MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014562	CAC	2	6	603028	603033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186099
11502	NC_014562	GCCA	2	8	603035	603042	25 %	0 %	25 %	50 %	308186099
11503	NC_014562	CCA	2	6	603054	603059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186099
11504	NC_014562	CTG	2	6	603076	603081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186099
11505	NC_014562	TGA	2	6	603140	603145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186099
11506	NC_014562	AGC	2	6	603216	603221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186099
11507	NC_014562	CGG	2	6	603279	603284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186099
11508	NC_014562	CAC	2	6	603304	603309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186099
11509	NC_014562	TTC	2	6	603310	603315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186099
11510	NC_014562	GC	3	6	603318	603323	0 %	0 %	50 %	50 %	308186099
11511	NC_014562	TCG	2	6	603416	603421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186099
11512	NC_014562	TCA	2	6	603447	603452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186099
11513	NC_014562	GCA	2	6	603455	603460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186099
11514	NC_014562	ACGT	2	8	603476	603483	25 %	25 %	25 %	25 %	308186099
11515	NC_014562	CA	3	6	603531	603536	50 %	0 %	0 %	50 %	308186099
11516	NC_014562	CCG	2	6	603573	603578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186099
11517	NC_014562	GC	3	6	603588	603593	0 %	0 %	50 %	50 %	308186099
11518	NC_014562	ATCA	2	8	603640	603647	50 %	25 %	0 %	25 %	308186099
11519	NC_014562	CTG	2	6	604318	604323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11520	NC_014562	GCC	2	6	604333	604338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186100
11521	NC_014562	GGCG	2	8	604375	604382	0 %	0 %	75 %	25 %	308186100
11522	NC_014562	ATG	2	6	604393	604398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186100
11523	NC_014562	AAAC	2	8	604401	604408	75 %	0 %	0 %	25 %	308186100
11524	NC_014562	AGC	2	6	604409	604414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11525	NC_014562	CAG	2	6	604507	604512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11526	NC_014562	GC	3	6	604530	604535	0 %	0 %	50 %	50 %	308186100
11527	NC_014562	TGT	2	6	604556	604561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186100
11528	NC_014562	CAG	2	6	604612	604617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11529	NC_014562	TGT	2	6	604628	604633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186100
11530	NC_014562	CGC	2	6	604657	604662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186100
11531	NC_014562	GAA	2	6	604684	604689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186100
11532	NC_014562	GCT	3	9	604744	604752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11533	NC_014562	CGA	2	6	604802	604807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11534	NC_014562	GAT	2	6	604845	604850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186100
11535	NC_014562	CAG	2	6	604867	604872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11536	NC_014562	CG	3	6	604995	605000	0 %	0 %	50 %	50 %	308186100
11537	NC_014562	CAT	2	6	605004	605009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186100
11538	NC_014562	GCT	2	6	605067	605072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11539	NC_014562	TG	3	6	605076	605081	0 %	50 %	50 %	0 %	308186100
11540	NC_014562	CCA	2	6	605091	605096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186100
11541	NC_014562	CACC	2	8	605157	605164	25 %	0 %	0 %	75 %	308186100
11542	NC_014562	AGCACC	2	12	605201	605212	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	308186100
11543	NC_014562	TGC	2	6	605228	605233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11544	NC_014562	CTGG	2	8	605313	605320	0 %	25 %	50 %	25 %	308186100
11545	NC_014562	TCA	2	6	605322	605327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186100
11546	NC_014562	GA	3	6	605366	605371	50 %	0 %	50 %	0 %	308186100
11547	NC_014562	GCG	2	6	605380	605385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186100
11548	NC_014562	ACA	2	6	605388	605393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186100
11549	NC_014562	CTG	2	6	605410	605415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11550	NC_014562	GTT	2	6	605421	605426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186100
11551	NC_014562	GCT	2	6	605439	605444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11552	NC_014562	CTTCGC	2	12	605490	605501	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	308186100
11553	NC_014562	GTT	2	6	605515	605520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186100
11554	NC_014562	CCA	2	6	605538	605543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186100
11555	NC_014562	GCT	2	6	605590	605595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186100
11556	NC_014562	GCG	2	6	605610	605615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186100
11557	NC_014562	GC	4	8	605633	605640	0 %	0 %	50 %	50 %	308186100
11558	NC_014562	CGC	2	6	605688	605693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186100
11559	NC_014562	GCT	2	6	605841	605846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11560	NC_014562	CGA	2	6	605859	605864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11561	NC_014562	GCT	2	6	605919	605924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11562	NC_014562	CA	3	6	605949	605954	50 %	0 %	0 %	50 %	308186101
11563	NC_014562	CGC	2	6	605961	605966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186101
11564	NC_014562	CTCA	2	8	605986	605993	25 %	25 %	0 %	50 %	308186101
11565	NC_014562	GGC	2	6	606025	606030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186101
11566	NC_014562	GCG	2	6	606050	606055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186101
11567	NC_014562	CAGCAC	2	12	606088	606099	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	308186101
11568	NC_014562	CGC	2	6	606109	606114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186101
11569	NC_014562	GCGCT	2	10	606131	606140	0 %	20 %	40 %	40 %	308186101
11570	NC_014562	CAGC	2	8	606174	606181	25 %	0 %	25 %	50 %	308186101
11571	NC_014562	CAG	2	6	606187	606192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186101
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11573	NC_014562	TGC	2	6	606206	606211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11574	NC_014562	AGCG	2	8	606270	606277	25 %	0 %	50 %	25 %	308186101
11575	NC_014562	GCC	2	6	606281	606286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186101
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11577	NC_014562	CTG	2	6	606337	606342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11578	NC_014562	CCG	3	9	606404	606412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186101
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11582	NC_014562	CTG	2	6	606538	606543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11583	NC_014562	CAG	2	6	606553	606558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186101
11584	NC_014562	CGC	2	6	606566	606571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186101
11585	NC_014562	TGT	2	6	606590	606595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186101
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11587	NC_014562	TAAT	2	8	606913	606920	50 %	50 %	0 %	0 %	308186102
11588	NC_014562	CGCC	2	8	606929	606936	0 %	0 %	25 %	75 %	308186102
11589	NC_014562	GGCG	2	8	606942	606949	0 %	0 %	75 %	25 %	308186102
11590	NC_014562	TAT	2	6	607029	607034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186102
11591	NC_014562	GA	3	6	607056	607061	50 %	0 %	50 %	0 %	308186102
11592	NC_014562	GCC	2	6	607134	607139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186102
11593	NC_014562	CAGT	2	8	607196	607203	25 %	25 %	25 %	25 %	308186102
11594	NC_014562	GTC	2	6	607227	607232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186102
11595	NC_014562	TTCG	2	8	607235	607242	0 %	50 %	25 %	25 %	308186102
11596	NC_014562	TCC	2	6	607248	607253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186102
11597	NC_014562	GC	3	6	607279	607284	0 %	0 %	50 %	50 %	308186102
11598	NC_014562	CAG	2	6	607311	607316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186102
11599	NC_014562	TGGA	2	8	607317	607324	25 %	25 %	50 %	0 %	308186102
11600	NC_014562	GAA	2	6	607337	607342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186102
11601	NC_014562	CACCCG	2	12	607352	607363	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	308186102
11602	NC_014562	CTG	2	6	607371	607376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186102
11603	NC_014562	TAA	2	6	607580	607585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186102
11604	NC_014562	GCGCTG	2	12	607596	607607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308186102
11605	NC_014562	GGT	2	6	607676	607681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186102
11606	NC_014562	GCG	2	6	607797	607802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186102
11607	NC_014562	CGA	2	6	607828	607833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186102
11608	NC_014562	GGCA	2	8	607857	607864	25 %	0 %	50 %	25 %	308186103
11609	NC_014562	GCT	2	6	607969	607974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186103
11610	NC_014562	TGC	2	6	608001	608006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186103
11611	NC_014562	GTG	2	6	608015	608020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186103
11612	NC_014562	CTG	3	9	608027	608035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186103
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11614	NC_014562	TGGTT	2	10	608081	608090	0 %	60 %	40 %	0 %	308186103
11615	NC_014562	GGC	2	6	608116	608121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186103
11616	NC_014562	GCAG	2	8	608203	608210	25 %	0 %	50 %	25 %	308186103
11617	NC_014562	CGTT	2	8	608340	608347	0 %	50 %	25 %	25 %	308186103
11618	NC_014562	GCG	3	9	608423	608431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186103
11619	NC_014562	CTG	2	6	608471	608476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186103
11620	NC_014562	TGGC	2	8	608486	608493	0 %	25 %	50 %	25 %	308186103
11621	NC_014562	GCA	3	9	608544	608552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186104
11622	NC_014562	ATC	2	6	608558	608563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186104
11623	NC_014562	CTCA	2	8	608637	608644	25 %	25 %	0 %	50 %	308186104
11624	NC_014562	GACT	2	8	608660	608667	25 %	25 %	25 %	25 %	308186104
11625	NC_014562	CTG	2	6	608704	608709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186104
11626	NC_014562	GCAGA	2	10	608716	608725	40 %	0 %	40 %	20 %	308186104
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11630	NC_014562	GCT	2	6	608883	608888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186104
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11643	NC_014562	GC	3	6	609508	609513	0 %	0 %	50 %	50 %	308186104
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11649	NC_014562	CTG	3	9	610099	610107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186105
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11652	NC_014562	GTCGAG	2	12	610369	610380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308186105
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11655	NC_014562	ATGA	2	8	610614	610621	50 %	25 %	25 %	0 %	308186106
11656	NC_014562	TGAT	2	8	610648	610655	25 %	50 %	25 %	0 %	308186106
11657	NC_014562	TGG	2	6	610678	610683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186106
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11670	NC_014562	TGG	2	6	611422	611427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186106
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11672	NC_014562	AGGGC	2	10	611513	611522	20 %	0 %	60 %	20 %	308186106
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11722	NC_014562	CG	3	6	614103	614108	0 %	0 %	50 %	50 %	308186109
11723	NC_014562	GCC	2	6	614119	614124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186109
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11728	NC_014562	TCG	2	6	614426	614431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186109
11729	NC_014562	CTG	2	6	614464	614469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186109
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11731	NC_014562	GTCAAA	2	12	614524	614535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308186109
11732	NC_014562	CGC	2	6	614540	614545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186109
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11734	NC_014562	ATG	2	6	614608	614613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186109
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11736	NC_014562	GAGC	2	8	614655	614662	25 %	0 %	50 %	25 %	308186109
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11855	NC_014562	CTG	2	6	620021	620026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186115
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11973	NC_014562	CG	3	6	625723	625728	0 %	0 %	50 %	50 %	308186122
11974	NC_014562	CGT	2	6	625735	625740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186122
11975	NC_014562	TCG	2	6	625761	625766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186122
11976	NC_014562	GTG	2	6	625784	625789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186122
11977	NC_014562	GAG	3	9	625911	625919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186122
11978	NC_014562	GC	3	6	625924	625929	0 %	0 %	50 %	50 %	308186122
11979	NC_014562	TAA	2	6	625976	625981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186122
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11982	NC_014562	AGTTC	2	10	626052	626061	20 %	40 %	20 %	20 %	308186122
11983	NC_014562	TC	3	6	626060	626065	0 %	50 %	0 %	50 %	308186122
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11985	NC_014562	AGC	2	6	626187	626192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186123
11986	NC_014562	GCT	2	6	626252	626257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186123
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11996	NC_014562	CGG	2	6	626741	626746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186123
11997	NC_014562	CAGC	2	8	626792	626799	25 %	0 %	25 %	50 %	308186123
11998	NC_014562	GCG	2	6	626850	626855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186123
11999	NC_014562	GGC	2	6	626861	626866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186123
12000	NC_014562	GCGG	2	8	626934	626941	0 %	0 %	75 %	25 %	308186123

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