MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014562	CCA	2	6	829974	829979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186301
16002	NC_014562	GCTGC	2	10	829984	829993	0 %	20 %	40 %	40 %	308186301
16003	NC_014562	TAA	2	6	830081	830086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186302
16004	NC_014562	GCG	2	6	830091	830096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186302
16005	NC_014562	CCA	2	6	830123	830128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186302
16006	NC_014562	GCG	2	6	830153	830158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186302
16007	NC_014562	ATCTGC	2	12	830166	830177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308186302
16008	NC_014562	GCTG	2	8	830183	830190	0 %	25 %	50 %	25 %	308186302
16009	NC_014562	ATC	2	6	830280	830285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186302
16010	NC_014562	GAGCA	2	10	830368	830377	40 %	0 %	40 %	20 %	308186302
16011	NC_014562	CTGG	2	8	830403	830410	0 %	25 %	50 %	25 %	308186302
16012	NC_014562	GAC	2	6	830436	830441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16013	NC_014562	CGG	2	6	830476	830481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186302
16014	NC_014562	CGATA	2	10	830483	830492	40 %	20 %	20 %	20 %	308186302
16015	NC_014562	TGA	2	6	830515	830520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186302
16016	NC_014562	CAGC	2	8	830624	830631	25 %	0 %	25 %	50 %	308186302
16017	NC_014562	ACG	2	6	830662	830667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16018	NC_014562	AAAGC	2	10	830706	830715	60 %	0 %	20 %	20 %	308186302
16019	NC_014562	CAG	2	6	830721	830726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16020	NC_014562	GAA	2	6	830772	830777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186302
16021	NC_014562	CGC	2	6	830783	830788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186302
16022	NC_014562	CCG	2	6	830872	830877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186302
16023	NC_014562	GCAAG	2	10	830882	830891	40 %	0 %	40 %	20 %	308186302
16024	NC_014562	TGCGT	2	10	830899	830908	0 %	40 %	40 %	20 %	308186302
16025	NC_014562	TGAA	2	8	830977	830984	50 %	25 %	25 %	0 %	308186302
16026	NC_014562	CAC	2	6	831003	831008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186302
16027	NC_014562	GA	4	8	831047	831054	50 %	0 %	50 %	0 %	308186302
16028	NC_014562	CG	3	6	831101	831106	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16029	NC_014562	CTGTG	2	10	831121	831130	0 %	40 %	40 %	20 %	308186302
16030	NC_014562	AAGC	2	8	831167	831174	50 %	0 %	25 %	25 %	308186302
16031	NC_014562	GC	3	6	831187	831192	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16032	NC_014562	GC	3	6	831215	831220	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16033	NC_014562	CG	3	6	831285	831290	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16034	NC_014562	CAG	2	6	831372	831377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16035	NC_014562	CGC	2	6	831416	831421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186302
16036	NC_014562	GCA	2	6	831422	831427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16037	NC_014562	AGT	3	9	831482	831490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186302
16038	NC_014562	CG	3	6	831509	831514	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16039	NC_014562	CGC	2	6	831524	831529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186302
16040	NC_014562	CCA	2	6	831572	831577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186302
16041	NC_014562	CGC	2	6	831609	831614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186302
16042	NC_014562	ATC	2	6	831615	831620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186302
16043	NC_014562	GC	3	6	831669	831674	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16044	NC_014562	CCGG	2	8	831710	831717	0 %	0 %	50 %	50 %	308186302
16045	NC_014562	CAG	2	6	831738	831743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16046	NC_014562	CAG	2	6	831747	831752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16047	NC_014562	CAG	3	9	831774	831782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16048	NC_014562	CAG	2	6	831843	831848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16049	NC_014562	ATA	2	6	831928	831933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186302
16050	NC_014562	CAG	2	6	831954	831959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16051	NC_014562	CAG	2	6	832002	832007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16052	NC_014562	TTC	2	6	832009	832014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186302
16053	NC_014562	GAC	2	6	832016	832021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16054	NC_014562	ATC	2	6	832032	832037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186302
16055	NC_014562	ACC	2	6	832060	832065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186302
16056	NC_014562	CCA	2	6	832104	832109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186302
16057	NC_014562	GCAGC	2	10	832117	832126	20 %	0 %	40 %	40 %	308186302
16058	NC_014562	GCA	2	6	832148	832153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186302
16059	NC_014562	CG	3	6	832239	832244	0 %	0 %	50 %	50 %	308186303
16060	NC_014562	GGC	2	6	832300	832305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186303
16061	NC_014562	ATG	2	6	832340	832345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186303
16062	NC_014562	TGCAC	2	10	832350	832359	20 %	20 %	20 %	40 %	308186303
16063	NC_014562	CCA	2	6	832390	832395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186303
16064	NC_014562	GAA	2	6	832399	832404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186303
16065	NC_014562	AGA	2	6	832413	832418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186303
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16068	NC_014562	GCA	2	6	832506	832511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186303
16069	NC_014562	CAG	2	6	832532	832537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186303
16070	NC_014562	CAGC	2	8	832591	832598	25 %	0 %	25 %	50 %	308186303
16071	NC_014562	GTG	2	6	832604	832609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186303
16072	NC_014562	GCC	2	6	832615	832620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186303
16073	NC_014562	CTG	2	6	832843	832848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186304
16074	NC_014562	CTG	2	6	832957	832962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186304
16075	NC_014562	ACGGA	2	10	832988	832997	40 %	0 %	40 %	20 %	308186304
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16078	NC_014562	CGA	2	6	833100	833105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186304
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16080	NC_014562	GCTG	2	8	833132	833139	0 %	25 %	50 %	25 %	308186304
16081	NC_014562	GCTG	2	8	833261	833268	0 %	25 %	50 %	25 %	308186304
16082	NC_014562	GACTG	2	10	833305	833314	20 %	20 %	40 %	20 %	308186304
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16087	NC_014562	TGG	2	6	833456	833461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186304
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16091	NC_014562	ATT	2	6	833623	833628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186304
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16100	NC_014562	GGC	2	6	833878	833883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186304
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16102	NC_014562	CTG	2	6	833962	833967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186304
16103	NC_014562	GC	3	6	833981	833986	0 %	0 %	50 %	50 %	308186304
16104	NC_014562	AGG	2	6	833993	833998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186304
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16107	NC_014562	GCAA	2	8	834140	834147	50 %	0 %	25 %	25 %	308186304
16108	NC_014562	ACC	2	6	834226	834231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186304
16109	NC_014562	TCA	2	6	834237	834242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186304
16110	NC_014562	GTGC	2	8	834264	834271	0 %	25 %	50 %	25 %	308186304
16111	NC_014562	CAG	2	6	834328	834333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186304
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16117	NC_014562	GC	3	6	834478	834483	0 %	0 %	50 %	50 %	308186304
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16119	NC_014562	TGG	2	6	834599	834604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186304
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16121	NC_014562	CGG	2	6	834632	834637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186304
16122	NC_014562	CG	5	10	834731	834740	0 %	0 %	50 %	50 %	308186304
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16234	NC_014562	CAG	2	6	841008	841013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186313
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16236	NC_014562	GCA	2	6	841246	841251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186313
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16238	NC_014562	CAGT	2	8	841272	841279	25 %	25 %	25 %	25 %	308186313
16239	NC_014562	GCT	2	6	841350	841355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186313
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16241	NC_014562	GTT	2	6	841423	841428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186313
16242	NC_014562	ATG	2	6	841442	841447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186313
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16346	NC_014562	GCC	2	6	846204	846209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186319
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16355	NC_014562	TCA	2	6	846734	846739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186319
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16479	NC_014562	CCG	2	6	853703	853708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186326
16480	NC_014562	CGA	2	6	853767	853772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186326
16481	NC_014562	ACC	2	6	853844	853849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186326
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