MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014562	TGC	2	6	580447	580452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11002	NC_014562	CGG	2	6	580470	580475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186076
11003	NC_014562	GAT	2	6	580498	580503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186076
11004	NC_014562	CTT	2	6	580522	580527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186076
11005	NC_014562	CGGT	2	8	580533	580540	0 %	25 %	50 %	25 %	308186076
11006	NC_014562	CTT	2	6	580711	580716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186076
11007	NC_014562	GCT	2	6	580720	580725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11008	NC_014562	CTG	2	6	580739	580744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11009	NC_014562	GAT	2	6	580765	580770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186076
11010	NC_014562	ACCT	2	8	580787	580794	25 %	25 %	0 %	50 %	308186076
11011	NC_014562	CAC	2	6	580804	580809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186076
11012	NC_014562	TGA	2	6	580860	580865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186076
11013	NC_014562	CGC	2	6	580945	580950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186076
11014	NC_014562	GCT	2	6	581038	581043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11015	NC_014562	TGC	2	6	581052	581057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11016	NC_014562	GCT	2	6	581059	581064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11017	NC_014562	TCA	2	6	581114	581119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186076
11018	NC_014562	TCA	2	6	581136	581141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186076
11019	NC_014562	TCA	2	6	581169	581174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186076
11020	NC_014562	CTG	2	6	581231	581236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186076
11021	NC_014562	GCC	2	6	581258	581263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186076
11022	NC_014562	ACC	2	6	581294	581299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186076
11023	NC_014562	TCAC	2	8	581356	581363	25 %	25 %	0 %	50 %	308186076
11024	NC_014562	TAA	2	6	581369	581374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186076
11025	NC_014562	CTG	3	9	581554	581562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186078
11026	NC_014562	GCT	2	6	581565	581570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186078
11027	NC_014562	CGG	2	6	581573	581578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186078
11028	NC_014562	GCG	2	6	581579	581584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186078
11029	NC_014562	CTG	2	6	581664	581669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186078
11030	NC_014562	CTG	2	6	581743	581748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186078
11031	NC_014562	CTA	2	6	581998	582003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186079
11032	NC_014562	GGT	2	6	582020	582025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186079
11033	NC_014562	CAG	2	6	582101	582106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186079
11034	NC_014562	CAG	2	6	582119	582124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186079
11035	NC_014562	GGC	3	9	582163	582171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186079
11036	NC_014562	TGA	2	6	582178	582183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186079
11037	NC_014562	TGA	2	6	582315	582320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186079
11038	NC_014562	TGAC	2	8	582365	582372	25 %	25 %	25 %	25 %	308186079
11039	NC_014562	CCT	2	6	582452	582457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308186080
11040	NC_014562	CAT	2	6	582462	582467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186080
11041	NC_014562	GCG	2	6	582493	582498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186080
11042	NC_014562	GAA	2	6	582583	582588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186080
11043	NC_014562	GGC	2	6	582592	582597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186080
11044	NC_014562	AAT	2	6	582652	582657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186080
11045	NC_014562	CATTC	2	10	582741	582750	20 %	40 %	0 %	40 %	308186080
11046	NC_014562	TGG	2	6	582860	582865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186080
11047	NC_014562	CGG	2	6	582923	582928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186080
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11049	NC_014562	CTG	2	6	583136	583141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186081
11050	NC_014562	ATT	2	6	583175	583180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186081
11051	NC_014562	CGAC	2	8	583212	583219	25 %	0 %	25 %	50 %	308186081
11052	NC_014562	GAT	2	6	583238	583243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186081
11053	NC_014562	CCG	2	6	583247	583252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186081
11054	NC_014562	TTG	2	6	583257	583262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186081
11055	NC_014562	ATT	2	6	583421	583426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186081
11056	NC_014562	CTG	2	6	583439	583444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186081
11057	NC_014562	TGA	2	6	583473	583478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186081
11058	NC_014562	GT	3	6	583518	583523	0 %	50 %	50 %	0 %	308186082
11059	NC_014562	GC	3	6	583555	583560	0 %	0 %	50 %	50 %	308186082
11060	NC_014562	GCT	2	6	583600	583605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11061	NC_014562	CAG	2	6	583639	583644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11062	NC_014562	CGT	2	6	583696	583701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11063	NC_014562	CAG	2	6	583718	583723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11064	NC_014562	CAG	2	6	583727	583732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11065	NC_014562	CAGC	2	8	583738	583745	25 %	0 %	25 %	50 %	308186082
11066	NC_014562	AGC	3	9	583752	583760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11067	NC_014562	GCA	3	9	583774	583782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11068	NC_014562	GCT	2	6	583808	583813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186082
11069	NC_014562	CAG	2	6	583817	583822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
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11071	NC_014562	CAG	2	6	583886	583891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186082
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11083	NC_014562	GCC	2	6	584093	584098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186082
11084	NC_014562	CAAAG	2	10	584125	584134	60 %	0 %	20 %	20 %	308186082
11085	NC_014562	GCG	3	9	584177	584185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186082
11086	NC_014562	GAAA	2	8	584215	584222	75 %	0 %	25 %	0 %	308186082
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11088	NC_014562	GCG	2	6	584279	584284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186082
11089	NC_014562	AAG	2	6	584307	584312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186082
11090	NC_014562	TGC	2	6	584356	584361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186082
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11092	NC_014562	TGC	3	9	584404	584412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186082
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11100	NC_014562	AAT	2	6	584841	584846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186082
11101	NC_014562	AAGC	2	8	584964	584971	50 %	0 %	25 %	25 %	308186083
11102	NC_014562	CGTTA	2	10	584978	584987	20 %	40 %	20 %	20 %	308186083
11103	NC_014562	T	6	6	584991	584996	0 %	100 %	0 %	0 %	308186083
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11107	NC_014562	GTG	2	6	585078	585083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186083
11108	NC_014562	GCGGGT	2	12	585096	585107	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	308186083
11109	NC_014562	CGG	2	6	585125	585130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186083
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11111	NC_014562	GC	3	6	585208	585213	0 %	0 %	50 %	50 %	308186083
11112	NC_014562	GCC	2	6	585228	585233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186083
11113	NC_014562	GC	3	6	585238	585243	0 %	0 %	50 %	50 %	308186083
11114	NC_014562	GTC	2	6	585261	585266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186083
11115	NC_014562	CGG	2	6	585326	585331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186083
11116	NC_014562	TGC	2	6	585392	585397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186083
11117	NC_014562	TGA	2	6	585410	585415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186083
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11119	NC_014562	GCA	2	6	585595	585600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186083
11120	NC_014562	TGG	2	6	585640	585645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186083
11121	NC_014562	CT	3	6	585747	585752	0 %	50 %	0 %	50 %	308186083
11122	NC_014562	GTCAG	2	10	585791	585800	20 %	20 %	40 %	20 %	308186083
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11130	NC_014562	ACA	3	9	586387	586395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186084
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11153	NC_014562	GCA	2	6	587211	587216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186085
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11214	NC_014562	GCAG	2	8	590680	590687	25 %	0 %	50 %	25 %	308186088
11215	NC_014562	TTG	2	6	590730	590735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186088
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11219	NC_014562	GCT	2	6	591121	591126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186089
11220	NC_014562	TGG	2	6	591147	591152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186089
11221	NC_014562	ACT	2	6	591156	591161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186089
11222	NC_014562	CGG	2	6	591199	591204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186089
11223	NC_014562	CCA	2	6	591255	591260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186089
11224	NC_014562	CTG	2	6	591263	591268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186089
11225	NC_014562	A	6	6	591318	591323	100 %	0 %	0 %	0 %	308186089
11226	NC_014562	CGT	2	6	591421	591426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186089
11227	NC_014562	TGTGC	2	10	591592	591601	0 %	40 %	40 %	20 %	308186089
11228	NC_014562	CGG	2	6	591678	591683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186089
11229	NC_014562	CAC	2	6	591702	591707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186089
11230	NC_014562	CCAG	2	8	591744	591751	25 %	0 %	25 %	50 %	308186089
11231	NC_014562	GGC	2	6	591760	591765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186089
11232	NC_014562	GAT	2	6	591787	591792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186089
11233	NC_014562	TCT	2	6	591813	591818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186089
11234	NC_014562	GCA	2	6	591826	591831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186089
11235	NC_014562	ATGG	2	8	591910	591917	25 %	25 %	50 %	0 %	308186089
11236	NC_014562	GCG	2	6	591960	591965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186089
11237	NC_014562	GGC	2	6	592003	592008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186089
11238	NC_014562	CTT	2	6	592107	592112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186090
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11343	NC_014562	CAG	2	6	595417	595422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186092
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11348	NC_014562	GCAG	2	8	595634	595641	25 %	0 %	50 %	25 %	308186092
11349	NC_014562	GCATC	2	10	595773	595782	20 %	20 %	20 %	40 %	308186092
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11472	NC_014562	GAA	2	6	601943	601948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186098
11473	NC_014562	CG	3	6	601950	601955	0 %	0 %	50 %	50 %	308186098
11474	NC_014562	CGG	2	6	601974	601979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186098
11475	NC_014562	GTATT	2	10	601980	601989	20 %	60 %	20 %	0 %	308186098
11476	NC_014562	TGA	2	6	602023	602028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186098
11477	NC_014562	CAC	2	6	602030	602035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186098
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11479	NC_014562	ATG	2	6	602136	602141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186098
11480	NC_014562	CAA	2	6	602155	602160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186098
11481	NC_014562	GCT	2	6	602224	602229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186098
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11483	NC_014562	GCT	2	6	602338	602343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186098
11484	NC_014562	CAC	2	6	602354	602359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186098
11485	NC_014562	GTC	2	6	602471	602476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186098
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11497	NC_014562	CAG	2	6	602911	602916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186099
11498	NC_014562	GCA	2	6	602988	602993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186099
11499	NC_014562	GGC	2	6	603013	603018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186099
11500	NC_014562	CCA	2	6	603019	603024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186099

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