
19341	NC_014562	GC	3	6	1011368	1011373	0 %	0 %	50 %	50 %	308186473
19342	NC_014562	ACT	2	6	1011411	1011416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186473
19343	NC_014562	TGG	2	6	1011432	1011437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186473
19344	NC_014562	CGG	2	6	1011454	1011459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186473
19345	NC_014562	TGAA	2	8	1011501	1011508	50 %	25 %	25 %	0 %	308186473
19346	NC_014562	CAC	2	6	1011511	1011516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186473
19347	NC_014562	CACC	2	8	1011570	1011577	25 %	0 %	0 %	75 %	308186473
19348	NC_014562	CCA	2	6	1011603	1011608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186473
19349	NC_014562	GCGCCA	2	12	1011626	1011637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	308186473
19350	NC_014562	GGGT	2	8	1011706	1011713	0 %	25 %	75 %	0 %	308186473
19351	NC_014562	ACT	2	6	1011746	1011751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186473
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19353	NC_014562	GCCA	2	8	1011808	1011815	25 %	0 %	25 %	50 %	308186473
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19355	NC_014562	GAT	2	6	1011832	1011837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186473
19356	NC_014562	GAT	2	6	1011848	1011853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186473
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19471	NC_014562	A	7	7	1021002	1021008	100 %	0 %	0 %	0 %	308186478
19472	NC_014562	GGT	2	6	1021029	1021034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186478
19473	NC_014562	AT	3	6	1021101	1021106	50 %	50 %	0 %	0 %	308186478
19474	NC_014562	T	8	8	1021108	1021115	0 %	100 %	0 %	0 %	308186478
19475	NC_014562	TTA	2	6	1021161	1021166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186478
19476	NC_014562	TAA	2	6	1021195	1021200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186478
19477	NC_014562	TAT	2	6	1021219	1021224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186478
19478	NC_014562	AGT	2	6	1021259	1021264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186478
19479	NC_014562	CTG	2	6	1021304	1021309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186478
19480	NC_014562	ATC	2	6	1021332	1021337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186478
19481	NC_014562	CAT	2	6	1021342	1021347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186478
19482	NC_014562	AATGC	2	10	1022542	1022551	40 %	20 %	20 %	20 %	308186479
19483	NC_014562	GCTG	2	8	1022591	1022598	0 %	25 %	50 %	25 %	308186479
19484	NC_014562	GGGC	2	8	1022617	1022624	0 %	0 %	75 %	25 %	308186479
19485	NC_014562	CCGG	2	8	1022891	1022898	0 %	0 %	50 %	50 %	308186479
19486	NC_014562	GCAGTG	2	12	1022946	1022957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308186479
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19490	NC_014562	CATCCG	2	12	1023087	1023098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308186479
19491	NC_014562	ACC	2	6	1023106	1023111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186479
19492	NC_014562	AGT	2	6	1023150	1023155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186479
19493	NC_014562	GGGC	2	8	1023243	1023250	0 %	0 %	75 %	25 %	308186479
19494	NC_014562	CA	3	6	1023348	1023353	50 %	0 %	0 %	50 %	308186479
19495	NC_014562	CG	3	6	1023361	1023366	0 %	0 %	50 %	50 %	308186479
19496	NC_014562	TGGC	2	8	1023467	1023474	0 %	25 %	50 %	25 %	308186479
19497	NC_014562	CA	4	8	1023540	1023547	50 %	0 %	0 %	50 %	308186480
19498	NC_014562	ACGG	2	8	1023619	1023626	25 %	0 %	50 %	25 %	308186480
19499	NC_014562	AGC	2	6	1023632	1023637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186480
19500	NC_014562	TGC	2	6	1023657	1023662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186480

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