MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_014562	GCA	2	6	701793	701798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186188
13503	NC_014562	CAT	2	6	701913	701918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186188
13504	NC_014562	CTC	2	6	701958	701963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186188
13505	NC_014562	GCGCA	2	10	702006	702015	20 %	0 %	40 %	40 %	308186188
13506	NC_014562	TGTT	2	8	702038	702045	0 %	75 %	25 %	0 %	308186188
13507	NC_014562	CGC	2	6	702215	702220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186188
13508	NC_014562	CGG	2	6	702281	702286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186188
13509	NC_014562	GAT	2	6	702330	702335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186188
13510	NC_014562	TCT	2	6	702368	702373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186188
13511	NC_014562	CTGATT	2	12	702394	702405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308186188
13512	NC_014562	GCTG	2	8	702413	702420	0 %	25 %	50 %	25 %	308186188
13513	NC_014562	TC	3	6	702477	702482	0 %	50 %	0 %	50 %	308186189
13514	NC_014562	CTG	2	6	702506	702511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13515	NC_014562	CCG	2	6	702564	702569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186189
13516	NC_014562	ACA	2	6	702582	702587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186189
13517	NC_014562	AGG	2	6	702600	702605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186189
13518	NC_014562	GCC	2	6	702623	702628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186189
13519	NC_014562	TGG	2	6	702641	702646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186189
13520	NC_014562	GCA	2	6	702712	702717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13521	NC_014562	TGC	2	6	702723	702728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13522	NC_014562	CAG	2	6	702812	702817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13523	NC_014562	GCCA	2	8	702878	702885	25 %	0 %	25 %	50 %	308186189
13524	NC_014562	CAG	3	9	702995	703003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13525	NC_014562	GCG	2	6	703004	703009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186189
13526	NC_014562	AGC	2	6	703014	703019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13527	NC_014562	ATG	2	6	703023	703028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186189
13528	NC_014562	GC	3	6	703080	703085	0 %	0 %	50 %	50 %	308186189
13529	NC_014562	GCA	3	9	703105	703113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13530	NC_014562	GCA	2	6	703126	703131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13531	NC_014562	ACC	2	6	703133	703138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186189
13532	NC_014562	CAG	3	9	703154	703162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13533	NC_014562	TGC	2	6	703278	703283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13534	NC_014562	ACC	2	6	703336	703341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186189
13535	NC_014562	TTCC	2	8	703368	703375	0 %	50 %	0 %	50 %	308186189
13536	NC_014562	CGT	2	6	703385	703390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13537	NC_014562	AGC	2	6	703535	703540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13538	NC_014562	CAG	2	6	703625	703630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13539	NC_014562	CAG	2	6	703715	703720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
13540	NC_014562	GAC	2	6	703741	703746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186189
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13542	NC_014562	GCG	2	6	703917	703922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186189
13543	NC_014562	TGA	2	6	704860	704865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186190
13544	NC_014562	GTT	3	9	704964	704972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186190
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13546	NC_014562	AGA	2	6	705023	705028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186190
13547	NC_014562	TGC	2	6	705052	705057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186190
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13550	NC_014562	A	6	6	705213	705218	100 %	0 %	0 %	0 %	308186190
13551	NC_014562	ATCA	2	8	705334	705341	50 %	25 %	0 %	25 %	308186191
13552	NC_014562	ATA	2	6	705393	705398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186191
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13554	NC_014562	T	6	6	705406	705411	0 %	100 %	0 %	0 %	308186191
13555	NC_014562	GTTA	2	8	705443	705450	25 %	50 %	25 %	0 %	308186191
13556	NC_014562	GCA	2	6	705451	705456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186191
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13558	NC_014562	GATG	2	8	705814	705821	25 %	25 %	50 %	0 %	308186192
13559	NC_014562	ATT	2	6	705850	705855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186192
13560	NC_014562	TGC	2	6	705930	705935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186192
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13563	NC_014562	GCTG	2	8	706014	706021	0 %	25 %	50 %	25 %	308186192
13564	NC_014562	AT	3	6	706156	706161	50 %	50 %	0 %	0 %	308186192
13565	NC_014562	GCA	2	6	706166	706171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186192
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13567	NC_014562	TCGT	2	8	706238	706245	0 %	50 %	25 %	25 %	308186192
13568	NC_014562	GTC	2	6	706341	706346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186192
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13576	NC_014562	GAT	2	6	706727	706732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186192
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13579	NC_014562	TGA	2	6	706794	706799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186192
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13581	NC_014562	GTTT	2	8	706906	706913	0 %	75 %	25 %	0 %	308186192
13582	NC_014562	GGT	2	6	706975	706980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186192
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13587	NC_014562	GC	3	6	707458	707463	0 %	0 %	50 %	50 %	308186193
13588	NC_014562	CACC	2	8	707515	707522	25 %	0 %	0 %	75 %	308186193
13589	NC_014562	CGCC	2	8	707536	707543	0 %	0 %	25 %	75 %	308186193
13590	NC_014562	GGC	2	6	707575	707580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186193
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13592	NC_014562	GCT	2	6	707674	707679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186193
13593	NC_014562	GCT	2	6	707698	707703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186193
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13598	NC_014562	GGC	2	6	707822	707827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186193
13599	NC_014562	ATG	2	6	707876	707881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186193
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13601	NC_014562	CAGCC	2	10	707979	707988	20 %	0 %	20 %	60 %	308186193
13602	NC_014562	CGA	2	6	707998	708003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186193
13603	NC_014562	GCA	2	6	708079	708084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186193
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13605	NC_014562	CAG	2	6	708122	708127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186194
13606	NC_014562	GGT	2	6	708248	708253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186194
13607	NC_014562	GCGCA	2	10	708339	708348	20 %	0 %	40 %	40 %	308186194
13608	NC_014562	CTG	2	6	708377	708382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186194
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13614	NC_014562	CAC	2	6	708605	708610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186194
13615	NC_014562	GCG	2	6	708639	708644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186194
13616	NC_014562	AGC	2	6	708650	708655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186194
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13618	NC_014562	GACT	2	8	708770	708777	25 %	25 %	25 %	25 %	308186194
13619	NC_014562	TCA	2	6	708783	708788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186194
13620	NC_014562	GCA	2	6	708820	708825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186194
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13844	NC_014562	TGCC	2	8	720073	720080	0 %	25 %	25 %	50 %	308186204
13845	NC_014562	GA	3	6	720085	720090	50 %	0 %	50 %	0 %	308186204
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13854	NC_014562	GGTC	2	8	720768	720775	0 %	25 %	50 %	25 %	308186205
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13856	NC_014562	CAGTA	2	10	721081	721090	40 %	20 %	20 %	20 %	308186205
13857	NC_014562	CG	3	6	721092	721097	0 %	0 %	50 %	50 %	308186205
13858	NC_014562	AAAGAG	2	12	721159	721170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186205
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13974	NC_014562	CG	3	6	726946	726951	0 %	0 %	50 %	50 %	308186214
13975	NC_014562	GCC	2	6	726990	726995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186214
13976	NC_014562	ATC	2	6	727017	727022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186214
13977	NC_014562	CGG	2	6	727063	727068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186214
13978	NC_014562	ACT	2	6	727072	727077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186214
13979	NC_014562	GTG	2	6	727078	727083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186214
13980	NC_014562	ACGGC	2	10	727141	727150	20 %	0 %	40 %	40 %	308186214
13981	NC_014562	TGC	2	6	727153	727158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186214
13982	NC_014562	CCG	2	6	727198	727203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186214
13983	NC_014562	GCT	2	6	727241	727246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186214
13984	NC_014562	CCT	2	6	727285	727290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186214
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13986	NC_014562	CGC	2	6	727333	727338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186214
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13988	NC_014562	TGG	2	6	727351	727356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186214
13989	NC_014562	GTG	2	6	727377	727382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186214
13990	NC_014562	GGC	2	6	727400	727405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186214
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13998	NC_014562	GCTG	2	8	727821	727828	0 %	25 %	50 %	25 %	308186214
13999	NC_014562	CTG	2	6	727947	727952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186215
14000	NC_014562	GCTG	2	8	727957	727964	0 %	25 %	50 %	25 %	308186215

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