MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014562	GCT	3	9	881480	881488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17003	NC_014562	TGA	2	6	881530	881535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186357
17004	NC_014562	GCT	2	6	881537	881542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17005	NC_014562	TGA	2	6	881563	881568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186357
17006	NC_014562	TGA	2	6	881575	881580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186357
17007	NC_014562	CGG	2	6	881602	881607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186357
17008	NC_014562	TAT	2	6	881619	881624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186357
17009	NC_014562	CAG	2	6	881652	881657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17010	NC_014562	GCT	3	9	881693	881701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17011	NC_014562	TGC	2	6	881737	881742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17012	NC_014562	GCC	2	6	881781	881786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186357
17013	NC_014562	CCT	2	6	881800	881805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186357
17014	NC_014562	TGC	2	6	881894	881899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17015	NC_014562	CGT	2	6	881904	881909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17016	NC_014562	GAT	2	6	881985	881990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186357
17017	NC_014562	GCT	2	6	882023	882028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17018	NC_014562	GC	3	6	882065	882070	0 %	0 %	50 %	50 %	308186357
17019	NC_014562	CGA	2	6	882098	882103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17020	NC_014562	CAG	2	6	882108	882113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17021	NC_014562	GCA	3	9	882158	882166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17022	NC_014562	CTG	2	6	882189	882194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17023	NC_014562	GTC	2	6	882200	882205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17024	NC_014562	GCA	2	6	882212	882217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17025	NC_014562	CAG	2	6	882219	882224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17026	NC_014562	TGC	2	6	882235	882240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17027	NC_014562	GCA	2	6	882272	882277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17028	NC_014562	CTGG	2	8	882335	882342	0 %	25 %	50 %	25 %	308186357
17029	NC_014562	TGT	2	6	882370	882375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186357
17030	NC_014562	GCG	2	6	882400	882405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186357
17031	NC_014562	GCG	2	6	882421	882426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186357
17032	NC_014562	AGC	2	6	882460	882465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17033	NC_014562	GATC	2	8	882482	882489	25 %	25 %	25 %	25 %	308186357
17034	NC_014562	GC	3	6	882616	882621	0 %	0 %	50 %	50 %	308186357
17035	NC_014562	GCT	2	6	882629	882634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17036	NC_014562	GCTGG	2	10	882659	882668	0 %	20 %	60 %	20 %	308186357
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17039	NC_014562	GCT	2	6	882779	882784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17040	NC_014562	GAT	2	6	882800	882805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186357
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17042	NC_014562	CAG	2	6	882839	882844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186357
17043	NC_014562	TAT	2	6	882874	882879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186357
17044	NC_014562	CTG	2	6	882903	882908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186357
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17047	NC_014562	GAT	2	6	882949	882954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186357
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17049	NC_014562	CTG	2	6	882971	882976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186358
17050	NC_014562	CTG	2	6	882983	882988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186358
17051	NC_014562	CAG	2	6	883018	883023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186358
17052	NC_014562	CCG	2	6	883070	883075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186358
17053	NC_014562	TCCG	2	8	883080	883087	0 %	25 %	25 %	50 %	308186358
17054	NC_014562	CAG	4	12	883094	883105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186358
17055	NC_014562	AGTC	2	8	883133	883140	25 %	25 %	25 %	25 %	308186358
17056	NC_014562	CTG	2	6	883142	883147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186358
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17058	NC_014562	CAG	2	6	883250	883255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186358
17059	NC_014562	TGCCGC	2	12	883260	883271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	308186358
17060	NC_014562	CAT	2	6	883303	883308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186358
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17062	NC_014562	CTG	2	6	883388	883393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186358
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17065	NC_014562	TGGC	2	8	883626	883633	0 %	25 %	50 %	25 %	308186359
17066	NC_014562	CTG	2	6	883650	883655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186359
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17088	NC_014562	GGC	2	6	884538	884543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186359
17089	NC_014562	ATTC	2	8	884618	884625	25 %	50 %	0 %	25 %	308186359
17090	NC_014562	AAC	2	6	884638	884643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186359
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17102	NC_014562	CGCGC	2	10	885343	885352	0 %	0 %	40 %	60 %	308186361
17103	NC_014562	CTA	2	6	885381	885386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186361
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17107	NC_014562	GAT	2	6	885570	885575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186361
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17111	NC_014562	GTC	2	6	885882	885887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186362
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17117	NC_014562	CG	4	8	886105	886112	0 %	0 %	50 %	50 %	308186362
17118	NC_014562	TGAT	2	8	886141	886148	25 %	50 %	25 %	0 %	308186362
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17236	NC_014562	A	7	7	891925	891931	100 %	0 %	0 %	0 %	308186368
17237	NC_014562	TGA	2	6	891943	891948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186368
17238	NC_014562	CTG	2	6	891975	891980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186368
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17240	NC_014562	GAT	2	6	892017	892022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186368
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17343	NC_014562	CCAG	2	8	898581	898588	25 %	0 %	25 %	50 %	308186372
17344	NC_014562	GC	3	6	898940	898945	0 %	0 %	50 %	50 %	308186373
17345	NC_014562	GCTG	2	8	898948	898955	0 %	25 %	50 %	25 %	308186373
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17353	NC_014562	GGC	2	6	899573	899578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186373
17354	NC_014562	ATC	2	6	899579	899584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186373
17355	NC_014562	TGA	2	6	899650	899655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186373
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17359	NC_014562	CTG	2	6	899756	899761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186373
17360	NC_014562	CTG	2	6	899800	899805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186373
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17470	NC_014562	GCA	3	9	906057	906065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186382
17471	NC_014562	GC	3	6	906120	906125	0 %	0 %	50 %	50 %	308186382
17472	NC_014562	GCG	2	6	906135	906140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186382
17473	NC_014562	CTG	2	6	906148	906153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186382
17474	NC_014562	TCG	2	6	906260	906265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186382
17475	NC_014562	CAC	2	6	906274	906279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186382
17476	NC_014562	TTC	2	6	906296	906301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186382
17477	NC_014562	ACC	2	6	906691	906696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186383
17478	NC_014562	TGG	2	6	906704	906709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186383
17479	NC_014562	GC	3	6	906832	906837	0 %	0 %	50 %	50 %	308186383
17480	NC_014562	TGC	2	6	906941	906946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186383
17481	NC_014562	GGCAGG	2	12	906995	907006	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	308186383
17482	NC_014562	CAG	2	6	907054	907059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186383
17483	NC_014562	CAT	2	6	907071	907076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186383
17484	NC_014562	CAGCG	2	10	907099	907108	20 %	0 %	40 %	40 %	308186383
17485	NC_014562	CTG	2	6	907114	907119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186383
17486	NC_014562	CTG	2	6	907162	907167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186383
17487	NC_014562	GACG	2	8	907171	907178	25 %	0 %	50 %	25 %	308186383
17488	NC_014562	AAT	2	6	907241	907246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186383
17489	NC_014562	CTGC	2	8	907300	907307	0 %	25 %	25 %	50 %	308186384
17490	NC_014562	CAC	2	6	907321	907326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186384
17491	NC_014562	GTG	2	6	907361	907366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186384
17492	NC_014562	AATCG	2	10	907380	907389	40 %	20 %	20 %	20 %	308186384
17493	NC_014562	GCA	2	6	907467	907472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186384
17494	NC_014562	GCC	2	6	907475	907480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186384
17495	NC_014562	GTG	2	6	907490	907495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186384
17496	NC_014562	AGC	2	6	907503	907508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186384
17497	NC_014562	CTG	3	9	907571	907579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186384
17498	NC_014562	GTC	2	6	907623	907628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186384
17499	NC_014562	CTG	2	6	907754	907759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186384
17500	NC_014562	GGC	2	6	907816	907821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186384

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