MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014562	GACG	2	8	525029	525036	25 %	0 %	50 %	25 %	308186026
10002	NC_014562	CAG	2	6	525042	525047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10003	NC_014562	GCG	2	6	525086	525091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186026
10004	NC_014562	TCA	2	6	525107	525112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186026
10005	NC_014562	GAC	2	6	525149	525154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10006	NC_014562	ATC	2	6	525162	525167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186026
10007	NC_014562	CAT	2	6	525366	525371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186026
10008	NC_014562	GTT	2	6	525429	525434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186026
10009	NC_014562	TTCGAC	2	12	525436	525447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308186026
10010	NC_014562	TCA	2	6	525517	525522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186026
10011	NC_014562	CTCAAC	2	12	525525	525536	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308186026
10012	NC_014562	GTT	2	6	525567	525572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186026
10013	NC_014562	GTA	2	6	525579	525584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186026
10014	NC_014562	CAGC	2	8	525593	525600	25 %	0 %	25 %	50 %	308186026
10015	NC_014562	CAG	2	6	525615	525620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10016	NC_014562	TCA	2	6	525634	525639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186026
10017	NC_014562	GCA	2	6	525662	525667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10018	NC_014562	GAA	2	6	525675	525680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186026
10019	NC_014562	ATG	2	6	525700	525705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186026
10020	NC_014562	ACC	2	6	525717	525722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186026
10021	NC_014562	AGT	2	6	525746	525751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186026
10022	NC_014562	CTT	2	6	525776	525781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186026
10023	NC_014562	GC	3	6	525801	525806	0 %	0 %	50 %	50 %	308186026
10024	NC_014562	GTA	2	6	525807	525812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186026
10025	NC_014562	AGG	2	6	525815	525820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308186026
10026	NC_014562	TCA	2	6	525926	525931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186026
10027	NC_014562	ACGC	2	8	526074	526081	25 %	0 %	25 %	50 %	308186026
10028	NC_014562	GCC	2	6	526093	526098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186026
10029	NC_014562	GCG	2	6	526126	526131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186026
10030	NC_014562	GC	3	6	526166	526171	0 %	0 %	50 %	50 %	308186026
10031	NC_014562	ACC	2	6	526228	526233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186026
10032	NC_014562	ACAG	2	8	526381	526388	50 %	0 %	25 %	25 %	308186026
10033	NC_014562	TCT	2	6	526406	526411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186026
10034	NC_014562	CGC	2	6	526518	526523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186026
10035	NC_014562	CGGG	2	8	526557	526564	0 %	0 %	75 %	25 %	308186026
10036	NC_014562	CAG	2	6	526698	526703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10037	NC_014562	CAG	3	9	526777	526785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10038	NC_014562	CGG	2	6	526841	526846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186026
10039	NC_014562	T	7	7	526850	526856	0 %	100 %	0 %	0 %	308186026
10040	NC_014562	GAA	2	6	526887	526892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186026
10041	NC_014562	CTGG	2	8	526916	526923	0 %	25 %	50 %	25 %	308186026
10042	NC_014562	CAG	2	6	526962	526967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10043	NC_014562	CGGTG	2	10	527016	527025	0 %	20 %	60 %	20 %	308186026
10044	NC_014562	GCAG	2	8	527050	527057	25 %	0 %	50 %	25 %	308186026
10045	NC_014562	GTA	2	6	527084	527089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186026
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10047	NC_014562	GGC	2	6	527165	527170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186026
10048	NC_014562	CGTTT	2	10	527238	527247	0 %	60 %	20 %	20 %	308186026
10049	NC_014562	TGC	2	6	527260	527265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186026
10050	NC_014562	TGA	2	6	527606	527611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186027
10051	NC_014562	ATGAC	2	10	527650	527659	40 %	20 %	20 %	20 %	308186027
10052	NC_014562	ATT	2	6	527769	527774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186027
10053	NC_014562	CAT	2	6	527853	527858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186027
10054	NC_014562	GT	3	6	527863	527868	0 %	50 %	50 %	0 %	308186027
10055	NC_014562	GTG	2	6	527883	527888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186027
10056	NC_014562	GT	3	6	527904	527909	0 %	50 %	50 %	0 %	308186027
10057	NC_014562	TTA	2	6	528105	528110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308186028
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10059	NC_014562	GT	3	6	528200	528205	0 %	50 %	50 %	0 %	308186028
10060	NC_014562	ACC	2	6	528207	528212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186028
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10063	NC_014562	TCA	2	6	528297	528302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186028
10064	NC_014562	GCT	3	9	528352	528360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186028
10065	NC_014562	CCG	2	6	528363	528368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186028
10066	NC_014562	CAG	2	6	528419	528424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186028
10067	NC_014562	GCT	2	6	528447	528452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186028
10068	NC_014562	TTG	2	6	528492	528497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186028
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10070	NC_014562	T	7	7	528574	528580	0 %	100 %	0 %	0 %	308186028
10071	NC_014562	GTT	2	6	528581	528586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186028
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10075	NC_014562	AGACC	2	10	528847	528856	40 %	0 %	20 %	40 %	308186029
10076	NC_014562	TGG	2	6	528901	528906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186029
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10078	NC_014562	GAT	2	6	529022	529027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186029
10079	NC_014562	TGCC	2	8	529037	529044	0 %	25 %	25 %	50 %	308186029
10080	NC_014562	CAGCGC	2	12	529058	529069	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	308186029
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10087	NC_014562	CGG	2	6	529369	529374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186029
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10089	NC_014562	ACA	2	6	529515	529520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308186030
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10091	NC_014562	GACCA	2	10	529624	529633	40 %	0 %	20 %	40 %	308186030
10092	NC_014562	TGG	2	6	529635	529640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186030
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10102	NC_014562	CAG	2	6	530017	530022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186030
10103	NC_014562	A	6	6	530050	530055	100 %	0 %	0 %	0 %	308186030
10104	NC_014562	GCA	2	6	530086	530091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186030
10105	NC_014562	CAGC	2	8	530125	530132	25 %	0 %	25 %	50 %	308186030
10106	NC_014562	AGGT	2	8	530135	530142	25 %	25 %	50 %	0 %	308186030
10107	NC_014562	TCA	2	6	530526	530531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186031
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10115	NC_014562	TGA	2	6	530842	530847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186031
10116	NC_014562	GCA	3	9	530884	530892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186031
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10118	NC_014562	T	6	6	530966	530971	0 %	100 %	0 %	0 %	308186031
10119	NC_014562	CAG	2	6	530975	530980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186031
10120	NC_014562	GTT	2	6	531038	531043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186031
10121	NC_014562	GCA	2	6	531082	531087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186031
10122	NC_014562	CGA	2	6	531199	531204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186031
10123	NC_014562	TGA	2	6	531239	531244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186031
10124	NC_014562	TCT	2	6	531283	531288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186031
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10126	NC_014562	CAG	2	6	531341	531346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186031
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10128	NC_014562	ATC	2	6	531684	531689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186032
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10130	NC_014562	CGC	2	6	531843	531848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186033
10131	NC_014562	CAG	2	6	531849	531854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186033
10132	NC_014562	GCCC	2	8	531879	531886	0 %	0 %	25 %	75 %	308186033
10133	NC_014562	GCA	2	6	531953	531958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186033
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10139	NC_014562	CAG	2	6	532116	532121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186033
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10141	NC_014562	GCA	2	6	532286	532291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186033
10142	NC_014562	GAT	2	6	532328	532333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186033
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10172	NC_014562	TCT	2	6	533621	533626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186034
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10225	NC_014562	CGCCTG	2	12	536346	536357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	308186037
10226	NC_014562	GCT	2	6	536390	536395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186037
10227	NC_014562	CAT	2	6	536414	536419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186037
10228	NC_014562	GCG	2	6	536431	536436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186037
10229	NC_014562	AGCTGA	2	12	536465	536476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308186037
10230	NC_014562	CTG	2	6	536523	536528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186037
10231	NC_014562	GC	3	6	536580	536585	0 %	0 %	50 %	50 %	308186037
10232	NC_014562	CG	3	6	536586	536591	0 %	0 %	50 %	50 %	308186037
10233	NC_014562	GC	3	6	536632	536637	0 %	0 %	50 %	50 %	308186037
10234	NC_014562	TCA	2	6	536639	536644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186037
10235	NC_014562	ATG	2	6	536725	536730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186037
10236	NC_014562	TGG	2	6	536756	536761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186037
10237	NC_014562	GGC	2	6	536790	536795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186037
10238	NC_014562	GCA	2	6	536804	536809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186037
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10342	NC_014562	GCTG	2	8	543656	543663	0 %	25 %	50 %	25 %	308186041
10343	NC_014562	ATCA	2	8	543702	543709	50 %	25 %	0 %	25 %	308186041
10344	NC_014562	GCC	2	6	543771	543776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186041
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10347	NC_014562	TCGA	2	8	543884	543891	25 %	25 %	25 %	25 %	308186042
10348	NC_014562	ATC	2	6	544001	544006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186042
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10350	NC_014562	CGGTG	2	10	544111	544120	0 %	20 %	60 %	20 %	308186042
10351	NC_014562	AAT	2	6	544204	544209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308186042
10352	NC_014562	CAG	2	6	544314	544319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186042
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10354	NC_014562	CGC	2	6	544480	544485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186042
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10356	NC_014562	GC	3	6	544595	544600	0 %	0 %	50 %	50 %	308186042
10357	NC_014562	TCA	2	6	544620	544625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186042
10358	NC_014562	GCT	2	6	544633	544638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186042
10359	NC_014562	GC	3	6	544685	544690	0 %	0 %	50 %	50 %	308186042
10360	NC_014562	TGAAC	2	10	544737	544746	40 %	20 %	20 %	20 %	308186042
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10362	NC_014562	CTG	2	6	544810	544815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186042
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10364	NC_014562	CCA	2	6	544872	544877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308186042
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10463	NC_014562	TCGA	2	8	550798	550805	25 %	25 %	25 %	25 %	308186047
10464	NC_014562	CAGAT	2	10	550843	550852	40 %	20 %	20 %	20 %	308186047
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10471	NC_014562	GTCA	2	8	551112	551119	25 %	25 %	25 %	25 %	308186047
10472	NC_014562	TCA	2	6	551498	551503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186048
10473	NC_014562	TCA	2	6	551561	551566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186048
10474	NC_014562	ATC	2	6	551590	551595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186048
10475	NC_014562	ATG	2	6	551672	551677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186048
10476	NC_014562	CGC	2	6	551730	551735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186048
10477	NC_014562	GTA	2	6	551821	551826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186048
10478	NC_014562	CAG	3	9	551842	551850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186048
10479	NC_014562	TCT	2	6	551870	551875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186048
10480	NC_014562	AGA	2	6	551976	551981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308186048
10481	NC_014562	CAG	2	6	552151	552156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186049
10482	NC_014562	ACG	2	6	552250	552255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186049
10483	NC_014562	TTG	2	6	552293	552298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308186049
10484	NC_014562	TCA	2	6	552311	552316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186049
10485	NC_014562	GCG	2	6	552349	552354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186049
10486	NC_014562	TCA	2	6	552356	552361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186049
10487	NC_014562	CGT	2	6	552376	552381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186049
10488	NC_014562	A	6	6	552583	552588	100 %	0 %	0 %	0 %	308186050
10489	NC_014562	CTG	2	6	552679	552684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308186050
10490	NC_014562	GAT	2	6	552750	552755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308186050
10491	NC_014562	GTG	2	6	552788	552793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308186050
10492	NC_014562	CGCC	2	8	552831	552838	0 %	0 %	25 %	75 %	308186050
10493	NC_014562	CAG	2	6	552850	552855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308186050
10494	NC_014562	CTT	2	6	552870	552875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308186050
10495	NC_014562	CGC	2	6	552901	552906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308186050
10496	NC_014562	TCA	2	6	552962	552967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186050
10497	NC_014562	GGC	2	6	552969	552974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308186050
10498	NC_014562	ATC	2	6	553004	553009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308186050
10499	NC_014562	GC	3	6	553038	553043	0 %	0 %	50 %	50 %	308186050
10500	NC_014562	TCATGG	2	12	553044	553055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308186050

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