MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014562	GTC	2	6	418605	418610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8002	NC_014562	ACCGC	2	10	418620	418629	20 %	0 %	20 %	60 %	308185916
8003	NC_014562	GCAA	2	8	418664	418671	50 %	0 %	25 %	25 %	308185916
8004	NC_014562	GCA	2	6	418692	418697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8005	NC_014562	CAC	2	6	418711	418716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185916
8006	NC_014562	TCG	2	6	418739	418744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8007	NC_014562	TGC	2	6	418802	418807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8008	NC_014562	GCCC	2	8	418892	418899	0 %	0 %	25 %	75 %	308185916
8009	NC_014562	TAG	2	6	418937	418942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185916
8010	NC_014562	GCA	2	6	418995	419000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8011	NC_014562	CGG	2	6	419017	419022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185916
8012	NC_014562	CAG	2	6	419029	419034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8013	NC_014562	GCA	2	6	419076	419081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8014	NC_014562	CTG	2	6	419083	419088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8015	NC_014562	AGCC	2	8	419162	419169	25 %	0 %	25 %	50 %	308185916
8016	NC_014562	TGC	2	6	419174	419179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8017	NC_014562	GC	3	6	419227	419232	0 %	0 %	50 %	50 %	308185916
8018	NC_014562	CTG	2	6	419251	419256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8019	NC_014562	CTG	2	6	419272	419277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185916
8020	NC_014562	ATGG	2	8	419436	419443	25 %	25 %	50 %	0 %	308185917
8021	NC_014562	ATT	2	6	419447	419452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185917
8022	NC_014562	ATC	2	6	419461	419466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185917
8023	NC_014562	CAG	2	6	419475	419480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185917
8024	NC_014562	GCG	2	6	419512	419517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185917
8025	NC_014562	CTGGCG	2	12	419523	419534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308185917
8026	NC_014562	GCC	2	6	419539	419544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185917
8027	NC_014562	CTG	2	6	419547	419552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185917
8028	NC_014562	TCAT	2	8	419683	419690	25 %	50 %	0 %	25 %	308185917
8029	NC_014562	GCT	2	6	419765	419770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185917
8030	NC_014562	ATCAGC	2	12	419860	419871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308185917
8031	NC_014562	GCG	2	6	419901	419906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185917
8032	NC_014562	CAA	2	6	419972	419977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185917
8033	NC_014562	GC	3	6	419983	419988	0 %	0 %	50 %	50 %	308185917
8034	NC_014562	TGT	2	6	419995	420000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185917
8035	NC_014562	AATG	2	8	420050	420057	50 %	25 %	25 %	0 %	308185917
8036	NC_014562	AG	3	6	420060	420065	50 %	0 %	50 %	0 %	308185917
8037	NC_014562	TCA	2	6	420091	420096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185917
8038	NC_014562	CTGG	2	8	420191	420198	0 %	25 %	50 %	25 %	308185917
8039	NC_014562	T	6	6	420264	420269	0 %	100 %	0 %	0 %	308185918
8040	NC_014562	TAG	2	6	420332	420337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185918
8041	NC_014562	CAG	2	6	420367	420372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185918
8042	NC_014562	CAC	2	6	420376	420381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185918
8043	NC_014562	CTG	2	6	420388	420393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185918
8044	NC_014562	CAT	2	6	420424	420429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185918
8045	NC_014562	GGC	2	6	420496	420501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185918
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8047	NC_014562	ACG	2	6	420555	420560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185918
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8049	NC_014562	TGC	2	6	420594	420599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185918
8050	NC_014562	TGC	2	6	420656	420661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185918
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8052	NC_014562	GCC	2	6	420730	420735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185918
8053	NC_014562	TGC	2	6	420782	420787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185918
8054	NC_014562	ATT	3	9	420814	420822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185918
8055	NC_014562	AGC	2	6	421022	421027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185918
8056	NC_014562	TGC	2	6	421056	421061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185918
8057	NC_014562	TGA	2	6	421063	421068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185918
8058	NC_014562	GA	3	6	421109	421114	50 %	0 %	50 %	0 %	308185918
8059	NC_014562	CAG	2	6	421289	421294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185918
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8061	NC_014562	CAG	2	6	421459	421464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185919
8062	NC_014562	CTG	2	6	421521	421526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185919
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8069	NC_014562	ATG	2	6	421769	421774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185919
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8223	NC_014562	AG	3	6	429956	429961	50 %	0 %	50 %	0 %	308185927
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8227	NC_014562	AATG	2	8	430043	430050	50 %	25 %	25 %	0 %	308185928
8228	NC_014562	ATC	2	6	430171	430176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185928
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8230	NC_014562	GTC	2	6	430345	430350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185928
8231	NC_014562	CA	3	6	430362	430367	50 %	0 %	0 %	50 %	308185928
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8236	NC_014562	TAC	2	6	431560	431565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185929
8237	NC_014562	GCAGC	2	10	431681	431690	20 %	0 %	40 %	40 %	308185929
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8345	NC_014562	ATGAA	2	10	436941	436950	60 %	20 %	20 %	0 %	308185934
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8351	NC_014562	TGC	2	6	437048	437053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185934
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8356	NC_014562	ATG	4	12	437360	437371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185934
8357	NC_014562	CGAT	2	8	437396	437403	25 %	25 %	25 %	25 %	308185934
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8359	NC_014562	GGT	2	6	437612	437617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185935
8360	NC_014562	GCATT	2	10	437710	437719	20 %	40 %	20 %	20 %	308185935
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8479	NC_014562	GGC	2	6	443366	443371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185942
8480	NC_014562	GCA	2	6	443390	443395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185942
8481	NC_014562	GCA	2	6	443447	443452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185942
8482	NC_014562	CTGC	2	8	443495	443502	0 %	25 %	25 %	50 %	308185942
8483	NC_014562	GCA	2	6	443509	443514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185942
8484	NC_014562	GCA	2	6	443543	443548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185942
8485	NC_014562	CT	3	6	443595	443600	0 %	50 %	0 %	50 %	308185942
8486	NC_014562	T	6	6	443727	443732	0 %	100 %	0 %	0 %	308185942
8487	NC_014562	GAG	2	6	443748	443753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185942
8488	NC_014562	TGG	2	6	443832	443837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185943
8489	NC_014562	TGA	2	6	443858	443863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185943
8490	NC_014562	CAG	2	6	443872	443877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185943
8491	NC_014562	CGC	2	6	443913	443918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185943
8492	NC_014562	GC	3	6	443972	443977	0 %	0 %	50 %	50 %	308185943
8493	NC_014562	CTG	2	6	444010	444015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185943
8494	NC_014562	TGA	2	6	444081	444086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185943
8495	NC_014562	AGA	2	6	444098	444103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185943
8496	NC_014562	GTCT	2	8	444108	444115	0 %	50 %	25 %	25 %	308185943
8497	NC_014562	CCA	2	6	444133	444138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185943
8498	NC_014562	CGCTG	2	10	444196	444205	0 %	20 %	40 %	40 %	308185944
8499	NC_014562	GCT	2	6	444251	444256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185944
8500	NC_014562	CAG	2	6	444390	444395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185944

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