MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014562	GGC	2	6	651863	651868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186141
12502	NC_014562	GCT	2	6	652177	652182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12503	NC_014562	A	7	7	652184	652190	100 %	0 %	0 %	0 %	308186142
12504	NC_014562	AAG	2	6	652251	652256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186142
12505	NC_014562	AGA	2	6	652275	652280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186142
12506	NC_014562	CG	3	6	652325	652330	0 %	0 %	50 %	50 %	308186142
12507	NC_014562	GCC	2	6	652356	652361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186142
12508	NC_014562	CTCTGG	2	12	652425	652436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12509	NC_014562	AAG	2	6	652464	652469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186142
12510	NC_014562	CGA	2	6	652498	652503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12511	NC_014562	GCA	2	6	652614	652619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12512	NC_014562	GCC	2	6	652646	652651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186142
12513	NC_014562	TGA	2	6	652665	652670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186142
12514	NC_014562	ACA	2	6	652722	652727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186142
12515	NC_014562	GCG	3	9	652800	652808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186142
12516	NC_014562	TGG	2	6	652812	652817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186142
12517	NC_014562	CGG	2	6	652848	652853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186142
12518	NC_014562	GCTG	2	8	652857	652864	0 %	25 %	50 %	25 %	308186142
12519	NC_014562	CTG	2	6	652874	652879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12520	NC_014562	ATGAGC	2	12	653006	653017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308186142
12521	NC_014562	GCG	2	6	653058	653063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186142
12522	NC_014562	TGA	2	6	653083	653088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186142
12523	NC_014562	GCG	2	6	653090	653095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186142
12524	NC_014562	AAG	2	6	653163	653168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186142
12525	NC_014562	CTG	2	6	653246	653251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12526	NC_014562	A	6	6	653279	653284	100 %	0 %	0 %	0 %	308186142
12527	NC_014562	GCT	2	6	653380	653385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12528	NC_014562	GCT	2	6	653422	653427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12529	NC_014562	ACA	2	6	653454	653459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186142
12530	NC_014562	GAT	2	6	653527	653532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186142
12531	NC_014562	TGG	2	6	653568	653573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186142
12532	NC_014562	GCC	2	6	653576	653581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186142
12533	NC_014562	CCA	2	6	653639	653644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186142
12534	NC_014562	CAG	2	6	653648	653653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12535	NC_014562	GCT	2	6	653656	653661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12536	NC_014562	TGA	2	6	653703	653708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186142
12537	NC_014562	TGAA	2	8	653730	653737	50 %	25 %	25 %	0 %	308186142
12538	NC_014562	GGC	2	6	653786	653791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186142
12539	NC_014562	CTA	2	6	653881	653886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186142
12540	NC_014562	ATG	2	6	653952	653957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186142
12541	NC_014562	ACCA	2	8	654037	654044	50 %	0 %	0 %	50 %	308186142
12542	NC_014562	CG	3	6	654048	654053	0 %	0 %	50 %	50 %	308186142
12543	NC_014562	CAT	2	6	654187	654192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186142
12544	NC_014562	CAG	2	6	654260	654265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12545	NC_014562	GCA	2	6	654268	654273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186142
12546	NC_014562	TGA	2	6	654300	654305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186142
12547	NC_014562	CAG	3	9	654476	654484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186143
12548	NC_014562	ATGA	2	8	654509	654516	50 %	25 %	25 %	0 %	308186143
12549	NC_014562	CT	3	6	654524	654529	0 %	50 %	0 %	50 %	308186143
12550	NC_014562	ATG	2	6	654602	654607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186143
12551	NC_014562	GCG	2	6	654609	654614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186143
12552	NC_014562	GC	3	6	654621	654626	0 %	0 %	50 %	50 %	308186143
12553	NC_014562	TGC	2	6	654639	654644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186143
12554	NC_014562	CGG	2	6	654648	654653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186143
12555	NC_014562	GGCG	2	8	654658	654665	0 %	0 %	75 %	25 %	308186143
12556	NC_014562	ATG	2	6	654695	654700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186143
12557	NC_014562	GCC	2	6	654702	654707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186143
12558	NC_014562	CAGT	2	8	654718	654725	25 %	25 %	25 %	25 %	308186143
12559	NC_014562	ACC	2	6	654737	654742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186143
12560	NC_014562	GCG	2	6	654807	654812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186143
12561	NC_014562	GCC	2	6	654836	654841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186143
12562	NC_014562	CGT	2	6	655009	655014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186143
12563	NC_014562	TGA	2	6	655060	655065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186143
12564	NC_014562	CCG	2	6	655071	655076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186143
12565	NC_014562	TGA	2	6	655092	655097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186143
12566	NC_014562	TGA	2	6	655131	655136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186143
12567	NC_014562	GAT	2	6	655222	655227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186143
12568	NC_014562	AAG	2	6	655232	655237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186143
12569	NC_014562	GGT	2	6	655263	655268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186143
12570	NC_014562	AGC	2	6	655663	655668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186144
12571	NC_014562	CGGC	2	8	655691	655698	0 %	0 %	50 %	50 %	308186144
12572	NC_014562	GGA	2	6	655794	655799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186144
12573	NC_014562	CAAA	2	8	655865	655872	75 %	0 %	0 %	25 %	308186144
12574	NC_014562	GGA	3	9	655963	655971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186144
12575	NC_014562	CGGTG	2	10	656031	656040	0 %	20 %	60 %	20 %	308186144
12576	NC_014562	TCGCGG	2	12	656165	656176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308186144
12577	NC_014562	GGC	2	6	656199	656204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186144
12578	NC_014562	GACCT	2	10	656237	656246	20 %	20 %	20 %	40 %	308186144
12579	NC_014562	GTT	2	6	656259	656264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186144
12580	NC_014562	CCT	2	6	656297	656302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186144
12581	NC_014562	ATG	2	6	656341	656346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186144
12582	NC_014562	GCGCA	2	10	656380	656389	20 %	0 %	40 %	40 %	308186144
12583	NC_014562	TGC	2	6	656477	656482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186144
12584	NC_014562	CTG	2	6	656575	656580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186144
12585	NC_014562	GCT	2	6	656668	656673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186145
12586	NC_014562	CTT	2	6	656712	656717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186145
12587	NC_014562	CG	3	6	657040	657045	0 %	0 %	50 %	50 %	308186146
12588	NC_014562	CAC	2	6	657074	657079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186146
12589	NC_014562	CTG	2	6	657104	657109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186146
12590	NC_014562	GGCT	2	8	657198	657205	0 %	25 %	50 %	25 %	308186146
12591	NC_014562	TCG	2	6	657214	657219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186146
12592	NC_014562	TCA	2	6	657241	657246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186146
12593	NC_014562	CTG	2	6	657254	657259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186146
12594	NC_014562	CGC	2	6	657290	657295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186146
12595	NC_014562	ATTC	2	8	658618	658625	25 %	50 %	0 %	25 %	308186147
12596	NC_014562	AAAG	2	8	658637	658644	75 %	0 %	25 %	0 %	308186147
12597	NC_014562	AAT	2	6	658677	658682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186147
12598	NC_014562	A	6	6	658778	658783	100 %	0 %	0 %	0 %	308186147
12599	NC_014562	GAT	3	9	658791	658799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186147
12600	NC_014562	T	8	8	658863	658870	0 %	100 %	0 %	0 %	308186147
12601	NC_014562	CTG	2	6	658878	658883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186147
12602	NC_014562	TCG	2	6	658996	659001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186147
12603	NC_014562	ATT	2	6	659116	659121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186147
12604	NC_014562	CTG	2	6	659122	659127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186147
12605	NC_014562	CT	3	6	659137	659142	0 %	50 %	0 %	50 %	308186147
12606	NC_014562	TGA	2	6	659224	659229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186148
12607	NC_014562	AGT	2	6	659248	659253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186148
12608	NC_014562	CTGG	3	12	659285	659296	0 %	25 %	50 %	25 %	308186148
12609	NC_014562	GCC	2	6	659368	659373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186148
12610	NC_014562	CTG	2	6	659419	659424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186148
12611	NC_014562	ATA	2	6	659457	659462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186148
12612	NC_014562	CTTT	2	8	659471	659478	0 %	75 %	0 %	25 %	308186148
12613	NC_014562	T	6	6	659733	659738	0 %	100 %	0 %	0 %	308186148
12614	NC_014562	CTG	2	6	659746	659751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186148
12615	NC_014562	AG	3	6	659790	659795	50 %	0 %	50 %	0 %	308186148
12616	NC_014562	CAC	2	6	659823	659828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186148
12617	NC_014562	CAGC	2	8	659848	659855	25 %	0 %	25 %	50 %	308186148
12618	NC_014562	CAG	2	6	659894	659899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186148
12619	NC_014562	GCT	2	6	659905	659910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186148
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12973	NC_014562	CCAG	2	8	675694	675701	25 %	0 %	25 %	50 %	308186163
12974	NC_014562	CAT	2	6	675725	675730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186163
12975	NC_014562	TCT	2	6	675741	675746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186163
12976	NC_014562	TCA	2	6	675918	675923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186163
12977	NC_014562	GCAG	2	8	675958	675965	25 %	0 %	50 %	25 %	308186163
12978	NC_014562	CAC	2	6	676015	676020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186163
12979	NC_014562	GCG	2	6	676057	676062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186163
12980	NC_014562	CGG	2	6	676068	676073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186163
12981	NC_014562	GCC	2	6	676107	676112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186163
12982	NC_014562	ACC	2	6	676113	676118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186163
12983	NC_014562	CGC	2	6	676145	676150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186163
12984	NC_014562	CAT	2	6	676199	676204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186163
12985	NC_014562	CATC	2	8	676270	676277	25 %	25 %	0 %	50 %	308186163
12986	NC_014562	CCA	2	6	676303	676308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186163
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12988	NC_014562	GGCG	2	8	676393	676400	0 %	0 %	75 %	25 %	308186163
12989	NC_014562	CAGC	2	8	676402	676409	25 %	0 %	25 %	50 %	308186163
12990	NC_014562	CGT	2	6	676426	676431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186163
12991	NC_014562	GCAT	2	8	676440	676447	25 %	25 %	25 %	25 %	308186163
12992	NC_014562	CCGGG	2	10	676531	676540	0 %	0 %	60 %	40 %	308186163
12993	NC_014562	CCCG	2	8	676599	676606	0 %	0 %	25 %	75 %	308186163
12994	NC_014562	CTGG	2	8	676628	676635	0 %	25 %	50 %	25 %	308186163
12995	NC_014562	ACG	2	6	676679	676684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186163
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12997	NC_014562	CTG	2	6	676969	676974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186164
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12999	NC_014562	TGC	2	6	677064	677069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186164
13000	NC_014562	CAC	2	6	677083	677088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186164

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