MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12003	NC_014562	TGC	2	6	627109	627114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186123
12004	NC_014562	GAC	2	6	627155	627160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186123
12005	NC_014562	CAG	2	6	627195	627200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186123
12006	NC_014562	TGTC	2	8	627201	627208	0 %	50 %	25 %	25 %	308186123
12007	NC_014562	GCG	2	6	627209	627214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186123
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12015	NC_014562	CTG	2	6	627746	627751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186124
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12119	NC_014562	GCA	2	6	632250	632255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12120	NC_014562	CTG	2	6	632380	632385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12121	NC_014562	CTG	2	6	632431	632436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12122	NC_014562	CGC	2	6	632464	632469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186129
12123	NC_014562	CAG	2	6	632494	632499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186129
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12125	NC_014562	CTG	2	6	632533	632538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12126	NC_014562	GCA	2	6	632565	632570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186129
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12131	NC_014562	CGT	2	6	632778	632783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12132	NC_014562	CTG	2	6	632896	632901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12133	NC_014562	CTG	2	6	632917	632922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
12134	NC_014562	GCCGA	2	10	632980	632989	20 %	0 %	40 %	40 %	308186129
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12142	NC_014562	CGT	2	6	633166	633171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186129
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12144	NC_014562	CTG	2	6	633321	633326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186130
12145	NC_014562	GCT	2	6	633407	633412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186130
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12149	NC_014562	GGC	2	6	633525	633530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186130
12150	NC_014562	TGCC	2	8	633592	633599	0 %	25 %	25 %	50 %	308186130
12151	NC_014562	CGGTAA	2	12	633607	633618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308186130
12152	NC_014562	CGGCT	2	10	633624	633633	0 %	20 %	40 %	40 %	308186130
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12157	NC_014562	GTG	2	6	633877	633882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186130
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12197	NC_014562	TCAG	2	8	636118	636125	25 %	25 %	25 %	25 %	308186132
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12221	NC_014562	TGA	2	6	637005	637010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186132
12222	NC_014562	GGA	2	6	637011	637016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186132
12223	NC_014562	GA	3	6	637015	637020	50 %	0 %	50 %	0 %	308186132
12224	NC_014562	GCT	2	6	637253	637258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12225	NC_014562	GCT	2	6	637290	637295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12226	NC_014562	GCA	2	6	637304	637309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12227	NC_014562	TGT	2	6	637404	637409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186133
12228	NC_014562	CCTGAT	2	12	637467	637478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308186133
12229	NC_014562	CTGC	2	8	637509	637516	0 %	25 %	25 %	50 %	308186133
12230	NC_014562	CGA	2	6	637635	637640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12231	NC_014562	CG	3	6	637647	637652	0 %	0 %	50 %	50 %	308186133
12232	NC_014562	ACCG	2	8	637654	637661	25 %	0 %	25 %	50 %	308186133
12233	NC_014562	GC	3	6	637694	637699	0 %	0 %	50 %	50 %	308186133
12234	NC_014562	CA	3	6	637705	637710	50 %	0 %	0 %	50 %	308186133
12235	NC_014562	GAC	2	6	637770	637775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12236	NC_014562	GCAT	2	8	637862	637869	25 %	25 %	25 %	25 %	308186133
12237	NC_014562	TTGG	2	8	637874	637881	0 %	50 %	50 %	0 %	308186133
12238	NC_014562	TCTT	2	8	637898	637905	0 %	75 %	0 %	25 %	308186133
12239	NC_014562	ACG	2	6	637976	637981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12240	NC_014562	TGC	2	6	637986	637991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12241	NC_014562	GTA	3	9	637999	638007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186133
12242	NC_014562	CAGG	2	8	638055	638062	25 %	0 %	50 %	25 %	308186133
12243	NC_014562	GCT	2	6	638067	638072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12244	NC_014562	GAT	2	6	638077	638082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186133
12245	NC_014562	TGC	2	6	638088	638093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186133
12246	NC_014562	CGG	2	6	638245	638250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186133
12247	NC_014562	GCC	2	6	638288	638293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186133
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12250	NC_014562	CTC	2	6	638672	638677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186134
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12253	NC_014562	CGC	2	6	638847	638852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186134
12254	NC_014562	CGA	2	6	638923	638928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186134
12255	NC_014562	CAG	2	6	638945	638950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186134
12256	NC_014562	CGC	2	6	639163	639168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186134
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12258	NC_014562	GAC	2	6	639230	639235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186134
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12260	NC_014562	CTG	2	6	639326	639331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186134
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12265	NC_014562	CAG	2	6	639659	639664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186134
12266	NC_014562	GCC	2	6	639736	639741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186134
12267	NC_014562	AGT	2	6	639742	639747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186134
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12300	NC_014562	GCC	2	6	640999	641004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186135
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12305	NC_014562	CAAG	2	8	641406	641413	50 %	0 %	25 %	25 %	308186136
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12317	NC_014562	CTGA	2	8	641937	641944	25 %	25 %	25 %	25 %	308186136
12318	NC_014562	GCT	2	6	642158	642163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186137
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12322	NC_014562	TGA	2	6	642343	642348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186137
12323	NC_014562	TGG	2	6	642355	642360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186137
12324	NC_014562	ATGA	2	8	642381	642388	50 %	25 %	25 %	0 %	308186137
12325	NC_014562	GAT	2	6	642389	642394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186137
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12330	NC_014562	AATG	2	8	642569	642576	50 %	25 %	25 %	0 %	308186137
12331	NC_014562	GC	3	6	642652	642657	0 %	0 %	50 %	50 %	308186137
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12335	NC_014562	CGA	2	6	642836	642841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186137
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12337	NC_014562	GAT	2	6	642869	642874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186137
12338	NC_014562	TGG	2	6	642895	642900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186137
12339	NC_014562	TGCC	2	8	642985	642992	0 %	25 %	25 %	50 %	308186137
12340	NC_014562	GCTGGC	2	12	643327	643338	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308186138
12341	NC_014562	GGCGCT	2	12	643351	643362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308186138
12342	NC_014562	GAT	2	6	643370	643375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186138
12343	NC_014562	TGC	2	6	643384	643389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
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12345	NC_014562	AGA	2	6	643446	643451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186138
12346	NC_014562	TGAA	2	8	643512	643519	50 %	25 %	25 %	0 %	308186138
12347	NC_014562	GGCCC	2	10	643610	643619	0 %	0 %	40 %	60 %	308186138
12348	NC_014562	GCG	2	6	643632	643637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186138
12349	NC_014562	CGA	2	6	643699	643704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12350	NC_014562	CTC	2	6	643750	643755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186138
12351	NC_014562	GCA	2	6	643812	643817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12352	NC_014562	GC	3	6	643826	643831	0 %	0 %	50 %	50 %	308186138
12353	NC_014562	CA	3	6	643852	643857	50 %	0 %	0 %	50 %	308186138
12354	NC_014562	TCT	2	6	643950	643955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186138
12355	NC_014562	GCT	2	6	643957	643962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12356	NC_014562	GGC	2	6	643963	643968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186138
12357	NC_014562	GCT	2	6	643969	643974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12358	NC_014562	TGA	2	6	643977	643982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186138
12359	NC_014562	CGT	2	6	643991	643996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12360	NC_014562	TAA	2	6	644029	644034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186138
12361	NC_014562	GGAAG	2	10	644041	644050	40 %	0 %	60 %	0 %	308186138
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12365	NC_014562	TGA	2	6	644146	644151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186138
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12367	NC_014562	ACCA	2	8	644269	644276	50 %	0 %	0 %	50 %	308186138
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12373	NC_014562	GCT	2	6	644575	644580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12374	NC_014562	GC	3	6	644600	644605	0 %	0 %	50 %	50 %	308186138
12375	NC_014562	CTG	2	6	644669	644674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
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12383	NC_014562	TGC	2	6	644976	644981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186138
12384	NC_014562	ACC	2	6	645023	645028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186138
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12424	NC_014562	GCC	2	6	647334	647339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186139
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12441	NC_014562	CGCAG	2	10	647843	647852	20 %	0 %	40 %	40 %	308186139
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12443	NC_014562	CTGG	2	8	647965	647972	0 %	25 %	50 %	25 %	308186139
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12446	NC_014562	CATCA	2	10	648040	648049	40 %	20 %	0 %	40 %	308186139
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12456	NC_014562	AGATC	2	10	648683	648692	40 %	20 %	20 %	20 %	308186140
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12460	NC_014562	AGG	2	6	649148	649153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186140
12461	NC_014562	GCC	2	6	649183	649188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186140
12462	NC_014562	AT	3	6	649459	649464	50 %	50 %	0 %	0 %	308186140
12463	NC_014562	CCG	2	6	649525	649530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186140
12464	NC_014562	CCATT	2	10	649537	649546	20 %	40 %	0 %	40 %	308186140
12465	NC_014562	GCG	2	6	649594	649599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186140
12466	NC_014562	CGCTGC	2	12	649768	649779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	308186140
12467	NC_014562	A	6	6	649784	649789	100 %	0 %	0 %	0 %	308186140
12468	NC_014562	CGT	2	6	649808	649813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186140
12469	NC_014562	TAACGC	2	12	649887	649898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308186140
12470	NC_014562	ATT	2	6	649902	649907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186140
12471	NC_014562	T	6	6	650222	650227	0 %	100 %	0 %	0 %	308186141
12472	NC_014562	CGC	2	6	650289	650294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186141
12473	NC_014562	CG	3	6	650354	650359	0 %	0 %	50 %	50 %	308186141
12474	NC_014562	TGCA	2	8	650391	650398	25 %	25 %	25 %	25 %	308186141
12475	NC_014562	AGA	2	6	650444	650449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186141
12476	NC_014562	TAG	2	6	650458	650463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186141
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